545 research outputs found
Genetic analysis for early diagnosis of otorhinolaryngeal diseases
Familiarity with the concepts and methods of human genetics is important in order to be able to perform genetic analysis
Molekulare Charakterisierung des Gens des Sporenwandproteins von Encephalitozoon hellem durch inverse und verankerte Polymerasekettenreaktion
Der labordiagnostische Nachweis von Mikrosporidieninfektionen bereitet noch immer Probleme. Aufgrund ihrer geringen Größe und ihrer unspezifischen Färbeeigenschaften ist der lichtmikroskopische Direktnachweis schwierig. Der elektronenmikroskopische Nachweis ist aufwendig und insbesondere aus Stuhl wenig sensitiv. Nicht alle Mikrosporidien können in Zellkulturen vermehrt werden. Die beim Menschen häufigste Spezies, Enterocytozoon bieneusi, ist nicht kultivierbar. Molekularbiologische Nachweisverfahren wie die PCR sind ebenfalls aufwendig, noch nicht standardisiert und derzeit noch Speziallaboratorien vorbehalten. Zuverlässige immundiagnostische Tests mit ausreichender Sensitivität und Spezifität fehlen insbesondere für E. bieneusi, da aufgrund der fehlenden Kultivierbarkeit die für eine Testentwicklung nötige Menge und Reinheit des Antigens kaum zu erzielen ist. Gene, durch deren rekombinante Expression dieses Problem gelöst werden könnte, sind bisher noch nicht bekannt. Dabei wäre zum Beispiel die Entwicklung eines Koproantigen-ELISA zum Nachweis von E. bieneusi aus Stuhl von großem praktischem Nutzen. Ziel der hier vorgelegten Arbeit war es, die Voraussetzungen hierfür zu verbessern.
Als aussichtsreichstes Antigen wurde das so genannte „Sporenwandprotein“ (SWP) gewählt, der Hauptbestandteil der Sporenwand von Mikrosporidien. In eigenen Vorarbeiten konnte gezeigt werden, dass es allerdings wenig aussichtsreich ist, alleine anhand der bis dahin ausschließlich für Encephalitozoon cuniculi und E. intestinalis bekannten SWP-Gensequenzen PCR-Primer zur Amplifikation des homologen Gens aus E. bieneusi zu konstruieren. Deshalb wurde in der vorliegenden Arbeit zunächst der bis dahin unbekannte, vollständige kodierende Bereich des SWP-Gens einer weiteren Encephalitozoon-Spezies, E. hellem, einschließlich benachbarter Genabschnitte auf Nukleinsäureebene charakterisiert. Durch die Vergleichsmöglichkeit mit dem SWP-Gen einer dritten Mikrosporidienart wurden die Voraussetzungen zur Konstruktion „universeller“ Primer, die homologe Abschnitte des wahrscheinlich auch in E. bieneusi vorhandenen SWP-Gens amplifizieren können, verbessert.
Ein weiteres Ziel, das in dieser Arbeit erreicht wurde, war bei dieser Charakterisierung ganz auf das Anlegen von Banken zu verzichten. Im Hinblick auf die fehlende Kultivierbarkeit von E. bieneusi und die damit verbundene Schwierigkeit, das Ausgangsmaterial für genomische oder cDNA-Banken (genomische DNA bzw. mRNA) in ausreichender Menge und Reinheit zu gewinnen, sollte nämlich bewiesen werden, dass es möglich ist, das SWP-Gen einer Mikrosporidienart alleine durch die Anwendung von PCR-Techniken bestimmen zu können.
Als Ausgangspunkt für die Charakterisierung des SWP-Gens aus E. hellem war die Amplifizierung eines ersten Genfragments. Dies konnte durch die Konstruktion so genannter „degenerierter“ Primer (Primermischungen) erreicht werden. Nach Kenntnis dieser ersten E. hellem-spezifischen DNA-Sequenz konnten anschließend Primer konstruiert werden, die vollständig zum SWP-Gen von E. hellem passten. In einer „klassischen“ PCR können jedoch nur DNA-Abschnitte zwischen bekannten Bereichen amplifiziert werden, da diese zur Konstruktion der beiden PCR-Primer bekannt sein müssen. Um dennoch die DNA-Sequenz aus dem ersten Genfragment nach beiden Seiten („upstream“ und „downstream“) verlängern zu können, wurden „inverse“ und „verankerte“ PCR-Reaktion als Spezialtechniken eingesetzt und durch Kombination mit bekannten Techniken („geschachtelte“, „halb-geschachtelte“ und „Touch Down“-PCR) optimiert.
Schließlich wurden in der vorliegenden Arbeit aus der Primärstruktur (Nukleotidabfolge) ableitbare Eigenschaften des SWP-Gens von E. hellem diskutiert. Durch Sequenzvergleich mit den bereits bekannten SWP-Genen aus E. cuniculi und E. intestinalis wurden zwei konservierte Loci identifiziert, die zur Konstruktion „universeller“ SWP-Primer vorgeschlagen werden.
In der vorliegenden Arbeit wurde somit (a) das bis dahin unbekannte Gen des Sporenwandproteins aus E. hellem erstmals auf Nukleotidebene charakterisiert, (b) bewiesen, dass die Charakterisierung eines unbekannten SWP-Gens durch ausschließliche Anwendung von PCR-Spezialtechniken und ohne die Herstellung von genomischen oder cDNA-Banken möglich ist und (c) Methoden der „inversen“ und der „verankerten“ PCR in der Arbeitsgruppe etabliert und optimiert
Pharmacological Modulation of Mucosa-Related Impairment of β-Adrenoceptor-Mediated Relaxation in Human Detrusor
Objectives: The mucosa of human detrusor strips impairs catecholamine-induced relaxation. In order to elucidate which signal transduction pathways are involved in this cross talk between the mucosa and detrusor, we have studied the effects of several pharmacological agonists and antagonists on noradrenaline-mediated relaxation in intact and mucosa-denuded detrusor strips. Patients and Methods: Strips of detrusor tissue were obtained from patients who had undergone cystectomy for bladder cancer and were set up for force measurement. KCl- or carbachol-precontracted strips were relaxed with increasing concentrations of noradrenaline in the absence and in the presence of nitric oxide synthase inhibitor, L-NAME; P2X-receptor antagonist, PPADS; ET A -receptor antagonist, BQ-123; ET B -receptor antagonist, BQ-788; cyclooxygenase inhibitor, diclofenac; AT 1 -receptor antagonist, candesartan; and NK 1 -receptor antagonist, L-703,606. Results: In intact strips, KCl-stimulated force was enhanced by all blockers; carbachol-stimulated force increased with L-703,606. In denuded strips, only L-NAME augmented the KCl-stimulated contraction. Noradrenaline relaxed the precontracted detrusor strips to a significantly larger extent and at lower concentrations in denuded than in intact strips. L-NAME, PPADS and BQ-123/BQ-788 had little effect on noradrenaline-induced relaxation, whereas diclofenac, candesartan and L-703,606 sensitized intact carbachol-stimulated detrusor strips to noradrenaline-induced relaxation. Conclusion: Inhibition of the noradrenaline-induced relaxation of precontracted human detrusor strips by the mucosa is attenuated by diclofenac, candesartan and L-703,606 suggesting the involvement of prostanoids, angiotensin and neurokinin pathways. Further experiments are required to unravel the exact mechanisms
Is the Post-Radical Prostatectomy Gleason Score a Valid Predictor of Mortality after Neoadjuvant Hormonal Treatment?
Purpose: To evaluate the validity of the Gleason score after neoadjuvant hormonal treatment as predictor of diseasespecific mortality after radical prostatectomy. Patients and Methods: A total of 2,880 patients with a complete data set and a mean follow-up of 10.3 years were studied; 425 of them (15%) had a history of hormonal treatment prior to surgery. The cumulative incidence of deaths from prostate cancer was determined by univariate and multivariate competing risk analysis. Cox proportional hazard models for competing risks were used to study combined effects of the variables on prostate cancer-specific mortality. Results: A higher portion of specimens with a history of neoadjuvant hormonal treatment were assigned Gleason scores of 8–10 (28 vs. 17%, p < 0.0001). The mortality curves in the Gleason score strata <8 vs. 8–10 were at large congruent in patients with and without neoadjuvant hormonal treatment. In patients with neoadjuvant hormonal treatment, a Gleason score of 8–10 was an independent predictor of prostate cancer-specific mortality; the hazard ratio was, however, somewhat lower than in patients without neoadjuvant hormonal treatment. Conclusion: This study suggests that the prognostic value of the post-radical prostatectomy Gleason score is not meaningfully jeopardized by heterogeneous neoadjuvant hormonal treatment in a routine clinical setting
Frequency of Microsatellite Instability in Unselected Sebaceous Gland Neoplasias and Hyperplasias
Sebaceous gland neoplasias are the cutaneous manifestation of the Muir–Torre syndrome, which is known to be a phenotypical variant of hereditary nonpolyposis colorectal cancer. Both hereditary nonpolyposis colorectal cancer and Muir–Torre syndrome are caused by inherited DNA mismatch repair defects. As a prominent molecular genetic feature, all tumors associated with a DNA mismatch repair defect exhibit high microsatellite instability. So far, the frequency of DNA mismatch repair defects in patients selected solely on the basis of a sebaceous gland tumor has never been determined. In order to estimate this frequency, we assessed microsatellite instability with up to 10 microsatellite markers in a newly collected unselected series of 25 sebaceous gland neoplasias (six sebaceous adenomas, 16 sebaceous epitheliomas, three sebaceous carcinomas) in comparison to 32 sebaceous gland hyperplasias from unrelated patients. As many as 15 of the 25 sebaceous gland neoplasias (60%), but only one of the 32 sebaceous gland hyperplasias (3%), exhibited high microsatellite instability. Thus, in our study, the majority of patients with a sebaceous gland neoplasia in contrast to patients with a sebaceous gland hyperplasia are highly suspicious for an inherited DNA mismatch repair defect. On the basis of the subsequently collected tumor histories, nine of the 15 patients with a high microsatellite unstable sebaceous gland neoplasia were identified to have Muir–Torre syndrome. In none of these cases, however, were the clinical Amsterdam criteria for diagnosing hereditary nonpolyposis colorectal cancer fulfilled. In the sebaceous tumors of the remaining six patients, high microsatellite instability was an incidental finding. In two of these six patients, single relatives were known to be affected with internal cancer; however, their family histories were not suggestive of Muir–Torre syndrome or hereditary nonpolyposis colorectal cancer. In comparison with microsatellite instability screening studies in a variety of other randomly selected tumors, our study identifies sebaceous gland neoplasias as tumors with the highest frequency of high microsatellite instability reported so far, whereas sebaceous gland hyperplasia rarely exhibits high microsatellite instability. Therefore, screening for microsatellite instability in sebaceous gland neoplasias will be of great value in the detection of an inherited DNA mismatch repair defect, which predisposes to various types of internal cancers
Association between TAS2R38 gene polymorphisms and colorectal cancer risk
Molecular sensing in the lingual mucosa and in the gastro-intestinal tract play a role in the detection of ingested harmful drugs and toxins. Therefore, genetic polymorphisms affecting the capability of initiating these responses may be critical for the subsequent efficiency of avoiding and/or eliminating possible threats to the organism. By using a tagging approach in the region of Taste Receptor 2R38 (TAS2R38) gene, we investigated all the common genetic variation of this gene region in relation to colorectal cancer risk with a case-control study in a German population (709 controls and 602 cases) and in a Czech population (623 controls and 601 cases). We found that there were no significant associations between individual SNPs of the TAS2R38 gene and colorectal cancer in the Czech or in the German population, nor in the joint analysis. However, when we analyzed the diplotypes and the phenotypes we found that the non-taster group had an increased risk of colorectal cancer in comparison to the taster group. This association was borderline significant in the Czech population, (OR = 1.28, 95% CI 0.99-1.67; P(value) = 0.058) and statistically significant in the German population (OR = 1.36, 95% CI 1.06-1.75; P(value) = 0.016) and in the joint analysis (OR = 1.34, 95% CI 1.12-1.61; P(value) = 0.001). In conclusion, we found a suggestive association between the human bitter tasting phenotype and the risk of CRC in two different populations of Caucasian origin
Система мотивации персонала для сферы малого бизнеса России на примере предприятия розничной торговли ООО «Космос»
Выпускная квалификационная работа содержит: 91 страницу , 13 рисунков, 11 таблиц, 48 источников, 1 приложение.Final qualifying work consists of: page 91 , figures 13 , tables 11 ,sources 48 , app 1
A Gene for Universal Congenital Alopecia Maps to Chromosome 8p21-22
SummaryComplete or partial congenital absence of hair (congenital alopecia) may occur either in isolation or with associated defects. The majority of families with isolated congenital alopecia has been reported to follow an autosomal-recessive mode of inheritance (MIM 203655). As yet, no gene has been linked to isolated congenital alopecia, nor has linkage been established to a specific region of the genome. In an attempt to map the gene for the autosomal recessive form of the disorder, we have performed genetic linkage analysis on a large inbred Pakistani family in which affected persons show complete absence of hair development (universal congenital alopecia). We have analyzed individuals of this family, using >175 microsatellite polymorphic markers of the human genome. A maximum LOD score of 7.90 at a recombination fraction of 0 has been obtained with locus D8S258. Haplotype analysis of recombination events localized the disease to a 15-cM region between marker loci D8S261 and D8S1771. We have thus mapped the gene for this hereditary form of isolated congenital alopecia to a locus on chromosome 8p21-22 (ALUNC [alopecia universalis congenitalis]). This will aid future identification of the responsible gene, which will be extremely useful for the understanding of the biochemistry of hair development
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