83 research outputs found
An impedimetric study of DNA hybridization on paper-supported inkjet-printed gold electrodes
In this study, two different supramolecular recognition architectures for impedimetric detection
of DNA hybridization have been formed on disposable paper-supported inkjet-printed gold
electrodes. The gold electrodes were fabricated using a gold nanoparticle based ink. The first
recognition architecture consists of subsequent layers of biotinylated self-assembly monolayer
(SAM), streptavidin and biotinylated DNA probe. The other recognition architecture is constructed by immobilization of thiol-functionalized DNA probe (HSDNA) and subsequent
backfill with 11mercapto1undecanol (MUOH) SAM. The binding capacity and selectivity
of the recognition architectures were examined by surface plasmon resonance (SPR)
measurements. SPR results showed that the HSDNA/MUOH system had a higher binding
capacity for the complementary DNA target. Electrochemical impedance spectroscopy (EIS)
measurements showed that the hybridization can be detected with impedimetric spectroscopy
in picomol range for both systems. EIS signal indicated a good selectivity for both recognition
architectures, whereas SPR showed very high unspecific binding for the HSDNA/MUOH
system. The factors affecting the impedance signal were interpreted in terms of the complexity
of the supramolecular architecture. The more complex architecture acts as a less ideal
capacitive sensor and the impedance signal is dominated by the resistive elements
Esiselvitys 3D-kameratekniikan ja koneoppimisen hyödyntämisestä suomalaisessa kalan- kasvatuksessa
Tehokas kalankasvatus edellyttää tarkkaa ajantasaista tietoa kalojen lukumäärästä, aktiivisuudesta, terveydentilasta ja kasvusta (biomassasta). Tämä mahdollistaa erilaisten toimenpiteiden, kuten ruokinnan, lajittelun, kasvatustiheyksien ja lopulta perkuuajankohdan optimaalisen hallinnan. Videovalvonnan ja -ohjauksen käyttö on lisääntynyt merkittävästi kalankasvatuksen seurannassa ja tuotannonohjauksessa.
Myös tietokoneavusteiset kuva-tai videoanalyysit ovat kehittyneet viimeisten kolmen vuosikymmenen aikana, ja ne ovat avainroolissa kasvatettavien kalastojen automaattisessa, ilman ihmistä tapahtuvassa mittaamisessa ja analysoinnissa. Tärkeimmät käytännön sovellukset liittyvät kasvatettavan kalaston ruokinnan ja biomassan seuraamiseen mutta myös kalaterveyteen ja välineiden kunnossapitoon. Kalankasvatusmarkkinoille on kehitetty jonkin aikaa muun muassa 3D-videoseurantaan perustuvia biomassalaskureita, mutta toistaiseksi niiden tarkkuus ei ole ollut välttämättä riittävä. Suomen sameissa rannikkovesissä laskureista ei ole raportoituja käyttökokemuksia, eivätkä sovellukset huomioi kotimaassa kasvatettavia kalalajeja. Laskurit ovat myös verrattain kalliita, jolloin kilpailukykyisten sovellusten kehittäminen voisi lisätä niiden käyttöä ja hyötyjä.
Tähän hankeraporttiin koottiin esiselvitys:
• Tämänhetkisistä seurantasovelluksista kalankasvatuksessa
• Kolmiulotteisen (3D) kuvamateriaalin soveltuvuudesta ja jatkokehitysmahdollisuuksista kasvatettavien kalojen seurannassa kotimaiset erityisolosuhdevaatimukset ja tekoälyn omat reunaehdot huomioiden.
Kuvauskokeiluissa ruokailevista kaloista (kirjolohi ja siika) saatiin liikedataa, josta pystyttiin toteamaan niiden aktiviteetin muutoksia. Datamäärät jäivät kuitenkin pieneksi varsinaista mallintamista ajatellen. Myös kuhakasvatusta kuvattiin, mutta samean veden ja kuhan passiivisen ruokailukäyttäytymisen takia niiden liikeaktiivisuutta ei havaittu. Kalojen pituudesta saatiin luotettavia metrisiä mittaustuloksia 3D-kameradatan avulla, joskaan näytemäärä ei ollut tässäkään tapauksessa suuri suoraan biomassan arviointiin. Tulosten perusteella 3D-kuvasta saatuja pituusmittoja voitaisiin käyttää kalojen kasvun tarkempaan arviointiin ilman invasiivisia (stressaavia) välimittauksia.
Hanke on toteutettu yritysyhteistyönä Luken koordinoimassa ja Euroopan meri-ja kalatalousrahaston rahoittamassa vesiviljelyn innovaatio-ohjelmassa vuonna 2018.201
Incomplete but Infectious Vaccinia Virions Are Produced in the Absence of Oncolysis in Feline SCCF1 Cells
Vaccinia virus is a large, enveloped virus of the poxvirus family. It has broad tropism and typically virus replication culminates in accumulation and lytic release of intracellular mature virus (IMV), the most abundant form of infectious virus, as well as release by budding of extracellular enveloped virus (EEV). Vaccinia viruses have been modified to replicate selectively in cancer cells and clinically tested as oncolytic agents. During preclinical screening of relevant cancer targets for a recombinant Western Reserve strain deleted for both copies of the thymidine kinase and vaccinia growth factor genes, we noticed that confluent monolayers of SCCF1 cat squamous carcinoma cells were not destroyed even after prolonged infection. Interestingly, although SCCF1 cells were not killed, they continuously secreted virus into the cell culture supernatant. To investigate this finding further, we performed detailed studies by electron microscopy. Both intracellular and secreted virions showed morphological abnormalities on ultrastructural inspection, suggesting compromised maturation and morphogenesis of vaccinia virus in SCCF1 cells. Our data suggest that SCCF1 cells produce a morphologically abnormal virus which is nevertheless infective, providing new information on the virus-host cell interactions and intracellular biology of vaccinia virus.Peer reviewe
Stroke is predicted by low visuospatial in relation to other intellectual abilities and coronary heart disease by low general intelligence
Background Low intellectual ability is associated with an increased risk of coronary heart disease and stroke. Most studies have used a general intelligence score. We studied whether three different subscores of intellectual ability predict these disorders. Methods We studied 2,786 men, born between 1934 and 1944 in Helsinki, Finland, who as conscripts at age 20 underwent an intellectual ability test comprising verbal, visuospatial (analogous to Raven's progressive matrices) and arithmetic reasoning subtests. We ascertained the later occurrence of coronary heart disease and stroke from validated national hospital discharge and death registers. Results 281 men (10.1%) had experienced a coronary heart disease event and 131 (4.7%) a stroke event. Coronary heart disease was predicted by low scores in all subtests, hazard ratios for each standard deviation (SD) lower score ranging from 1.21 to 1.30 (confidence intervals 1.08 to 1.46). Stroke was predicted by a low visuospatial reasoning score, the corresponding hazard ratio being 1.23 (95% confidence interval 1.04 to 1.46), adjusted for year and age at testing. Adjusted in addition for the two other scores, the hazard ratio was 1.40 (1.10 to 1.79). This hazard ratio was little affected by adjustment for socioeconomic status in childhood and adult life, whereas the same adjustments attenuated the associations between intellectual ability and coronary heart disease. The associations with stroke were also unchanged when adjusted for systolic blood pressure at 20 years and reimbursement for adult antihypertensive medication. Conclusions Stroke is predicted by low visuospatial reasoning scores in relation to scores in the two other subtests. This association may be mediated by common underlying causes such as impaired brain development, rather than by mechanisms associated with risk factors shared by stroke and coronary heart disease, such as socio-economic status, hypertension and atherosclerosisPeer reviewe
Suomi lasten kasvuympäristönä : Kahdeksantoista vuoden seuranta vuonna 1997 syntyneistä
Suomi lasten kasvuympäristönä -raportissa kuvataan Suomessa vuonna 1997 syntyneiden lasten elämänkulkua täysi-ikäisyyteen asti. Raportissa tarkastellaan lasten hyvinvointia usealla ulottuvuudella: koulumenestys, somaattinen ja psyykkinen terveys, kuntoutus, lastensuojelu ja rikollisuus. Lasten hyvinvointia peilataan suhteessa perheen tilanteisiin, kohortin vanhempien sosioekonomisten, terveydellisten ja perhesuhdetilanteiden kautta. Lasten hyvinvoinnin ulottuvuuksia tarkastellaan myös alueellisesti, lähialueen kautta, maakuntatasolla, sekä kaupunki–maaseutu-luokitteluin. Aineistona on käytetty Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen Kansallinen syntymäkohortti 1997 -tutkimusaineistoa, johon on kerätty useita eri rekisteritietoja kaikista Suomessa vuonna 1997 syntyneistä henkilöistä sikiöajalta täysi-ikäisyyteen. Raportti on jatkoa vuonna 1987 Suomessa syntyneiden seurantatutkimukselle. Raportissa vertaillaankin hyvinvoinnin ulottuvuuksia näiden kahden syntymäkohortin välillä. Tulosten mukaan suurin osa ikäluokan lapsista voi hyvin ja on saanut viettää lapsuutensa ilman perheen hyvinvointia uhkaavien tekijöiden kasautumista. Osalla lapsista on kuitenkin ollut hyvinvointia haastavia tekijöitä matkalla täysi-ikäisyyteen. Tutkimuksessa havaittiin merkittäviä sukupuolieroja eroja useiden hyvinvoinnin alueiden osalta. Psykiatrisen diagnoosin on saanut ikäluokasta noin viidesosa (20,7 %). Psyykenlääkkeiden ostokertoja tarkastellessa sukupuolittainen ero on huomattava tyttöjen (12,7 %) ja poikien (9,6 %) välillä. Rangaistusmääräyksiä on määrätty seuranta-aikana lähes joka viidennelle pojalle (19,5 %). Vastaavasti 5,2 prosenttia tytöistä on saanut rangaistusmääräyksen. Kodin ulkopuolelle sijoitettuna on ollut 5,7 prosenttia koko kohortista, aikaisempaan kohorttiin verrattuna kasvu on lähes kaksinkertainen. Noin 3 prosenttia kohorttilaisista ei ole saanut paikkaa 2. asteen koulutuksessa seurannan loppuun mennessä. Ilman paikkaa jääneistä hieman yli puolet eivät olleet hakeneet paikkaa. Vanhempien matala koulutusaste ja heikko taloudellinen tilanne on selkeästi yhteydessä lasten hyvinvointiin, ja esimerkiksi koulumenestys määrittyi vahvasti vanhempien taloudellisen tilanteen mukaan. Kodin ulkopuolelle sijoitettujen lasten hyvinvointia haastavia tekijöitä oli kasautunut muuhun ikäluokkaan verrattuna merkittävästi enemmän. Alueelliset erot ovat paikoitellen voimakkaita. Raportin johtopäätöksissä tuodaan esiin lapsiperheisiin suunnattujen sosiaalisten investointien merkitys sekä muiden kasvuympäristöjen rooli varhaisen hyvinvoinnin tukemisessa
Early life origins cognitive decline: findings in elderly men in the helsinki birth cohort study.
OBJECTIVES: To examine whether the adverse effects of slow prenatal and postnatal growth on cognitive function persist to old age and predict age related cognitive decline. DESIGN AND SETTING: A longitudinal birth cohort study of men born in Helsinki, Finland 1934-44. PARTICIPANTS: Nine-hundred-thirty-one men of the Helsinki Birth Cohort Study, with detailed data on growth from birth to adulthood, aged 20.1 (SD = 1.4) at the first and 67.9 (SD = 2.5) years at the second cognitive testing. MAIN OUTCOME MEASURES: The Finnish Defense Forces Basic Intellectual Ability Test assessed twice over nearly five decades apart. RESULTS: Lower weight, length and head circumference at birth were associated with lower cognitive ability at 67.9 years (1.04-1.55 points lower ability per each standard deviation [SD] unit decrease in body size, 95% Confidence Interval [95%CI]: 0.05 to 2.72) and with cognitive decline after 20.1 years (0.07-0.11 SD decline over time per each SD decrease in body size, 95%CI:0.00 to 0.19). Men who were born larger were more likely to perform better in the cognitive ability test over time (1.22-1.43 increase in odds to remain in the top relative to the lower two thirds in ability over time per each SD increase in body size, 95%CI:1.04 to 1.79) and were more resilient to cognitive decline after 20.1 years (0.69 to 0.76 decrease in odds to decline from than remain in the top third of ability over time per each SD increase in body size, 95%CI:0.49 to 0.99). Slower growth between birth and two years in weight, height and body mass index was associated with lower cognitive ability at 67.9 years, but not with cognitive decline. CONCLUSIONS: Poorer lifetime cognitive ability is predicted by slower growth before and after birth. In predicting resilience to age related cognitive decline, the period before birth seems to be more critical.Peer reviewe
- …