A Labeled Graph Kernel for Relationship Extraction

In this paper, we propose an approach for Relationship Extraction (RE) based on labeled graph kernels. The kernel we propose is a particularization of a random walk kernel that exploits two properties previously studied in the RE literature: (i) the words between the candidate entities or connecting them in a syntactic representation are particularly likely to carry information regarding the relationship; and (ii) combining information from distinct sources in a kernel may help the RE system make better decisions. We performed experiments on a dataset of protein-protein interactions and the results show that our approach obtains effectiveness values that are comparable with the state-of-the art kernel methods. Moreover, our approach is able to outperform the state-of-the-art kernels when combined with other kernel methods

What is the role of the infringement procedure in tackling rule of law backsliding in the EU?

The rule of law is a foundational and fundamental value of the European Union, embodied by the complete and coherent system of legal remedies based on the fundamental right to effective judicial protection. In some Member States, the rule of law has been facing challenges and difficulties of varying degrees of severity, leading to what has been called a “rule of law backsliding” in those States. The urgency to tackle these challenges has led to the search for immediate solutions within the European Union’s tools and mechanisms, which has increased the focus given to the infringement procedure, a judicial procedure whose goal is to review the behaviours of Member States and find breaches of European Union law committed by them. The past uses of this judicial mechanism by the European Commission and the decisions of the Court of Justice of the European Union (“CJEU”) that followed have showed positive results and opened promising paths to follow in the fight to uphold the rule of law in the European Unio

How does the spider mite Tetranychus urticae respond to bacteria infection

Tese de mestrado. Biologia (Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013As bactérias encontram-se distribuídas por todo o planeta, possuindo grande diversidade, o que lhes permite explorar uma vasta gama de habitats e recursos. Durante a vida de um animal, é provável que entre em contacto com estes microrganismos, algumas podendo penetrar as suas defesas, provocando infecção sistémica. Sabe-se que diferentes bactérias possuem diferente patogenicidade e que podem utilizar diferentes vias para infectar os seus hospedeiros. As vias mais comuns de infecção são a ingestão e a penetração por brechas nas barreiras protectoras dos organismos (por feridas, por exemplo). Sabe-se ainda que infecção por diferentes vias leva a diferentes respostas nos hospedeiros. Por exemplo, a infecção por via oral despoleta as defesas ao nível do intestino e do sistema imunitário; por seu turno, uma bactéria que penetre o organismo por uma ferida apenas activa o sistema imune. Contudo, independentemente da via, a infecção bacteriana exerce uma forte pressão selectiva nos hospedeiros, podendo levar à evolução de mecanismos de defesa contra bactérias. Para combater a infecção, o hospedeiro pode utilizar diferentes estratégias defensivas: 1) evitar ou diminuir o contacto com bactérias, 2) usar as barreiras físicas/químicas do seu corpo para impedir a penetração das bactérias, ou se as bactérias ultrapassarem as duas primeiras estratégias defensivas 3) activar o sistema imunitário, montando uma resposta contra a infecção. As defesas dos artrópodes contra bactérias têm sido estudadas, recorrendo a diversos organismos. A importância económica deste grupo na agricultura, o facto de terem impacto na saúde humana e as semelhanças que as defesas destes possuem com algumas das defesas dos vertebrados foram alguns dos motivos que levaram à realização destes estudos. Contudo, a maioria dos trabalhos tem-se focado em estudar Drosophila melanogaster, que observando a árvore filogenética dos artrópodes, surge como um dos representantes mais derivados, pertencendo à classe Insecta e ordem Diptera. Por ser um organismo tão derivado, as defesas de D. melanogaster possuem características que poderão não ser encontradas em organismos mais basais. O estudo de classes mais basais, como os Chelicerata, poderá inferir acerca das características mais ancestrais das defesas dos artrópodes face à infecção bacteriana. Como representante dos Chelicerata, neste trabalho foram estudadas as defesas do ácaro-aranha Tetranychus urticae. A análise do genoma de T. urticae revelou que este ácaro não possui inúmeros genes que em D. melanogaster são responsáveis pela resposta imunitária contra bactérias. As vias de genes Toll e IMD, responsáveis pela defesa contra bactérias Gram positivas e Gram negativas respectivamente, estão incompletas no ácaro. Para além disso, não foram encontradas AMPs, as proteínas efectoras das duas redes. Várias hipóteses, não exclusivas, foram propostas para explicar estes resultados: 1) T. urticae possui mecanismos/vias de genes diferentes de D. melanogaster; 2) no seu ambiente natural, a infecção bacteriana não é frequente e portanto não existe uma pressão selectiva selecionando imunidade contra bactérias; 3) os artrópodes mais basais não possuem sistema imune. A principal questão deste trabalho foi tentar identificar quais as estratégias defensivas que T. urticae usa para se proteger contra bactérias, de forma a poder validar algumas destas hipóteses. Para responder a estas questões, diferentes vias de infecção – ingestão, injecção e pulverização - foram testadas com o intuito de perceber se a via de infeção afecta a resposta do ácaro. Diferentes bactérias – Escherichia coli, Bacillus megaterium, Pseudomonas putida e Enterococcus faecalis - foram usadas para perceber se diferentes desafios levam a diferentes respostas. Usando microarrays, estudou-se a regulação da expressão génica após infecção por injecção; o que permitiu estudar se T. urticae possui um mecanismo de regulação da expressão génica diferente de Drosophila, ou se não possui nenhum mecanismo. Ainda, estudou-se se T. urticae comportamentalmente evita a ingestão de bactérias e se estímulos olfatórios despoletam esses comportamentos. Finalmente, recorrendo a outra espécie de ácaro (Sancassania berlesei) com uma ecologia diferente de T. urticae, inferiu-se se as características das defesas de T. urticae são representativas dos ácaros ou se são exclusivas ao ácaro-aranha. Primariamente, testou-se como a infecção por diferentes vias (ingestão, pulverização e injecção) afectava a sobrevivência de T. urticae. Para estudar o efeito de infecção por ingestão, por experiência 320 fêmeas adultas de T. urticae foram divididas por 4 tratamentos (alimentando-se de LB (controlo negativo) ou de bactérias à densidade óptica de 1, 10 ou 25) e colocados em arenas com bolhas de parafilm com o alimento contido no seu interior. O período de alimentação durava 48 horas e mais tarde, o número de ácaros vivos era contado, assim como o número de ácaros que ingeriram comida. Esta informação foi utlizada para estudar se T. urticae evitava ingerir alimentos contaminados com bactérias. Para além disso, os ácaros que ingeriram a comida contaminada, foram transferidos para folhas de feijão e a sua sobrevivência foi medida durante 4 dias. E. coli e a P. putida foram as bactérias testadas e para cada bactéria foram feitas 5 repetições da experiencia. Os resultados referentes à ingestão de alimentos contaminados, demonstraram que menos ácaros ingeriam comida contaminada com bactérias, que comida com LB. Esta observação verificou-se quer para E. coli , quer para P. putida. Em seguida analizou-se a sobrevivência dos ácaros que ingeriram a comida oferecida e observou-se que a sobrevivência dos ácaros era afectada, quer pela ingestão de E. coli, quer de P. putida. Considerando a infecção por pulverização, por experiencia, 200 ácaros foram colocados em caixas de petri com folhas de feijoeiro (um ácaro por folha), e foram pulverizados ou com LB ou com bactérias à densidade óptica de 1, 10 ou 25 (50 ácaros por tratamento). A sobrevivência dos ácaros após infecção foi medida durante 4 dias. As bactérias testadas foram E. coli, P. putida e E. faecalis. Para cada bactéria, foram feitas 3 repetições da experiencia. A pulverização de bactérias levou a uma grande redução da sobrevivência dos ácaros infectados, para todas as bactérias estudadas. Estes resultados sugerem que E. coli, P. putida e E. faecalis são bactérias patogénicas de T. urticae. Considerando as experiencias de injecção, por tratamento (LB, bactéria à densidade óptica de 0.1, 1 e 10 ) 100 ácaros foram injectados, transferidos para folhas de feijoeiro e a sua sobrevivência foi contada durante 48 horas. As bactérias testadas foram E. coli e B. megaterium. A infecção por injecção de bactérias levou a uma redução da sobrevivência dos ácaros infectados. A infecção com E. coli levou a uma redução da sobrevivência a valores próximos de 0% em apenas 48 horas. Considerando a experiencia com B. megaterium, houve igualmente uma redução da sobrevivência, observando-se diferenças consoante da concentração testada. Considerando as três vias de infecção testadas, a infecção por injecção levou a uma maior redução da sobrevivência de T. urticae. Após estudar o efeito da infecção por diferentes vias, o estudo da expressão génica de T. urticae após injecção foi testado usando microarrays. Analisou-se a expressão génica 3, 6 e 12 horas após injecção. As bactérias injectadas foram E. coli e B. megaterium à densidade óptica de 1, comparando-se os resultados com os de ácaros injectados com LB. Analizando os resultados dos microarrays, poucos genes sofreram alterações na sua expressão, para infecção quer com E. coli, quer para com B. megaterium. Não foi possível observar um padrão comum na função dos genes com diferente expressão e ainda, nenhum destes tem um papel conhecido na resposta imunitária, noutras espécies. Estes dados sugerem que T. urticae não possui uma resposta imune contra infecção, pelo menos contra E. coli e B. megaterium. Com o intuito de estudar o papel do olfacto no comportamento de evitamento de bactérias, recorreu-se a um olfactómetro conectado a uma bomba de vácuo. Estudou-se a influencia dos estímulos olfatórios no comportamento de evitamento de E. coli. Os ácaros testados na experiencia do olfactómetro não evitaram E. coli, sugerindo que os estímulos olfatórios não despoletam este comportamento. Visto que as defesas de T. urticae aparentam ser pouco eficazes, testou-se se estas seriam representativas dos artrópodes mais basais. Para tal, recorreu-se a outra espécie de ácaro, o Sancassania berlesei, e infectou-se esta espécie por pulverização e injecção de bactérias. A sobrevivência de S. berlesei não foi reduzida quando as bactérias foram pulverizadas sobre os ácaros e a injecção bacteriana apenas levou a uma redução da sobrevivência quando em concentrações elevadas. Em geral, os nossos resultados sugerem que T. urticae possui poucas defesas contra bactérias, recorrendo principalmente à capacidade de comportamentalmente evitar bactérias e de prevenir a penetração de bactérias graças às suas barreiras físicas/químicas. O habitat de T. urticae poderá explicar o porquê destas deficiências nas defesas, visto que as folhas, onde estes ácaros vivem e se alimentam, parecem possuir uma quantidade reduzida de bactérias, diminuindo a probabilidade de infecção. As experiencias com S. berlesei parecem apoiar esta conclusão de que a ecologia de T. urticae levou, durante a evolução da espécie, a uma degradação das defesas do ácaro-aranha. O facto dos afídios, que partilham o habitat de T. urticae, possuírem igualmente defesas fracas reforça a ideia de que a ecologia parece ter sido determinante. É ainda possível que T. urticae possua outras estratégias defensivas contra bactérias, como um aumento da oviposição após infecção, protecção conferida por endossimbiontes, ou ainda que a sua teia possua propriedades antimicrobianas.Most organisms contact with bacteria during their lifetime, some of which cross the organism physical barriers, causing systemic infection. To prevent or cope with infection, hosts may use distinct strategies such as avoidance, physical or chemical barriers and deployment of immune defenses. We explored these different levels of defense in the spider mite Tetranychus urticae, with the aim to unveil basal features of arthropod immunity, from behavior to physiology and genetics. For this, we infected T. urticae with different bacteria, from different groups and with different degrees of pathogenicity to arthropods, under different infection routes: feeding, spraying and systemic injection. We also determined the impact of olfactory cues on avoidance behavior and the transcriptional response to infection by systemic infection using microarrays. We found that: i) all bacteria severely reduce the survival of spider mites under all routes of infection ii) avoidance to bacteria is observed, although odor cues do not appear to play a role, iii) no consistent upregulation or downregulation of genes is observed under any of the infection scenarios. Comparison between T. urticae and other mite species with a different ecology, Sancassania berlesei, suggests that T. urticae defenses may not represent mites’ defenses, neither basal arthropods’. S. berlesei mites were not as susceptible to bacteria infection as T. urticae, when infected by spraying and systemic infection. Overall, the results from the different infection regimes and microarrays suggest that, independently of the route and bacteria tested, spider mites are unable to respond to infection. T. urticae defenses against bacterial infection rely on avoidance behavior and its body phisycal/chemical barriers and we hypothesize that other factors (eg web), may also confer protection

Image Segmentation and Classification using Small Data: An Application on Friendly Statements - A Computer Vision and Document Intelligence Project

Internship Report presented as the partial requirement for obtaining a Master's degree in Data Science and Advanced Analytics, specialization in Data ScienceInsurance companies face significant challenges in managing numerous physical documents containing critical information, resulting in considerable time and cost expenditures. Although Deep Learning models offer a promising solution, their implementation costs and data privacy concerns restrict widespread adoption, especially when dealing with confidential documents. This internship report presents a novel approach to address these challenges by developing a lightweight computer vision solution for accurately detecting and processing checkboxes from Portuguese friendly statements. The key objective was to demonstrate the feasibility of achieving high accuracy without relying on advanced Deep Learning techniques. By leveraging a small set of examples, we successfully extracted checkbox information while mitigating the high computational requirements associated with traditional Deep Learning models. The results highlight the practicality and cost-effectiveness of our approach, offering insurance companies a viable solution to streamline document management, enhance data security, and improve overall efficiency. This research contributes to the computer vision field by providing valuable insights into alternative methodologies that can be adopted to overcome the limitations of Deep Learning, facilitating broader accessibility and utilization among insurance providers

Wireless sensor network for collecting environmental data and controlling several parameters in the perimeter of a vegetable farm

This project was developed under the framework of the Tese/ Dissertação (TEDI) Curricular Unit, of the second year of the Masters in Electronical Engineering and Computers, Telecommunications specialization. The topic is the development of a system that collects and processes data by the means of a wireless sensor network utilizing the ZigBee standard, in the frame of a vegetable farm. The farm facility includes a variety of buildings that perform di erent functions related to the farm and also the area which contains the cultivated terrain itself. The system uses di erent devices that work together in order to process the data collected from the sensors and also allows the user the ability to control and alter speci c parameters related to agriculture, security and automation such as humidity of the soil, security of the perimeter, illumination systems and heating systems for the plantations and the buildings. Accompanying the network is a program equipped with a Graphical User Interface (GUI) that processes the collected data from the sensors, issues the commands to the devices and provides statistical reports by keeping a history of the values of the parameters observed and the decisions taken. The research activity includes the practical execution of a pilot network containing two data collecting nodes, a coordinator, a server and the associated software developed throughout the project

Processo Especial de Revitalização (PER) : the process to recover financially distressed companies in Portugal

Este tese tem por objecto de estudo, o Processo Especial de Revitalização (PER). Sendo o PER, a mais relevante medida do Programa Revitalizar, programa este implementado pelo governo Português no ano de 2012 para combater a crise no sector empresarial português, com o objectivo de ser um mecanismo que permitisse às empresas a sua recuperação, satisfazendo os credores e mantendo postos de trabalho, foi importante perceber de que forma o sucesso de aprovação de um PER variava de empresa para empresa e quais os factores comuns que poderiam levar à aprovação, ou não, do PER. Com essa finalidade, foram analisados dois casos indivíduais. Mesmo sabendo da particularidade individual de cada caso, esta tese conclui sobre um conjunto de medidas comuns que podem beneficiar individualmente cada PER submetido no futuro, podendo assim melhorar ainda mais um mecanismo fundamental na ajuda da recuperação das empresas em Portugal.This thesis centers its study in PER. Being PER, the most relevant measure of Programa Revitalizar, a program introduced by the Portuguese government in 2012, with the objective of battling the economic crisis faced by the Portuguese companies, allowing these companies its financial recovery, therefore satisfying its creditors and maintaining job places, it was important to understand in which way did the approval of a PER changed from company to company and what were the common factors that could have led to an approval, or not, of the PER. With that goal on focus, two different individual cases were analyzed. Despite knowing about the individual particularity of each PER case, this thesis concludes about a range of common measures which might benefit individually future submitted cases, by this improving even more a crucial mechanism, responsible for the recuperation of failing companies in Portugal

Essays on corporate finance and political economy

The first chapter of this dissertation investigates how financial frictions affect companies' product market decisions. As different products have different production cycles, I find that companies focus on products entailing short cash flow maturity as a way of alleviating financial constraints. The second chapter focuses on a randomized controlled trial where a financial education course was offered to managers of medium and large companies in Mozambique. The results suggest that financial education improves corporate practices and performance. The final chapter analyses the impact of information on electoral behaviour. We expose 1800 participants to information about central government performance and evaluate its impact on voting in local elections

Role of oxidative stress in ERK and p38 MAPK activation induced by the chemical sensitizer DNFB in a fetal skin dendritic cell line

The intracellular mechanisms involved in the early phase of dendritic cell (DC) activation upon contact with chemical sensitizers are not well known. The strong skin sensitizer 2,4-dinitrofluorobenzene (DNFB) was shown to induce the activation of mitogen-activated protein kinases (MAPK) in DC. In the present study, we investigated a putative role for oxidative stress in DNFB-induced MAPK activation and upregulation of the costimulatory molecule CD40. In a DC line generated from fetal mouse skin, DNFB induced a significant increase in protein oxidation, measured by the formation of carbonyl groups, while it had almost no effect on lipid peroxidation. The antioxidants glutathione and vitamin E, which inhibit protein and lipid oxidation, respectively, were used to assess the role of oxidative stress in DNFB-induced MAPK activation. Glutathione, but not vitamin E, inhibited DNFB-induced p38 MAPK and ERK1/2 phosphorylation, whereas none of the antioxidants interfered significantly with the DNFB-induced upregulation of CD40 protein levels. Taken together, these results indicate that DNFB activates p38 MAPK and ERK1/2 via production of reactive oxygen species, and that protein oxidation plays an important role in MAPK activation

Estilos de liderança nas PME e sua influência no desempenho: estudos de caso exploratórios

Em virtude da grande maioria do tecido empresarial Europeu e Nacional ser constituído por pequenas e médias empresas (PME), e face ao actual contexto de crescente globalização da economia ser caracterizado por constantes mutações económicas, políticas, tecnológicas e sociais, é de todo o interesse perceber quem são os líderes que se encontram ao leme dessas mesmas PME e compreender como as suas acções e comportamentos, enquanto Líderes, contribuem para o desempenho empresarial. Esta investigação teve como objetivo final perceber quais os estilos de liderança mais frequentes nas PME, e qual a sua influência no desempenho. Para a concretização deste objetivo foi adotado um método de investigação misto, e foram seleccionadas para o estudo três PME (casos), de sectores de atitividade diferentes, onde se procurou identificar o estilo de liderança predominante na perspectiva dos seus colaboradores, e quais os resultados obtidos com essa mesma liderança. Neste sentido e como fontes de recolha de dados adotouse a triangulação de dados entre entrevistas aos líderes e questionários aos seus colaboradores. Para o tratamento dos dados, adotou-se a análise de conteúdo nas entrevistas e análise estatística para os questionários. Com base nas evidências empíricas obtidas, concluiu-se que não existe um estilo de liderança puro que seja seguido de forma fiel pelos líderes das PME. Identificou-se ainda que estilos de liderança diferentes influenciam de forma distinta o desempenho empresarial. Contudo, dos três casos/PME estudadas, foi a PME que segue um estilo de Liderança Transacional aquela que apresenta um melhor desempenho. De fato, com este estilo de Liderança consegue-se não só um esforço extra por parte dos colaboradores, que se empenham nas suas tarefas e funções de forma mais “acérrima”, como também estes apresentam um grau de satisfação considerável em relação ao desempenho e liderança da empresa. Contudo, apesar dos estilos de liderança serem geralmente vistos como tendo influência na gestão das PME, o seu impacto no desempenho deste tipo de empresas tem sido pouco explorado empiricamente. Este estudo foi uma primeira aproximação para verificar esta relação, pelo que os resultados obtidos apresentam também um contributo importante para a literatura sobre a ligação entre estas duas áreas: liderança e desempenho empresarial. Portanto, os resultados encontrados são uma contribuição empírica para o estudo da influência da liderança no impacto do desempenho, em particular, num contexto económico, cultural e geográfico específico: as PME

Aplicação móvel como solução para a aprendizagem de programação

Mestrado em Métodos Quantitativos para a Decisão Económica e EmpresarialSaber programar é uma competência considerada cada vez mais relevante. Porém, aprender a programar é difícil, exige esforço e motivação. Neste contexto, importante identificar quais as soluções para contribuir para melhorar o desempenho de quem quer aprender a programar. Para responder a esta questão começou por se realizar a revisão de literatura. Enumera os principais fatores que influenciam a aprendizagem e o ensino de programação e ainda propostas para solucionar os mesmos. Analisadas as propostas de solução, é proposto como solução uma aplicação móvel. Ainda da revisão da literatura foi possível derivar um modelo concetual. Sendo ainda possível identificar as principais funcionalidades. Assim, são detalhadas as particularidades da aplicação bem como a sua implementação. Por fim é produzida uma avaliação preliminar onde são identificados os pontos fortes e fracos da aplicação.Knowing how to program is an increasingly relevant skill. However, programming is difficult, requires effort and motivation. In this context, it is important to identify what are the solutions to help improve the performance of those who want to learn to program. To answer this question, we start by conducting a literature review. This allows us to list the main factors that influence the learning and teaching of programming and still apply to solve them. Analysing the literature, we propose a solution: a mobile application. The literature review also allows us to derive a conceptual model and identifying the main features. Then we implemented a prototype. Finally, we performed a preliminary assessment, which identifies the strengths and weaknesses of the application.info:eu-repo/semantics/publishedVersio