The DNA damage response is developmentally regulated in the African trypanosome

Genomes are affected by a wide range of damage, which has resulted in the evolution of a number of widely conserved DNA repair pathways. Most of these repair reactions have been described in the African trypanosome Trypanosoma brucei, which is a genetically tractable eukaryotic microbe and important human and animal parasite, but little work has considered how the DNA damage response operates throughout the T. brucei life cycle. Using quantitative PCR we have assessed damage induction and repair in both the nuclear and mitochondrial genomes of the parasite. We show differing kinetics of repair for three forms of DNA damage, and dramatic differences in repair between replicative life cycle forms found in the testse fly midgut and the mammal. We find that mammal-infective T. brucei cells repair oxidative and crosslink-induced DNA damage more efficiently than tsetse-infective cells and, moreover, very distinct patterns of induction and repair of DNA alkylating damage in the two life cycle forms. We also reveal robust repair of DNA lesions in the highly unusual T. brucei mitochondrial genome (the kinetoplast). By examining mutants we show that nuclear alkylation damage is repaired by the concerted action of two repair pathways, and that Rad51 acts in kinetoplast repair. Finally, we correlate repair with cell cycle arrest and cell growth, revealing that induced DNA damage has strikingly differing effects on the two life cycle stages, with distinct timing of alkylation-induced cell cycle arrest and higher levels of damage induced death in mammal-infective cells. Our data reveal that T. brucei regulates the DNA damage response during its life cycle, a capacity that may be shared by many microbial pathogens that exist in variant environments during growth and transmission

Monitoramento em longo prazo da contenção vegetativa em talude rodoviário de saprolito de gnaisse em Minas Gerais

A sucessão de eventos após a revegetação de uma área, em geral, não é estudada. Com o passar do tempo, um consórcio vegetal que se apresentou favorável na fase inicial pode não ser adequado no futuro, deixando a área com o solo descoberto e suscetível à ação dos fatores intempéricos. O objetivo deste trabalho foi monitorar características associadas à contenção vegetativa e, em longo prazo, o surgimento de novas formas de cobertura ou exposição do solo em resposta à revegetação com gramíneas e leguminosas em talude rodoviário de declividade acentuada. Após quatro anos, foi observada, nas parcelas experimentais, a presença de novas formas de cobertura ou exposição do solo, denominadas tipologias, como: cobertura de braquiária, leguminosa, capim-gordura, espécies invasoras, biomanta, resíduos em decomposição, crostas microfíticas, crosta física, solo exposto, erosão e afloramento de rochas. Essas tipologias foram quantificadas em dois levantamentos: antes e após o período chuvoso. Foram confeccionados mapas de cobertura para cada parcela experimental e analisadas a dinâmica, distribuição espacial, frequência e competição entre as tipologias encontradas nos dois levantamentos. Das 11 tipologias encontradas, as espécies vegetais e as crostas microfíticas foram as mais importantes no estádio primário da sucessão ecológica, resultando em rápida estabilização e recuperação da superfície degradada e favorecendo o aparecimento de espécies invasoras. A variação sazonal entre os dois levantamentos levou à diminuição da erosão e ao solo exposto, pelo incremento da cobertura vegetal e das crostas microfíticas

Strategy of specification of management areas: rice grain yield as related to soil fertility

Atualmente, sabe-se que a variabilidade do solo pode influenciar a produtividade das culturas agrícolas. Assim, durante o ano agrícola 2009/10, no município de Selvíria, Estado do Mato Grosso do Sul, situado no Cerrado brasileiro (longitude 51º24' 21'' W e latitude 20º20' 56'' S), foram estudadas as correlações (Pearson e a espacial) da produtividade de grãos de arroz com o teor de matéria orgânica e pH de um Latossolo Vermelho distroférrico (Typic Acrustox), sob plantio direto, objetivando-se determinar zonas específicas de manejo do solo. A planta-teste empregada foi o cultivar de arroz de terras altas IAC 202. Instalou-sea malha geoestatística para a coleta de dados do solo e da planta, com 120 pontos amostrais, numa área de 3,0 ha e declive homogêneo de 0,055 m m-1. Os atributos pesquisados foram a produtividade de grãos de arroz e os teores de matéria orgânica, pH e acidez potencial e o teor de alumínio, nas camadas de 0-0,10 e 0,10-0,20 m do solo. Espacialmente, observaram-se duas zonas específicas de manejo agrícola do solo. A primeira, com os maiores valores da matéria orgânica e da produtividade de grãos de arroz; e, a segunda, com os menores. Efetuando-se adubações com taxas variáveis na segunda zona, poderá ser obtido substancial aumento dessa produtividade agrícola. O teor de matéria orgânica confirmou ser bom indicador da qualidade do solo, quando correlacionado espacialmente com a produtividade de grãos de arroz.It is well-known nowadays that soil variability can influence crop yields. Therefore, to determine specific areas of soil management, we studied the Pearson and spatial correlations of rice grain yield with organic matter content and pH of an Oxisol (Typic Acrustox) under no- tillage, in the 2009/10 growing season, in Selvíria, State of Mato Grosso do Sul, in the Brazilian Cerrado (longitude 51º24' 21'' W, latitude 20º20' 56'' S). The upland rice cultivar IAC 202 was used as test plant. A geostatistical grid was installed for soil and plant data collection, with 120 sampling points in an area of 3.0 ha with a homogeneous slope of 0.055 m m-1. The properties rice grain yield and organic matter content, pH and potential acidity and aluminum content were analyzed in the 0-0.10 and 0.10-0.20 m soil layers. Spatially, two specific areas of agricultural land management were discriminated, differing in the value of organic matter and rice grain yield, respectively with fertilization at variable rates in the second zone, a substantial increase in agricultural productivity can be obtained. The organic matter content was confirmed as a good indicator of soil quality, when spatially correlated with rice grain yield.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Instituto Federal de Mato Grosso Departamento de AgronomiaUNESP FEIS Departamento de Fitossanidade, Engenharia Rural e SolosUNESP FEIS Departamento de Fitossanidade, Engenharia Rural e Solo

Anatomical aspects of the embryo and initial development of Oenocarpus minor Mart: a palm tree from the Amazon

The anatomy of the embryo and the initial germination phase of O. minor seeds are examined here. Ripe fruits were collected from five individuals, the pulp removed, and the seeds sown in beds with sandy substrate in a greenhouse with 50% shade. Germination follow-up was made by collecting different stages of development. The anatomical study done according to usual techniques of light microscopy. The embryo is capitate and occupies a central position in the basal region of the seed. The embryogenic axis is located in the proximal region in a position that is oblique to the cotyledon axis. The cotyledon is formed by parenchymatous, procambial and protodermic tissue. The vascular bundles lie along the peripheral zone of the distal region to the embryogenicaxis. After 14 days, the primary rootemerges; after 21 days, the first cotyledon sheath and after 35 days, the second cotyledon sheath, and the seedling emerges above the substrate. Germination is of the ligule adjacent type.Neste trabalho foi feita a anatomia do embrião e a fase inicial da germinação da semente de O. minor. Frutos maduros de cinco indivíduos foram despolpados e as sementes obtidas foram semeadas em canteiros contendo substrato areia em casa de vegetação com sombreamento a 50%. O acompanhamento da germinação foi feito através de coletas das diferentes fases do desenvolvimento. O estudo anatômico foi realizado conforme técnicas usuais de microscopia de luz. O embrião é capitado. O eixo embrionário localiza-se na região proximal em posição oblíqua ao eixo cotiledonar. O cotilédone é formado por tecido parenquimático, procambial e protodérmico. Os feixes vasculares ocorrem ao longo da zona periférica da região distal até ao eixo embrionário. Aos 14 dias é emitida a raiz primária. Aos 21 dias forma-se a primeira bainha cotiledonar e aos 35 dias a segunda bainha cotiledonar ocorrendo à emergência da plântula acima do substrato. A germinação é do tipo adjacente ligular

Atratividade de genótipos de feijão-caupi para oviposição de Bemisia tabaci biótipo B

O objetivo deste trabalho foi avaliar a atratividade de genótipos de feijão-caupi para oviposição de Bemisia tabaci biótipo B e identificar possíveis fontes de resistência à mosca-branca. Foram avaliados 51 genótipos, com uso de testes de chance de escolha. Os genótipos foram divididos aleatoriamente em dois grupos, tendo-se utilizado o genótipo Canapu como testemunha sucetível. Os 14 genótipos mais promissores (sete de cada grupo) foram selecionados para a realização de ensaios complementares (com ou sem chance de escolha). No teste com chance de escolha, os genótipos BRS-Urubuquara, TVU-36, TE93-244-23 F-1, BR 17-Gurgueia, BRS-Marataoã, MNC99-541 F-21 e TE97-304 G-4 foram menos atrativos à mosca-branca. Os genótipos TE93-244-23 F-1 e TVU-36 apresentaram resistência pelo mecanismo de não preferência para ovoposição. No teste sem chance de escolha, apenas o genótipo TVU-36 apresentou resistência por esse mecanismo