Analyzing peptides and proteins by mass spectrometry: principles and applications in proteomics

Podeu consultar el llibre complet a: http://hdl.handle.net/2445/32166The study of proteins has been a key element in biomedicine and biotechnology because of their important role in cell functions or enzymatic activity. Cells are the basic unit of living organisms, which are governed by a vast range of chemical reactions. These chemical reactions must be highly regulated in order to achieve homeostasis. Proteins are polymeric molecules that have taken on the evolutionary process the role, along with other factors, of control these chemical reactions. Learning how proteins interact and control their up and down regulations can teach us how living cells regulate their functions, as well as the cause of certain anomalies that occur in different diseases where proteins are involved. Mass spectrometry (MS) is an analytical widely used technique to study the protein content inside the cells as a biomarker point, which describes dysfunctions in diseases and increases knowledge of how proteins are working. All the methodologies involved in these descriptions are integrated in the field called Proteomics

Identificación de productos de Triticum Aestivum en las pastas alimenticias. IV. Lipoproteínas solubles en éter de petróleo

Se ha establecido en trabajos anteriores (1-4) que, si bien el contenido en palmitato de sitosterol es un buen índice de la presencia de productos de Triticum aestivum en las pastas alimenticias, algunas variedades de dicha especie no podían ser detectadas debido a que su contenido en palmitato de sitosterol era similar al de las variedades de T. durum. La búsqueda de nuevas diferencias bioquímicas interespecíficas está justificada, no sólo por este hecho, sino también porque para obtener una buena aproximación en la determinación cuantitativa de productos de T. aestivum en las pastas alimenticias es necesario emplear más de un índice bioquímico, ya que todos ellos han de presentar cierta variabilidad intraespecífica

On the computation of reducible invariant tori on a parallel computer

We present an algorithm for the computation of reducible invariant tori of discrete dynamical systems that is suitable for tori of dimensions larger than 1. It is based on a quadratically convergent scheme that approximates, at the same time, the Fourier series of the torus, its Floquet transformation, and its Floquet matrix. The Floquet matrix describes the linearization of the dynamics around the torus and, hence, its linear stability. The algorithm presents a high degree of parallelism, and the computational effort grows linearly with the number of Fourier modes needed to represent the solution. For these reasons it is a very good option to compute quasi-periodic solutions with several basic frequencies. The paper includes some examples (flows) to show the efficiency of the method in a parallel computer. In these flows we compute invariant tori of dimensions up to 5, by taking suitable sections

Eyespot resistance gene Pch-1 from Aegilops ventricosa is associated with a different chromosome in wheat line H-93-70 than the resistance factor in "Roazon" wheat

The hexaploid wheat line H-93-70 carries a gene (Pch-1) that has been transferred from the wild grass Aegilops ventricosa and confers a high degree of resistance to eyespot diesease, caused by the fungus Pseudocercosporella herpotrichoides. Crosses of the resistant line H-93-70 with the susceptible wheat Pané 247 and with a 7D/7Ag wheat/Agropyron substitution line were carried out and F2 kernels were obtained. The kernels were cut transversally and the halves carrying the embryos were used for the resistance test, while the distal halves were used for genetic typing. Biochemical markers were used to discriminate whether the transferred Pch-1 gene was located in chromosome 7D, as is the case for a resistance factor present in Roazon wheat. In the crosses involving Pané 247, resistance was not associated with the 7D locus Pln, which determines sterol ester pattern (dominant allele in H-93-70). In the crosses with the 7D/7Ag substitution line, resistance was neither associated with protein NGE-11 (7D marker), nor alternatively inherited with respect to protein C-7 (7Ag marker). It is concluded that gene Pch-1 represents a different locus and is not an allele of the resistance factor in Roazon whea

Los tipos de traducción automática y su evaluación mediante perífrasis verbales y expresiones idiomáticas (alemán-español)

El present treball de fi de màster té com a objectiu avaluar la traducció automàtica entre el parell de llengües alemany-castellà. Atès que s'hi poder avaluar moltes qüestions idiomàtiques, en aquest treball es duu a terme l'avaluació mitjançant perífrasis verbals i expressions idiomàtiques. S'hi ofereix un marc teòric sobre la traducció automàtica, els tipus de traducció automàtica i els motors escollits per dur a terme l'avaluació. Així mateix, s'hi expliquen amb detall cadascunes de les perífrasis verbals i les diferències que presenten en relació amb la llengua alemanya i les expressions idiomàtiques amb les que es treballa. Una vegada obtinguts tots els resultats dels motors, amb la mètrica BLEU es determina quin motor proporciona millors resultats. Finalment, amb l'anàlisi de les dades, s'arriba a unes determinades conclusions incloent-hi la confirmació / refutació de les hipòtesis de partida.El presente trabajo final de máster tiene como objetivo evaluar la traducción automática entre el par de lenguas alemán-español. Dado que pueden evaluarse muchas cuestiones idiomáticas, en este trabajo se lleva a cabo la evaluación mediante perífrasis verbales y expresiones idiomáticas. A lo largo del trabajo se ofrece un marco teórico relacionado con la traducción automática, los tipos de traducción automática y los motores seleccionados para llevar a cabo la evaluación. Asimismo, se explican con detalle cada una de las perífrasis verbales y sus diferencias en relación con la lengua alemana, así como las expresiones idiomáticas con las que se trabaja. Una vez obtenidos los resultados de los motores, con la métrica BLEU se determina qué motor proporciona mejores resultados. Finalmente, con el análisis de los datos, se obtiene una serie de conclusiones que incluyen la confirmación / refutación de las hipótesis de partida.The aim of this Master's Degree Dissertation is to evaluate the results of the different translation engines in order to determine which of them offers the best results in relation to verbal periphrases and idiomatic expressions between German and Spanish. A theoretical explanation about machine translation and an account of the existing machine translation systems are provided. Verbal periphrases and their differences in relation to the German language are also explained in detail, and the same procedure is applied to the idiomatic expressions used in the work. Once the results of the engines are obtained, the BLEU automatic quality metric is implemented to determines which engine provide the best results. Finally, with the analysis of the data, a series of conclusions are obtained that include the confirmation / refutation of the starting hypotheses

Identificación de productos de Triticum aestivum en las pastas alimenticias. II. Determinación colorimétrica del palmitato de sitosterol.

Walde y Mangel (1930) estudiaron los extractos acetónicos de las harinas de una variedad de Triticum durum y otra de Triticum aestivum (incl. T. vulgare); encontraron que la sustancia grasa de esta última contenía una cantidad apreciable de sustancia cristalina, mientras que la de T. durum no presentaba cristales y era menos viscosa. Ambos extractos daban reacción positiva de Liebermann-Burchard, pero el desarrollo de color era más lento en el de T. durum. También encontraron estos autores que el extracto de T. aestivum, disuelto en acetona y llevado a 0o C, separaba un precipitado que no aparecía en el de T. durum. Dicho precipitado fue estudiado por Spielman (1933), siendo identificado como el ester palmítico de una mezcla de sitosterol y sitostanol. Walde y Mangel fueron, por tanto, los primeros en sugerir la presencia de palmitato de sitosterol como posible carácter específico de T. aestivum

Dithiothreitol increases f3-glucuronidase accumulation in transformed tobacco (Nicotiana tabacum) protoplasts without altering their viability or the synthesis and export of cellular proteins

The effect of dithiothreitol (DTT) on the expression of the β-glucuronidase (GUS) reporter gene under the control of the CaMV-35 S promoter has been investigated by radioactive labelling and immunoprecipitation of the enzyme in protoplasts from stably transformed tobacco plants and compared with that observed in protoplasts transiently expressing the same gene construct. An increase in net accumulation of GUS during the culture period in response to externally added DTT (2 mm) was observed both in protoplasts from transformed tobacco plants and in electroporated protoplasts. DTT had no effect on rate of degradation of the mature GUS protein, as shown in a pulse-chase experiment. Relevant aspects of protoplast physiology, such as viability, synthesis of 35S-labelled cellular proteins, or synthesis and export of pathogenesis-related proteins (one putative chitinase and two 1,3-β-glucanases) were not affected by the reducing reagen

Estudio de género en Japón a través de las figuras de Itô Noe y Hiratsuka Raichô y la revista Seitô

Este trabajo busca establecer un recorrido histórico a lo largo de los años 1890-1930 (finales de las eras Meiji y principios de Taishô) en torno a la cuestión de género y feminismo de la mano de las pensadoras y activistas Hiratsuka Raichô e Itô Noe a través de su revista Seitô. Siguiendo las publicaciones de la revista estableceremos contacto con la realidad del momento para así entender las políticas existentes alrededor de la figura de la mujer. Mediante esta aproximación histórica del feminismo en el Japón de Meji-Taishô entenderemos la posición a la que se veía sometida la mujer, sin derechos como ciudadano, a cumplir unas labores predeterminadas para con la nación y el estado. En este sentido veremos como Seitô ofreció un espacio de discusión para estas mujeres las cuales se veían oprimidas por las leyes y la moral estatal donde su individualidad se veía coartada por la voluntad del hombreAquest treball busca establir un recorregut històric al llarg dels anys 1890-1930 (finals de l'era Meiji i principis de Taishô) entorn de la qüestió de gènere i feminisme de la mà de les pensadores i activistes Hiratsuka Raichô i Itô Noe a través de la seva revista Seitô. Seguint les publicacions de la revista establirem contacte amb la realitat del moment per així entendre les polítiques existents al voltant de la figura de la dona. Mitjançant aquesta aproximació històrica del feminisme en el Japó de Meji-Taishô entendrem la posició a la qual es veia sotmesa la dona, sense drets com a ciutadà, a complir unes labors predeterminades envers la nació i l'estat. En aquest sentit veurem com Seitô va oferir un espai de discussió per a aquestes dones les quals es veien oprimides per les lleis i la moral estatal on la seva individualitat es veia coartada per la voluntat de l'homeThis work aims to establish a historical view along the years 1890-1930 (the late Meiji and early Taisho era) around gender and feminism through the works of the activists Hiratsuka Raichô and Itô Noe through its magazine Seitô. Following publications of the magazine we can comprehend the actual context with the aim to explore the existing policies around the social role of the woman. Through this historical approach of feminism in Meiji-Taisho Japan we can understand the subaltern position of women in the society. In this sense we will see how Seitô offered a space for discussion for these women which were oppressed by the laws and moral of the state, where individuality was constrained by the will of man