Occasional essay: upper motor neuron syndrome in amyotrophic lateral sclerosis

The diagnosis of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) requires recognition of both lower (LMN) and upper motor neuron (UMN) dysfunction.1 However, classical UMN signs are frequently difficult to identify in ALS.2 LMN involvement is sensitively detected by electromyography (EMG)3 but, as yet, there are no generally accepted markers for monitoring UMN abnormalities,4 the neurobiology of ALS itself, and disease spread through the brain and spinal cord,.5 Full clinical assessment is therefore necessary to exclude other diagnoses and to monitor disease progression. In part, this difficulty regarding detection of UMN involvement in ALS derives from the definition of ‘the UMN syndrome’. Abnormalities of motor control in ALS require reformulation within an expanded concept of the UMN, together with the neuropathological, neuro-imaging and neurophysiological abnormalities in ALS. We review these issues here

Obtaining efficient collisional engines via velocity dependent drivings

Brownian particles interacting sequentially with distinct temperatures and driving forces at each stroke have been tackled as a reliable alternative for the construction of engine setups. However they can behave very inefficiently depending on the driving used for the worksource and/or when temperatures of each stage are very different from each other. Inspired by some models for molecular motors and recent experimental studies, a coupling between driving and velocities is introduced as an alternative ingredient for enhancing the system performance. Here, the role of this new ingredient for levering the engine performance is detailed investigated from stochastic thermodynamics. Exact expressions for quantities and distinct maximization routes have been obtained and investigated. The search of an optimal coupling provides a substantial increase of engine performance (mainly efficiency), even for large $\Delta T$. A simple and general argument for the optimal coupling can be estimated, irrespective the driving and other model details.Comment: 10 pages, 8 figures, comments are welcom

Efeito da endogamia sobre pesos aos 120 e 210 dias de idade de bovinos da raça Nelore mocho criado no bioma cerrado.

Objetivou-se com este trabalho estudar os efeitos da endogamia sobre pesos calculados aos 120 e 210 dias de idade, em bovinos da raça Nelore pertencentes ao rebanho da Embrapa Cerrados. Os dados foram coletados no período de 1990 a 2010. O coeficiente de endogamia foi calculado por meio do aplicativo MTDFREML. A matriz de parentesco incluiu 23.513 animais, cuja estimativa média e máxima dos animais endogâmicos foi 2,17% e 14,10%, respectivamente. Os resultados indicaram que a endogamia direta provocou redução dos pesos calculados aos 120 e 210 dias de idade, possivelmente, devido à redução na variância genética aditiva. A endogamia é um processo prejudicial para as características de interesse econômico, quando utilizada indiscriminadamente e deve ser utilizada com parcimônia e bastante cuidado ao se promover acasalamentos entre animais consanguíneos

Learning prognostic models using a mixture of biclustering and triclustering: predicting the need for non-invasive ventilation in amyotrophic lateral sclerosis

© 2022 The Author(s). Published by Elsevier Inc. This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)Longitudinal cohort studies to study disease progression generally combine temporal features produced under periodic assessments (clinical follow-up) with static features associated with single-time assessments, genetic, psychophysiological, and demographic profiles. Subspace clustering, including biclustering and triclustering stances, enables the discovery of local and discriminative patterns from such multidimensional cohort data. These patterns, highly interpretable, are relevant to identifying groups of patients with similar traits or progression patterns. Despite their potential, their use for improving predictive tasks in clinical domains remains unexplored. In this work, we propose to learn predictive models from static and temporal data using discriminative patterns, obtained via biclustering and triclustering, as features within a state-of-the-art classifier, thus enhancing model interpretation. triCluster is extended to find time-contiguous triclusters in temporal data (temporal patterns) and a biclustering algorithm to discover coherent patterns in static data. The transformed data space, composed of bicluster and tricluster features, capture local and cross-variable associations with discriminative power, yielding unique statistical properties of interest. As a case study, we applied our methodology to follow-up data from Portuguese patients with Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) to predict the need for non-invasive ventilation (NIV) since the last appointment. The results showed that, in general, our methodology outperformed baseline results using the original features. Furthermore, the bicluster/tricluster-based patterns used by the classifier can be used by clinicians to understand the models by highlighting relevant prognostic patterns.This work was partially supported by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT), Portugal, the Portuguese public agency for science, technology and innovation, funding to projects AIpALS (PTDC/CCI-CIF/4613/2020), LASIGE (UIDB/ 00408/2020 and UIDP/00408/2020) and INESC-ID (UIDB/ 50021/2020) Research Units, and PhD research scholarship (2020.05100.BD) to DFS; and by the BRAINTEASER project which has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme, under the grant agreement No 101017598.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Relações entre o mérito genético dos touros e suas progênies para as características de crescimento, fertilidade e carcaça de bovinos da raça Nelore de provas de ganho em peso a pasto.

Objetivou-se com este estudo predizer os valores genéticos bovinos da raça Nelore provenientes de provas de ganho em peso a pasto e avaliar a relação touro x progênie com base em seus respectivos valores genéticos. As características avaliadas foram peso calculado aos 210 dias (P210), aos 365 dias (P365) e aos 450 dias de idade (P450), ganho médio diário pré desmame e pós desmame (GPPRE e GPPOS), perímetro escrotal aos 365 dias e 450 dias de idade (PE365 e PE450), área de olho de lombo (AOL) e acabamento de carcaça (ACAB), avaliadas no teste de desempenho de touros jovens conduzidos a pasto na Embrapa Arroz e Feijão e Embrapa Cerrados. As analise estatística dos dados foram estimadas por meio do aplicativo SAS e os valores genéticos dos animais foram estimados por meio do programa MTDFREML. Para os inter-relacionamentos genéticos dos touros e de suas respectivas progênies foram realizadas analises de correlação de Spearman e correlação canônica. Os valores de correlação encontrados são de alta magnitude para todas as características avaliadas 0,71 (PE365), 0,67 (PE450), 0,77 (ACAB), 0,73 (AOL), 0,63 (P210), 0,68 (P365), 0,62 (P450), 0,64 (GPPRE), 0,66 (GPPOS). Os valores genéticos e correlações encontrados nesse estudo mostraram que houve relação positiva e crescente entre valor genético dos touros e de suas respectivas progênies. Portanto, a seleção dos melhores touros, tem sido eficientes em termos de progresso genético

Efeito da suplementação com aditivos nutricionais sobre características de crescimento de bovinos da raça Nelore em Testes de Desempenho de Touros Jovens.

Objetivou-se com este estudo avaliar o efeito da suplementação, com diferentes tipos de aditivos, sobre características de crescimento de bovinos da raça Nelore em Testes de Desempenho de Touros Jovens. Foram avaliadas três provas de ganho em peso (PGP 1, PGP 2 e PGP 3). Em cada PGP, foi utilizado um aditivo diferente, tanto no período da seca quanto das águas. Dessa forma, os aditivos utilizados foram: PGP 1, monensina sódica; PGP 2, probiótico; e, PGP 3, virginiamicina. O valor genético dos animais foi predito pelo método da máxima verossimilhança restrita, o qual foi subtraído de sua respectiva pesagem, de forma que todos os animais apresentassem valor genético igual à zero. As análises de dados longitudinais foram realizadas utilizando o método de medidas repetidas no tempo. Os animais suplementados com monensina sódica e virginiamicina apresentaram os maiores pesos médios. Entretanto, os animais alimentados com o aditivo virginiamicina no suplemento, apresentaram maior velocidade de crescimento e desenvolvimento. Portanto, a utilização de virginiamicina promoveu incrementos positivos tanto no peso quando ganho em peso diário dos animais participantes dos Testes de Desempenho de Touros Jovens

Efeito da idade da vaca sobre peso ao nascimento calculado aos 120 e 210 dias de idade de um rebanho de bovinos da raça Nelore.

Este estudo foi realizado com intuito de avaliar o efeito da idade da vaca sobre os pesos de bezerros ao nascimento e calculados aos 120 e 210 dias de idade, de um rebanho de bovinos Nelore, pertencentes à Embrapa Cerrados, manejados em sistema extensivo de criação. Foram realizadas análises de variância para testar o efeito das classes de idade da vaca ao parto sobre as características em estudo. Observou-se efeito significativo da idade da vaca sobre todas as características analisadas. Tanto para peso ao nascer quando para pesos calculados aos 120 e 210 dias de idade, as idades iniciais e finais apresentaram os piores resultados. A idade da vaca ao parto influenciou significativamente as características de peso ao nascimento e calculados aos 120 e 210 dias de idade. Portanto, há necessidade de considerar o efeito da idade da vaca sobre as características produtivas, para que os animais, candidatos à seleção, tenham seus valores genéticos preditos com maior confiabilidade, garantindo assim maximização do ganho genético, por meio da seleção dos melhores reprodutores

Efeito da idade da vaca sobre intervalo de partos e fertilidade real de vacas da raça Nelore.

Este estudo foi realizado com intuito de se avaliar o efeito da idade da vaca sobre o intervalo de partos e fertilidade real de um rebanho de bovinos Nelore, pertencentes à Embrapa Cerrados, manejados em sistema extensivo de criação. Foram realizadas análises de variância para testar o efeito da idade da vaca ao parto, como covariável e análises de regressão a fim de se conhecer a evolução de cada característica em estudo. Observou-se efeito significativo da idade da vaca sobre todas as características analisadas. Houve decréscimo do intervalo de partos à medida que a vaca atingiu idade média de seis anos e após este período houve aumento do intervalo de partos. Em média, para estas características a idade ideal foi por volta dos sete anos de idade. A idade da vaca ao parto influenciou significativamete as características de intervalo de partos e fertilidade real. Portanto, há necessidade de ajustes, por meio de modelos de regressão, das características aos efeitos da idade da vaca como covariável, para que os animais, candidatos à seleção, tenham seus valores genéticos preditos com maior confiabilidade, garantindo assim maximização do ganho genético, por meio da seleção dos melhores reprodutores