Interações na dinâmica do carbono e nutrientes da liteira entre a floresta de terra firme e o igarapé de drenagem na Amazônia Central

Para ajudar a entender as interações do carbono e dos nutrientes minerais da liteira numa pequena bacia hidrográfica, foram estudadas as dinâmicas sazonais da liteira fina num gradiente topográfico sob floresta de terra firme e do carbono nas águas de drenagem do igarapé. O objetivo principal deste trabalho foi estudar a dinâmica do carbono da liteira na floresta e no igarapé de drenagem da bacia e avaliar os nutrientes minerais da liteira, correlacionando-os com os períodos sazonais, além de analisar as formas do carbono orgânico encontrado na liteira do igarapé e dissolvido nas águas deste. O estudo foi realizado na Reserva Biológica do Cuieiras, ZF-2, em uma pequena bacia (Igarapé Asú), que foi toda instrumentada. A produção de liteira na floresta, foi medida em coletas quinzenais, usando coletores de PVC de 50 cm x 50 cm, em três posições topográficas (PI=platô, V=vertente e B=baixio), durante 1 ano. Simultaneamente, foi quantificada a massa de liteira sobre o solo, utilizando-se um quadrado de madeira de 20 cm x 20 cm. A liteira carreada pelo igarapé foi coletada utilizando uma rede amostradora em uma cerca feita no igarapé, efetuando-se duas campanhas intensivas que abrangeram os períodos: chuvoso (fevereiro) e seco Oulho-agosto).Análises químicas de C, N e macronutrientes, foram feitas em todo o material coletado. A produção anual de liteira foi mais alta no platô (9,4 t ha-1) e mais baixa no baixio (7,5 t ha-1).Os maiores valores de P, K, e Ca entrando via liteira fina foram observados no baixio. Houve diferenças significativas para Ca (BVPI) e K (BPIV) com relação às três posições topográficas. A quantidade de liteira acumulada sobre o solo foi praticamente similar para as parcelas do platô e vertente (6,0 t ha-¹), e o quociente de decomposição mais alto (kl = 1,6) ocorreu no platô. A retenção de liteira do igarapé no período chuvoso variou de 5,7 mg m-³ a 76 mg m-³; no período seco, foi de 8,2 mg m-³ a 155,3 mg m-³. O estoque de DOC total diário variou de 60,9 a 673,6 kg no período chuvoso; e 60 a 675 kg no período seco. As menores concentrações de POD foram encontradas no período chuvoso (2,9 a 37,7 mg m-³) e as maiores no período seco (4,2 a 74,4 mg m-³). A menor concentração de DOC (6,1 g m-³) e a maior (14,7 g m-³) foram observadas no período chuvoso. O POC não mostrou relação significativa com a variação de descargas baixas (r²=0,4), somente com as altas (r²=0,7), em ambos os períodos. Entretanto, o DOC mostrou uma forte relação com a descarga no período seco e no período chuvoso, independente de grandes eventos de precipitações. O DOC representou 99% do carbono orgânico encontrado no Igarapé Asú e parte deste carbono provém da lavagem da liteira depositada sobre o solo da floresta de baixio, que é eventualmente inundada pelo igarapé

The germline mutational landscape of BRCA1 and BRCA2 in Brazil

The detection of germline mutations in BRCA1 and BRCA2 is essential to the formulation of clinical management strategies, and in Brazil, there is limited access to these services, mainly due to the costs/availability of genetic testing. Aiming at the identification of recurrent mutations that could be included in a low-cost mutation panel, used as a first screening approach, we compiled the testing reports of 649 probands with pathogenic/likely pathogenic variants referred to 28 public and private health care centers distributed across 11 Brazilian States. Overall, 126 and 103 distinct mutations were identified in BRCA1 and BRCA2, respectively. Twenty-six novel variants were reported from both genes, and BRCA2 showed higher mutational heterogeneity. Some recurrent mutations were reported exclusively in certain geographic regions, suggesting a founder effect. Our findings confirm that there is significant molecular heterogeneity in these genes among Brazilian carriers, while also suggesting that this heterogeneity precludes the use of screening protocols that include recurrent mutation testing only. This is the first study to show that profiles of recurrent mutations may be unique to different Brazilian regions. These data should be explored in larger regional cohorts to determine if screening with a panel of recurrent mutations would be effective.This work was supported in part by grants from Barretos Cancer Hospital (FINEP - CT-INFRA, 02/2010), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP, 2013/24633-2 and 2103/23277-8), Fundação de Apoio à Pesquisa do Rio Grande do Norte (FAPERN), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (FAPERGS), Ministério da Saúde, the Breast Cancer Research Foundation (Avon grant #02-2013-044) and National Institute of Health/National Cancer Institute (grant #RC4 CA153828-01) for the Clinical Cancer Genomics Community Research Network. Support in part was provided by grants from Fundo de Incentivo a Pesquisa e Eventos (FIPE) from Hospital de Clínicas de Porto Alegre, by Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES, BioComputacional 3381/2013, Rede de Pesquisa em Genômica Populacional Humana), Secretaria da Saúde do Estado da Bahia (SESAB), Laboratório de Imunologia e Biologia Molecular (UFBA), INCT pra Controle do Câncer and Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). RMR and PAP are recipients of CNPq Productivity Grants, and Bárbara Alemar received a grant from the same agencyinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

FT-MS molecular composition data from two whitesand catchments in the lower Rio Negro basin from October/ November 2017 (end of dry season)

We investigated the role of whitesand ecosystems (WSEs) in blackwater formation in the Rio Negro basin in order to develop novel constraints for the terrestrial carbon export from land to ocean. Orbitrap mass spectrometry, a kind of ultrahigh resolution technique (FT-MS), allows to resolve thousand of individual molecular features per DOM sample. Precise determination of exact mass allows the assignment of molecular formulae to these features. We therefore identified molecular markers using Orbitrap mass spectrometry from dissolved organic carbon (DOC) of ground- and surface waters in two contrasting WSEs feeding Rio Negro tributaries and compared them with known Rio Negro markers. One tributary was fed by a whitesand riparian valley connected to a terra firme plateau, while the other was fed by a typical upland whitesand Campina. We sampled at the end of October and beginning of November 2017. "Data Set S1", an .xlsx file, contains the crosstab (samples in columns, formulae in rows) of all molecular formulae, the DOM index data (chemical indices calculated from the formula data), ecosystem averages (averages across DOM samples from the same ecosystem), ecosystem fingerprint assignments (indicative formulae per ecosystem type as assessed by t-tests, i.e., significantly "enriched" formulae based on ion abundance data), Rio Negro marker overlap (comparison of fingerprints with two sets of published Rio Negro markers from Gonsior et al. 2016 (doi:10.5194/bg-13-4279-2016) and Simon et al. 2019 (doi:10.1016/j.orggeochem.2019.01.013), and evaluation of structural data from PubChem (for those nine WSE formulae that showed consistent matching with Rio Negro markers). "Data Set S2", also an .xlsx file, contains the merged crosstab that was used for a general dataset comparison of whitesand DOM and the two openly available Rio Negro datasets. "Data Set S3" is a .docx file containing the list of structure suggestions for nine potential whitesand Rio Negro markers from PubChem, including the structural formulae (which are not provided in "Data Set S1")