Biogeografia e florística dos bosques secos estacionais neotropicais (BSEN)

Existe en Sudamérica un patrón de distribución altamente coincidente entre las diferentes especies de leñosas arbóreas de los bosques estacionalmente secos, que atraviesa el continente en forma de herradura o arco desde las Caatingas del NE del Brasil, atraviesa el sector de las antiguas misiones jesuíticas de Brasil, Paraguay y Argentina, la Chiquitanía boliviana, el Bosque Pedemontano Subandino del SW de Bolivia y NW de Argentina, e incluye algunos valles secos interandinos de Bolivia y Perú. Se ha propuesto establecer a esta distribución fragmentaria y disyunta de Bosques Secos Estacionales Neotropicales (BSEN) como un nuevo Dominio fitogeográfico, con el árbol Anadenanthera colubrina (Mimosoideae, Fabaceae) como su especie más paradigmática. El concepto actual de los BSEN abarca tipos de vegetación leñosa correlacionados con una fuerte estacionalidad climática en los trópicos de Sudamérica, con una estación seca bien definida pero de duración muy variable. El vínculo más fuerte entre los BSEN es su composición florística, lo cual ha sido demostrado tanto analizando los patrones de distribución biogeográfica de sus especies leñosas más importantes como comparando su vegetación (con análisis fitosociológico clásico y por análisis numérico). Esta nueva interpretación de los BSEN conduce a varias derivaciones con impactos biogeográficos (Teoría del Arco Pleistocénico), evolutivos (con estudios recientes a nivel molecular) y con impacto en otras ciencias (v.g. Zoología). Los BSEN han recibido poca atención de conservacionistas comparado con bosques tropicales lluviosos. Se realiza un urgente llamado a la preservación de sus recursos genéticos y de biodiversidad.Existe na América do Sul um padrão de distribuição altamente coincidente entre as diferentes espécies de lenhosas arbóreas de bosques estacionais secos, que atravessa o continente em forma de ferradura ou arco desde a Caatinga do NE do Brasil, até o setor das antigas missões jesuítas do Brasil, Paraguai e Argentina, na Chiquitania boliviana, o Bosque Pedemontano Subandino do SW da Bolívia e NW da Argentina, e inclui alguns vales secos interandinos de Bolivia e Perú. Este artigo apresenta a proposta de estabelecer essa distribuição fragmentaria e disjunta de Bosques Secos Estacionais Neotropicais (BSEN) como um novo Domínio fitogeográfico, com a árvore Anadenanthera colubrina (Mimosoideae, Fabaceae) sendo a espécie mais paradigmática. O conceito atual dos BSEN abarca tipos de vegetação lenhosa correlacionados com uma forte estacionalidade climático nos trópicos da América do Sul, com uma estação seca bem definida, porém de duração muito variável. O vinculo mais forte entre BSEN e sua composição florística, o qual foi demostrado por analises os padrões de distribuição biogeográfica de suas espécies lenhosas mais importantes comparando sua vegetação (com analises fitosociológica clássica e por análises numéricas). Esta nova interpretação dos BSEN conduz a várias derivações com impactos biogeográficos (Teoria do Arco Pleistocênico), evolutivos (com estudos recentes a nível molecular) e com impacto em outras ciências (v.g. Zoologia). Os BSEN receberam pouca atenção de conservacionistas comparando com os bosques tropicais chuvosos. É preciso uma urgente chamada para a preservação dos recursos genéticos e da biodiversidade.Fil: Mogni, Virginia Yanina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Botánica Morfológica y Sistemática Agronómica; ArgentinaFil: Oakley, Luis Jorge. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Botánica Morfológica y Sistemática Agronómica; ArgentinaFil: Maturo, Hernán Mauro. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Botánica Morfológica y Sistemática Agronómica; ArgentinaFil: Galetti, Luciano Alberto. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Botánica Morfológica y Sistemática Agronómica; ArgentinaFil: Prado, Darien Eros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Botánica Morfológica y Sistemática Agronómica; Argentin

Vegetation units of Argentina

Existen numerosos mapas de la vegetación espontánea de la Argentina. Sin embargo, no contamos aún con uno de todo el país con una resolución que permita distinguir unidades de vegetación dentro de las provincias fitogeográficas descriptas por Cabrera (1946). Analizamos las descripciones de vegetación publicadas en las últimas décadas, con especial atención sobre aquellas que produjeron mapas fisonómico-florísticos. Como resultado de ese análisis, presentamos aquí un mapa fisonómico-florístico de la vegetación espontánea de la Argentina que muestra la heterogeneidad dentro de provincias fitogeográficas. El mapa tiene 50 unidades de vegetación como subdivisiones de las provincias fitogeográficas y el ecotono descritos con anterioridad,acompañadas de una breve descripción de la fisonomía y composición florística. Proponemos una nomenclatura de las unidades de vegetación según el tipo de vegetación espontánea dominante y especies características, y presentamos material cartográfico electrónicoThere are numerous maps of the spontaneous vegetation of Argentina. However, a country-level map with enough detail to discriminate vegetation units within the phytogeographic provinces described by Cabrera (1976) is lacking. We analyzed vegetation descriptions published in recent decades, with special aention to those that produced physiognomic-floristic maps. As a result of this analysis, here we present a physiognomic-floristic map of spontaneous vegetation of Argentina that shows the heterogeneity within phytogeographic provinces. The map has 50 vegetation units as subdivisions of the phytogeographic ecotone and provinces early described, and a brief physiognomic-floristic description of each ecotone, province and vegetation unit. We propose a nomenclature of each vegetation unit based on dominant type of spontaneous vegetation and characteristic species and present digital cartographic material.Fil: Oyarzabal, Mariano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; ArgentinaFil: Clavijo, José Rafael. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; ArgentinaFil: Oakley, Luis Jorge. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Biganzoli, Fernando. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Métodos Cuantitativos y Sistemas de Información; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; ArgentinaFil: Tognetti, Pedro Maximiliano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; ArgentinaFil: Barberis, Ignacio Martín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; ArgentinaFil: Maturo, Hernán Mauro. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Aragón, Myriam Roxana. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Ecología Regional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Ecología Regional; ArgentinaFil: Campanello, Paula Inés. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ingeniería - Sede Esquel; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; ArgentinaFil: Prado, Darien Eros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; ArgentinaFil: Oesterheld, Martin. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Recursos Naturales y Ambiente; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; ArgentinaFil: Leon, Rolando Juan Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; Argentin

Plant diversity patterns in neotropical dry forests and their conservation implications

This is the author accepted manuscript. The final version is available from American Association for the Advancement of Science via the DOI in this record.Seasonally dry tropical forests are distributed across Latin America and the Caribbean and are highly threatened, with less than 10% of their original extent remaining in many countries. Using 835 inventories covering 4660 species of woody plants, we show marked floristic turnover among inventories and regions, which may be higher than in other neotropical biomes, such as savanna. Such high floristic turnover indicates that numerous conservation areas across many countries will be needed to protect the full diversity of tropical dry forests. Our results provide a scientific framework within which national decision-makers can contextualize the floristic significance of their dry forest at a regional and continental scale.This paper is the result of the Latin American and Caribbean Seasonally Dry Tropical Forest Floristic Network (DRYFLOR), which has been supported at the Royal Botanic Garden Edinburgh by a Leverhulme Trust International Network Grant (IN-074). This work was also supported by the U.K. Natural Environment Research Council grant NE/I028122/1; Colciencias Ph.D. scholarship 529; Synthesys Programme GBTAF-2824; the NSF (NSF 1118340 and 1118369); the Instituto Humboldt (IAvH)–Red colombiana de investigación y monitoreo en bosque seco; the Inter-American Institute for Global Change Research (IAI; Tropi-Dry, CRN2-021, funded by NSF GEO 0452325); Universidad Nacional de Rosario (UNR); and Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). The data reported in this paper are available at www.dryflor.info. R.T.P. conceived the study. M.P., A.O.-F., K.B.-R., R.T.P., and J.W. designed the DRYFLOR database system. K.B.-R. and K.G.D. carried out most analyses. K.B.-R. R.T.P., and K.G.D. wrote the manuscript with substantial input from A.D.-S., R.L.-P., A.O.-F., D.P., C.Q., and R.R. All the authors contributed data, discussed further analyses, and commented on various versions of the manuscript. K.B.-R. thanks G. Galeano who introduced her to dry forest research. We thank J. L. Marcelo, I. Huamantupa, C. Reynel, S. Palacios, and A. Daza for help with fieldwork and data entry in Peru

Description of a pure seed fraction of oat through usual evaluations and radiographic images

O objetivo deste trabalho foi avaliar a incidência da largura e do comprimento numa única fração de sementes de aveia [Avena sativa (L.)] cv. Cristal. Essa fração de sementes foi selecionada por um divisor mecânico e seleção manual e sua correspondência com imagens radiográficas em sementes com glumas e seus cariopses. Foram medidos a largura e o comprimento das sementes com glumas e seus cariopses com um calibrador eletrônico, e seu peso, com o emprego de uma balança de precisão. As imagens radiográficas das sementes com glumas foram tomadas com um equipamento experimental de raios X. O analista escolheu sementes com glumas de largura e comprimento previamente determinado, e, portanto, com peso maior do que o das obtidas pela separação manual, as quais foram menos largas, mais compridas e mais leves. A presença das glumas mascarou as dimensões reais dos cariopses (largura e comprimento), conduzindo o analista a selecionar sementes que diferiram mais pela largura que pelo comprimento. As imagens radiográficas mostraram a presença, ou não, dos cariopses no interior das sementes e suas reais dimensões. Os métodos de seleção mecânica de sementes mostraram ser os mais eficientes, pois não foi considerada a subjetividade do analista quando a seleção foi feita por suas dimensões. As análises por raios X foram um instrumento útil que complementou a seleção da fração pura como outro fator da qualidade da semente.  The objective of this work was to evaluate the width and length incidence in a single seed fraction of oat [Avena sativa (L.)] cv. Cristal. The seeds were selected by a mechanical divider and by hand, and their correspondence to radiographic images in seeds with glumes and their caryopses. The width and length of the seeds with glumes and their caryopses were measured with electronic calliper, and their weight, with precision balance. Radiographic images of seeds with glumes were taken with an X-ray experimental equipment. The analyst selected seeds with glumes by the width and by the length previously determined and so with more weight, than that obtained by hand selection was slightly narrower, larger and lighter. The presence of the glumes masked the caryopses real dimensions (width and length), and conduced the analyst to select seeds that differed more by the width than by the length. The radiographic images showed the presence, or not, of caryopses inside the seed and its real dimensions. The mechanical partition method for seeds showed to be more efficient because the analyst subjectivity was not considered when the selection upon its dimensions was done. The X-ray analysis was a useful tool that complements the pure seed fraction selection as another factor of seed quality

Clinical next generation sequencing in developmental and epileptic encephalopathies: Diagnostic relevance of data re-analysis and variants re-interpretation

Developmental and epileptic encephalopathies (DEE) are complex pediatric epilepsies, in which heterogeneous pathogenic factors play an important role. Next-generation-sequencing based tools have shown excellent effectiveness. The constant increase in the number of new genotype-phenotype associations suggests the periodic need for re-interpretation and re-analysis of genetic studies without positive results. In this study, we report the diagnostic utility of targeted gene panel sequencing and whole exome sequencing in 55 Argentine subjects with DEE, focusing on the utility of re-interpretation and re-analysis of undetermined and negative genetic diagnoses. The new information in biomedical literature and databases was used for the re-interpretation. For re-analysis, sequencing data processing was repeated using updated bioinformatics tools. Initially, pathogenic variants were detected in 21 subjects (38%). After an average time of 29 months, 25% of the subjects without a genetic diagnosis were re-categorized as diagnosed. Finally, the overall diagnostic yield increased to 53% (29 subjects). In consequence of the re-interpretation and re-analysis, we identified novel variants in the genes: CHD2, COL4A1, FOXG1, GABRA1, GRIN2B, HNRNPU, KCNQ2, MECP2, PCDH19, SCN1A, SCN2A, SCN8A, SLC6A1, STXBP1 and WWOX. Our results expand the diagnostic yield of this subgroup of infantile and childhood seizures and demonstrate the importance of re-evaluation of genetic tests in subjects without an identified causative etiology.Fil: Salinas Calderon, Valeria Macarena. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; ArgentinaFil: Martinez, Nerina. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Perez Maturo, Josefina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; ArgentinaFil: Rodríguez Quiroga, Sergio Alejandro. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Zavala, Lucía. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Medina, Nancy. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Amartino, Hernán. Hospital Universitario Austral; ArgentinaFil: Sfaello, Ignacio. Instituto de Neurología Infanto-Juvenil; ArgentinaFil: Agosta, Guillermo. Instituto Universitario del Hospital Italiano de Buenos Aires; ArgentinaFil: Serafín, Eva Maria. Hospital Alemán; ArgentinaFil: González Morón, Dolores. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Biología Celular y Neurociencia "Prof. Eduardo de Robertis". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Biología Celular y Neurociencia; ArgentinaFil: Kauffman, Marcelo Andres. Universidad Austral, Facultad de Ciencias Biomedicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Vega, Patricia. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentin

Summary of procedures^* and visits^* performed during the <i>Diagnostic Odysseys</i>.

<p>Summary of procedures^{<a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0191228#t003fn001" target="_blank">*</a>} and visits^{<a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0191228#t003fn001" target="_blank">*</a>} performed during the <i>Diagnostic Odysseys</i>.</p

Demographic characteristics and clinical features of patients selected for WES (^*).

<p>Demographic characteristics and clinical features of patients selected for WES (^{<a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0191228#t001fn001" target="_blank">*</a>}).</p

Summary of patients with established molecular diagnosis by WES.

<p>Summary of patients with established molecular diagnosis by WES.</p

The odyssey of complex neurogenetic disorders: From undetermined to positive

The genetic and phenotypic heterogeneity of neurogenetic diseases forces patients and their families into a ?diagnostic odyssey.? An increase in the variability of genetic disorders and the corresponding gene-disease associations suggest the need to periodically re-evaluate the significance of variants of undetermined pathogenicity. Here, we report the diagnostic and clinical utility of Targeted Gene Panel Sequencing (TGPS) and Whole Exome Sequencing (WES) in 341 patients with suspected neurogenetic disorders from centers in Buenos Aires and Cincinnati over the last 4 years, focusing on the usefulness of reinterpreting variants previously classified as of uncertain significance. After a mean of ±2years (IC 95:0.73?3.27), approximately 30% of the variants of uncertain significance were reclassified as pathogenic. The use of next generation sequencing methods has facilitated the identification of both germline and mosaic pathogenic variants, expanding the diagnostic yield. These results demonstrate the high clinical impact of periodic reanalysis of undetermined variants in clinical neurology.Fil: Salinas, Valeria Macarena. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Universidad Austral; ArgentinaFil: Vega, Patricia. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Marsili, Luca. University of Cincinnati; Estados UnidosFil: Perez Maturo, Josefina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; ArgentinaFil: Martínez, Nerina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Zavala, Lucía. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: González Morón, Dolores. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Medina, Nancy. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Rodríguez Quiroga, Sergio Alejandro. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Amartino, Hernán. Universidad Austral. Hospital Universitario Austral; ArgentinaFil: Maxit, Clarisa. Hospital Italiano; ArgentinaFil: Sturchio, Andrea. University of Cincinnati; Estados UnidosFil: Grimberg, Barbara. University of Cincinnati; Estados UnidosFil: Duque, Kevin. University of Cincinnati; Estados UnidosFil: Comas, Betiana. Hospital de la Baxada Dra. Teresa Ratto; ArgentinaFil: Silva, Walter. Hospital Italiano; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Consalvo, Damián. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Sfaello, Ignacio. No especifíca;Fil: Espay, Alberto J.. University of Cincinnati; Estados UnidosFil: Kauffman, Marcelo Andres. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentina. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; Argentin