Linking cellular proteostasis to yeast longevity

Proteostasis is a cellular housekeeping process that refers to the healthy maintenance of the cellular proteome that governs the fate of proteins from synthesis to degradation. Perturbations of proteostasis might result in protein dysfunction with consequent deleterious effects that can culminate in cell death. To deal with the loss of proteostasis, cells are supplied with a highly sophisticated and interconnected network that integrates as major players the molecular chaperones and the protein degradation pathways. It is well recognized that the ability of cells to maintain proteostasis declines during ageing, although the precise mechanisms are still elusive. Indeed, genetic or pharmacological enhancement of the proteostasis network has been shown to extend lifespan in a variety of ageing models. Therefore, an improved understanding of the interventions/mechanisms that contribute to cellular protein quality control will have a huge impact on the ageing field. This mini-review centers on the current knowledge about the major pathways that contribute for the maintenance of Saccharomyces cerevisiae proteostasis, with particular emphasis on the developments that highlight the multidimensional nature of the proteostasis network in the maintenance of proteostasis, as well as the age-dependent changes on this network.This work was developed under the scope of the project NORTE01-0145-FEDER-000013, supported by the Northern Portugal Regional Operational Programme (NORTE 2020), under the Portugal 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (FEDER). BSM is supported by the fellowship SFRH/BPD/90 533/2012 funded by the Fundac¸ao para a Ci ˜ encia e ˆ Tecnologia (FCT, Portugal)

Exportações brasileiras de manufaturados e o papel do crédito orçamentário, 2001-2006

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Economia, Administração e Contabilidade, Departamento de Economia, 2008.Este estudo tem por objetivo avaliar os efeitos dos instrumentos de crédito à comercialização (pós-embarque) das exportações brasileiras inseridos no orçamento da União – o seguro de crédito à exportação do Fundo de Garantia das Exportações (FGE), e as modalidades de financiamento e de equalização de taxas de juros do Programa de Financiamento às Exportações (PROEX) – sobre as exportações brasileiras de produtos manufaturados no período 2001 a 2006. O modelo proposto envolve a análise de dados em painel com utilização dos dados disponíveis desagregados ao nível de país de destino das exportações. Os resultados sugerem que os instrumentos afetam exportações de manufaturados de forma distinta, com implicações referentes à otimização e à qualidade do gasto público. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACTThis study aims to evaluate the effects of credit instruments for trade (post-shipment) of Brazilian exports inserted into the government budget – the export credit insurance of the Export Guarantee Fund (FGE), and financing and equalization of interest rates of the Export Financing Program (PROEX) – on Brazilian exports of manufactured goods in the period 2001 to 2006. The proposed model involves the analysis of panel data and use disaggregated data available for the country of destination of exports. The results suggest that the instruments affect exports of manufactured differently, with implications for the optimization and quality of public spending

Do aprendizado às margens : autobiografia verbo-visual como narrativa de experiências

Monografia (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Artes, Departamento de Artes Visuais, 2015.O objetivo desta pesquisa é retratar através de uma linguagem verbovisual minhas experiências escolares no que se refere ao aprendizado de artes, busquei dentre alguns autores de meu conhecimento, algum que também retratasse sua experiência escolar. Assim decidi abordar o quadrinho Persépolis de Marjane Satrapi, pois além de ser um quadrinho autobiográfico consagrado e um dos mais conhecidos mundialmente nesse gênero, sua história retrata proximidades com identificações que trago em minha pesquisa e relato do processo de aprendizado em artes

A narrativa da confissão : uma análise dos quadrinhos autobiográficos

Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, 2013.As histórias em quadrinhos autobiográficos ao longo dos anos vêm ganhando destaque no mercado editorial. Dentre os principais cartunistas tem Robert Crumb, Art Spiegelman, Marjane Satrapi, David Small e Guy Delisle. Estas narrativas encontraram novas contextualizações de acordo com as mudanças históricas e sociais da civilização, como a evolução da escrita/narrativa e a criação da indústria gráfica. Baseado nesta nova tendência o objetivo deste trabalho é apresentar um breve histórico deste tipo de produção dando destaque ao enfoque religioso destas obras

O papel emergente da autofagia/mitofagia na toxicidade induzida por α-sinucleína: estudos no modelo de levedura de envelhecimento cronológico

Tese de doutoramento em Ciências da Saúdeα-Synuclein (α-syn) misfolding and aggregation is strongly associated with both idiopathic and familial forms of Parkinson disease (PD). Evidence suggests that α-syn has an impact on cell clearance routes and protein quality control systems, such as the ubiquitin-proteasome system (UPS) and autophagy. Recent advances in the key role of the autosomal recessive PARK2/PARKIN and PINK1 genes in mitophagy, highlighted this process as a prominent new pathogenic mechanism. Nevertheless, the role of autophagy/mitophagy in the pathogenesis of sporadic and autosomal dominant familial forms of PD is still enigmatic. The yeast Saccharomyces cerevisiae is a powerful “empty room” model that has been exploited to clarify different molecular aspects associated with α-syn toxicity, which combines the advantage of being an established system for aging research. Here, we showed that the heterologous expression of α-syn WT or the A53T mutant form induced toxicity, additionally the toxic phenotype was more aggravated when the α-syn expression was induced at the stationary cells growth phase. At this growth phase, it was demonstrated that the induction of the toxic α-syn variants led to the stimulation of the unfolded protein response (UPR), by the activation of the Ire-Hac1 signaling pathway. The activation of this pathway is probably responsible by the induction of the ATG6 and ATG8 mRNA levels, linked with autophagy and ATG32, ATG33 and DNM1 mRNA levels, which are genes specifically associated with mitophagy, suggesting that autophagy and mitophagy are stimulated under α-syn-induced toxicity. In fact modulation of autophagy, by its inhibition with chloroquine or 3 methyladenine, reverted the α-syn toxic phenotype detected by an extension of in the chronological life span (CLS) of cells expressing the α-syn WT or A53T mutant forms. Additionally, with the specific method to quantify the autophagy or mitophagy activities, the alkaline phosphatase assay, it was confirmed that the toxicity due to the heterologous expression of the toxic α-syn variants was accompanied by exacerbated stimulation of both autophagy and mitophagy. Modulation of mitophagy, by its impairment, achieved by deletion of ATG11 or ATG32 resulted in a CLS extension, accompanied by physiologic autophagic levels, further implicating mitophagy in the α-syn toxicity. It is established that reactive oxygen species, particularly superoxide anion (O22-), are associated with autophagy induction. In the experimented conditions, the stimulation of autophagy/mitophagy under α-syn expression was accompanied with O22- accumulation. Nevertheless, cells with impaired mitophagy display lower levels of O22-. Thus, the findings do not rule out O22- as inducer of autophagy in these conditions. Other molecules that have been associated with the regulation of autophagy in higher eukaryotic cells are the sirtuins, particularly the SIRT1. Deletion of SIR2, the yeast homologue of SIRT1, essential for α-syn-induced toxicity, abolished autophagy and mitophagy, thereby rescuing cells from α-syn toxicity. These data show that Sir2 functions as a regulator of autophagy, like its mammalian homologue, SIRT1, but also of mitophagy, mediating the ATG32 mRNA levels. Caloric restriction (CR) is a physiologic intervention known to promote life span extension, by reducing the activity of various signal transduction pathways either directly or through the decrease in the activity of nutrient-sensing pathways. Wild type cells submitted to CR experienced a CLS extension accompanied by physiological levels of autophagy/mitophagy, independently of the expression of α-syn toxic variants. In fact, in α-syn-induced toxicity conditions, autophagy/mitophagy induction was significant lower in comparison with the same cells submitted to non-CR conditions, supporting the hypothesis that induction of autophagy/mitophagy are directly related with the α-syn-induced toxicity. CR, like mitophagy abrogation, has the capacity to reduce α-syn-induced toxicity. The observed high CLS of atg11 and atg32 cells expressing α-syn WT or A53T mutant form in comparison with the wild type cells submitted to the same conditions, suggested that CR controls autophagy/mitophagy independently, or at least partially independent, of the pathways regulating mitophagy . Similar results were observed in sir2 cells, in which CR is able to further increase the CLS of sir2 cells expressing α-syn toxic variants, suggesting that under CR conditions, the activated signaling pathways are independent of Sir2. Altogether our work highlights that α-syn expression is associated with autophagy, particularly mitophagy stimulation mediated by the regulation of ATG32 by Sir2, an important phenomenon linked to α-syn-induced toxicity during aging. These findings open new insights to the study of the mechanism associated with PD pathogenesis in higher eukaryote organisms.A acumulação intracelular da proteína α-sinucleina (α-sin) com alterações conformacionais leva à formação de agregados que estão associados com as formas idiopática e familiar da doença de Parkinson (DP). Evidências sugerem que a α-sin interfere com as vias de degradação proteica e com o sistema de controlo de qualidade das proteínas, tais como o sistema ubiquitina-proteasoma e a autofagia. Um papel fundamental das proteínas PARK2/PARKIN e PINK1, cujos genes estão envolvidos em formas autossómicas recessivas da DP, na regulação da mitofagia, destacam este processo como um novo proeminente mecanismo patogénico da DP. No entanto, o papel da autofagia/mitofagia na patogénese das formas esporádica e familiar autossómica dominante da DP é ainda enigmático. A levedura Saccharomyces cerevisiae é um poderoso modelo, que tem sido explorado para esclarecer diferentes aspectos moleculares associados com a toxicidade da α-sin, combinando a vantagem de ser um sistema estabelecido para o estudo do envelhecimento. Este trabalho demonstra que a expressão heteróloga da α-sin selvagem ou da forma mutante A53T induz toxicidade, que é mais evidente quando a expressão da α-sin foi induzida em células envelhecidas (pós-mitóticas em fase estacionária de crescimento). A expressão das variantes tóxicas de α-sin levou à ativação de uma resposta específica da célula através da via de sinalização Ire-Hac1. A activação desta via é, provavelmente, responsável pelo aumento dos níveis de mRNA dos genes ATG6 e ATG8, associados com o processo autofágico, e também dos genes ATG32, ATG33 e DNM1, especificamente associados com a mitofagia, sugerindo que a autofagia e a mitofagia estão implicadas na toxicidade induzida pela expressão de α-sin. De fato, a modulação da autofagia, através da sua inibição com cloroquina ou 3 metiladenina reverteu o fenótipo tóxico da α-sin, detetado através do aumento da longevidade cronológica das células. Paralelamente, com o auxílio de um método específico para a quantificação da atividade autofágica ou mitofágica, confirmou-se que a toxicidade devida à expressão heteróloga das variantes tóxicas de α-sin foi acompanhada pela estimulação exacerbada do processo autofágico e mitofágico. A modelação da mitofagia, através da sua inibição, por deleção dos genes ATG11 ou ATG32, resultou numa extensão da longevidade cronológica, acompanhada por níveis autofágicos fisiológicos, implicando a mitofagia na toxicidade induzida pela α-sin. Está estabelecido que as espécies reactivas de oxigénio, em particular o anião superóxido (O22-), regulam a indução de autofagia. Nas condições em estudo, a estimulação da autofagia/mitofagia em células a expressar α-sin foi acompanhada pela acumulação de O22-. No entanto a acumulação de O22- não é observada em células incapazes de realizar mitofagia. Assim, os resultados não descartam a possibilidade de O22- estar a contribuir para a indução da autofagia, em condições de toxicidade induzida pela α-sin. Outras moléculas que têm sido associadas com a regulação da autofagia, em células eucariotas superiores, são as sirtuinas, particularmente SIRT1. A deleção de Sir2 (proteína de levedura homólogo de SIRT1), cujo seu papel foi previamente demonstrado como sendo crucial para a toxicidade da α-sin, resultou na supressão da autofagia e da mitofagia, e consequentemente numa melhor performance das células. Estes dados mostram, pela primeira vez, que Sir2 para além de ser uma molécula reguladora da autofagia, tal como o seu homólogo de mamífero, SIRT1, regula também a mitofagia, controlando os níveis de mRNA do gene ATG32. A restrição calórica (RC) é uma intervenção fisiológica que promove a extensão da longevidade, reduzindo diretamente a atividade de várias vias de transdução de sinal, ou diminuindo a actividade das vias de sinalização de nutrientes. As células da estirpe selvagem submetidas a RC demonstraram uma extensão na longevidade cronológica, acompanhada por níveis fisiológicos de autofagia/mitofagia, independentemente da expressão das variantes tóxicas de α-sin. No entanto, esta indução foi significativamente menor quando comparada com as mesmas células submetidas a condições de não-RC, corroborando a hipótese de que a RC tem a capacidade de reduzir a toxicidade induzida por expressão da α-sin. Adicionalmente, células deletadas no gene ATG11 ou ATG32, a expressar α-sin selvagem ou a forma mutante A53T, quando sujeitas a RC apresentaram uma maior longevidade cronológica em comparação com as células da estirpe selvagem submetidos às mesmas condições, o que sugere que a RC tem a capacidade de controlar a toxicidade, devido a expressão de α-sin, por mecanismos independentes, ou pelo menos parcialmente independentes, dos mecanismos que estão na base da regulação da mitofagia. Os mesmos resultados foram observados para as células deletadas no gene SiR2, sugerindo que a RC regula a autofagia/mitofagia por vias de sinalização independentes de Sir2. Em suma, o nosso trabalho sugere que a expressão de α-sin promove a estimulação da autofagia, particularmente da mitofagia, e que esta indução é regulada pelos níveis de mRNA do gene ATG32, através da acção da proteína Sir2, um evento relevante ligado à indução da toxicidade de α-sin, durante o envelhecimento. Estes resultados abrem novas perspectivas para o estudo de mecanismos associados com a patogénese da DP, em organismos eucariotas superiores.Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT) - project PTDC/BIAMIC/ 114116/2009 and SRFH/BD/41674/200

Targeting metabolic reprogramming in acute myeloid leukemia

The cancer metabolic reprogramming allows the maintenance of tumor proliferation, expansion and survival by altering key bioenergetics, biosynthetic and redox functions to meet the higher demands of tumor cells. In addition, several metabolites are also needed to perform signaling functions that further promote tumor growth and progression. These metabolic alterations have been exploited in different cancers, including acute myeloid leukemia, as novel therapeutic strategies both in preclinical models and clinical trials. Here, we review the complexity of acute myeloid leukemia (AML) metabolism and discuss how therapies targeting different aspects of cellular metabolism have demonstrated efficacy and how they provide a therapeutic window that should be explored to target the metabolic requirements of AML cells.This research was funded by the Northern Portugal Regional Operational Programme (NORTE 2020), under the Portugal 2020 Partnership Agreement, by the European Regional Development Fund (FEDER), through the Competitiveness Factors Operational Programme (COMPETE), grant number NORTE-01-0145-FEDER-000013 and by the projects POCI-01-0145-FEDER-028159 and POCI-01-0145-FEDER-030782 by FEDER, through the COMPETE, and by National funds, through the Foundation for Science and Technology (FCT)

The search for an optimal size of gene and protein for maximum philogeny quality

Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães PereiraDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: Um problema recorrente em Filogenética é saber de antemão que melhores tamanhos de genes ou proteínas se deve ter para a construção de dendrogramas mais precisos. Neste trabalho, examinamos quais os efeitos de variados tamanhos de um alinhamento conhecido na qualidade da inferência de filogenia, em particular a filogenia dos fungos, utilizando 198 táxons fungais e 16 de grupo externo. Adicionalmente, calculamos a entropia de Shannon de cada ponto do alinhamento e fizemos iterações semelhantes por seus limiares. Para isto construímos um programa open-source baseado no toolkit bioperl que calcula estes dados. Concluímos que tanto para as iterações por tamanho quanto os para entropia, os limiares ideais são aquém do tamanho total do gene, podendo justificar uso de drafts de seqüenciamentos em inferências filogenéticas usando um pequeno número de regrasAbstract: A recurring issue in phylogenetics is knowing beforehand which best sizes for genes or proteins one should have for building more accurate cladograms. Herein we examine the effects or varying sizes of a known aligment on the quality of its inferred phylogeny, specifically considering the fungi phylogeny by using 198 fungal taxa plus 16 outgroup taxa. Additionally, we calculate the Shannon entropy of each point of the alignment and iterate similarly by its thresholds. To that end, we developed an open-source software based on the bioperl toolkit to calculate this data. Finally, we concluded that either for the size iterations or for the entropy iterations, the ideal thresholds are below the gene full size, justifying the use of sequencing drafts in phylogenetic inferrences using a handful of rulesMestradoBioinformaticaMestre em Genética e Biologia Molecula

Otimização de um sistema automático de deteção visual de defeitos

Desde o início da industrialização em Portugal que a produção automóvel assumiu uma grande importância no seu desenvolvimento económico. Desde então e até hoje, apesar da crise, este setor continua a ser marcante no PIB português e, consequentemente, a ter uma elevada importância estratégica para o país. Sendo este um setor bastante exigente, a qualidade na produção automóvel não pode ser minimizada, levando produtores e fornecedores a elevados investimentos nesta área. A constante evolução da tecnologia automóvel é visível na velocidade do aparecimento de novos modelos, com motores mais eficientes, materiais com desempenhos superiores e soluções mais inovadoras. A concorrência no setor e a exigência do cliente final assim o exigem. O investimento na área da qualidade é também crucial por questões de segurança, pois uma falha pode significar enormes custos (como os “Recalls” de viaturas) e, em casos extremos, acidentes rodoviários com graves consequências. O objetivo deste projeto é, como o título indica, a otimização de um sistema automático de defeitos, a realizar na empresa Borgstena Textile Portugal, situada em Nelas, no distrito de Viseu. Com esta otimização do sistema que já se encontra instalado, a empresa deverá obter uma melhoria significativa no sistema de qualidade e produção, assim como uma diminuição de tempos e custos. A realização do projeto numa empresa que envolvesse as duas áreas mencionadas era um objetivo pessoal, quer pelo gosto do setor automóvel, quer pela importância da qualidade em qualquer empresa. A possibilidade de criar, através do desenvolvimento deste projeto, uma parceria entre a empresa Borgstena e o Instituto Superior Politécnico de Viseu é também uma mais-valia para as instituições envolvidas.ABSTRACT: Since the beginning of industrialization in Portugal that car production assumed a great importance in its economic development. Since then, despite the crisis, this setor continues to be outstanding in the Portuguese GDP and consequently strategically important for the country. As a very demanding sector, quality in car production can’t be minimized, since it leads producers and suppliers to high investments in this area. The constant evolution of car technology can be seen in the speed of the emergence of new models with more efficient engines, with improved performance materials and innovative solutions. All this is required by the competition in the setor and by the final costumer demand. Investing in quality is also crucial for security reasons, because a failure may cause high costs (such as car “Recalls”) and, in extreme cases, road accidents with serious consequences. The objective of this project is, as the title indicates, the optimization of an automatic defects system, to be implemented in the company Borgstena Textile Portugal, located in Nelas, district of Viseu. This already installed system optimization will reduce time and costs and will improve significantly quality and production systems of the company. It was a personal goal to undertake the project in a company that involved the two mentioned areas, either because I like the car sector, either because of the importance of quality in a company. The development of this project allows the establishment of a partnership between Borgstena and Instituto Politécnico de Viseu, which is also an asset for both institutions

FUNNY GAMES E A NÃO RELAÇÃO DE CAUSALIDADE NOS FILMES DE MICHAEL HANEKE

A proposta desteartigo é problematizar a relação entre as histórias trágicas contadas nos filmes de Michael Hanekee o espectador que, ao se deparar com diversas perguntas lançadas nestas películas,fica sem respostas. Há um consenso nos estudos, críticas e resenhas dos filmes deste diretor de que neles existe uma unidade precisa de forma e conteúdo. Um plano ligado a outro. Um detalhe aparentemente desprovido de importância que surge no início será significado no decorrer da história. Não há perda de energia dramática. Especificamente em Funny Games(1997), personagens que falam aos espectadores olhando diretamente para a câmera, rebobinam uma cena com o controle remoto alterando totalmente o desenrolar da história e trocam de nomes entre si, levantam questões a respeito da forma e da ética do filme. Essas peripécias narrativas, isoladamente, não são inovadoras, mas todas elas no mesmo filme formam um conjunto de artifícios para atingir o espectador, incomodando-o, desestabilizando-o, desejo confesso e marcante do diretor em todas as suas obras

Currently used systems of dental posts for endodontic treatment

An advanced stage of a tooth decay promotes an extremely damaged tooth that needs endodontic treatment to be restored. When satisfactory coronal tooth structure remains, an artificial crown can be placed without a post. On the other hand, the treatment of seriously damaged teeth often require an endodontic post. The main reason for using post is to enable rebuilding of the tooth structure prior to crown restoration. Dentists believe that endodontic posts provide a stable and solid restoration of the tooth, as well as providing strengthening of the tooth root, which constitutes the solid basis for a dental crown restoration. However, some authors reported that the strength of the tooth is directly related to the remaining dentin, and because of that, an endodontic treatment can present a higher risk of biomechanical failure. A number of different materials have been used for the manufacturing of dental posts. The fundamental posts requirements include high tensile strength, high fatigue resistance to occlusal and shear loading and a good distribution of the forces affecting the tooth root. The purpose of this article is to review the current literature and identify the various characteristics of a dental post, as well as some principles on the endodontic treatment for tooth decay.info:eu-repo/semantics/publishedVersio