Polimorfisme Gen Glutamylcysteine Ligase Catalytic (GCLC) Sebagai Deteksi Kerentanan Pasien Tuberkulosis Terhadap Stres Oksidatif Akibat Infeksi Mycobacterium tuberculosis

The important genetic factor about susceptibility of oxidative stress in Pulmonary Tuberculosis (PTB) has not been determined. The aim of this study was to analyse the association between polymorphism glutamatecysteine ligase catalytic subunit (GCLC) genes with susceptibility of oxidative stress in PTB in Makassar population of Indonesian. The Methods use is a case-control study was performed on 25 paired subjects with or without PTB, These subjects were selected from result of BTA stain from sputum subjects. The following polymorphisms were genotyped by PCR-RFLP of −129C/T in the GCLC gene. Genotype frequencies and allelic frequencies were analysed. The Results was found There were significant differences in the distribution of genotype frequencies for polymorphism −129C/T in GCLC gene between PTB and non-PTB subjects. The distribution of the allelic frequencies of these genes also showed significant difference between the two groups. Conclusions is The genetic polymorphisms in GCLC −129C/T are associated with susceptibility of Oxidative stress on PTP subject

IDENTIFIKASI, SEBARAN DAN DERAJAT KERUSAKAN KAYU OLEH SERANGAN RAYAP COPTOTERMES (ISOPTERA: RHINOTERMITIDAE) DI SULAWESI SELATAN

Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengidentifikasi spesies Coptotermes yang terdapat di Sulawesi Selatan berdasarkan morfologi dan genetik, (2) menganalisis sebaran spesies Coptotermes berdasarkan wilayah, jenis tanah dan habitat spesifik, dan (3) mengevaluasi potensi kerusakan kayu yang ditimbulkannya oleh serangan Coptotermes serta hubungannya dengan faktor lingkungan. \ud Survey rayap dilakukan pada seluruh wilayah Sulawesi Selatan, dengan metode insidential sampling. Identifikasi berbasis morfologi dilakukan terhadap 9 karakter morfologi rayap prajurit, yang dicocokkan dengan kunci determinasi; sedangkan identifikasi berbasis molekuler dilakukan terhadap rayap pekerja. Analisis spasial dan deskriptif digunakan untuk sebaran spesies berdasarkan wilayah, jenis tanah dan habitat spesifik. Rating scale dan analisis varian digunakan untuk mengevaluasi derajat kerusakan sampel kayu, dan analisis korelasi Spearman???s Rho dilakukan untuk mengetahui hubungannya dengan faktor lingkungan. \ud Hasil analisis varian, analisis cluster, serta data morfometri rayap prajurit yang tersebar pada 34 lokasi di wilayah Sulawesi Selatan menghasilkan 3 jenis Coptotermes, yaitu Coptotermes sp., C. gestroi Wasmann; dan C. curvignathus. Analisis high similarity blast nucleotide menghasilkan 6 spesies Coptotermes, yaitu C. sjoestedti, C. gestroi, C. amanii, Coptotermes sp. (P2Wo); C. curvignathus, dan Coptotermes sp. Spesies dari cluster 1 dan 2 tersebar hampir merata pada seluruh daerah yang disurvey, sedangkan C. curvignathus memiliki penyebaran terbatas. Keseluruhan Coptotermes tersebar pada 8 jenis tanah dan dominan ditemukan pada kayu Lannea grandis. Derajat kerusakan yang ditimbulkan oleh setiap jenis berbeda-beda; dan derajat kerusakan tersebut berkorelasi dengan jenis makanan dan sanitasi lingkungan, tetapi tidak berkorelasi dengan jenis habitat

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI GEN pneumcoccal surface adhesin A (psaA) SEBAGAI FAKTOR VIRULENSI Streptoccus pneumoniae

Streptococcus pneumoniae (pneumokokus) merupakan flora normal pada traktus respiratorius atas yang juga dapat menjadi bakteri patogen penyebab invasive Pneumococcal Disease (IPD) seperti pneumoniae, otitis media, dan meningitis. Namun belum banyak yang melaporkan kejadian oleh bakteri ini pada penderita IPD khususnya di Kota Makassar. Belum ada metode gold standar dalam mengidentifikasi pneumokokus menjadi salah satu faktor sulitnya menegakkan diagnosis terkait dengan bakteri ini.  Maka dari itu tujuan dari penelitian ini untuk mengevaluasi kinerja metode pemeriksaan baik dengan menggunakan metode konvensioanl (bakteriologi kultur) dan metode molekuler dengan Polymerase Chain Reaction  (PCR) dalam mengisolasi dan identifikasi gen psaA sebagai faktor virulensi. Metode yang digunakan secara konvensional adalah  mikroskopis, kultur, dan uji biokimia dimana hasilnya mengarahkan pada spesies Streptococcus kemudin dilakukan uji susptibility dengan opthocin sedangkan untuk metode molekuler digunakan teknik PCR sebagai pembanding. Diperoleh hasil uji Opthocin 3 (12%)  sampel yang sensitive kemudian dilanjutkan dengan melakukan amplifikasi PCR gen PsaA menggunakan primer spesifik maka diperoelh juga pita dengan ukuran 834 bp yang menunjukkan bahwa pada ke-3 (100%) isolate S.pneumoniae terdeteksi  gen PsaA Kata kunci : Sputum, psaA, PCR, Streptococcus pneumonia

DETECTION OF SHIGELLA SP ON STOOL CHILDREN WITH DIARRHEA USING CULTURE METHODE AND PCR

ABSTRACT Introduction: Diarrhea is one health problem in the world with mortality and morbidity rates are high, both in developed and developing countries. This research aims to detect Shigella sp in the stool of children with diarrhea using culture method and PCR. Methods: This research is a descriptive with cross-sectional design. A total of 50 samples were obtained from four health centers in Makassar city, i.e Barabaraya, Pampang, Antang Perumnas and Tamangapa from May - July 2016 with rectal swab method. For culture test, the samples were inoculated on medium SSA. While with PCR test, primer icsA (526 bp) was used. Results: The results indicate that, from 50 samples tested by using culture method, there is no sample (0%) posi- tive detected Shigella sp. While the PCR method there 6 samples (24%) positive detected Shigella sp. Conclusion: The sensitivity of PCR in the detection of Shigella sp from the level of dilution 100 - 10-3. Al together, it can be inferred that PCR method is more accurate method detect Shigellasp than other culture methode. Keywords: Diarrhea, Shigellasp, Culture, PC

DETEKSI RESISTENSI Mycobacterium tuberculosis TERHADAP OBAT ANTITUBERKULOSIS OFLOXACIN (OFL) PADA BERBAGAI KONSENTRASI

Penelitian Deteksi Resistensi Mycobacterium tuberculosis Terhadap Obat Antituberkulosis Ofloxacin (OFL) pada Berbagai Konsentrasi telah dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui resistensi Mycobacterium tuberculosis terhadap obat antituberkulosis Ofloxacin (OFL) pada berbagai konsentrasi. Sampel dalam penelitian ini adalah 15 isolat bakteri Mycobacterium tuberculosis strain klinis, satu isolat bakteri Mycobacterium tuberculosis strain H37RV dan satu isolat bakteri Mycobacterium tuberculosis ATCC 700457 sebagai kontrol. Isolat tersebut merupakan koleksi dari Laboratorium NECHRI HUM-RC RS Wahidin Sudirohusodo Makassar. Sampel kemudian diremajakan dengan menggunakan medium Middlebrook 7H9 Broth. Setiap sampel dibuat dengan suspensi 0,5 Mc Farland. Karakterisasi isolat bakteri Mycobacterium tuberculosis meliputi morfologi koloni dan pengecatan Ziehl-Neelsen. Uji resistensi dilakukan dengan menumbuhkan sampel pada medium Lowenstein Jensen yang berisi ofloxacin dengan konsentrasi 1 ??g/ml, 2 ??g/ml, 4 ??g/ml, dan 8 ??g/ml serta tanpa obat sebagai GC (Growth Control). Hasil penelitian menunjukkan bahwa pada konsentrasi 1 ??g/ml terdapat 11 sampel (84,62%) resisten, 2 sampel (15,38%) intermediet dan tidak ada sampel yang sensitif. Untuk konsentrasi 2 ??g/ml, terdapat 7 sampel (53,85%) resisten, 5 sampel (38,46%) intermediet dan 1 sampel (7,69%) sensitif. Pada konsentrasi 4 ??g/ml terdapat 2 sampel (15,38%) resisten, 2 sampel (15,38%) intermediet, dan 9 sampel (69,24%) sensitif. Sedangkan untuk konsentrasi 8 ??g/ml terdapat 1 sampel (7,69%) resisten, 2 sampel (15,38%) intermediet dan 10 sampel (76,93%) sensitif

DETECTION OF NONTUBERCULOUS MYCOBACTERIA (NTM) IN ISOLATES FROM SUSPECTED TUBERCULOSIS USING PCR IS6110 GENE

ABSTRACT  Introduction: NTM is a group of mycobacterium other than M.tuberculosis complex and M.Leprae, which found in the environment and can be pathogenic. Objectives: This study aim was to detect NTM isolates using PCR on target genes IS 6110. Methods: This study was conducted in Laboratory of Microbiology, Faculty of Medicine, Hasanuddin University and Laboratorium microbiology in Hasanuddin University Hospital. 14 sample isolates of NTM from sputum of suspected tuberculosis patients. The method using PCR IS6110 gene. Results: The results showed that of 14 samples, 8 positive samples with M. tuberculosis and 6 samples negative. Conclusions: IS6110 PCR can be used to detect NTM isolates from sputum of suspected tuberculosis patients. Keywords : NTM, PCR, IS6110, M.tuberculosi

Pseudomonas Putida E16 16 SRNA Potential as Enzyme-Producing Bacteria

seudomonas putida strain E16 16S Ribosomal RNA is identified molecularly as bacterial symbiont spesies of macroalga Sargassum polycystum which produce L-Asparaginase (E.C.3.5.1.1), levels of optimum fermentation time and substrate concentration are 48 hours and 10g/L respectively, 60-80% Fraction is The Highest L-Asparaginase Activity (2,03 IU/ml). Gel filtration chromatography sefadeks G-100 has a purity level of 11.505 compared to the crude extract which continued to CM-Sephadex C50 ion-exchange chromatography, the pure L-Asparaginase of fraction 28 have purity level of 197.112 compared to crude extract

Perbandingan Metode Proporsi dengan Metode Resazurin Microtiter Assay (Rema) untuk Deteksi Mycobacterium tuberculosis yang Resisten Terhadap Rifampisin

Tuberculosis (TB) is one of the high infectious diseases in Indonesia caused by Mycobacteriumtuberculosis. Drugs which used for tuberculosis therapy has been widely reported experiencing resistance, while inappropriately treatment will lead to not effective and efficient care. Culture in Lowenstein Jensen medium is a gold standard to perform the drug susceptibility but it takes a long time to get results, therefore, new methods were developed to replace it, one of them is colorimetric method. This research aimed to compare Rifampicin susceptibility test in colorimetric method use REMA and culture method use Lowenstein Jensen medium. This study was a cross sectional with experimental laboratory design used 42 sputums from patients with tuberculosis, done at October 2010 until March 2011. In this research, 5 samples rifampicin resistant have been detected. As a results, we founded Rifampicin susceptibility test of REMA have 80 % sensitivity, 100 % specificity, 100 % PPV, and 97 % NPV when compared with culture method.Keywords:Proportion, Resazurin, Mycobacterium tuberculosis, Resistanc

N-Acetyl Transferase (NAT) 2 Polymorphisms and Susceptibility to Antituberculosis Drug-induced Hepatotoxicity in Indonesia

Tuberculosis (TB) treatment, based on the use of isoniazid (INH), rifampicin (RMP) and pyrazinamide (PZA), shown to cause drug-induced hepatotoxicity (DIH). Recent studies have demonstrated that genetic variations may associate with the risk of DIH, such as INH acetylation status, related to N-acetyl transferase (NAT) 2 polymorphism, which slow acetylation are more prone to side effects from drugs. The proportion of rapid and slow acetylator vary remarkably in populations of different ethnic or geographic origin which has been described in the various study, but, there is still limited information on our population. The objective of this study is to investigate the contribution of NAT2 polymorphisms to the anti-TB DIH in our population. This case-control study conducted at the Cipto Mangunkusumo Hospital, Jakarta and Omni Hospital Alam Sutera, Tangerang, Indonesia from January 201

EXTENDED SPECTRUM BETA LACTAMASE (ESBL); INDIKATOR RESISTENSI ANTIBIOTIKA GOLONGAN SEFALOSPORIN UNTUK PASIEN TERINFEKSI BAKTERI Pseudomonas aeruginosa di RSUP DR. WAHIDIN SUDIROHUSODO MAKASSAR

β-laktamase spektrum luas (ESBL) merupakan suatu kelompok enzim laktamase yang bertanggungjawab terhadap sebagian besar kasus resisten bakteri yang sebagian besar merupakan bakteri gram negatif, terhadap antibiotika β-laktam generasi baru yang kini telah teridentifikasi dalam jumlah besar di seluruh dunia. Penelitian ini bertujuan untuk Memperoleh data prevalensi dari resistensi antibiotika golongan sefalosporin pada bakteri Pseudomonas aeruginosa dan Mengetahui frekuensi kejadian Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL) pada 25 spesimen klinis di RSUP Dr. Wahidin Sudirohusodo Makassar selama periode April – Juli 2017. Pengujian yang dilakukan meliputi uji sensitivitas antimikroba yang dilakukan dengan mengguakan metode difusi agar Kirby-Bauer dan uji produksi ESBL dengan menggunakan metode double disc synergy test (DDST) dan phenotypic confirmatory test. Hasil penelitian menunjukkan bahwa bakteri Pseudomonas aeruginosa berhasil diisolasi dari semua sampel dengan tingkat keakuratan sebesar (90% - 99%). Pada uji sensitivitas antimikroba ditemukan bahwa dari 25 sampel klinik yang diuji terhadap antibiotika sefalosporin, yang telah mengalami resistensi secara berurutan dari yang terbesar adalah cefotaxime 19 sampel (76%), ceftriaxone 16 sampel (64%), dan ceftazidime 7 sampel (28%). Pada uji produksi ESBL ditemukan 21 sampel (84%) positif ESBL pada antibiotika cefotaxime+as. klavulanat, 21 sampel (84%) positif ESBL pada antibiotika ceftriaxone+as.klavunalat, dan 16 sampel (64%) positif ESBL pada antibiotika ceftriaxone