Using plant litter decomposition as an indicator of ecosystem response to soil contamination

The inventory and remediation of contaminated sites have emerged as top environmental priorities worldwide. A large body of evidence has accumulated to show how soil contamination affects biological communities and ecological processes. This knowledge has yet to be used for the development of indicators of soil quality that are meaningful to end-users and are easy to implement in soil quality assessment schemes. In this study, we used quantifiable measures of litter decomposition, a key biophysical process, as indicators of the ecological impact of soil contamination by trace metals and hydrocarbons. We conducted a litterbag experiment with coarse and fine mesh bags to compare highly vs. minimally contaminated sites within eight locations representative of a wide array of environmental conditions and types of pollution. Contrary to the common assumption that soil contamination hampers soil functions, idiosyncratic responses were detected for litter decomposition rate and decomposer activity metrics. A negative relationship between detritivore and microbial responses to soil contamination indicates that wherever the activity of one group of decomposers is reduced, increase in activity of the other group may ensure litter decomposition to proceed at rate similar or higher than baseline rate. This finding may indicate that compensatory dynamics in soil communities is important in determining ecosystem stability against chemical stressors. As litter decomposition may inform on the capacity of terrestrial ecosystems to cope with soil contamination, it may be a useful complement to chemical soil analyses in routine soil quality assessment schemes

Évaluation médico-économique de la réforme de l’Assurance maladie du 13 août 2004 : application au parcours de soins coordonnés de patients chroniques traités par corticostéroïdes inhalés

The objective of this thesis is to conceptualize, starting from the exploitation of the refunding data of cares from the Sickness insurance, the various trajectories of cares recourses introduced by chronic diseases as asthma, and to study their determinants by analysing the profile and the subsequent behavior of the general practitioner. The study of the relation between the prescriptive behavior and the trajectory of cares is carried out by different multivariate analyses. The other objective is to evaluate, from a pharmacoeconomic point of view, the impact of the general practitioner characteristics on the various trajectories of cares followed by the patients with chronic diseases. The characteristics likely to identify a typology of practitioners correspond to the variables influencing the prescriptive behavior (age, sex, duration of exercise, type of exercise, etc). The principal question of the thesis is that of the regulating effect of the economic incentive, rested on the coordinated care pathway (reform of the Sickness insurance, August 2004), on the trajectories of cares, really observed by the chronic patients. The corollaries are: Does the no-reimbursement of some medical acts, not considered in the coordinated care pathway, have a significant impact on the empirical recourse of the patient? Does the profile of the general practitioner have an effect on the respect or not of the allowed trajectory of cares classified by the French reform? Which are the principal determinants of disregarding this referential trajectory, by notably analysing the “practitioner - patient” characteristics?L’objectif de cette thèse est de conceptualiser, à partir de l’exploitation des données de remboursement de soins de l’Assurance Maladie, les différentes trajectoires de recours aux soins relatives à la prise en charge d’une pathologie chronique (asthme), et d’étudier les déterminants de ces trajectoires du point de vue du profil et du comportement subséquent du prescripteur de soins. L’étude de la relation entre le comportement prescriptif et la trajectoire de soins est appréhendée par des techniques de modélisation et d’analyses multivariées. L’objectif sous-jacent est d’évaluer, d’un point de vue médico-économique, l’impact de la typologie des prescripteurs (caractéristiques des offreurs de soins) sur les différentes trajectoires de soins suivies par les patients atteints de la pathologie définie supra. Les caractéristiques susceptibles d’identifier une typologie de prescripteur correspondent aux variables influant sur le comportement prescriptif, au sens large, du médecin (âge, sexe, durée d’exercice, type d’exercice, etc.). La question principale de la thèse est celle de l’effet régulateur de l’incitation économique, instaurée par le parcours de soins coordonnés (réforme de l’Assurance Maladie, août 2004), sur les trajectoires de soins, réellement observées, de patients atteints de pathologies chroniques. Les corollaires sont : Le déremboursement des actes hors parcours de soins coordonnés peut-il avoir un impact significatif sur la trajectoire empirique de prise en charge du patient ? Le profil du prescripteur d’actes médicaux a-t-il, toutes choses égales par ailleurs, un effet sur le respect ou non de la trajectoire de soins référentielle admise par le parcours de soins coordonnés ? Quels sont les déterminants principaux du non respect de cette trajectoire référentielle, du point de vue de l’analyse des caractéristiques des couples « médecin – patient»

Necessary and sufficient conditions for the existence of α\alpha-determinantal processes

International audienceWe give necessary and sufficient conditions for existence and infinite divisibility of $\alpha$-determinantal processes. For that purpose we use results on negative binomial and ordinary binomial multivariate distributions

Can the French general practitioner as a gatekeeper be cost-effective for managing chronic patients treated with inhaled corticosteroids ?

L’objectif de cette thèse est de conceptualiser, à partir de l’exploitation des données de remboursement de soins de l’Assurance Maladie, les différentes trajectoires de recours aux soins relatives à la prise en charge d’une pathologie chronique (asthme), et d’étudier les déterminants de ces trajectoires du point de vue du profil et du comportement subséquent du prescripteur de soins. L’étude de la relation entre le comportement prescriptif et la trajectoire de soins est appréhendée par des techniques de modélisation et d’analyses multivariées. L’objectif sous-jacent est d’évaluer, d’un point de vue médico-économique, l’impact de la typologie des prescripteurs (caractéristiques des offreurs de soins) sur les différentes trajectoires de soins suivies par les patients atteints de la pathologie définie supra. Les caractéristiques susceptibles d’identifier une typologie de prescripteur correspondent aux variables influant sur le comportement prescriptif, au sens large, du médecin (âge, sexe, durée d’exercice, type d’exercice, etc.). La question principale de la thèse est celle de l’effet régulateur de l’incitation économique, instaurée par le parcours de soins coordonnés (réforme de l’Assurance Maladie, août 2004), sur les trajectoires de soins, réellement observées, de patients atteints de pathologies chroniques. Les corollaires sont : Le déremboursement des actes hors parcours de soins coordonnés peut-il avoir un impact significatif sur la trajectoire empirique de prise en charge du patient ? Le profil du prescripteur d’actes médicaux a-t-il, toutes choses égales par ailleurs, un effet sur le respect ou non de la trajectoire de soins référentielle admise par le parcours de soins coordonnés ? Quels sont les déterminants principaux du non respect de cette trajectoire référentielle, du point de vue de l’analyse des caractéristiques des couples « médecin – patient» ?The objective of this thesis is to conceptualize, starting from the exploitation of the refunding data of cares from the Sickness insurance, the various trajectories of cares recourses introduced by chronic diseases as asthma, and to study their determinants by analysing the profile and the subsequent behavior of the general practitioner. The study of the relation between the prescriptive behavior and the trajectory of cares is carried out by different multivariate analyses. The other objective is to evaluate, from a pharmacoeconomic point of view, the impact of the general practitioner characteristics on the various trajectories of cares followed by the patients with chronic diseases. The characteristics likely to identify a typology of practitioners correspond to the variables influencing the prescriptive behavior (age, sex, duration of exercise, type of exercise, etc). The principal question of the thesis is that of the regulating effect of the economic incentive, rested on the coordinated care pathway (reform of the Sickness insurance, August 2004), on the trajectories of cares, really observed by the chronic patients. The corollaries are: Does the no-reimbursement of some medical acts, not considered in the coordinated care pathway, have a significant impact on the empirical recourse of the patient? Does the profile of the general practitioner have an effect on the respect or not of the allowed trajectory of cares classified by the French reform? Which are the principal determinants of disregarding this referential trajectory, by notably analysing the “practitioner - patient” characteristics

Existence conditions for determinantal and permanental processes

Nous établissons des conditions nécessaires et suffisantes d’existence et d’infinie divisibilité pour des processus ponctuels alpha-déterminantaux et, lorsque alpha est positif, pour leur intensité sous-jacente (en tant que processus de Cox). Dans le cas où l’espace est fini, ces distributions correspondent à des lois binomiales, négatives binomiales et gamma multidimensionnelles. Nous étudions de façon approfondie ces deux derniers cas avec un noyau non nécessairement symétrique.We establish necessary and sufficient conditions for the existence and infinite divisibility of alpha-determinantal processes and, when alpha is positive, of their underlying intensity (as Cox process). When the space is finite, these distributions correspond to multidimensional binomial, negative binomial and gamma distributions. We make an in-depth study of these last two cases with a non necessarily symmetric kernel

Conditions d'existence des processus déterminantaux et permanentaux

We establish necessary and sufficient conditions for the existence and infinite divisibility of alpha-determinantal processes and, when alpha is positive, of their underlying intensity (as Cox process). When the space is finite, these distributions correspond to multidimensional binomial, negative binomial and gamma distributions. We make an in-depth study of these last two cases with a non necessarily symmetric kernel.Nous établissons des conditions nécessaires et suffisantes d’existence et d’infinie divisibilité pour des processus ponctuels alpha-déterminantaux et, lorsque alpha est positif, pour leur intensité sous-jacente (en tant que processus de Cox). Dans le cas où l’espace est fini, ces distributions correspondent à des lois binomiales, négatives binomiales et gamma multidimensionnelles. Nous étudions de façon approfondie ces deux derniers cas avec un noyau non nécessairement symétrique

Le processus de décision markovien : Adaptation des routines

National audienceThe multi-state Markov model is a useful way of describing a process in which an individual moves through aseries of states in continuous time. The msm package for R allows a general multi-state model to be fitted to longitudinaldata. The progression of chronic diseases is often described by stages of severity. Features of msm include the ability tomodel transition rates between these different stages. The observations of the state Si(t) are made on a number of individualsi at arbitrary times t, which may vary between individuals. The interest of this paper is to specify the contribution of themulti-states modeling R package for pharmacoeconomics, in a health strategy assessment view.Le modèle de Markov multi-états est une méthode pertinente pour décrire un processus dynamique de répartitiond’une cohorte d’individus vers une série d’états de santé, en temps continu. La librairie « msm » du logiciel R (multi-statemodel) autorise la création d’un modèle multi-états pour ajuster des données longitudinales. La progression d’une maladiechronique est souvent décrite par des stades de sévérité ; les spécificités principales de la librairie « msm » incluent lapossibilité de modéliser les probabilités de transition entre ces différents stades. Les observations de l’état Si(t) sont fondéessur la répartition d’un nombre d’individus i à un temps arbitraire t, lequel varie d’un patient à l’autre. L’intérêt de ce papierest de spécifier l’apport de la modélisation dynamique multi-états à l’évaluation médico-économique des stratégies de santé,notamment par l’adaptation des routines « msm » du logiciel R

Le processus de décision markovien : Adaptation des routines

National audienceThe multi-state Markov model is a useful way of describing a process in which an individual moves through aseries of states in continuous time. The msm package for R allows a general multi-state model to be fitted to longitudinaldata. The progression of chronic diseases is often described by stages of severity. Features of msm include the ability tomodel transition rates between these different stages. The observations of the state Si(t) are made on a number of individualsi at arbitrary times t, which may vary between individuals. The interest of this paper is to specify the contribution of themulti-states modeling R package for pharmacoeconomics, in a health strategy assessment view.Le modèle de Markov multi-états est une méthode pertinente pour décrire un processus dynamique de répartitiond’une cohorte d’individus vers une série d’états de santé, en temps continu. La librairie « msm » du logiciel R (multi-statemodel) autorise la création d’un modèle multi-états pour ajuster des données longitudinales. La progression d’une maladiechronique est souvent décrite par des stades de sévérité ; les spécificités principales de la librairie « msm » incluent lapossibilité de modéliser les probabilités de transition entre ces différents stades. Les observations de l’état Si(t) sont fondéessur la répartition d’un nombre d’individus i à un temps arbitraire t, lequel varie d’un patient à l’autre. L’intérêt de ce papierest de spécifier l’apport de la modélisation dynamique multi-états à l’évaluation médico-économique des stratégies de santé,notamment par l’adaptation des routines « msm » du logiciel R

Soil spore bank in <em>Tuber melanosporum</em>: up to 42% of fruitbodies remain unremoved in managed truffle grounds

International audienceFungi fruiting hypogeously are believed to form spore banks in soil especially because some fruitbodies are not removed by animals. However, little is known on the proportion of fruitbodies that are not removed by animals. We took advantage of the brûlé phenomenon, which allows delineation of the mycelium distribution, to assess the proportion of unremoved black truffle (Tuber melanosporum) fruitbodies in the context of plantations where fruitbodies are actively sought and harvested by truffle growers. We inspected portions of the brûlés after the harvest season to find unremoved fruitbodies. On average, from six truffle grounds in which a total of 38 brûlés were investigated, unremoved fruitbodies represented 33% of the whole fruitbody production (42% when averaging all the brûlés). We discuss this value and its high variability among truffle grounds. Beyond the local and variable accidental reasons that may lead to this high proportion, we speculate that the formation of some undetectable fruitbodies may be under selection pressure, given the reproductive biology of T. melanosporum