Effect of Initial Configuration on DFT Calculations for Transition Metal Complexes

Computational methods, which solves the Schrödinger’s equation for molecules, have become an indispensable tool in last decades. And Density Functional Theory is one of the most used, and most effective computational method. Transition Metal complexes, on the other hand, have been being used extensively in many important applications in many fields, such as chemical catalysts, atomic thin films, and pharmaceutical industry. Applying computational methods to transition metal complexes has become inevitable to understand better, to control and to design these compounds. As it is known, it is very difficult to handle transition metals computationally, mostly due to near degeneracy in their electronic states. The computational algorithms usually cannot achieve as successive result as they can do for other typical elements, like carbon or nitrogen for instance. Computational methods are needed to be improved for properly deal with transition metal complexes. To find computationally cheaper but still effective methods to deal with these complexes is a major challenge. Unlike the analogue calculations, computational methods solve all equations iteratively, so there are major differences between these two calculation types. The starting point in state space (the assumed initial conformation of molecule) is could have a stronger effect then the expected, on the flow of the iterative solving algorithm of the computational approach. Here we present a comparative study for a Ruthenium complex. We have optimised the molecule several times. Each of the optimisations started from different initial molecular conformations. Then we have compared the result in different ways, like calculation times and minimum energy that had reached, to see effect of starting configurations on the calculation. It is showed that, starting configuration is an important parameter for computational calculations of transition metal complexes, and it is needed to be carefully chosen to improve success of calculations

Chemically enhanced membrane process-towards a novel sewage treatment concept to potentially replace biological processes

This study tested the potential of a chemically enhanced membrane process as a novel treatment system producing reusable effluent from domestic wastewater and potentially replacing biological treatment. The process involved chemical conditioning followed by a sequence of ultrafiltration and nanofiltration. Polyaluminum chloride (PACs) was selected as the optimum chemical reducing chemical oxygen demand (COD) in the supernatant to 80-100 mg/L, below the soluble COD level of 170 mg/L in domestic wastewater. Particle size distribution (PSD) analysis indicated that chemical conditioning removed 40-45% of the soluble COD fraction below 2nm and modified the size distribution of residual COD below 450 nm, suitable for the following membrane treatment. Performance of the selected coagulant was also compared with FeCl3. PSD results were also confirmed by batch experiments indicating that the proposed novel process was capable of generating a clear effluent with a COD of around 60 mg/L with micro/ultrafiltration and 35 mg/L with nanofiltration. The process offered the possibility of conserving more than 90% of the available energy in domestic wastewater, through both chemical conditioning/settling and entrapment by the membrane, which may be reused and/or recovered as part of sludge processing and disposal. The use of PACs was also observed to avoid bulky sludge generation associated with conventional chemical treatment

Catalysts for the asymmetric transfer hydrogenation of various ketones from [3-[(2S)-2-[(diphenylphosphanyl)oxy]-3-phenoxypropyl]-1-methyl-1H-imidazol-3-ium chloride] and [Ru(eta(6)-arene)(mu-Cl)Cl](2), Ir(eta(5)-C5Me5)(mu-Cl)Cl](2) or [Rh(mu-Cl)(cod)](2)

The combination of [3-[(2S)-2-[(diphenylphosphanyl)oxy]-3-phenoxypropyl]-1-methyl-1H-imidazol-3-ium chloride] with [Ru(eta(6)-arene)(mu-Cl)Cl](2), Ir(eta(5)-C5Me5)(mu-Cl)Cl](2) or [Rh(mu-Cl)(cod)](2), in the presence of KOH/isoPrOH, has been found to generate catalysts that are capable of enantioselectively reducing alkyl, aryl ketones to the corresponding (R)-alcohols. Under optimized conditions, when the catalysts were applied to the asymmetric transfer hydrogenation, we obtained the secondary alcohol products in high conversions and enantioselectivities using only 0.5 mol% catalyst loading. In addition, [3-[(2S)-2-{[(chloro(eta(4)-1,5-cyclooctadiene)rhodium)diphenyl phosphanyl] oxy}-3-phenoxypropyl]-1-methyl-1H-imidazol-3-ium chloride], (6) complex is much more active than the other analogous complexes in the transfer hydrogenation. Catalyst 6 acts as excellent catalysts, giving the corresponding (R)-1-phenyl ethanol in 99% conversion in 30 min (TOF <= 396 h(-1)) and in high enantioselectivity (92% ee)

Biological assays and theoretical density functional theory calculations of Rh(I), Ir(III), and Ru(II) complexes of chiral phosphinite ligand

Four metal complexes, IL-OPPh2-Ru-p-cymene (3), IL-OPPh2-Ru-benzene (4), IL-OPPh2-Ir-Cp* (5), IL-OPPh2-Rh-COD (6), have been evaluated for in vitro antioxidant activity such as 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) radical scavenging and reducing power activity. Maximum scavenging activity (71.43%) was obtained with IL-OPPh2-Ru-p-cymene, whereas IL-OPPh2-Rh-COD showed the highest reducing power ability. The complexes were also studied for their antimicrobial activity against three Gram-positive and three Gram-negative bacteria. In addition, DNA binding of the complexes was evaluated using calf thymus DNA. Both Ru(II) complexes exhibited good DNA-binding activity while the other complexes did not have any activity. Furthermore, ab initio quantum calculations of four complexes were also carried out using density functional theory to better understand their chemical behaviors

YIPRANMIŞ DOLOMİT TAŞININ NANO TANELİ SOLÜSYONLARLA KENDİ YAPISINA UYGUN SAĞLAMLAŞTIRILMASI

Dolotaş (Dolomit taşı) (CaMgCO3 – kalsiyum magnezyum karbonat), arkeolojik dönemlerde ve Ortaçağ dönemlerinde Anadolu’da birçok tarihi yapıda kullanılmış önemli bir yapı taşıdır. Örneğin, 1985 yılından bu yana Dünya Kültür Mirasları (World Heritage List) listesinde bulunan Sivas Divriği Ulu Camii’nin yapı taşı dolotaştır. Ülkemiz dolotaş yatakları açısından zengindir ve birçok yapının yapımı ve onarımında dolotaş yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu yapılarda zaman içerisinde oluşan taş bozulma sorunları gözlenmekte ve taş koruma çalışmalarına gereksinim duyulmaktadır.Bu çalışmada, kireçtaşı gibi bir tortul kayaç türü olan dolotaşın, kendi bünyesi ile uyumlu bir nano taneli solüsyonla sağlamlaştırılması ve bu sağlamlaştırma işleminin etkilerinin takibi konu edilmiştir. Bu kapsamda: yıpranmış dolotaşın kendi yapısına uygun nano taneli sağlamlaştırma ürünleri ile kuvvetlendirilmesi, bu amaçla laboratuvar ortamında nano boyutlarda kalsiyum hidroksit ve magnezyum hidroksit tanelerinin bir arada kullanılması ile üretilen nano dağılımlı solüsyonlar ile sağlamlaştırma işleminin yapılması ve bu işlemin etkilerinin laboratuvar analizleri ile incelenmesi, hedeflenmiştir. Önerilen bu araştırma konusu, malzeme bilimine ve nano taneli taş sağlamlaştırma teknolojilerine katkı sağlayacağı düşünülmektedir. Bu araştırma konusu, literatürde henüz çok çalışılmamış olan bir alanda bilgi üretecek niteliktedir. Teklif edilen proje bir yıllıktır

Ankara Çevresindeki Geleneksel Ahşap İskeletli Konutlarda Kullanılan Yapı Malzemelerinin Teknolojik Özellikleri: Kerpiç ve Sıvalar

Bu araştırma kapsamında:•Ankara'nın Beypazarı ve Güdül ilçelerindeki geleneksel ahşap iskeletli ve yığma taş konut yapılarında kullanılan yerel yapı malzemelerinin performans ve uyumluluk özelliklerinin, •Bu konut yapılarının onarımında kullanılacak malzemelerin fiziksel, mekanik ve bileşim özellikleri ve hammadde niteliklerininbelirlenmesi amaçlanmıştır.Bu çalışmada, Ankara iline bağlı Beypazarı ve Güdül ilçeleri ve bu ilçelere bağlı köylerde geleneksel olarak inşa edilmiş konut yapılarından alınan dış cephe sıvası, iç cephe sıvası, kerpiç tuğla, harç ve dolgu malzeme örnekleri çalışılacaktır. Önerdiğimiz proje ile yöreye özgü, özellikle de köylerde sıklıkla kullanılmış olan geleneksel malzeme ve yapım teknolojisini tanımlayabilmek üzere ayrıntılı malzeme ve detay çalışmalarının yapılması planlanmıştır. Böylelikle, kültür mirasımız olan geleneksel konut mimarisine katkıda bulunan yöresel yapım ve malzeme teknolojilerinin başarım ve dayanıklılık niteliklerin iyi anlaşılması ve tanımlanması; bu sayede günümüz yapı malzemelerinden beklenen başarım ve dayanım niteliklerinin edinilen bilgiler ışığında sorgulanması amaçlanmaktadır

KİREÇ ESASLI SIVALARIN SES YUTMA ÖZELLİKLERİ İLE GÖZENEK YAPILARI ARASINDAKİ İLİŞKİNİN İNCELENMESİ

Günümüzde yaygın olarak kullanılan çimento sıvaları ile tarihi yapılarda kullanılan pozolanik katkılı kireç sıvaları arasında perfomans özellikleri ve uzun dönem dayanımları bakımından belirgin farklılıklar vardır. Günümüz çimento sıvalarının ise, tarihi sıvalara kıyasla, çok daha yoğun, az gözenekli, su buharı geçirimliliği düşük, ısıl direnci zayıf, mekanik özellikleri yüksek, ses yutma katsayıları düşük ve kagir malzemeyle aderans sorunları oldukları bilinmektedir.Bu proje önerisi kapsamında, farklı performans özelliklerine sahip pozolanik katkılı kireç sıvaların gözenek yapıları ile ses yutma özellikleri arasındaki ilişkiler ve gözenek yapısına etki eden ham madde ve bileşim özellikleri çalışılacaktır. Bu çalışma, günümüz sıva teknolojisinin gelişmesine yol gösterici olacak ve restorasyon çalışmalarında özgün yapı ve malzemelerle uyumlu onarım sıvalarının üretilmesine destek olacak kapsamlı deneysel çalışmanın ilk aşamasını oluşturmaktadır.Önerilen bu çalışmanın, bilimsel araştırmalar arasında ilgi görecek, literatürde henüz çok çalışılmamış olan bir sahada bilgi üretecek nitelikte olduğu düşünülmektedir. Teklif edilen proje bir yıllıktır

Real life efficacy, renal and lipid profile data of tenofovir alafenamide in switched chronic hepatitis B patients

....