Caractérisation des isolats de Phytophthora spp du verger cacaoyers de Côte d’Ivoire

Objectifs : La pourriture brune des cabosses due à Phytophthora spp. est l’affection la plus répandue et la plus importante dans la cacaoculture ivoirienne. Cette étude a été réalisée pour caractériser et identifier les isolats de Phytophthora spp à partir des caractères morphologiques et moléculaires.Méthodologie et résultats : Cinquante isolats provenant des principales zones (Est, Centre-Ouest, et Sudouest) du verger cacaoyers de la Côte d’ivoire ont été isolés à partir de cabosses immatures atteintes de pourriture brune. Les caractères phénotypiques asexués et moléculaires à savoir : la longueur, la largeur, le rapport longueur/largeur des sporocystes, la longueur du pédicelle, la forme et la caducité des sporocystes, le type de colonie et l’analyse des fragments de restriction de l’ADN des régions ITS (Espaceur Interne Transcrit) ont été évalués. Les sporocystes des isolats étudiés apparaissaient très variables dans leur forme d’un isolat à un autre. Ils étaient de forme ovoïde, ellipsoïde, obpyriforme, ovoïde-obpyriforme et arrondis à leur base. Les sporanges des isolats observés étaient caducs donc éparpillés avec un pédicelle court (2,92 ± 1,18 Gm). Les sporanges étaient également variables par leur taille, variant entre 33,25 à 55,00 Gm en longueur et entre 21,99 à 34,37 Gm en largeur avec un rapport longueur/largeur variant de 1,23 à 1,94. Les colonies sur culture carotte-agar brut étaient radiées, striés et/ou stellées, et pétaloïdes. L’amplification par ITS-PCR de l’ADN a généré un fragment spécifique de 900 bp. L’analyse des fragments de restriction obtenus après digestion par les endonucléases (AluI ; PvuII ; HaeIII ;HinfI et MspI) a montré que tous les isolats étudiés appartenaient à l’espèce Phytophthora palmivora.Conclusion et application de résultats : Il ressort de notre étude que la technique PCR-RFLP a été plus discriminante par rapport aux méthodes traditionnelles pour caractériser et identifier les isolats de Phytophthora spp. Les résultats montrent également que la technique PCR-RFLP est un moyen rapide sélectif et fiable dans l’identification des Phytophthora spp. En outre, cette méthode peut être utilisée comme outil de prévention et de gestion dans la lutte contre la pourriture brune des cabosses. Cette étude a confirmé la présence de Phytophthora palmivora comme l’espèce la plus prédominante bien que Phytophthora megakarya ait été récemment découverte dans l’Est du verger cacaoyers.Mots clés : pourriture brune ; sporange ; pédicelle ; papille ; Phytophthora spp ; région ITS ; PCR-RFL

Isolement et identification de microorganismes indigènes de cacaoyères en côte d’ivoire et mise en évidence de leurs effets antagonistes vis-àvis de Phytophthora palmivora, agent de la pourriture brune des cabosses.

En Côte d’Ivoire, avec des pertes de production qui avoisinent 60 % dans certaines régions, la lutte contre la pourriture brune des cabosses du cacaoyer est devenue une priorité. La stratégie préconisée par la recherche est le développement d’une méthode de lutte intégrée, peu onéreuse et compatible avec les préoccupations environnementales. L’une des approches privilégiées de cette stratégie est l’utilisation des antagonistes naturels de Phytophthora sp. Dans cette optique, la biodiversité a été explorée dans l’écosystème de la cacaoyère. Des champignons et des bactéries ont été isolés à partir des sols sous cacaoyères et des cabosses. L’action antagoniste des champignons sur P. palmivora a été évaluée in vitro ainsi que la sensibilité foliaire à P. palmivora sur des disques de feuilles de cacaoyers en présence des bactéries. Les résultats montrent qu’en culture mixte avec P. palmivora, des isolats de Trichoderma sp ont montré un effet fongistatique et fongicide. Une réduction significative des notes de sensibilité selon l’échelle de Blaha a été obtenue avec deux bactéries, appartenant au genre Bacillus. L’étude se poursuit avec l’évaluation de l’efficacité des antagonistes naturels de Phytophthora sp en milieu réel sur le cacaoyer.In Côte d’Ivoire, yield losses due to Phytophthora sp. reach of about 60% in some cocoa growing areas; therefore, the control of cocoa black pod disease has become a priority. The management strategy is based on thedevelopment of an integrated control method which is cost effective and environmentally sound. The emphasis has been put on the use of natural antagonists of Phytophthora sp. Thus, the microbial biodiversity in the cocoa ecosystem has been explored. Fungi and bacteria have been isolated from pods and soil in cocoa farms. The antagonistic effects of these micro-organisms on Phytophthora sp. have been assessed in vitro. In addition, the leaf susceptibility to P. palmivora was assessed on cocoa leaf disks in the presence of the bacteria. The results showed that in a mix culture with P. palmivora, some isolates of Trichoderma sp. showed fungicidal effects. Two bacteria belonging to the genus Bacillus significantly reduced cocoa leaf susceptibility to P. palmivora. The study will continue to assess the efficacy of the potentially effective micro-organisms in the field for the control of the black pod disease.Mots clés : Cacaoyer ; pourriture brune ; Phytophthora ; Trichoderma ; antagoniste

Relationship between five climatic parameters and somatic embryogenesis from sporophytic floral explants of Theobroma cacao L.

To analyse the relationship between climatic parameters and somatic embryogenesis (SE), some favourable and unfavourable periods were identified. Likewise, to optimize SE in unfavourable periods the relationship among 2,4-D/TDZ, SE and year was analysed. Staminodes and petals of six hybrids and two clones as controls were sown in bulk onto three different calli induction media. Minimal temperature, rainfall, maximal temperature, mean temperature, temperature gaps, sunshine and relative humidity as climatic parameters were simultaneously recorded the day of the harvest of flower buds. Student-Fisher’s test at 5% level, Principal Component Analysis and Pearson’s linear correlation at 5%, 1% or 1‰ were used to separate the averages, identify the best climatic parameters and analyse the link between the climate and SE, respectively. The relative humidity and mean temperature were eliminated from the study. The period that spreads out from January to September favoured SE. In favourable periods, the SE variation was independent of that of concentration in 2,4-D/TDZ. This shows that these are the metabolites coming from 2,4-D/TDZ that activate the genes rather than these two compounds themselves. In unfavourable periods, in the first year, the weakest concentration in 2,4- D/TDZ of PCG3 medium favoured SE, while in the second year that is the strongest concentration of PCG4 which increased it. This could indicate an interaction among year, concentration in 2,4-D/TDZ and SE. However, the link thus established is only statistical. It did not allow the quantification of the contribution level of these climatic parameters to variations of SE.Key words: Somatic embryogenesis variations, staminodes, petals, PCG calli induction media, favourable and unfavourable periods. 2,4-D/TDZ concentration in periods

Antagonist potential of Trichoderma indigenous isolates for biological control of Phytophthora palmivora the causative agent of black pod disease on cocoa (Theobroma cacao L.) in Côte d’Ivoire

The biodiversity of Trichoderma isolates from cocoa rhizosphere in cocoa production areas of Côte d’Ivoire, and their antagonist potential with Phytophthora palmivora using in vitro assays and bioassays, were investigated and screened for field trials. A total of 135 isolates were analysed at the species level by using sequence analysis of ITS1 and 2 of the rRNA region and a fragment of translation elongation factor 1a (tef1) gene. Sixty-four isolates were identified as T. virens, 60 as T. harzianum, 7 as T. spirale, two as T. asperellum and two unidentified. Forty-three Trichoderma isolates were in vitro confronted with P. palmivora on agar plates, and their antagonist activity was further evaluated by the damages on leaf discs and detached pods. Twenty-five isolates reduced the mycelial growth of P. Palmivora more than 50%. The isolate T17 assigned to T .virens was the best to reduce mycelium growth upto 97.9%. All of Trichoderma isolates with the exception of isolate T39 reduced foliar sensitivity to P. palmivora. Tweenty-six Trichoderma isolates reduced the pod sensitivity to P. palmivora more than 50%. Based on the combined analysis, T. virens T7, T. harzianum T40, T. asperellum T54 and T. spirale T4 isolates were selected for field trials

Evaluation of cassava hybrids performance obtained by controlled pollination of elite accessions from Niari landscape in the Republic of Congo

Open Access Journal; Published online: 03 May 2018Cassava is the main crop in the Congo but its low yield doesn’t meet the needs of Congolese populations. The low yield is due to the use of less effective sensitive varieties to diseases, non-mastering of techniques and biotic constraint of which the African cassava mosaic. This study aims at selecting resistant genotypes to the African cassava mosaic and assessing their agronomic and production performances. Six elite accessions selected based on a villager participative approach have been crossed by controlled pollination with three clones (192/0401, 192/0325 and 197/0162) distributed by the International Institute for Tropical Agriculture (IITA). Growth, agronomic and production parameters of genotypes from the controlled pollination were evaluated at the station. Of the ten tested genotypes, the one resulting from the crossing (Mahabama x I92/0401) did not show any symptom of the cassava mosaic disease 12 months after planting. Apart from the root length, foliar surface and the height of the plant, this genotype differed from the others only by the biomass, the diameter of the stem, the harvest index, the rate of starch, the rate of dry matter and marketable or non-marketable tuberous roots. The genotype (Mahabama x I92/0401) will be included in the cassava improvement section plan in the Republic of Congo

REVIEW OF MODELING PREFERENCES FOR DECISION MODELS

A group decision problem is set in environments where there is a common issue to solve, a set of possible options to choose, and a set of individuals who are experts and express their opinions about the set of possible alternatives with the intention to reach a collective decision as the unique solution of the problem in question. The modeling of the preferences of the decision-maker is an essential stage in the construction of models used in the theory of decision, operations research, economics, etc. On decision problems experts use models of representation of preferences that are close to their disciplines or fields of work. The structures of information most commonly used for the representation of the preferences of experts are vectors of utility, orders of preference and preference relations. In decision problems, the expression of preferences domain is the domain of information used by the experts to express their preferences, the main are numerical, linguistic, and intervalar stressing the multi-granular linguistic. This paper is a review of these concepts. Its purpose is to provide a guide of bibliographic references for these concepts, which are briefly discussed in this document

Inhibition de Phytophthora palmivora, agent de pourriture brune des cabosses de cacaoyer en Côte d’Ivoire, par Trichoderma sp.

La pourriture brune des cabosses du cacaoyer causée par Phytophthora palmivora entraîne en Côte d’Ivoire 30 % de pertes sur les productions. Actuellement, pour combattre cette maladie, la lutte intégrée est envisagée. Elle inclue les pratiques culturales, la sélection des variétés résistances et l’utilisation des antagonistes contre Phytophthora sp. notamment les espèces du genre Trichoderma. Cette dernière approche nécessite l’isolement, l’établissement d’une collection des Trichoderma issus de la cacaoyère et l’évaluation du potentiel antagoniste de celle-ci pour le choix des antagonistes efficaces à Phytophthora palmivora. A cet effet, des confrontations directes in vitro aussi bien que in vivo sur feuilles et sur cabosses ont été réalisées. Quarante trois isolats de Trichoderma montrent une activité antagoniste vis à vis de Phytophthora palmivora sur milieu de culture, avec des taux d’inhibition de l’ordre de 34 à 79 % mais, aussi réduisent significativement la sensibilité foliaire de 6 clones de cacaoyer et de cabosses. Ces tests in vitro et in vivo ont permis de retenir les isolats T.spirale T4, T.virens T7, T.asperellum T54 et T.harzianum T40 à forte action inhibitrice vis à vis de Phytophthora palmivora, offrant une forte aptitude à réduire la sensibilité et surtout à renforcer la résistance intrinsèque du clone sensible NA32 au parasite. Ces tests d’antagonistes ont permis la sélection des Trichoderma sp. candidats aux essais au champ. La réalisation des essais au champ évaluera l’efficacité en milieu réel des antagonistes naturels sur le développement de la maladie.Cocoa black pod disease in Côte d’ivoire, due to Phytophthora palmivora , can cause crop losses up to 30%. At present, for controlling cocoa black pod rot, an integrated pest management strategie was envisaged, and include cultural pratices, selection for resistant cocoa varieties and biological control microorganisms. The latter approach need isolation, establishment of collection microorganisms found in the cocoa ecology of Côte d’Ivoire and evaluations for their ability to control P. palmivora for screening biocontrol candidates. In vitro direct confrontation also although leaf disc and the cocoa pod biocontrol screening biotest have been carried out. Fortythree of isolates Trichoderma expressed in vitro inhibition against P. palmivora on high-nutrient media, with in the order of 34 à 79 % of inhibition rate but, also were significantly reduced the level of susceptibility of six clones and cocoa pods to P. Palmivora. The isolates T.spirale T4, T.virens T7, T.asperellum T54 et T.harzianum T40 were found to be very effective against P. palmivora by these in vitro and in vivo tests, exhibiting high potential to reduce the susceptibility and especially to reinforce intrinsic resistant susceptible clone (NA32) towards P. palmivora. These screening tests pemitted the selection of Trichoderma isolates candidates for field trials. This field trials will assess for efficacy biocontrol candidates from cacao agrosystems on the evolution of disease.Mots clés : Pourriture brune, Phytophthora palmivora, lutte biologique, Trichoderma sp, cacaoye