Polycomb Repressive Complex 2 Controls the Embryo-to-Seedling Phase Transition

Polycomb repressive complex 2 (PRC2) is a key regulator of epigenetic states catalyzing histone H3 lysine 27 trimethylation (H3K27me3), a repressive chromatin mark. PRC2 composition is conserved from humans to plants, but the function of PRC2 during the early stage of plant life is unclear beyond the fact that it is required for the development of endosperm, a nutritive tissue that supports embryo growth. Circumventing the requirement of PRC2 in endosperm allowed us to generate viable homozygous null mutants for FERTILIZATION INDEPENDENT ENDOSPERM (FIE), which is the single Arabidopsis homolog of Extra Sex Combs, an indispensable component of Drosophila and mammalian PRC2. Here we show that H3K27me3 deposition is abolished genome-wide in fie mutants demonstrating the essential function of PRC2 in placing this mark in plants as in animals. In contrast to animals, we find that PRC2 function is not required for initial body plan formation in Arabidopsis. Rather, our results show that fie mutant seeds exhibit enhanced dormancy and germination defects, indicating a deficiency in terminating the embryonic phase. After germination, fie mutant seedlings switch to generative development that is not sustained, giving rise to neoplastic, callus-like structures. Further genome-wide studies showed that only a fraction of PRC2 targets are transcriptionally activated in fie seedlings and that this activation is accompanied in only a few cases with deposition of H3K4me3, a mark associated with gene activity and considered to act antagonistically to H3K27me3. Up-regulated PRC2 target genes were found to act at different hierarchical levels from transcriptional master regulators to a wide range of downstream targets. Collectively, our findings demonstrate that PRC2-mediated regulation represents a robust system controlling developmental phase transitions, not only from vegetative phase to flowering but also especially from embryonic phase to the seedling stage

Modélisation de la corrosion des alliages de zirconium par l'eau (application aux éléments de combustible nucléaire)

La shadow corrosion est un phénomène observé sur les gaines en alliages de zirconium des assemblages de combustibles dans les réacteurs nucléaires. Il consiste en l'augmentation de la corrosion sur les zones de la gaine qui sont à proximité d'autres parties de l'assemblage en Inconel. Afin d'améliorer la compréhension de ses mécanismes, des modèles numériques sont développés suivant deux axes d'études. Un premier modèle de couplage galvanique a pour but de dégager les facteurs de premier ordre. Les résultats des simulations montrent que l'intensité du courant anodique, et sa dépendance en potentiel, contrôlent le caractère local (effet d'ombre) de ce phénomène. D'autre part, cet effet nécessitant un courant cathodique assez élevé révèle l'importance du pouvoir oxydant de l'électrolyte. Un deuxième modèle d'oxydation du zirconium est développé en intégrant le transport multi particules dans l'oxyde. Ce modèle, couplé aux effets d'interfaces (métal/oxyde et oxyde/électrolyte), permet de démontrer le rôle crucial de la polarisation et de l'hydrogène provenant de la dissociation de l'eau sur les cinétiques d'oxydation. A partir de ces modèles, un scénario explicatif de la shadow corrosion est élaboré suggérant l'importance de la radiolyse de l'eau.La shadow corrosion est un phénomène observé sur les gaines en alliages de zirconium des assemblages de combustibles dans les réacteurs nucléaires. Il consiste en l'augmentation de la corrosion sur les zones de la gaine qui sont à proximité d'autres parties de l'assemblage en Inconel. Afin d'améliorer la compréhension de ses mécanismes, des modèles numériques sont développés suivant deux axes d'études. Un premier modèle de couplage galvanique a pour but de dégager les facteurs de premier ordre. Les résultats des simulations montrent que l'intensité du courant anodique, et sa dépendance en potentiel, contrôlent le caractère local (effet d'ombre) de ce phénomène. D'autre part, cet effet nécessitant un courant cathodique assez élevé révèle l'importance du pouvoir oxydant de l'électrolyte. Un deuxième modèle d'oxydation du zirconium est développé en intégrant le transport multi particules dans l'oxyde. Ce modèle, couplé aux effets d'interfaces (métal/oxyde et oxyde/électrolyte), permet de démontrer le rôle crucial de la polarisation et de l'hydrogène provenant de la dissociation de l'eau sur les cinétiques d'oxydation. A partir de ces modèles, un scénario explicatif de la shadow corrosion est élaboré suggérant l'importance de la radiolyse de l'eau.SAVOIE-SCD - Bib.électronique (730659901) / SudocGRENOBLE1/INP-Bib.électronique (384210012) / SudocGRENOBLE2/3-Bib.électronique (384219901) / SudocSudocFranceF

Le problème de l'activité des failles de Nîmes, de Salon-Cavaillon et de la moyenne Durance (SE de la France) : apports de la géomorphologie structurale/The problem of tectonic activity along the Nîmes, Salon-Cavaillon and moyenne Durance fault zones: evidence from structural geomorphology

Abstract The tectonic activity along the main faults of western Provence is studied by the means of structural geomorphology. This activity is demonstrated by seismotectonic analysis in the western Provence and lower Rhône regions. Mainly focused on the Moyenne Durance, Salon-Cavaillon and Nîmes fault zones and along a few compressive zones, it follows a complex tectonic history which has interfered all along the Cenozoic times with alternate stages of erosion, planation, sedimentary infilling of basins and incision. Together with the low rates of recent tectonism, this history explains why the geomorphic indices of activity along the fault zones are faint or ambiguous. Medium (hectometric to kilometric) scale landforms are the only geomorphic features that can be used for the purpose of tectonic analysis, but they result from a longer tectonic history than the short period of activity revealed by seismic and palaeoseismic analysis. Their study does not show any significant post-Pliocene activity along the Nîmes fault, suggests only a moderate and poorly characterized post-Pliocene activity along the Moyenne Durance fault zone, and may indicate some post- Miocene normal or strike-slip movements along parts of the Salon-Cavaillon fault zone, with a weak subsidence west of it (Carpentras basin). These results are in fairly close agreement with those of geodetic and seismic studies. Therefore, structural geomorphology is useful for validating geophysical and geological interpretations of tectonic movements in weakly active zones, particularly by giving upper limits to the amplitude of cumulate movements during given periods.Résumé L'article propose une évaluation de l'activité tectonique récente le long des principales failles de Provence occidentale et du Bas Rhône au moyen d'une analyse morphostructurale. Se concentrant surtout sur les failles de la moyenne Durance, de Salon-Cavaillon et de Nîmes, cette activité s'inscrit dans la suite d'une histoire tectonique complexe qui a interféré au Cénozoïque avec une histoire érosive caractérisée par des phases alternées d'aplanissement, de remblaiement et de dissection. Jointe à la modération des mouvements tectoniques récents, cette histoire explique le caractère souvent discret ou ambigu de l'expression morphologique des failles : ce sont surtout des formes structurales d'échelle moyenne (hectométrique à kilométrique) qui sont utilisables pour caractériser leur jeu. Intégrant les effets des déformations sur une plus longue durée que les analyses sismiques et paléosismiques, l'analyse ne révèle pas de mouvements post-pliocènes significatifs le long de la faille de Nîmes ; elle ne montre qu'une activité post-pliocène modérée et mal caractérisée sur celle de la Durance et qu'une faible activité post-miocène normale ou décrochante sur certains segments de l'accident de Salon-Cavaillon, suivie par un jeu flexural comportant une subsidence à l'W (bassin de Carpentras). Assez conformes à ce que suggèrent les données de la géodésie et de la sismicité, ces résultats montrent que la géomorphologie structurale contribue à la validation des données issues de la géophysique en contexte de tectonique modérément active, en particulier en fixant des limites supérieures à l'amplitude des mouvements cumulés sur des périodes données.Peulvast Jean-Pierre, Baroux Emmanuel, Bellier Olivier, Sébrier Michel. Le problème de l'activité des failles de Nîmes, de Salon-Cavaillon et de la moyenne Durance (SE de la France) : apports de la géomorphologie structurale/The problem of tectonic activity along the Nîmes, Salon-Cavaillon and moyenne Durance fault zones: evidence from structural geomorphology. In: Géomorphologie : relief, processus, environnement, Décembre 1999, vol. 5, n°4. pp. 327-358

Design, Synthesis and Evaluation of Enzyme-Responsive Fluorogenic Probes Based on Pyridine-Flanked Diketopyrrolopyrrole Dyes

The ever-growing demand for fluorogenic dyes usable in the rapid construction of analyte-responsive fluorescent probes, has recently contributed to a revival of interest in the chemistry of diketopyrrolopyrrole (DPP) pigments. In this context, we have explored the potential of symmetrical and unsymmetrical DPP derivatives bearing two or one 4-pyridyl substituents acting as optically tunable group(s). The unique fluorogenic behavior of these molecules, closely linked to N-substitution/charge state of their pyridine unit (i.e., neutral pyridine or cationic pyridinium), has been used to design DPP-based fluorescent probes for detection of hypoxia-related redox enzymes and penicillin G acylase (PGA). In this paper, we describe synthesis, spectral characterization and bioanalytical validations of these probes. Dramatic differences in terms of aqueous stability and enzymatic fluorescence activation were observed. This systematic study enables to delineate the scope of application of pyridine-flanked DPP fluorophores in the field of enzyme biosensing

The Limitations of the Rheumatogenic Concept for Group A Streptococcus :Systematic Review and Genetic Analysis

Background and Objective:The concept that a minority of Group A streptococcus (GAS) emm-types are more “rheumatogenic” than others is widely disseminated. The objective of this study is to provide a comprehensive list of ARF-associated strains and analyze their genetic diversity. Methods: All articles reporting ARF-associated strains or ARF-associated emm-type-specific antibody responses were identified in Pubmed from 01/01/1944 (first publication of Jones criteria) to 31/12/2016. The revised Jones Criteria (American Heart Association, 2015) were used to define ARF and a maximum time-period of four weeks between microbiological characterization and ARF onset was accepted. A database of 175 M-protein sequences was used to analyze the genetic diversity of ARF-associated strains in a PhyML phylogenetic tree. Geneious software was used to search for the presence of putative ARF-associated motifs (PARF motif and two proposed rheumatogenic peptides).Results:Thirty-six relevant studies were identified among 677 publications. 440 ARF-associated isolates belonging to 66 different emm-types were included in the analysis. The classical “rheumatogenic” emm-types represented 41% of the 440 ARF-associated isolates and 14% of the 66 identified emm-types. When the classical rheumatogenic emm-type were mapped by specific clade onto the emm-cluster-type phylogenetic tree, ARF-associated emm-types were disseminated along the tree suggesting ARF-associated strains belong to various genetic backgrounds. ARF-associated motifsOral presentationinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe

Design, synthesis and evaluation of enzyme-responsive fluorogenic probes based on pyridine-flanked diketopyrrolopyrrole dyes

International audienceThe ever-growing demand for fluorogenic dyes usable in the rapid construction of analyteresponsive fluorescent probes, has recently contributed to a revival of interest in the chemistry of diketopyrrolopyrrole (DPP) pigments. In this context, we have explored the potential of symmetrical and unsymmetrical DPP derivatives bearing two or one 4-pyridyl substituents acting as optically tunable group(s). The unique fluorogenic behavior of these molecules, closely linked to N-substitution/charge state of their pyridine unit (i.e., neutral pyridine or cationic pyridinium), has been used to design DPP-based fluorescent probes for detection of hypoxia-related redox enzymes and penicillin G acylase (PGA). In this paper, we describe synthesis, spectral characterization and bioanalytical validations of these probes. Dramatic differences in terms of aqueous stability and enzymatic fluorescence activation were observed. This systematic study enables to delineate the scope of application of pyridine-flanked DPP fluorophores in the field of enzyme biosensing