Phylogeographic analysis of introns and mitochondrial DNA in the clam Ruditapes decussatus uncovers the effects of Pleistocene glaciations and endogenous barriers to gene flow

Studies on the phylogeography of species inhabiting the Mediterranean and the nearby coasts of the NE Atlantic Ocean (MEDAT) have found subdivision and/or phylogeographic structure in one or more of the Atlantic, western Mediterranean and eastern Mediterranean basins. This structure has been explained as the result of past population fragmentation caused by Pleistocene sea level changes and current patterns of marine circulation. However, the increasing use of nuclear markers has revealed that these two factors alone are not enough to explain the phylogeographic patterns, and an additional role has been suggested for endogenous barriers to gene flow or natural selection. In this article we examined the role of these factors in Ruditapes decussatus, a commercial clam species native to MEDAT. A genetic analysis of 11 populations was carried out by examining 6 introns with a PCR-RFLP technique. We found subdivision in three regions: Atlantic (ATL), western Mediterranean plus Tunisia (WMED), and Aegean and Adriatic seas (AEGAD). Two introns (Ech and Tbp) showed alleles that were restricted to AEGAD. Sequencing a subsample of individuals for these introns indicated that AEGAD-specific alleles were separate clades, thus revealing a phylogeographic brake at the WMED-AEGAD boundary. Sequencing of the mitochondrial COI locus confirmed this phylogeographic break. Dating of the AEGAD mitochondrial haplotypes and nuclear alleles with a Bayesian MCMC method revealed that they shared common ancestors in the Pleistocene. These results can be explained in the framework of Pleistocene sea level drops and patterns of gene flow in MEDAT. An additional observation was a lack of differentiation at COI between the ATL and WMED, in sharp contrast with 4 introns that showed clear genetic subdivision. Neutrality tests did not support the hypothesis of a selective sweep acting on mtDNA to explain the contrasting levels of differentiation between mitochondrial and nuclear markers across the ATL-WMED transition, and we argue that the difference between markers is best explained by the existence of an endogenous genetic barrier, rather than by a physical barrier to larval migration alone.This work has been funded by grants AGL2003-04143 from MCYT (Spain) and AGL2006-08944 from MEC (Spain) to J.B. Peña, and AGL2007-60049 and AGL2010-16743 from MICINN (Spain) to C. Saavedra. Partial funding was obtained from the Marine Genomics Europe Network of Excellence (GOCE 505403).Peer Reviewe

Evaluación de la calidad de aplicación de plaguicidas en un cultivo de espinaca

Se realizaron dos ensayo de campo para evaluar el comportamiento de 3 boquillas de cono hueco (TeeJet TX800050VK, TeeJet TXA8004VK y TX-Royal Condor) y una boquilla de abanico plano (TeeJet XR8004VS), con dos técnicas de aplicación en un cultivo de espinaca (Spinacea oleracea l.) establecido en la sabana de Bogotá. En ambos ensayo se realizaron evaluaciones mediante análisis de imagen para determinar la calidad de las aplicaciones considerando como parámetros los tamaños representativos, la amplitud relativa (SPAN), el coeficiente q de la función de Rosin Rammler, la densidad de manchas o gotas por unidad de superficie y el porcentaje de recubrimiento. Para evaluar la calidad de la aplicación de los plaguicidas se utilizaron colectores de papel hidrosensible y el trazador fluorescente Tinopal CBS-X, se uso para evaluar los depósitos secos de mezcla (agua + plaguicida + trazador) sobre las hojas. Entre tanto, para el segundo ensayo la cantidad de trazador depositas sobre las hojas fue determinada mediante espectrofotometría de absorción. Los resultados de esta investigación mostraron que la técnica de aplicación de dos pases con la boquilla TX-Royal Condor, de baja descarga y de gota fina presenta las mejores características para la aplicación de fungicidas e insecticidas de acción de sistémica y de contacto, con una pulverizadora de espalda de accionamiento manual. Además se observó que el método de los colectores de papel hidrosensible es adecuado para evaluara la calidad de aplicación con tasa de aplicación menores a 500 L/ha. Entre tanto, se observo la existencia de una correlación lineal entre el porcentaje de recubrimiento medido en las hojas y el porcentaje de recubrimiento medido en los colectores.Abstract. We realised 2 field tests to evaluate the behaviour of 3 hollow cone nozzles (TeeJet TX800050VK, TeeJet TXA8004VK and TX-Royal Condor) and 1 flat fan nozzle (TeeJet XR8004VS), with 2 application techniques in a spinach crop (Spinacea oleracea l) in Bogota’s savannah. Both tests were evaluated with image analysis to determinate the quality of the application considering parameters like representative sizes, relative width (SPAN), the Rosin Rammler coefficient, the density by spots or drops per unit area and covering percentage. To evaluate the quality of the application of pesticides were used water sensitive paper and the fluorescent tracer Tinopal CBS-X, to evaluate dry mixed deposits (Water+pesticede+tracer) over the leaves. In the meanwhile, for the second test the tracer quantity over the leaves was determined absorption spectrophotometry. The results of this investigation showed that the 2 steps application with the nozzle TX-Royal Condor, of low discharge and fine drops shows the bests characteristics for fungicides and insecticides application of the type systemic and contact action, with manually operated backpack sprayer. Also was observed that the water sensitive paper collector method is suitable to evaluate the application quality with an application rate under 500 L/ha. Meanwhile, it was observed that there was a lineal relation between the measured coating on leaves and the coating percentage measured in the collectors.Maestrí

AUKUS: Un Nuevo Capítulo en la Geopolítica de Asia Pacífico

En tiempos recientes se ha hecho conocer a la comunidad internacional la intención de Australia, EE. UU y Reino Unido de establecer una alianza de transferencia tecnológica de capacidades submarinas nucleares. Este acuerdo, enmarcado desde las dinámicas geopolíticas de la región, han generado enormes reacciones en Europa y Asia, especialmente por la República Popular de China, primera amenazada ante las intenciones de esta nueva alianza de restringir sus capacidades de movilización militar en el océano Pacífico. Con esto, se inicia un nuevo proceso geoestratégico en Asia Pacífico que debe observarse de manera cuidadosa

De un mundo bipolar a uno multipolar. La importancia de la prórroga del Tratado START III para el futuro nuclear del mundo

En un nuevo giro de la política internacional el Presidente Donald Trump cambió la estrategia de los Estados Unidos de América (EE. UU) a una posición contraria a lo que se había estado implementando en materia de política exterior en el gobierno inmediatamente anterior. Su accionar implicó, que los Estados Unidos se apartara del apego al multilateralismo característico de este país en los últimos años, desencadenando una serie de movimientos estratégicos en contra de acuerdos y tratados que afectaban la capacidad de maniobra del país a nivel internaciona

La Guerra del Alto Karabaj: ¿Un retrato de los nuevos campos de batalla?

Desde el comienzo de la estructuración del poder aéreo, las aeronaves han realizado misiones que han abierto las dimensiones del campo de batalla, otorgando ventajas que anteriormente eran inimaginables para el creador de la estrategia militar, no obstante, el factor de riesgo humano siempre se ha mantenido presente en la imagen del piloto de combate altamente entrenado y terriblemente costoso de perder en acciones poco relevantes; de tal manera, en los últimos años se ha buscado en la tecnología que los UAV realicen este tipo de misiones, reduciendo el costo humano y económico de la guerra. Aquello ha generado que, en conflictos regionales como el del Alto Karabaj del 2020 entre la República Democrática de Armenia y la República de Azerbaiyán, la utilización de estos equipos sea masivo y vaticinen, quizás, el campo de batalla del futuro, en donde el ser humano se vea a la merced de una máquina dirigida a miles de kilómetros de distancia. En conclusión, por tanto, se expone que el UAV es un arma moderna que ya no dejará el campo de batalla y que, por tanto, debe ser tomada en cuenta por todos los ejércitos del mundo, incluido Colombi

Single-layer economic model predictive control for periodic operation

In this paper we consider periodic optimal operation of constrained periodic linear systems. We propose an economic model predictive controller based on a single layer that unites dynamic real time optimization and control. The proposed controller guarantees closed-loop convergence to the optimal periodic trajectory that minimizes the average operation cost for a given economic criterion. A priori calculation of the optimal trajectory is not required and if the economic cost function is changed, recursive feasibility and convergence to the new periodic optimal trajectory is guaranteed. The results are demonstrated with two simulation examples, a four tank system, and a simplified model of a section of Barcelona's water distribution network.Peer ReviewedPostprint (author’s final draft

Bagazo de sorgo dulce: una alternativa para la producción de etanol de segunda generación en Colombia (Parte I)

Each lignocellulosic material is a new terrain to be explored, therefore, the physical chemical characterization of these materials is a fundamental step for the biotransformation process. The lignocellulosic composition of sweet sorghum bagasse was determined, values close to values reported in the literature were found. Pretreatment technologies were explored with steam, mild acid hydrolysis, alkaline delignification, NH3 soaking, AFEX, ozonolysis and alkaline peroxide; Being that the alkaline delignification with NaOH is the best option to pre-treat this substrate. The lignin content was decreased by 52% and ethanol productivity of 0.87 g / Lh was obtained, which equates to a yield of 114 L of ethanol / Ton bagasse of pre-treated dry sweet sorghum.Cada material lignocelulósico es un nuevo terreno por explorar, por tanto, la caracterización físico-química de estos materiales es un paso fundamental para el proceso de biotransformación. Se determinó la composición lignocelulósica del bagazo de sorgo dulce, encontrándose valores cercanos a los valores reportados en la literatura. Se estudiaron las tecnologías de pretratamiento, explosión con vapor, hidrólisis ácida suave, deslignificación alcalina, remojo con NH3, pretratamiento con amoniaco AFEX, ozonólisis y peróxido alcalino; encontrándose que la deslignificación alcalina con NaOH es la mejor opción para pretratar este sustrato. Se disminuyó el contenido de lignina en un 52% y se obtuvo una productividad a etanol de 0,87 g/L h, lo cual equivale a un rendimiento de 114 L de etanol/Ton bagazo de sorgo dulce seco pretratado

Early warning system for coffee rust disease based on error correcting output codes: a proposal

Colombian coffee producers have had to face the severe consequences of the coffee rust disease since it was first reported in the country in 1983. Recently, machine learning researchers have tried to predict infection through classifiers such as decision trees, regression Support Vector Ma­chines (SVM), non-deterministic classifiers and Bayesian Networks, but it has been theoretically and empirically demonstrated that combining multiple classifiers can substantially improve the classification perfor­mance of the constituent members. An Early Warning System (EWS) for coffee rust disease was therefore proposed based on Error Correcting Output Codes (ECOC) and SVM to compute the binary functions of Plant Density, Shadow Level, Soil Acidity, Last Nighttime Rainfall Intensity and Last Days Relative Humidity.Los productores de café colombianos han sufrido severas consecuencias por la Roya desde que fue reportada por primera vez en el país en el año 1983. Recientemente, investigadores de aprendizaje automático han intentado predecir la roya a través de clasificadores como: arboles de de­cisión, máquinas de vector de soporte, clasificadores no determinísticos y redes bayesianas, pero se ha demostrado teórica y empíricamente que la combinación de múltiples clasificadores puede mejorar sustancialmente el rendimiento en la clasificación. En este sentido es propuesto un sistema de alerta temprana para la roya en el café, basado en códigos de salida de corrección de error y máquinas de vector de soporte para calcular las funciones binarias de la densidad de planta, el nivel de sombra, la acidez del suelo, la intensidad de lluvia en la última noche, y en últimos días, con humedad relativa

Current Production Scenario and Functional Potential of the Whole Amaranth Plant: A Review

Amaranth grain is a pseudocereal that has been widely studied, standing out as a gluten-free seed and plant-based protein source. Amaranth seeds have been associated with functional properties and attractive medical benefits. Besides the seeds themselves, various other parts of the plant possess significant nutritional and functional value. Thus, on one hand, this chapter summarizes an overview of amaranth seeds, leaves, and flowers. Apart from this, recent research and studies have reported on amaranth’s composition, its uses, and potential benefits for human health. This chapter also offers insight into the global socioeconomic scenario of farmers and producers. Possible strategies that include biotechnology, ingredient innovation, and ethical biotrade have been proposed here. These three fronts, acting synergistically, would exploit the considerable diversity of these species and promote programs to improve the value chain and, therefore, the life quality of their communities