Atypical carcinoid tumours of the lung: prognostic factors and patterns of recurrence

Background: Atypical carcinoids (AC) of the lung are rare intermediate-grade neuroendocrine neoplasms. Prognostic factors for these tumours are undefined. Methods: Our cooperative group retrieved data on 127 patients operated between 1980 and 2009 because of an AC. Several clinical and pathological features were studied. Results: In a univariable analysis, T-status (p=0.005), N-status (p=0.021), preoperative M-status (previously treated) (p=0.04), and distant recurrence developed during the outcome (p<0.001) presented statistically significant differences related to survival of these patients. In a multivariable analysis, only distant recurrence was demonstrated to be an independent risk factor for survival (p<0.001; HR: 13.1). During the monitoring, 25.2% of the patients presented some kind of recurrence. When we studied recurrence factors in a univariable manner, sublobar resections presented significant relationship with locoregional recurrence (p<0.001). In the case of distant recurrence, T and N status presented significant differences. Patients with preoperative M1 status presented higher frequencies of locoregional and distant recurrence (p=0.004 and p<0.001, respectively). In a multivariable analysis, sublobar resection was an independent prognostic factor to predict locoregional recurrence (p=0.002; HR: 18.1). Conclusions: Complete standard surgical resection with radical lymphadenectomy is essential for AC. Sublobar resections are related to locoregional recurrence, so they should be avoided except for carefully selected patients. Nodal status is an important prognostic factor to predict survival and recurrence. Distant recurrence is related to poor outcome

Guía para la evaluación de repositorios institucionales de investigación

Esta es la segunda versión de la Guía para la evaluación de repositorios institucionales de investigación, cuya primera edición fue publicada por RECOLECTA en Diciembre de 2010.La presente versión de la Guía para la evaluación de repositorios institucionales de investigación ofrece a toda la comunidad nacional un conjunto de directrices, basadas en criterios internacionales ya existentes, que garantizan la interoperabilidad de todos los recursos de acceso abierto y aseguran un acceso de calidad a sus contenidos. Además, en esta guía también se recogen los criterios obligatorios que marca RECOLECTA para ingresar en su plataforma.Ministerio de Ciencia e Innovación; Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología (FECYT); RECOLECTA ; Conferencia de Rectores de la Universidades Españolas (CRUE

Guía para la evaluación de repositorios institucionales de investigación

Esta es una modificación de la segunda versión de junio de 2014 de la Guía para la evaluación de repositorios institucionales de investigación, cuya primera edición fue publicada por RECOLECTA en Diciembre de 2010.El objetivo general que nos planteamos con este grupo de trabajo es, partiendo del estudio de la situación actual de los repositorios institucionales de investigación españoles, elaborar una serie de directrices que guíen la creación y permitan la evaluación de los mismos.Ministerio de Ciencia e Innovación; Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología (FECYT); Conferencia de Rectores de la Universidades Españolas (CRUE); Red de Bibliotecas Universitarias (REBIUN

La Epigrafía griega y latina en la enseñanza de las materias de Filología Clásica: aplicación de nuevas metodologías y nuevas tecnologías

Informe final del Proyecto de Innovación Docente PIMCD 2016/17-5

La tomata ‘Valenciana’ del Perelló: comparació de les seues característiques genètiques i fenotípiques amb el conjunt de tomates tradicionals europees.

[CA] La tomata ‘Valenciana del Perelló’, originaria de l’horta de València, representa una de les més importants i apreciades varietats tradicional valencianes de consum en fresc. A pesar d’açò manquem d’una tipificació i caracterització en profunditat, el que dificulta identificar de manera especifica i objectiva característiques distintives d’aquest tipus de tomata tant especial. En aquest treball comparem les característiques genètiques i fenotípiques de la tomata la ‘Valenciana’ i, concretament la ‘Valenciana del Perelló’ amb un conjunt de mes de 1000 varietats de tomates tradicionals Europees amb la finalitat de proporcionar les bases per distingir la tomata ‘Valenciana’ del Perelló’ d’aquelles pertanyents a altres varietats tradicionals anomenades també valencianes o aquelles que són similars dins del conjunt tradicional europeu. La caracterització morfològica, basada en 10 caràcters morfològics i qualitatius ens indica que encara que hi ha diferències poblacionals, no són suficients per discriminar entre tipus varietals. El genotipat de les varietats tradicionals europees revela una estructura genètica ben definida per a la varietat de tomata ‘Valenciana del Perelló’ i respecte a altres tomates valencianes o tomates europees de característiques similars. En particular, 18 variants de seqüència SNPs en llocs específics del genoma de la tomata són suficients per distingir clarament la tomata ‘Valenciana’ tipus ‘ el Perelló’ de les altres varietats de tomata ‘Valenciana’ i la tomata ‘Valenciana’ del conjunt de tomata tradicional europeu. Tenint en compte açò, els nostres resultats proporcionen l’empremta genètica de la tomata ‘Valenciana del Perelló’, punt de partida per a la valorització d’aquesta varietat local i per a la seua utilització en programes de millora o el seu us certificat en mercats de productes d’alta qualitat.[EN] The ‘Valenciana d’El Perelló’ tomato, originating from the Spanish region l’Horta de València, represents one of the most important and appreciated Valencian landraces for fresh market. Despite this, we still lack a detailed typification and characterization of this variety which is a prerequisite for identifying specific and objective distinctive characteristics of this type of tomato. In this work we compared genetic and phenotypic traits of the tomato variety ‘Valenciana’, in particular the ‘Valenciana d’El Perelló’, against more than 1000 traditional varieties in order to provide the basis to distinguish the tomato ‘Valenciana d’El Perelló’ from a number of other landraces named ‘Valenciana’ or to those similar within the traditional European tomato collection. Morphological characterization, based in 10 fruit morphological and qualitative traits indicated that despite differences between populations, these traits do not discriminate varietal types. The genotyping of European traditional varieties reveal a well defined genetic structure of ‘Valenciana d’El Perelló’ with respect to other Valencian or European tomatoes with similar characteristics. In particular, 18 sequence SNP variants are sufficient to distinguish clearly the tomato ‘Valenciana d’El Perelló’ type from other ‘Valenciana’ varieties and the ‘Valenciana’ variety from the rest of European traditional tomato. Taking this into account, our results provide the ‘Valenciana d’El Perelló’ tomato genetic fingerprint, starting point for the valorization of this landrace and for its use in breeding programs or its certified use in high quality markets.Aquest projecte ha rebut financiació del programa Horizon 2020 de la Unió Europea a través del projecte No 634561 [This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement No 634561].Pons Puig, C.; Monforte Gilabert, AJ.; Figás Moreno, MDR.; Soler Aleixandre, S.; Blanca Postigo, JM.; Ziarsolo Areitioaurtena, P.; Cañizares Sales, J.... (2020). La tomata ‘Valenciana’ del Perelló: comparació de les seues característiques genètiques i fenotípiques amb el conjunt de tomates tradicionals europees. En I Congrés de la Tomaca Valenciana: La Tomaca Valenciana d'El Perelló. Editorial Universitat Politècnica de València. 141-152. https://doi.org/10.4995/TOMAVAL2017.2017.6196OCS14115

Atlas of phenotypic, genotypic and geographical diversity present in the European traditional tomato

[EN] The Mediterranean basin countries are considered secondary centres of tomato diversification. However, information on phenotypic and allelic variation of local tomato materials is still limited. Here we report on the evaluation of the largest traditional tomato collection, which includes 1499 accessions from Southern Europe. Analyses of 70 traits revealed a broad range of phenotypic variability with different distributions among countries, with the culinary end use within each country being the main driver of tomato diversification. Furthermore, eight main tomato types (phenoclusters) were defined by integrating phenotypic data, country of origin, and end use. Genome-wide association study (GWAS) meta-analyses identified associations in 211 loci, 159 of which were novel. The multidimensional integration of phenoclusters and the GWAS meta-analysis identified the molecular signatures for each traditional tomato type and indicated that signatures originated from differential combinations of loci, which in some cases converged in the same tomato phenotype. Our results provide a roadmap for studying and exploiting this untapped tomato diversity.We thank Universitat Illes Balears, the Greek Gene Bank (GGB-NAGREF), Universita degli Studi Mediterranea Reggio Calabria, the CRB-Leg (INRA-GAFL)", the Genebank of CNR-IBBR (Bari, Italy) and ARCA 2010 for seed sharing. CNR-IBBR also acknowledges the seed donors, the Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Maria Cristina Patane (CNR-IBE, Catania, Italy) and La Semiorto Sementi SRL, as well as Mrs. Roberta Nurcato for technical assistance. IBMCP-UPV acknowledges Maurizio Calduch (ALCALAX) for technical assistance and Mario Fon for English grammar editing. This work was supported by European Commission H2020 research and innovation program through TRADITOM grant agreement No.634561, G2P-SOL, grant agreement No. 677379, and HARNESSTOM grant agreement No. 101000716. Clara Pons and Mariola Plazas are grateful to Spanish Ministerio de Ciencia e Innovacion for postdoctoral grants FJCI-2016-29118 and IJC2019-039091I/AEI/10.13039/501100011033; Joan Casals to a Serra Hunter Fellow at Universitat Politècnica de Catalunya.Pons Puig, C.; Casals, J.; Palombieri, S.; Fontanet, L.; Riccini, A.; Rambla Nebot, JL.; Ruggiero, A.... (2022). Atlas of phenotypic, genotypic and geographical diversity present in the European traditional tomato. Horticulture Research. 9:1-16. https://doi.org/10.1093/hr/uhac112116

Deep-sequencing reveals broad subtype-specific HCV resistance mutations associated with treatment failure

A percentage of hepatitis C virus (HCV)-infected patients fail direct acting antiviral (DAA)-based treatment regimens, often because of drug resistance-associated substitutions (RAS). The aim of this study was to characterize the resistance profile of a large cohort of patients failing DAA-based treatments, and investigate the relationship between HCV subtype and failure, as an aid to optimizing management of these patients. A new, standardized HCV-RAS testing protocol based on deep sequencing was designed and applied to 220 previously subtyped samples from patients failing DAA treatment, collected in 39 Spanish hospitals. The majority had received DAA-based interferon (IFN) a-free regimens; 79% had failed sofosbuvir-containing therapy. Genomic regions encoding the nonstructural protein (NS) 3, NS5A, and NS5B (DAA target regions) were analyzed using subtype-specific primers. Viral subtype distribution was as follows: genotype (G) 1, 62.7%; G3a, 21.4%; G4d, 12.3%; G2, 1.8%; and mixed infections 1.8%. Overall, 88.6% of patients carried at least 1 RAS, and 19% carried RAS at frequencies below 20% in the mutant spectrum. There were no differences in RAS selection between treatments with and without ribavirin. Regardless of the treatment received, each HCV subtype showed specific types of RAS. Of note, no RAS were detected in the target proteins of 18.6% of patients failing treatment, and 30.4% of patients had RAS in proteins that were not targets of the inhibitors they received. HCV patients failing DAA therapy showed a high diversity of RAS. Ribavirin use did not influence the type or number of RAS at failure. The subtype-specific pattern of RAS emergence underscores the importance of accurate HCV subtyping. The frequency of “extra-target” RAS suggests the need for RAS screening in all three DAA target regions

Derecho ex cathedra. 1847-1936 Diccionario de catedráticos españoles

Edición revisada 2020.Publicación de las entradas biográficas del Diccionario de catedráticos españoles de Derecho, accesible en http://www.uc3m.es/diccionariodecatedraticos. Al dar forma de libro al material hemos prescindido de algunos elementos informativos, que se mantienen en la página electrónica indicada. Se recogen ahora solamente a los ingresados en el cuerpo con anterioridad a la guerra civil.Publication of the biographical entries of the Diccionario de catedráticos españoles de Derecho, accessible at http://www.uc3m.es/diccionariodecatedraticos. By giving those material book form, we have dispensed with some informative elements, however kept on the web page. Only professors apointed prior to the Civil War are now included.Esta publicación forma parte del proyecto “La memoria del jurista español: génesis y desarrollo de las disciplinas jurídicas” (ref. DER2014-55035-C2-1-P/DER2014-55035-C2-2-P), financiado por el Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (España)

Depósito asistido: una apuesta decidida por el acceso abierto en la Universidad

Comunicación presentada al XIV Workshop Rebiun de Poyectos Digitales / VI Jornadas OS-Repositorios (Córdoba, 11-13 de marzo de 2015)De sobra es conocido, y ampliamente demostrado por diversos estudios, que los principales beneficios del acceso abierto para los investigadores son el aumento de la visibilidad de su producción científica, el considerable crecimiento del número de citas, y como consecuencia una mayor difusión e impacto de sus publicaciones. Cualquier estrategia de implementación del acceso abierto en las instituciones universitarias se fundamenta en tres ejes: el primero de los cuales se basa en una infraestructura tecnológica adecuada, consistente principalmente en la implementación de un repositorio institucional que cumpla con los estándares internacionales en la estructura de sus metadatos y la interoperabilidad con otros repositorios, así como en unos recursos humanos suficientes que den soporte a los investigadores. El segundo de los ejes se refiere al esfuerzo de difusión y concienciación de los beneficios del acceso abierto, así como de animación al depósito entre los miembros de la comunidad universitaria a través de diversos medios. Sin embargo, la infraestructura técnica y los esfuerzos de difusión conjuntamente no son suficientes para impulsar de forma definitiva el acceso abierto. Por ello es necesario un tercer aspecto: la aprobación de políticas institucionales de acceso abierto, que al menos impulsen de forma clara el depósito de publicaciones científicas. La Universidad Complutense de Madrid (UCM) lleva una década centrada en los dos primeros ejes, sin resultados notables (un 13% de su producción científica total está depositada), por lo que recientemente ha optado por dar un impulso definitivo al acceso abierto. De esta manera, el 27 de mayo de 2014 se aprobó en Consejo de Gobierno de la Universidad la Política institucional de Acceso Abierto a la producción científica y académica de la Universidad Complutense (UCM). Esta política apoya de forma explícita la "vía verde" de acceso abierto a los resultados y datos de investigación llevados a cabo en la UCM, consistente en depositarlos para su archivo en repositorios institucionales y temáticos accesibles en línea. En esta política la UCM requiere el depósito de los trabajos de investigación de su personal docente e investigador, que deberá llevarse a cabo en un plazo no superior a 12 meses una vez publicados, las tesis, material docente y, adicionalmente, el depósito de otros trabajos académicos de la comunidad universitaria, tales como trabajos fin de máster y de grado, según los criterios de calidad que se determinen. Además, la UCM se compromete, entre otros aspectos, a velar por el respeto a los derechos de autor y propiedad intelectual de los contenidos depositados en el repositorio institucional E-prints Complutense, e incluye hasta 8 compromisos, entre los que se encuentran "preservar, asegurar y mantener el acceso perpetuo" a esta información, garantizar la interrelación con los curriculos investigadores, establecer procedimientos adecuados para este proceso. Por último, la biblioteca va a jugar ahora un papel clave y estratégico mediante el ?depósito asistido? consistente en una doble estrategia: por un lado, asesoramiento, formación y apoyo técnico a los profesores e investigadores para así facilitar el depósito y archivo de esos materiales (como se ha estado haciendo habitualmente), y por otro, captación de contenidos y servicios de depósito en nombre de los autores. Para lo cual se ha constituido una Subcomisión dependiente de la Comisión de Biblioteca y un Grupo de trabajo formado por bibliotecarios encargados de identificar los artículos científicos publicados desde el 27 de mayo de 2014 por los profesores complutenses y de depositar las versiones permitidas por las editoriales, las cuales son solicitadas a los autores correspondientes. El objetivo marcado es tener al menos un 75% de la producción científica de la UCM depositada en el repositorio