Perpignan – Ruscino

Le sondage a été motivé par un projet de réfection du mur très dégradé soutenant le talus du site archéologique, en bordure nord de la parcelle DV143 (à une dizaine de mètres de la limite des fouilles programmées du quartier d’habitat antique menées de 1976 à 1990 par G. Barruol puis R. Marichal). Le mur surplombe le chemin d’accès au Mas Ramon où les fouilles de D. Henry révélèrent au milieu du xixe s. la présence de bassins interprétés comme les thermes publics. Long d’environ 35 m, il s’ap..

Soil macroinvertebrate communities: A world-wide assessment

© 2022 The Authors. Global Ecology and Biogeography published by John Wiley & Sons Ltd. This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial License, which permits use, distribution and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited and is not used for commercial purposes.[Aim] Macroinvertebrates comprise a highly diverse set of taxa with great potential as indicators of soil quality. Communities were sampled at 3,694 sites distributed world-wide. We aimed to analyse the patterns of abundance, composition and network characteristics and their relationships to latitude, mean annual temperature and rainfall, land cover, soil texture and agricultural practices.[Location] Sites are distributed in 41 countries, ranging from 55° S to 57° N latitude, from 0 to 4,000 m in elevation, with annual rainfall ranging from 500 to >3,000 mm and mean temperatures of 5–32°C.[Time period] 1980–2018.[Major taxa studied] All soil macroinvertebrates: Haplotaxida; Coleoptera; Formicidae; Arachnida; Chilopoda; Diplopoda; Diptera; Isoptera; Isopoda; Homoptera; Hemiptera; Gastropoda; Blattaria; Orthoptera; Lepidoptera; Dermaptera; and “others”.[Methods] Standard ISO 23611-5 sampling protocol was applied at all sites. Data treatment used a set of multivariate analyses, principal components analysis (PCA) on macrofauna data transformed by Hellinger’s method, multiple correspondence analysis for environmental data (latitude, elevation, temperature and average annual rainfall, type of vegetation cover) transformed into discrete classes, coinertia analysis to compare these two data sets, and bias-corrected and accelerated bootstrap tests to evaluate the part of the variance of the macrofauna data attributable to each of the environmental factors. Network analysis was performed. Each pairwise association of taxonomic units was tested against a null model considering local and regional scales, in order to avoid spurious correlations.[Results] Communities were separated into five clusters reflecting their densities and taxonomic richness. They were significantly influenced by climatic conditions, soil texture and vegetation cover. Abundance and diversity, highest in tropical forests (1,895 ± 234 individuals/m2) and savannahs (1,796 ± 72 individuals/m2), progressively decreased in tropical cropping systems (tree-associated crops, 1,358 ± 120 individuals/m2; pastures, 1,178 ± 154 individuals/m2; and annual crops, 867 ± 62 individuals/m2), temperate grasslands (529 ± 60 individuals/m2), forests (232 ± 20 individuals/m2) and annual crops (231 ± 24 individuals/m2) and temperate dry forests and shrubs (195 ± 11 individuals/m2). Agricultural management decreased overall abundance by ≤54% in tropical areas and 64% in temperate areas. Connectivity varied with taxa, with dominant positive connections in litter transformers and negative connections with ecosystem engineers and Arachnida. Connectivity and modularity were higher in communities with low abundance and taxonomic richness.[Main conclusions] Soil macroinvertebrate communities respond to climatic, soil and land-cover conditions. All taxa, except termites, are found everywhere, and communities from the five clusters cover a wide range of geographical and environmental conditions. Agricultural practices significantly decrease abundance, although the presence of tree components alleviates this effect.Peer reviewe

Proteins-nanoparticles interactions : influence of emerging factors affecting the protein corona formation

Les nanoparticules sont de plus en plus présentes dans notre quotidien et leur présence dans les organismes vivants est aujourd’hui avérée. Aussi, dans un milieu biologique, des protéines recouvrent spontanément la surface des nanoparticules pour former une couronne de protéines. Suivant la composition de cette couronne, une nanoparticule acquiert une "identité biologique" spécifique qui peut conditionner sa biodistribution ainsi que son éventuelle toxicité.De nombreuses zones d’ombre persistent quant à la connaissance des mécanismes d’adsorption des protéines sur les nanoparticules. Deux caractéristiques physico-chimiques, peu abordées jusqu’à maintenant, ont été étudiées ici : la taille des protéines et la présence de modification post-traductionnelles. Aussi, du fait de leur forte utilisation, nous nous sommes concentrés sur les nanoparticules de silice (SiNPs).L’adsorption d’hémoprotéines, de nature similaire mais de tailles différentes, sur des SiNPs, elles-mêmes de tailles différentes, a été étudiée. Les isothermes d’adsorption et les titrations calorimétriques ont notamment montré qu’il existe une relation entre la taille des protéines et leur affinité pour une surface de silice. Des différences plus fines ont aussi pu être observées selon la taille des nanoparticules. Une analyse structurale des protéines adsorbées a également été effectuée par dichroïsme circulaire et diffusion de neutrons aux petits angles. Les hémoprotéines apparaissent comme des protéines très structurées qui sont peu affectées par l’adsorption. Cependant, bien que la structure quaternaire soit conservée, des modifications structurales sont observables.Des études faites en présence de mélanges de protéines (extraits de protéines de levure) ainsi que de peptides de synthèse ont également montré le rôle important de la diméthylation asymétrique de l’arginine sur l’interaction protéines/SiNPs. L’utilisation d’un panel de techniques expérimentales et de simulations a permis de comprendre le mécanisme responsable de la forte affinité de peptides contenant cette méthylation particulière. De façon plus générale, nos travaux suggèrent que les modifications post-traductionnelles peuvent influencer notablement les interactions de biomolécules avec des surfaces minérales.Nanoparticles are ubiquitous in our environment and their presence inside our bodies is now established. Besides, in a biological medium, nanoparticles are spontaneously covered by proteins that form the so-called protein corona. Depending on the corona composition, a nanoparticle will possess a specific "biological identity" conditioning its biodistribution as well as its potential toxicity.Despite being highly studied, many aspects of the protein adsorption mechanisms remain unknown. Here we particularly focused on the influence of two physicochemical characteristics, which had rarely been addressed: protein size and post-translational modifications. Also, because of their intensive use, we worked on silica nanoparticles (SiNPs).We studied the adsorption of hemoproteins on SiNPs, both of them having different sizes. Adsorption isotherms and calorimetry studies showed a relationship between the protein size and its affinity towards silica surfaces. Finer differences could also be observed by varying the SiNPs size. Additionally, structural analyses of adsorbed proteins were performed using circular dichroism and small-angle neutron scattering. The adsorption of hemoproteins, which are well-structured proteins, seems to have little effects on their structure. However, even though the quaternary structure is maintained, structural modifications can be seen.Using yeast protein extracts and synthetic peptides, the major role of arginine asymmetric dimethylation on proteins/SiNPs interaction could be established. The use of experimental and simulation techniques allowed us to understand the mechanism responsible for the high affinity of peptides having this peculiar methylation. As a whole, this work suggests that post-translational modifications can influence considerably the interactions between biomolecules and mineral surfaces

Interactions protéines et nano-particules

International audienc

Interactions protéines-nanoparticules : émergence de nouveaux facteurs déterminant la formation de la couronne de protéines

Nanoparticles are ubiquitous in our environment and their presence inside our bodies is now established. Besides, in a biological medium, nanoparticles are spontaneously covered by proteins that form the so-called protein corona. Depending on the corona composition, a nanoparticle will possess a specific "biological identity" conditioning its biodistribution as well as its potential toxicity.Despite being highly studied, many aspects of the protein adsorption mechanisms remain unknown. Here we particularly focused on the influence of two physicochemical characteristics, which had rarely been addressed: protein size and post-translational modifications. Also, because of their intensive use, we worked on silica nanoparticles (SiNPs).We studied the adsorption of hemoproteins on SiNPs, both of them having different sizes. Adsorption isotherms and calorimetry studies showed a relationship between the protein size and its affinity towards silica surfaces. Finer differences could also be observed by varying the SiNPs size. Additionally, structural analyses of adsorbed proteins were performed using circular dichroism and small-angle neutron scattering. The adsorption of hemoproteins, which are well-structured proteins, seems to have little effects on their structure. However, even though the quaternary structure is maintained, structural modifications can be seen.Using yeast protein extracts and synthetic peptides, the major role of arginine asymmetric dimethylation on proteins/SiNPs interaction could be established. The use of experimental and simulation techniques allowed us to understand the mechanism responsible for the high affinity of peptides having this peculiar methylation. As a whole, this work suggests that post-translational modifications can influence considerably the interactions between biomolecules and mineral surfaces.Les nanoparticules sont de plus en plus présentes dans notre quotidien et leur présence dans les organismes vivants est aujourd’hui avérée. Aussi, dans un milieu biologique, des protéines recouvrent spontanément la surface des nanoparticules pour former une couronne de protéines. Suivant la composition de cette couronne, une nanoparticule acquiert une "identité biologique" spécifique qui peut conditionner sa biodistribution ainsi que son éventuelle toxicité.De nombreuses zones d’ombre persistent quant à la connaissance des mécanismes d’adsorption des protéines sur les nanoparticules. Deux caractéristiques physico-chimiques, peu abordées jusqu’à maintenant, ont été étudiées ici : la taille des protéines et la présence de modification post-traductionnelles. Aussi, du fait de leur forte utilisation, nous nous sommes concentrés sur les nanoparticules de silice (SiNPs).L’adsorption d’hémoprotéines, de nature similaire mais de tailles différentes, sur des SiNPs, elles-mêmes de tailles différentes, a été étudiée. Les isothermes d’adsorption et les titrations calorimétriques ont notamment montré qu’il existe une relation entre la taille des protéines et leur affinité pour une surface de silice. Des différences plus fines ont aussi pu être observées selon la taille des nanoparticules. Une analyse structurale des protéines adsorbées a également été effectuée par dichroïsme circulaire et diffusion de neutrons aux petits angles. Les hémoprotéines apparaissent comme des protéines très structurées qui sont peu affectées par l’adsorption. Cependant, bien que la structure quaternaire soit conservée, des modifications structurales sont observables.Des études faites en présence de mélanges de protéines (extraits de protéines de levure) ainsi que de peptides de synthèse ont également montré le rôle important de la diméthylation asymétrique de l’arginine sur l’interaction protéines/SiNPs. L’utilisation d’un panel de techniques expérimentales et de simulations a permis de comprendre le mécanisme responsable de la forte affinité de peptides contenant cette méthylation particulière. De façon plus générale, nos travaux suggèrent que les modifications post-traductionnelles peuvent influencer notablement les interactions de biomolécules avec des surfaces minérales

Le management humain des New Ways of Working: Leçons et enjeux

Sur base des recherches menées dans la cadre de la Chaire laboRH et ailleurs, ainsi que de l'expérience de praticiens de la GRH et des projets NWoW, ce chapitre tire quelques leçons des expériences passées et en cours et identifie une série d'enjeux, pour la pratique et la recherche dans le domaine

Genetic and Imaging Approaches Reveal Pro-Inflammatory and Immunoregulatory Roles of Mast Cells in Contact Hypersensitivity

Contact hypersensitivity (CHS) is a common T cell-mediated skin disease induced by epicutaneous sensitization to haptens. Mast cells (MCs) are widely deployed in the skin and can be activated during CHS responses to secrete diverse products, including some with pro-inflammatory and anti-inflammatory functions. Conflicting results have been obtained regarding pathogenic versus protective roles of MCs in CHS, and this has been attributed in part to the limitations of certain models for studying MC functions in vivo. This review discusses recent advances in the development and analysis of mouse models to investigate the roles of MCs and MC-associated products in vivo. Notably, fluorescent avidin-based two-photon imaging approaches enable in vivo selective labeling and simultaneous tracking of MC secretory granules (e.g., during MC degranulation) and MC gene activation by real-time longitudinal intravital microscopy in living mice. The combination of such genetic and imaging tools has shed new light on the controversial role played by MCs in mouse models of CHS. On the one hand, they can amplify CHS responses of mild severity while, on the other hand, can limit the inflammation and tissue injury associated with more severe or chronic models, in part by representing an initial source of the anti-inflammatory cytokine IL-10