«ΜΟΡΙΑΚΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΙ ΠΟΥ ΚΑΘΟΡΙΖΟΥΝ ΤΗ ΣΧΕΣΗ ΙΙΚΗΣ ΜΟΛΥΝΣΗΣ, ΙΣΤΙΚΗΣ ΝΟΡΜΟΞΙΑΣ ΚΑΙ L-DOPA ΑΠΟΚΑΡΒΟΞΥΛΑΣΗΣ ΓΙΑ ΗΠΑΤΟΤΡΟΠΟΥΣ ΙΟΥΣ»

Η L-Dopa αποκαρβοξυλάση (DDC), η οποία καταλύει τη βιοσύνθεση της κατεχολαμίνης ντοπαμίνης, εκφράζεται στο νευρικό σύστημα και σε 27 ακόμα περιφερικούς ιστούς, όπως το ήπαρ, όπου ο ρόλος της παραμένει άγνωστος. Πρόσφατα, το ένζυμο συσχετίστηκε με το σηματοδοτικό μόριο της PI3K. Στην συγκεκριμένη εργασία επιβεβαιώνεται η συμμετοχή της DDC σε ιικές μολύνσεις και συγκεκριμένα σε μολύνσεις με τον ιό της ηπατίτιδας C. Σε ηπατικά κύτταρα παρατηρήθηκε αρνητική σχέση μεταξύ της DDC και της ιικής αντιγραφής. Ειδικότερα, η ιική αντιγραφή φαίνεται να μειώνει τα επίπεδα του mRNA και τα επίπεδα του 120 kDa πρωτεϊνικού συμπλόκου της DDC, ενώ ταυτόχρονα αυξάνει το 50 kDa πρωτεϊνικό μονομερές της DDC. Η συσσώρευση του 50 kDa DDC μονομερούς είναι PI3K-εξαρτώμενο. Επιπλέον, η ιική μόλυνση δεν αλλάζει το είδος των μεταγράφων DDC που κωδικοποιούνται, ούτε την υποκυτταρική τοπολογία της DDC, ενώ δεν παρατηρείται συνεντοπισμός του ενζύμου με τις θέσεις αντιγραφής του HCV. Η χημική αναστολή της DDC αυξάνει την αντιγραφή και την μολυσματικότητα του HCV. Η μόλυνση με ιό της ηπατίτιδας Β (HBV) είναι η συχνότερη αιτία πρόκλησης χρόνιας ηπατικής νόσου, παρά την ύπαρξη ασφαλών και αποτελεσματικών εμβολίων. Ο καταλληλότερος τρόπος αντιμετώπισης για τη μείωση της νοσηρότητας και θνητότητας από κίρρωση και ηπατοκυτταρικό καρκίνο, είναι η ανάπτυξη αντιικής θεραπείας. Αυτή τη στιγμή δύο κατηγορίες αντιικών παραγόντων χρησιμοποιούνται έναντι της λοίμωξης με HBV: ιντερφερόνες και νουκλεοζιτικοί/νουκλεοτιδικοί αναστολείς του πολλαπλασιασμού του ιού. Ωστόσο, οι ανεπιθύμητες ενέργειες των ιντερφερονών, αλλά και η συνήθης εμφάνιση ανθεκτικών στελεχών του ιού ΗBV κατά τη χρήση των νουκλεοζιτικών αναλόγων, αυξάνουν την ανάγκη για ανάπτυξη νέων αντιικών ουσιών για την αντιμετώπιση της ηπατίτιδας Β. Η ανάπτυξη μηνουκλεοζιτικών βενζιμιδαζολικών αναλόγων παρέχει μία πολλά υποσχόμενη θεραπευτική στρατηγική. Στην προσπάθεια επέκτασης των σχέσεων δομής-δράσης αυτών των μορίων, αξιολογήσαμε τη βιολογική δράση νέων αναλόγων που φέρουν ιμιδαζο[4,5-b]πυριδινικό δακτύλιο, ως πιθανών αναστολέων έναντι του HBV. Κάποια από τα ανάλογα παρουσίασαν αξιόλογη αντιική δράση με χαμηλή κυτταροτοξικότητα.L-Dopa decarboxylase (DDC), the enzyme that catalyzes dopamine biosynthesis, is expressed in the nervous system and 27 more peripheral tissues, including the liver, where its physiological role remains unknown. Recently, this enzyme was related to the signaling PI3K protein. In this study, we show the involvement of DDC in viral infections and more specific with Hepatitis C (HCV) virus. In liver cells we observed negative association between DDC and HCV infection. Specifically, it seems that viral infection reduces DDC mRNA levels and the levels of 120 kDa SDS-resistant immunoreactive DDC complex and increase the intracellular levels of the ~50 kDa DDC monomer. This effect appears to be dependent on the PI3K/AKT pathway. In addition, viral infection doesn’t affect the DDC neuronal/non neuronal types or the distribution of the protein in the cell, while it seems that there is no co-localization of DDC and the viral replicase site. Finally, chemical inhibition of DDC increases viral replication and infectivity. Hepatitis B virus (HBV) infection is the most common cause of chronic liver disease worldwide, despite the availability of safe and effective vaccines. Τhe best way to reduce morbidity and mortality from cirrhosis and hepatocellular carcinoma is with proper antiviral treatment. Currently, two major classes of agents are utilized in chronic hepatitis B: the interferons and the nucleotide analogues. However, the side effects of interferons and the high emergence of HBV drug-resistant strains arising from nucleoside analogues, indicates the clinical need for the discovery of novel classes of antiviral agents for the treatment of hepatitis B. The development of a series of nonnucleoside bezimidazoles is a promising therapeutic strategy. In an effort to contribute to the structure-activity relationship studies we did screening to a number of novel analogues bearing the more purine-like imidazo[4,5-b]pyridine scaffold and investigated their biological activity as potential HBV inhibitors. Some of them showed considerable antiviral effect with low cytotoxicity

Applied optimization and artificial intelligence methods in logistics support

Περίληψη: Η διοικητική μέριμνα αποτελεί σημείο συνάντησης πολλών επιμέρους επιστημών όπως της επιχειρησιακής έρευνας, της πληροφορικής, της στατιστικής, της λογιστικής αλλά και της υπάρχουσας κοινωνικής κατάστασης. Οι επαγγελματίες που θα κληθούν να διοικήσουν θα αντιμετωπίσουν μια σειρά από προβλήματα δομημένα ή αδόμητα, αντιμετωπίσιμα ή όχι, αναμενόμενα ή απροσδόκητα, κρίσιμα ή μικρότερης σημασίας. Το πρώτο βήμα για την επίλυση του προβλήματος είναι η μοντελοποίησή του. Για την μοντελοποίηση και στη συνέχεια την επίλυση αυτών των προβλημάτων έχουν αναπτυχθεί μεθοδολογίες και αλγόριθμοι. Προαπαιτούμενο της επίλυσης είναι η διαχείριση του μεγάλου όγκου πληροφοριών, μη διαχειρίσιμου από έναν άνθρωπο, όσο προετοιμασμένος, μορφωμένος ή έμπειρος και αν είναι. Η ορθή απόφαση δεν είναι πλέον προφανής αλλά απαιτεί μία σειρά πολύπλοκων μαθηματικών υπολογισμών για να βρεθεί. Οι μαθηματικοί υπολογισμοί θα γίνουν με τη χρήση εργαλείων και μεθόδων βελτιστοποίησης. Στη συνέχεια οι υπολογιστές θα «εκπαιδευτούν» με μεθόδους μηχανικής μάθησης ώστε να επιλύουν τέτοιου είδους προβλήματα. Σε αυτή τη διατριβή θα παρατεθούν οι βασικότεροι αλγόριθμοι βελτιστοποίησης και οι εφαρμογές τεχνητής νοημοσύνης που μπορούν να εφαρμοστούν για την ορθή επίλυση των προβλημάτων που αντιμετωπίζει η διοικητική μέριμνα, μαζί με ψευδοκώδικες και παραδείγματα εφαρμογών

Determination of chip compression ratio using a high speed camera

Διπλωματική εργασία που υποβλήθηκε στη σχολή ΜΠΔ του Πολυτεχνείου Κρήτης για την πλήρωση προυποθέσεων λήψης του Διπλώματος Μηχανικού Παραγωγής και Διοίκησης.Περίληψη: Στην εργασία αυτή θα πραγματοποιηθούν πειράματα ορθογωνικής κοπής σε κατεργαζόμενα υλικά, στο πενταξονικό κέντρο κατεργασίας DMU 50 του εργαστηρίου. Όλη η διαδικασία θα καταγράφεται από κάμερα υψηλής ταχύτητας (MotionBLITZ High-Speed Camera) με σκοπό τη μέτρηση του λόγου συμπίεσης του αποβλίττου. Ο λόγος αυτός μπορεί να υπολογισθεί πειραματικά με μεγάλη ακρίβεια μέσα από πολυάριθμες μετρήσεις διαφορετικών συνθηκών κοπής, γεγονός που αποτελεί το σκοπό της παρούσας εργασίας. Τα τελικά αποτελέσματα θα βοηθήσουν στη μελέτη των δυναμικών καταπονήσεων του κοπτικού εργαλείου

Emerging Role of l-Dopa Decarboxylase in Flaviviridae Virus Infections

l-dopa decarboxylase (DDC) that catalyzes the biosynthesis of bioactive amines, such as dopamine and serotonin, is expressed in the nervous system and peripheral tissues, including the liver, where its physiological role remains unknown. Recently, we reported a physical and functional interaction of DDC with the major signaling regulator phosphoinosite-3-kinase (PI3K). Here, we provide compelling evidence for the involvement of DDC in viral infections. Studying dengue (DENV) and hepatitis C (HCV) virus infection in hepatocytes and HCV replication in liver samples of infected patients, we observed a negative association between DDC and viral replication. Specifically, replication of both viruses reduced the levels of DDC mRNA and the ~120 kDa SDS-resistant DDC immunoreactive functional complex, concomitant with a PI3K-dependent accumulation of the ~50 kDa DDC monomer. Moreover, viral infection inhibited PI3K-DDC association, while DDC did not colocalize with viral replication sites. DDC overexpression suppressed DENV and HCV RNA replication, while DDC enzymatic inhibition enhanced viral replication and infectivity and affected DENV-induced cell death. Consistently, we observed an inverse correlation between DDC mRNA and HCV RNA levels in liver biopsies from chronically infected patients. These data reveal a novel relationship between DDC and Flaviviridae replication cycle and the role of PI3K in this process

Modern Use of Traditional Rainwater Harvesting Practices: An Assessment of Cisterns’ Water Supply Potential in West Mani, Greece

Water has always been a driver of human civilization. The first human civilizations thrived in places with an abundance of water, typically nearby large rivers as the Tigris–Euphrates, Yang Che and Nile. The invention and construction of hydraulic infrastructure came only later, in prehistoric times, triggered by the expansion of humanity in water-scarce areas. The ancient Greeks invented impressive hydraulic works and small-scale structures, some of which, such as cisterns, were still fully operational until the 20th century. We present a model that explains the use of cisterns in the water-scarce area of West Mani, which allows us to assess the potential of this traditional rainfall harvesting practice to support the modern water supply needs. To assess the system’s reliability, we employ a long-term simulation of a typical cistern system, using synthetic rainfall series from a stochastic model, and assuming variable water demand on a monthly scale. We show that a proper restoration of the cisterns could be sustainable as a complementary water supply source, decreasing the area’s drinking water cost and increasing the locals’ resilience against water shortages. In addition, we highlight the links between the area’s hydroclimate and its history and discuss the cultural merits of reviving and preserving this centuries-long practice