Études de biomarqueurs chez la mye commune (Mya arenaria) du fjord du Saguenay : bilan de recherches (1997 à 2006)

Cet écrit se veut une synthèse des principales trouvailles afférentes aux études de terrain conduites annuellement de 1997 à 2006 en zones intertidales du fjord du Saguenay, et de celles situées autour de sa confluence avec l’estuaire du Saint-Laurent, dans le but de mieux comprendre les stress anthropiques auxquels est soumise la mye commune (Mya arenaria), bivalve ubiquiste de ces habitats sédimentaires. À l’aide d’une batterie variée de biomarqueurs, lesquels ont fait l’objet de mesures chez l’animal entier, certains de ses tissus ou cellules, nous avons pu mettre en évidence divers effets écotoxiques qui sont vraisemblablement imputables aux sources (urbaines, industrielles, portuaires, diffuses ou atmosphériques) de contamination chimique impactant le Saguenay. Dépendant du site et de ses caractéristiques pollutionnelles, nous avons noté des dérèglements de santé chez la mye qui incluent des effets sur son système reproducteur (divers types de perturbation endocrine associés aux substances estrogéniques, aux métaux ou aux TBT), sur son système immunitaire (stimulation ou dépression d’immunocompétence jaugée par la capacité de phagocytose d’hémocytes), ainsi que des effets cumulatifs de polluants qui se traduisent par des réponses, à la hausse ou à la baisse, de biomarqueurs de défenses (e.g., métallothionéines, CYP1A1, glutathione S-transférases), de dommages (e.g., augmentation de brins d’ADN, augmentation de l’activité de cyclo-oxygénase témoignant d’inflammation, peroxydation des lipides) et morphologiques (e.g., inhibition de croissance, baisse d’indice gonado-somatique). Nous démontrons aussi une plus grande dépense en énergie au niveau mitochondrial (transport d’électrons mitochondrial dans la gonade ou glande digestive) chez les myes de zones impactées, laquelle semble pouvoir être exacerbée en conditions de stress thermiques que laissent présager les changements climatiques à venir. Au final, ce bilan d’études de biomarqueurs confirme l’utilité du modèle bivalve Mya arenaria comme bio-indicateur de la qualité hydrique du Saguenay et il renseigne sur les divers affronts que subissent ces invertébrés dans ce milieu toujours aux prises avec des sources de contamination variées. D’autres études envisagées affineront nos connaissances au sujet des risques cumulatifs liés à la contamination chimique du fjord.This paper presents the major findings of annual field outings conducted from 1997 to 2006 in Saguenay Fjord intertidal areas as well as those located in proximity with the St. Lawrence River estuary. Study objectives sought to enhance our understanding of pollution pressures incurred on the soft shell clam, Mya arenaria, endemic to mud flats of these regions. By measuring the responses of a battery of biomarkers in whole animals, organs or cells, we demonstrated various adverse effects that are likely linked to chemical contamination sources (municipal, industrial, portuary, non point and atmospheric) intrinsic to the Saguenay area. Based on site and pollution features proper to each, health problems were observed in clams that included effects on their reproductive system (endocrine disruption events linked to estrogenic substances, metals or TBT), on their immune system (increase or decrease of immunocompetence assessed by phagocytic performance of hemocytes), as well as cumulative effects of pollutants, shown either by upward or downward responses of defense biomarkers ((e.g., metallothioneins, CYP1A1, glutathion S‑transferase), damage biomarkers (e.g., increase in DNA strand breaks, increase in inflammatory cyclo-oxygenase activity, lipid peroxidation) and metrics biomarkers (e.g., growth inhibition, lower gonado-somatic index). In pollution-impacted sites, clams further displayed a greater expenditure of mitochondrial energy (measured by mitochondrial electron transport in gonad or digestive gland), an energy loss that could possibly be augmented under thermic stress conditions linked to climate change. This long-term biomarker work establishes Mya arenaria as a useful bioindicator species to appraise Saguenay Fjord water quality as reflected by the diverse chemical insults to which these invertebrates are exposed in an ecosystem still struggling with multiple contamination inputs. Future studies should contribute to strengthen our knowledge related to cumulative risk issues linked to the fjord’s chemical pollution

Qu’en est-il de l’état de santé des myes au Saguenay ? Un bilan d’études sur plus d’une décennie

Le fjord du Saguenay, reconnu pour sa faune diversifiée mais aussi pour la contamination reliée aux activités industrielles et anthropiques, a fait l’objet d’un vaste programme de suivi environnemental, entrepris par notre équipe et qui visait à répondre à la question fondamentale : L’état de santé des myes s’est-il modifié dans le fjord du Saguenay ? Dans cet article de synthèse, nous avons regroupé des résultats déjà publiés sur la condition physiologique de Mya arenaria ainsi que des résultats originaux pour extraire des tendances, de façon à répertorier les sites qui s’avèrent critiques pour le bien-être physiologique de la mye. Mya arenaria (LINNÉ, 1758) ou mye des sables, choisie comme espèce sentinelle, a été échantillonnée de 1994 à 2007, en période de maturité sexuelle, dans des sites situés à l’intérieur du fjord et à son embouchure. Les objectifs de cet article sont de comparer les résultats de différents indices de condition et de suivis hormonaux et de la gamétogenèse de chaque site et en fonction des sexes, pour identifier les sites moins favorables pour la croissance et la reproduction de la mye. Nous avons démontré que les myes de Baie‑Sainte-Catherine subissent des retards de gamétogenèse tandis que les niveaux d’hormones stéroïdiennes sont très bas à Tadoussac. Ces deux sites sont soumis à des influences portuaires et à la circulation navale. Le site de Baie‑Éternité, plus en amont, se caractérise par des influences portuaires (huiles et peintures antisalissures) et une forte contamination métallique de sources urbaines et terrigènes. Anse‑aux‑Érables est un site près des influences industrielles, tandis que Anse‑Saint‑Jean est fortement influencée par les effluents municipaux et domestiques. D’amont en aval sur la rivière Saguenay, les myes des sites Anse‑à‑la‑Croix, Anse‑aux‑Érables, Petit‑Saguenay, Anse‑à‑la‑Barque, Tadoussac et Pointe‑aux‑Alouettes ont montré une croissance moindre. Les sites de Baie‑Éternité, Anse‑aux‑Érables, Anse‑Saint‑Jean et Baie-Sainte-Catherine ont un indice de maturité sexuelle moindre qu’aux autres sites, les données regroupées démontrant que ce sont les sites les plus influencés dans le fjord du Saguenay, résultats corroborés par les résultats de phagocytose. Toutes ces données démontrent que l’état physiologique de la mye répond à différents facteurs, anthropiques, biotiques et abiotiques, et que les sources ponctuelles de contamination viennent renforcer les effets négatifs de paramètres abiotiques telles la température et les conditions trophiques.The Saguenay fjord has been submitted for many years to anthropogenic influences. We surveyed this ecosystem between 1994 and 2007 to assess if Mya arenaria health status was altered by the contamination present in this ecosystem. The physiological condition of clams was determined using grouped annual data from sites at the mouth and in the Saguenay fjord. The results were analyzed according to sex and sites for all the samplings done during the active gametogenesis. The aims of this paper are to compare results of condition signs, gametogenesis stages and hormonal levels between sites and according to sex, to finally identify which sites were less favorable for the growth and reproduction of clams. We have shown that clams from Baie-Sainte-Catherine had delayed gametogenesis while those from Tadoussac showed very low steroid hormonal levels. Portuary and naval circulation influences could explain these particular results that also correspond to those from phagocytosis. Upstream in Baie‑Éternité, portuary influences (oils, anti-fouling paints) and metallic inputs from urban and terrigenous sources were reported. In Anse-aux-Érables, metallic contamination comes from industrial sources, while Anse-Saint‑Jean is influenced by sewage discharges from domestic and urban origin. From upstream to downstream, clams from Anse‑à‑la‑Croix, Anse‑aux‑Érables, Petit‑Saguenay, Anse‑à‑la‑Barque, Tadoussac and Pointe‑aux‑Alouettes showed decreased growth. Baie‑Éternité, Anse‑aux‑Érables, Anse‑Saint‑Jean and Baie-Sainte-Catherine sites, with their lower sexual maturity index and decreased phagocytosis, were shown to be the more influenced by contamination. All these data show that physiological condition of Mya arenaria reflects the combined effects of abiotic factors such as contamination, trophic conditions and site characteristics

A 2 Million Commercial Song Interactive Navigator

International audienceIn this paper, we present a web-based interactive tool for exploring a collection of two million commercially released songs. It gathers song information from a large number of heterogeneous sources, web-based and audio-based, and integrates work from multiple research groups. The resulting tool can be used to request information about a specific song such as lyrics, metadata and chords; to navigate further on to linked external resources such as Discogs, AllMusic, Mu-sicBrainz or a number of streaming providers; or to browse the collection by artist's discographies or band membership. Several Web Audio applications are integrated and use the dataset to enrich the experience

Paradoxical cerebral emboli of hypernephroma metastatic to the right ventricle five years after primary tumor resection

AbstractJ Thorac Cardiovasc Surg 2002;123:572-

Discontinuités longitudinales des dynamiques sédimentaires holocènes dans les petites vallées de l'Ouest du Bassin Parisien, l'exemple de la Mue (Basse Normandie)

Les recherches géomorphologiques et paléoenvironnementales entreprises dans la vallée de la Mue contribuent à la connaissance de l'évolution des dynamiques de fonds de vallée dans la Plaine de Caen et plus généralement de la partie sédimentaire de la Basse-Normandie restées à l'écart des études récentes sur l'Holocène. Elles soulignent l’ampleur, l’hétérogénéité et l'originalité des remplissages sédimentaires postglaciaires. L'inventaire systématique du remplissage de cette vallée de 24 km de long s’est appuyé sur la réalisation de sondages ainsi que sur des carottages dans les secteurs clefs. La sédimentation tardiglaciaire apparaît absente comme dans de nombreuses vallées normandes mais la sédimentation holocène est particulièrement dilatée atteignant 4 à 15 m. Elle obéit à un dispositif longitudinal marqué par la succession de plusieurs tronçons aux caractéristiques morphologiques et sédimentaires différentes. La succession de formations tufacées, tourbeuses, détritiques ou mixtes révèle la complexité du fonctionnement du système fluvial en même temps qu'elle offre un potentiel intéressant pour les analyses multiparamètres. Les analyses sédimentologiques, malacologiques et palynologiques appuyées sur la réalisation de 21 datations radiocarbones permettent de reconstituer la chronostratigraphie des 9 derniers millénaires et d'apprécier le rôle des facteurs paléohydrologiques et anthropiques dans la mutation des milieux sédimentaires. La sédimentation qui s’amorce au début de l'Holocène (9000 14C BP) se caractérise par la mise en place de formations tufacées parfois très dilatées (de 7 à 13 m) qui sont à l’origine de la construction de véritables seuils dans le fond de vallée. Ce n’est qu’au cours de l’Atlantique et du début du Subboréal (6500-4500 14C BP) que le remplissage sédimentaire, principalement tourbeux se généralise, en particulier en arrière des seuils à sédimentation carbonatée. Le diachronisme de ces séquences sédimentaires souligne le poids des conditions locales. A partir de l’âge du Bronze (3500 14C BP), les formations détritiques résultant de l'érosion des tufs et des sols limoneux des plateaux se développent puis prennent de l’ampleur au cours de l’Âge du Fer et de l’époque gallo-romaine attestant l’emprise croissante des hommes sur les milieux. Cet article souligne l'intérêt d'étendre les recherches dans les trois dimensions des systèmes fluviaux afin de prendre en compte les discontinuités spatio-temporelles des systèmes hydro-sédimentaires holocènes, même dans des vallées de faible ordre.Geomorphologic and palaeoenvironmental researches conducted in the Mue valley allow improving the valley bottom sedimentation knowledge in the Plain of Caen and more generally in the sedimentary area of Lower Normandy, both poorly known areas of the Paris basin. They underline the extent, the heterogeneity and the originality of the Postglacial infilling. The systematic geomorphologic survey in this valley bottom, 24 km long, is based on boreholes and core drillings in the key areas. The Lateglacial filling is missing like in most of the valleys of Normandy while the Holocene sedimentation is 4 to 15 m thick. Its longitudinal arrangement is characterized by sections with different morphologic and sedimentary features. The succession of tufaceous, peaty, detritic or mixed deposits illustrates the fluvial system complexity and offers opportunity for multi-proxy analyses. To establish the Holocene chronostratigraphy and to determine the role of the palaeohydrologic and anthropogenic control in the sedimentary changes, sedimentologic, malacologic, pollen analyses and radiocarbon dating (21) have been undertaken. The filling begins around 9000 14C BP with tufaceous deposits. Locally, they are very thick (7 to 13 m) and form barriers in the valley bottom. From the Atlantic and Sub-Boreal periods (6500-4500 14C BP) peat deposits become widespread, in particular behind the tufa barriers. Nevertheless, the onset of the alluvial aggradation is diachronic along the valley bottom and the alluvial sedimentation has a high variability in relation with the valley morphology and the local geological controls. Since the Bronze Age (3500 14C BP) and mainly during the Iron Age and Gallo-Roman period, the spread of detritic alluvial sedimentation derived from the erosion of tufaceous deposits and loamy soils testifies the increase of land use changes within the river basin. However the spatial variability of landscapes and sedimentation is also strongly controlled by local human activities. The research underlines the necessity of longitudinal studies to take into account the spatial and time discontinuities of the Holocene hydro-sedimentary systems even in small order valleys in sedimentary basin

WASABI: a Two Million Song Database Project with Audio and Cultural Metadata plus WebAudio enhanced Client Applications

This paper presents the WASABI project, started in 2017, which aims at (1) the construction of a 2 million song knowledge base that combines metadata collected from music databases on the Web, metadata resulting from the analysis of song lyrics, and metadata resulting from the audio analysis, and (2) the development of semantic applications with high added value to exploit this semantic database. A preliminary version of the WASABI database is already online1 and will be enriched all along the project. The main originality of this project is the collaboration between the algorithms that will extract semantic metadata from the web and from song lyrics with the algorithms that will work on the audio. The following WebAudio enhanced applications will be associated with each song in the database: an online mixing table, guitar amp simulations with a virtual pedal-board, audio analysis visualization tools, annotation tools, a similarity search tool that works by uploading audio extracts or playing some melody using a MIDI device are planned as companions for the WASABI database

Same habitat types but different use: evidence of context-dependent habitat selection in roe deer across populations

International audienceWith the surge of GPS-technology, many studies uncovered space use of mobile animals and shed light on the underlying behavioral mechanisms of habitat selection. Habitat selection and variation in either occurrence or strength of functional responses (i.e. how selection changes with availability) have given new insight into such mechanisms within populations in different ecosystems. However, linking variation in habitat selection to site-specific conditions in different populations facing contrasting environmental conditions but the same habitat type has not yet been investigated. We aimed to fill this knowledge gap by comparing within-home range habitat selection across 61 female roe deer (Capreolus capreolus) during the most critical life history stage in three study areas showing the same habitat types but with different environmental conditions. Female roe deer markedly differed in habitat selection within their home range, both within and among populations. Females facing poor environmental conditions clearly displayed a functional response, whereas females facing rich environmental conditions did not show any functional response. These results demonstrate how the use of a given habitat relative to its availability strongly varies in response to environmental conditions. Our findings highlight that the same habitat composition can lead to very different habitat selection processes across contrasted environments

Short-term telomere dynamics is associated with glucocorticoid levels in wild populations of roe deer

International audienceWhile evidence that telomere length is associated with health and mortality in humans and birds is accumulating, a large body of research is currently seeking to identify factors that modulate telomere dynamics. We tested the hypothesis that high levels of glucocorticoids in individuals under environmental stress should accelerate telomere shortening in two wild populations of roe deer (Capreolus capreolus) living in different ecological contexts. From two consecutive annual sampling sessions, we found that individuals with faster rates of telomere shortening had higher concentrations of fecal glucocorticoid metabolites, suggesting a functional link between glucocorticoid levels and telomere attrition rate. This relationship was consistent for both sexes and populations. This finding paves the way for further studies of the fitness consequences of exposure to environmental stressors in wild vertebrates

Diversité des agricultures – le cas des filières céréales, oléagineux et légumineuses à graines

L’objectif de cet article est de décrire, sans être exhaustif, la diversité des agricultures en mobilisant des exemples au niveau du système technique et des pratiques culturales, pour la France métropolitaine et pour trois filières : les céréales, les oléagineux et les légumineuses à graines. L’analyse de la diversité des agricultures montre que des voies de diversification des systèmes techniques et des pratiques culturales existent, mais que celles-ci sont fortement dépendantes de la diversité des voies de valorisation dans les filières. Au sein de ces dispositifs de valorisation, hormis quelques dispositifs spécifiques, les recommandations sur les pratiques sont suffisamment vastes pour permettre une diversité de systèmes de culture et de production, dès lors que les critères technologiques d’accès à la filière sont atteints. Il convient alors de s’interroger sur le poids de ces critères technologiques sur les choix techniques des agriculteurs. Il apparait également nécessaire de questionner la valeur donnée à la diversité par les différents acteurs des filières, de l’agriculteur au consommateur, en évaluant notamment la performance économique des systèmes agricoles les plus diversifiés ainsi que les leviers pour augmenter les performances d’une agriculture diversifiée. Il s’agit d’élargir le socle de connaissances sur lequel les acteurs pourront concevoir eux-mêmes de nouvelles formes de diversité et d’ouvrir le débat avec les acteurs des filières sur la préservation des formes de diversité des agricultures comme potentiel de résilience