FONA-7, a Novel Extended-Spectrum β-Lactamase Variant of the FONA Family Identified in Serratia fonticola

Serratia fonticola is a human pathogen widely found in the environment, with birds being reported as possible natural hosts. During an epidemiological and genomic surveillance study conducted to monitor the occurrence of extended-spectrum b-lactamase (ESBL)-producing Enterobacterales in South American wild birds, we identified an ESBL-positive S. fonticola in a fecal sample collected from a Hudsonian Whimbrel, during its non-breeding range on the Pacific Coast of Chile. Whole genome sequencing analysis and in silico modeling revealed a novel variant of the class A ESBLs FONA family, designated FONA-7, which shows 96.28% amino acid identity with FONA-6; with amino acid substitutions occurring in the signal peptide sequence (Thr22/Ser), and in the mature protein (Ser39/Asn and Thr227/Ile). This finding denotes that migratory birds can be potential vectors for the transboundary spread of ESBL-producing bacteria, creating a further theoretical riskfor the origin of novel plasmid-encoded b-lactamases.Fil: Fuentes Castillo, Danny. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Power, Pablo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Cerdeira, Louise. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Cardenas-Arias, Adriana. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Moura, Quézia. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Oliveira, Flavio A.. Universidade Estadual de Campinas; BrasilFil: Levy, Carlos E.. Universidade Estadual de Campinas; BrasilFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Catão-Dias, José L.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Lincopan, Nilton. Universidade de Sao Paulo; Brasi

SERVIDORES DA SAÚDE NA REGIÃO TOPAMA E SUA ATUAÇÃO EM VIGILÂNCIA EM SAÚDE

The practices related to health surveillance are integrated in health regions to strengthen integrality and care management, thus aiming to outline the profile and practices in health surveillance, through self-assessment of managers and health workers from 30 municipalities in the TOPAMA region. A cross-sectional study was carried out through the application of self-answered questionnaires. The profiles of professional activity, participation in training, indication of health surveillance activities, use and level of knowledge about health information systems were delineated. A descriptive analysis of the data was performed, separated by profiles. Of the 569 respondents, 19 were municipal managers and 59 health surveillance managers, among whom the levels of education and knowledge of the legal frameworks of health were higher than those of professionals who are members of health surveillance and primary care teams. Among these, 61.0% did not participate in continuing education activities and 53.6% had little knowledge of the municipal health plan, and self-reported knowledge of health information systems with basic level was reported by 76.3% for SINASC, similar to what was observed in other systems. The results are close to the literature reports of weakening actions, and denote a path that enables educational intervention to strengthen the quality of services in the region.Las prácticas relacionadas con la vigilancia en salud se integran en las regiones de salud para fortalecer la integralidad y la gestión del cuidado, por lo tanto, el objetivo es perfilar el perfil y las prácticas en vigilancia en salud, a través de la autoevaluación de los gestores y trabajadores de salud de 30 municipios de la región TOPAMA. Se realizó un estudio transversal, mediante la aplicación de cuestionarios autoadministrados. Se perfilaron perfiles de actividad profesional, participación en capacitaciones, indicación de actividades de vigilancia en salud, uso y nivel de conocimiento sobre los sistemas de información en salud. Se realizó un análisis descriptivo de los datos separados por perfiles. De los 569 encuestados, 19 eran gestores municipales y 59 gestores de vigilancia en salud, entre los cuales los niveles de educación y conocimiento de los marcos legales en salud eran superiores a los de los profesionales integrantes de equipos de vigilancia y atención primaria en salud. De estos, el 61,0% no participaba en actividades de educación continua y el 53,6% tenía poco conocimiento del plan municipal de salud, y el conocimiento autoreferido sobre los sistemas de información en salud con nivel básico lo reportó el 76,3% para el SINASC, similar a los observados. en otros sistemas. Los resultados se acercan a los relatos literarios del debilitamiento de las acciones, y denotan un camino que posibilita la intervención educativa para fortalecer la calidad de los servicios en la región.As práticas relacionadas à vigilância em saúde são integradas nas regiões de saúde para fortalecer a integralidade e a gestão do cuidado, sendo assim objetiva-se delinear o perfil e as práticas em vigilância em saúde, através da autoavaliação de gestores e servidores de saúde de 30 municípios da região TOPAMA. Realizou-se estudo transversal, por meio da aplicação de questionários autorrespondidos. Foram delineados os perfis de atividade profissional, participação em capacitações, indicação de atividades de vigilância em saúde, a utilização e o nível de conhecimento sobre os sistemas de informações em saúde. Realizou-se análise descritiva dos dados, separada por perfis. Dos 569 respondentes, 19 eram gestores municipais e 59 gestores de vigilância em saúde, entre os quais, os níveis de escolaridade e conhecimento dos marcos legais da saúde foram superiores aos dos profissionais membros de equipes de vigilância em saúde e da atenção primária. Estes, 61,0% não participavam de atividades de educação permanente e 53,6% possuíam pouco conhecimento do plano municipal de saúde, e autorrelato de conhecimento sobre os sistemas de informação em saúde com nível básico foi relatado por 76,3% para o SINASC, similar ao observados em outros sistemas. Os resultados são próximos aos relatos literários de enfraquecimento das ações, e denotam um caminho que possibilita a intervenção educacional para fortalecer a qualidade dos serviços na região. Palavras-chave: Gestão em Saúde; Sistema Único de Saúde; Regionalização, Profissionais de Saúde. &nbsp

Fatores associados à infecção por SARS-CoV-2 entre profissionais da saúde de hospitais universitários

Objetivo: investigar fatores associados à infecção por SARS-CoV-2 entre profissionais da saúde de hospitais universitários. Método: estudo multicêntrico, de abordagem mista com estratégia incorporada concomitante, realizado com 559 profissionais na etapa quantitativa, e 599 na etapa qualitativa. Foram utilizados quatro instrumentos de coleta de dados, aplicados via formulário eletrônico. A análise quantitativa foi realizada com estatística descritiva e inferencial e os dados qualitativos por meio de análise de conteúdo. Resultados: os fatores associados à infeção foram: realização de teste “RT-PCR” (p<0,001) e unidades com atendimento a pacientes com COVID-19 (p=0,028). Ter sintomas aumentou em 5,63 vezes a prevalência de infeção e aderir ao distanciamento social na maior parte do tempo na vida particular reduziu em 53,9%. Dados qualitativos evidenciaram dificuldades enfrentadas pelos profissionais: escassez e baixa qualidade de equipamentos de proteção individual, sobrecarga de trabalho, distanciamento físico no trabalho, processos e rotinas inadequadas e ausência de uma política de triagem e testagem em massa. Conclusão: os fatores associados à infecção por SARS-CoV-2 entre profissionais da saúde foram em sua maioria relacionados a questões ocupacionais.Objetivo: investigar los factores asociados a la infección por SARSCoV-2 en los profesionales de la salud de hospitales universitarios. Método: estudio multicéntrico, con abordaje mixto con estrategia incorporada concomitante, realizado con 559 profesionales en la etapa cuantitativa, y 599 en la etapa cualitativa. Fueron utilizados cuatro instrumentos de recolección de datos, aplicados a través un formulario electrónico. El análisis cuantitativo se realizó mediante estadística descriptiva e inferencial y los datos cualitativos mediante análisis de contenido. Resultados: los factores asociados a la infección fueron: realización de la prueba “RT-PCR” (p<0,001) y unidades que atienden a pacientes con COVID-19 (p=0,028). Tener síntomas aumentó la prevalencia de infección 5,63 veces y cumplir la mayor parte del tiempo con el distanciamiento social en la vida privada la redujo un 53,9%. Los datos cualitativos mostraron las dificultades que enfrentaron los profesionales: escasez y baja calidad de equipos de protección personal, sobrecarga de trabajo, distanciamiento físico en el trabajo, procesos y rutinas inadecuados y la ausencia de una política de triage y testeo masivos. Conclusión: los factores asociados a la infección por SARS-CoV-2 en los profesionales de la salud se relacionaron mayormente con cuestiones laborales.Objective: to investigate factors associated with the SARS-CoV-2 infection among health professionals from university hospitals. Method: a multicenter, mixed approach study with concomitant incorporated strategy, carried out with 559 professionals in the quantitative stage, and 599 in the qualitative stage. Four data collection instruments were used, applied by means of an electronic form. The quantitative analysis was performed with descriptive and inferential statistics and the qualitative data were processed by means of content analysis. Results: the factors associated with the infection were as follows: performance of the RT-PCR test (p<0.001) and units offering care to COVID-19 patients (p=0.028). Having symptoms increased 5.63 times the prevalence of infection and adhering to social distancing most of the time in private life reduced it by 53.9%. The qualitative data evidenced difficulties faced by the professionals: scarcity and low quality of Personal Protective Equipment, work overload, physical distancing at work, inadequate processes and routines and lack of a mass screening and testing policy. Conclusion: the factors associated with the SARS-CoV-2 infection among health professionals were mostly related to occupational issues

A utilização das técnicas opioid-free e opioid-sparing na prática Anestésica

O presente artigo teve como objetivo apresentar, a partir de uma revisão narrativa de literatura, os prós e contras das Técnicas Opioid-Free (TOF) e Opioid-Sparing (TOS) no manejo da prática anestésica. Sabe-se que os opioides apresentam propriedades analgésicas que os tornam componentes importante da anestesia; porém, apresentam riscos indesejáveis, como dependência e hiperalgesia. Desse modo, a utilização de novas modalidades anestésicas é uma alternativa para um intra e pós-operatório mais seguros, visando minimizar os efeitos adversos do uso opioides. Entre as novas técnicas, a TOF é caracterizada pela não utilização de opioides, mas sim anti-inflamatórios não esteroidais, técnicas analgésicas regionais e adjuvantes não farmacológicos. Tem-se também a TOS, em que se administra a quantidade mínima possível de opioide no ambiente cirúrgico capaz de produzir efeitos analgésicos e prolongar a sedação. Contudo, ainda não há estudos suficientes que consolidem as técnicas alternativas em detrimento ao uso convencional de opioide na prática anestésica, tornando necessárias novas pesquisas que esclareçam suas vantagens e indicações

WHO Critical Priority Escherichia coli as One Health Challenge for a Post-Pandemic Scenario: Genomic Surveillance and Analysis of Current Trends in Brazil.

The dissemination of carbapenem-resistant and third generation cephalosporin-resistant pathogens is a critical issue that is no longer restricted to hospital settings. The rapid spread of critical priority pathogens in Brazil is notably worrying, considering its continental dimension, the diversity of international trade, livestock production, and human travel. We conducted a nationwide genomic investigation under a One Health perspective that included Escherichia coli strains isolated from humans and nonhuman sources, over 45 years (1974-2019). One hundred sixty-seven genomes were analyzed extracting clinically relevant information (i.e., resistome, virulome, mobilome, sequence types [STs], and phylogenomic). The endemic status of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-positive strains carrying a wide diversity of variants, and the growing number of colistin-resistant isolates carrying -type genes was associated with the successful expansion of international ST10, ST38, ST115, ST131, ST354, ST410, ST648, ST517, and ST711 clones; phylogenetically related and shared between human and nonhuman hosts, and polluted aquatic environments. Otherwise, carbapenem-resistant ST48, ST90, ST155, ST167, ST224, ST349, ST457, ST648, ST707, ST744, ST774, and ST2509 clones from human host harbored and genes. A broad resistome to other clinically relevant antibiotics, hazardous heavy metals, disinfectants, and pesticides was further predicted. Wide virulome associated with invasion/adherence, exotoxin and siderophore production was related to phylogroup B2. The convergence of wide resistome and virulome has contributed to the persistence and rapid spread of international high-risk clones of critical priority E. coli at the human-animal-environmental interface, which must be considered a One Health challenge for a post-pandemic scenario. A One Health approach for antimicrobial resistance must integrate whole-genome sequencing surveillance data of critical priority pathogens from human, animal and environmental sources to track hot spots and routes of transmission and developing effective prevention and control strategies. As part of the Grand Challenges Explorations: New Approaches to Characterize the Global Burden of Antimicrobial Resistance Program, we present genomic data of WHO critical priority carbapenemase-resistant, ESBL-producing, and/or colistin-resistant Escherichia coli strains isolated from humans and nonhuman sources in Brazil, a country with continental proportions and high levels of antimicrobial resistance. The present study provided evidence of epidemiological and clinical interest, highlighting that the convergence of wide virulome and resistome has contributed to the persistence and rapid spread of international high-risk clones of E. coli at the human-animal-environmental interface, which must be considered a One Health threat that requires coordinated actions to reduce its incidence in humans and nonhuman hosts

Antimicrobial resistance in a remote community in the Amazon Forest.

O objetivo deste trabalho foi investigar a presença de bactérias produtoras de β-lactamases adquiridas na microbiota Gram-negativa comensal de humanos e animais domésticos em uma comunidade remota na região da Floresta Amazônica. De março a julho de 2013 foram coletadas amostras de fezes de indivíduos atendidos e funcionários de um centro assistencial em saúde restrito a comunidades indígenas e de swab retal de animais de companhia da comunidade. Nas amostras de humanos foram detectados isolados de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter aerogenes, Enterobacter kobei e Morganella morganii, carregando os genes blaTEM-1, blaCTX-M-15, blaCTX-M-14, blaCTX-M-8 e blaGES-5. Nas amostras de animais foram detectados apenas isolados de E. coli carregando os genes blaTEM-1, blaCTX-M-14, blaCTX-M-2 e blaCTX-M-8. Foi observada a relação clonal entre isolados de E. coli de origem humana e de origem animal. Estes resultados demonstram a disseminação de um problema endêmico em áreas urbanas para uma comunidade, em teoria, com baixa exposição a antibacterianos.The aim of this study was to investigate the presence of acquired β-lactamase in the commensal Gram-negative microbiota of humans and domestic animals of a remote community in the Amazon Forest region. From March to July 2013 stool samples were collected from individuals attended in a health care center restricted to indigenous communities and from the local staff, and rectal swab samples were collected from companion animals in the community. In the human samples were detected Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter aerogenes, Enterobacter kobei and Morganella morganii isolates harboring blaTEM-1, blaCTX-M-15, blaCTX-M-14, blaCTX-M-8 e blaGES-5 genes. In the animal samples only E. coli strains harboring blaTEM-1, blaCTX-M-14, blaCTX-M-2 and blaCTX-M-8 were detected. The clonal relatedness between E. coli strains from human and animal samples was observed. These results demonstrate the dissemination of an urban endemic problem to a community, in theory, with low antimicrobial exposure

Antimicrobial resistance in a remote community in the Amazon Forest.

O objetivo deste trabalho foi investigar a presença de bactérias produtoras de β-lactamases adquiridas na microbiota Gram-negativa comensal de humanos e animais domésticos em uma comunidade remota na região da Floresta Amazônica. De março a julho de 2013 foram coletadas amostras de fezes de indivíduos atendidos e funcionários de um centro assistencial em saúde restrito a comunidades indígenas e de swab retal de animais de companhia da comunidade. Nas amostras de humanos foram detectados isolados de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter aerogenes, Enterobacter kobei e Morganella morganii, carregando os genes blaTEM-1, blaCTX-M-15, blaCTX-M-14, blaCTX-M-8 e blaGES-5. Nas amostras de animais foram detectados apenas isolados de E. coli carregando os genes blaTEM-1, blaCTX-M-14, blaCTX-M-2 e blaCTX-M-8. Foi observada a relação clonal entre isolados de E. coli de origem humana e de origem animal. Estes resultados demonstram a disseminação de um problema endêmico em áreas urbanas para uma comunidade, em teoria, com baixa exposição a antibacterianos.The aim of this study was to investigate the presence of acquired β-lactamase in the commensal Gram-negative microbiota of humans and domestic animals of a remote community in the Amazon Forest region. From March to July 2013 stool samples were collected from individuals attended in a health care center restricted to indigenous communities and from the local staff, and rectal swab samples were collected from companion animals in the community. In the human samples were detected Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter aerogenes, Enterobacter kobei and Morganella morganii isolates harboring blaTEM-1, blaCTX-M-15, blaCTX-M-14, blaCTX-M-8 e blaGES-5 genes. In the animal samples only E. coli strains harboring blaTEM-1, blaCTX-M-14, blaCTX-M-2 and blaCTX-M-8 were detected. The clonal relatedness between E. coli strains from human and animal samples was observed. These results demonstrate the dissemination of an urban endemic problem to a community, in theory, with low antimicrobial exposure

Occurrence of filamentous fungi in Simulium goeldii Cerqueira & Nunes de Mello (diptera: simuliidae) larvae in central Amazonia, Brazil Ocorrência de fungos filamentosos associados a larvas de Simulium goeldii Cerqueira & Nunes de Mello da Amazônia Central, Brasil

The family Simuliidae is the host of simbiontes fungi that inhabit the digestive tracts of arthropods. This paper reports the presence of fungi in Simulium goeldii Cerqueira & Nunes de Mello larvae in Amazonia. We observed that the larvae are a good component of aquatic systems to isolate filamentous fungi.<br>A família Simuliidae é hospedeira de fungos simbiontes que habitam o trato digestivo de artrópodos. Este estudo reporta a presença de fungos em larvas de Simulium goeldii Cerqueira & Nunes de Mello da Amazônia. Foi observado que as larvas são bons componentes do sistema aquático para isolar fungos filamentosos

Genomic data reveals the emergence of an IncQ1 small plasmid carrying blaKPC-2 in Escherichia coli of the pandemic sequence type 648

Objectives: The global success of carbapenem-resistant pathogens has been attributed to large plasmids carrying blaKPC genes circulating among high-risk clones. In this study, we sequenced the genome of a carbapenem-resistant Escherichia coli strain (Ec351) isolated from a human infection. Phylogenomic analysis based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) as well as the comparative resistome and plasmidome of globally disseminated blaKPC-2-positive E. coli strains with identical sequence type (ST) were further investigated. Methods: Total DNA was sequenced using an Illumina NextSeq 500 platform and was assembled using Unicycler. Genomic data were evaluated through bioinformatics tools available from the Center of Genomic Epidemiology and by in silico analysis. Results: Genomic analysis revealed the convergence of a wide resistome and virulome in E. coli ST648, showing a high-level phylogenetic relationship with a KPC-2-positive ST648 cluster identified in the USA and association with international clade 2. Additionally, the emergence of an IncQ1 small plasmid (pEc351) carrying blaKPC-2 (on an NTEKPC-IId element), aph(3')-VIa, and plasmid regulatory and replication genes in the pandemic clone ST648 is reported. Conclusion: Identification of a blaKPC-2-positive IncQ1 plasmid in a high-risk E. coli clone represents rapid adaptation and expansion of these small plasmids encoding carbapenemases to novel bacterial hosts with global distribution, which deserves continued monitoring

Zooanthroponotic Transmission of Drug-Resistant Pseudomonas aeruginosa, Brazil

We recovered VIM-2 carbapenemase-producing Pseudomonas aeruginosa isolates from an infected dog, its owner, and the domestic environment. Genomic investigation revealed household transmission of the high-risk hospital clone sequence type 233 in the human–animal–environment interface. Results suggest zooanthroponotic transmission of VIM-2–producing P. aeruginosa in the household following the patient's hospital discharge