95 research outputs found

    Variabilità nel numero di paragnati in popolazioni di <i>Hediste diversicolor</i> (Polychaeta, Nereididae) del Mediterraneo occidentale

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    Con il presente lavoro è stata analizzata la variabilità nel numero di paragnati (dentelli chitinosi) presenti sul faringe del polichete di ambienti salmastri Hediste diversicolor. Il faringe è classicamente suddiviso in 7 zone distribuite in una cintura mascellare (I-IV) e una orale (V-VII+VIII). L'assenza di paragnati nella zona V è uno dei caratteri diagnostici di H. diversicolor. Sono stati raccolti 30 individui in ciascuna delle seguenti località: 1) Fiume Morto e 2) Coltano (Toscana nord occidentale), 3) Migliacciaru (Corsica orientale), 4) Baia di Figari (Corsica sud occidentale) e 5) Stagno di Calich (Sardegna nord occidentale). Il conteggio dei paragnati è stato effettuato allo stereomicroscopio su individui fissati in etanolo al 70%. Per tutte le zone del faringe è stata rilevata una notevole variabilità tra le popolazioni che è risultata significativa mediante ANOVA (tutti i valori di P&lt;0.001). Le due popolazioni corse sono caratterizzate da un numero di paragnati superiore rispetto alle altre e la popolazione di Migliacciaru è risultata più asimmetrica rispetto alle altre. L'ANOVA delle misure di asimmetria (|IIsx-IIdx|, |IVsx-IVdx| e |VIsx-VIdx|) ha dato differenziazione significativa tra le popolazioni solo per le zone II e IV. Data la funzione che i paragnati svolgono nell'alimentazione di H. diversicolor, le differenze osservate tra le popolazioni suggeriscono che esse sono localmente adattate a condizioni trofiche peculiari

    Survey of the genetic variability of populations of <i>Ruditapes philippinarum</i> from tre Gulf of Olbia (N-E Sardinia) by microsatellites = Indagine sulla variabilità genetica di popolazioni di <i>Ruditapes philippinarum</i> provenienti dal golfo di Olbia (N-E Sardegna)

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    Genetic variability was investigated at six microsatellite loci of the Manila clam Ruditapes philippinarum (Adams &amp; Reeve, 1850) (Bivalvia) from the Gulf of Olbia (N-E Sardinia) and Sacca di Goro (N Adriatic Sea). We found no significant differentiation among Sardinian samples and between those and the Adriatic one, which suggests the absence of a founder effect in Sardinian population

    Mitochondrial DNA reveals genetic structuring of <i>Pinna nobilis</i> across the Mediterranean Sea

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    Pinna nobilis is the largest endemic Mediterranean marine bivalve. During past centuries, various human activities have promoted the regression of its populations. As a consequence of stringent standards of protection, demographic expansions are currently reported in many sites. The aim of this study was to provide the first large broad-scale insight into the genetic variability of P. nobilis in the area that encompasses the western Mediterranean, Ionian Sea, and Adriatic Sea marine ecoregions. To accomplish this objective twenty-five populations from this area were surveyed using two mitochondrial DNA markers (COI and 16S). Our dataset was then merged with those obtained in other studies for the Aegean and Tunisian populations (eastern Mediterranean), and statistical analyses (Bayesian model-based clustering, median-joining network, AMOVA, mismatch distribution, Tajima’s and Fu’s neutrality tests and Bayesian skyline plots) were performed. The results revealed genetic divergence among three distinguishable areas: (1) western Mediterranean and Ionian Sea; (2) Adriatic Sea; and (3) Aegean Sea and Tunisian coastal areas. From a conservational point of view, populations from the three genetically divergent groups found may be considered as different management units

    Analisi della struttura genetica di <i>Hediste diversicolor</i> (Polychaeta, Nereididae) nel Mediterraneo occidentale mediante marcatori ISSR

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    La struttura genetica del polichete Hediste diversicolor del Mediterraneo occidentale è stata studiata utilizzando gli ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) come marcatori genetici. Sono stati raccolti 30 individui in ciascuna delle seguenti località: Stagno di Calich (Sardegna N-O), Baia di Figari (Corsica S-O), Migliacciaru (Corsica E), Fiume Morto (Toscana N-O) e Coltano (Toscana N-O). L'MDS applicato alle distanze genetiche individuali ha mostrato elevata diversità tra gli individui, ma non ha messo in evidenza alcuna sottostrutturazione genetica nelle popolazioni. Un forte segnale della divergenza genetica tra le popolazioni è dato dal fatto che il 37% del numero totale di bande rilevato è costituito da bande private, cioè esclusive di una popolazione. La varianza genetica, analizzata mediante AMOVA, è risultata equamente ripartita nelle componenti intra- e inter-popolazione (rispettivamente 46.9% e 53.1%). La Φ-statistica ha evidenziato la divergenza genetica tra le popolazioni (Φst = 0.469, P&lt;0.001). La notevole divergenza genetica tra le popolazioni di H. diversicolor è determinata in primo luogo dalla frammentazione naturale dell'habitat che produce isolamento con virtuale assenza di flusso genico tra le popolazioni. L'assenza di sottostrutturazione delle popolazioni, invece, conferma le osservazioni fatte in passato sulla dispersione degli adulti e delle postlarve all'interno dei singoli biotopi

    La Biodiversità degli invertebrati marini è sottostimata? Il caso di <i>Ophelia bicornis</i> e <i>Ophelia barquii</i> (Annelida, Polychaeta)

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    Negli ultimi anni gli studi molecolari condotti su invertebrati marini hanno contribuito fortemente alla valutazione della biodiversità locale mediante la risoluzione di complessi casi di tassonomia. Ophelia bicornis s.l. è un polichete che vive in habitat intertidali sabbiosi delle coste mediterranee ed europee atlantiche, la cui sistematica è ancora in fase di definizione. Un nostro precedente studio effettuato tramite alloenzimi ha suggerito che O. bicornis s.l. è costituita da due specie: O. bicornis s.s. e O. barquii, rispettivamente riconducibili a morfotipi con 6 e 5 paia di nefridiopori. Nel presente lavoro è stata abbinata l'analisi morfologica (conteggio dei nefridiopori) con quella genetica (genotipizzazione tramite ISSR). Sono stati analizzati 6 campioni (n=50) di O. bicornis s.l. provenienti da 3 località sarde e 3 siciliane. I dati morfologici indicano una diversa distribuzione dei due morfotipi, che sono stati rilevati in simpatria, sia in località sarde che siciliane. L'analisi genetica effettuata tramite gli ISSR ripropone la distinzione tra individui con 6 e 5 paia di nefridiopori, confermando la precedente separazione di O. bicornis s.l. in due specie distinte. Il presente lavoro i) rappresenta un'ulteriore conferma del fatto che i livelli di biodiversità negli invertebrati marini sono attualmente sottostimati e ii) pone le basi per uno studio più accurato delle caratteristiche dell'habitat di queste specie

    Analysis of the genetic variability of <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastropoda: Patellidae) populations from the North-East Sardinia = Analisi della variabilità genetica in popolazioni di <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastropoda: Patellidae) provenienti dalla Sardegna nord-orientale

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    The mollusc Patella ferruginea (Gastropoda, Patellidae), endemic to the Medilerranean, is the most endangered marine species on the list of the European Couneil Directive 92/43/EEC and it is presently under serious risk of extinction. This research was aimed to unravel the genetic variability of some Sardinian populations sampled on the North-Eastern coast, in order to shed light on their status of conservation

    The Role of a marine protected area in safeguarding the genetic diversity of rare species: the case of <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastrpoda: Patellidae) = Il Ruolo delle aree marine protette per la salvaguardia della diversità genetica di specie rare: il caso di <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastropoda: Patellidae)

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    Patella ferruginea (Gastropoda: Patellidae) is an endangered marine gastropod, distributed on the western Mediterranean coasts, whose range has progressively contracted, due to intense human exploitation. Our attention focused on its genetic structure, in order to gather information about levels of genetic variability of P. ferruginea from the Asinara Marine Protected Area and a neighbouring non-protected area

    Mitochondrial DNA Variation among Dogs of Mongolian, Tuvinian and Altaic Nomads

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    Dogs originated from the domestication of Eurasian grey wolves. From a genetic viewpoint, they can be grouped into two main clusters: the first is represented by several breeds obtained by artificial selection, whereas the second is of dogs that adapted to a human commensal lifestyle. Here we have provided a molecular survey aimed to infer on the genetic variability of dogs from nomadic camps in Mongolia, and the Republics of Tuva and Altai belonging to the Russian Federation. The results provided evidence of typical marks of expanding populations with multiple origins. Such a scenario could be the result of genetic exchanges among dogs from different camps, that were likely mediated by nomads

    Mendelian breeding units <i>versus</i> standard sampling strategies: mitochondrial DNA variation in southwest Sardinia

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    We report a sampling strategy based on Mendelian Breeding Units (MBUs), representing an interbreeding group of individuals sharing a common gene pool. The identification of MBUs is crucial for case-control experimental design in association studies. The aim of this work was to evaluate the possible existence of bias in terms of genetic variability and haplogroup frequencies in the MBU sample, due to severe sample selection. In order to reach this goal, the MBU sampling strategy was compared to a standard selection of individuals according to their surname and place of birth. We analysed mitochondrial DNA variation (first hypervariable segment and coding region) in unrelated healthy subjects from two different areas of Sardinia: the area around the town of Cabras and the western Campidano area. No statistically significant differences were observed when the two sampling methods were compared, indicating that the stringent sample selection needed to establish a MBU does not alter original genetic variability and haplogroup distribution. Therefore, the MBU sampling strategy can be considered a useful tool in association studies of complex traits

    Spatial genetic patterns of Octopus vulgaris Mediterranean populations support the hypothesis of a transitional zone across the Siculo-Tunisian Strait

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    AbstractRecent research hypothesised that the Siculo-Tunisian Strait might fit, at least for some species, the picture of a genetic transitional zone instead of a sharp genetic break between the Western and Eastern Mediterranean basins. The present study aimed at using the common Octopus, Octopus vulgaris as an empirical test-case to evaluate this hypothesis. To accomplish this goal, 458 new sequences of the mitochondrial gene cytochrome c oxidase subunit I were used. Combining the new sequences with those available on public databases, we assembled a dataset containing 920 sequences to investigate the spatial genetic patterns across 34 Mediterranean populations of O. vulgaris. The genetic structure of this species was assessed combining analysis of molecular variance and Median-Joining networks. Results supported the hypothesis of a complex spatial genetic pattern across the Sicilian channel. Contemporary factors, such as marine currents, likely affect the species' genetic structuring across this area. Overall, our results highlighted that focusing the attention on the whole transitional area rather than on a unique genetic break might help to detect similar patterns across different species. Finally, acknowledging the occurrence of complex spatial genetic patterns across transitional zones may improve stock identification and management practices for commercially valuable species
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