Malignant tumors of the eye and adnexa, morbidity and mortality (population-based study)

For the first time in Russia there are presented data on dynamics of morbidity and mortality from malignant tumors of the eye and adnexa (С69). there were demonstrated details of prevalence by age groups of patients, provided characteristics of dynamics of the levels of morphological verification and distribution of patients by stages of tumor process

Characterization of newly isolated lytic bacteriophages active against Acinetobacter baumannii

Based on genotyping and host range, two newly isolated lytic bacteriophages, myovirus vB_AbaM_Acibel004 and podovirus vB_AbaP_Acibel007, active against Acinetobacter baumannii clinical strains, were selected from a new phage library for further characterization. The complete genomes of the two phages were analyzed. Both phages are characterized by broad host range and essential features of potential therapeutic phages, such as short latent period (27 and 21 min, respectively), high burst size (125 and 145, respectively), stability of activity in liquid culture and low frequency of occurrence of phage-resistant mutant bacterial cells. Genomic analysis showed that while Acibel004 represents a novel bacteriophage with resemblance to some unclassified Pseudomonas aeruginosa phages, Acibel007 belongs to the well-characterized genus of the Phikmvlikevirus. The newly isolated phages can serve as potential candidates for phage cocktails to control A. baumannii infections

Состояние онкологической помощи в России: рак тонкого кишечника (С17). Выживаемость больных, медиана выживаемости, выживаемость больных с учетом локализационной, гистологической структуры и стадии заболевания. (Популяционное исследование на уровне федерального округа). Часть II

Background. Small intestine cancer is extremely rare cancer worldwide with an incidence of less than 1.0 per 100,000 population. In 2020, 1,711 cases of small intestine cancer were recorded in Russia, including 781 cases among the male population, and 930 among the female population. It should be noted that in Russia, despite the decrease in the total number of new cancer cases associated with the coronavirus epidemic, the number of patients with small intestine cancer increased by 4.14 % from 2019 to 2020. In the Northwestern Federal district of the Russian Federation, 216 patients with newly diagnosed small intestine cancer were registered in 2020, (29 more patients than in the previous year). The purpose of the study was to analyze the efficiency of small intestine cancer care provision based on of the database of the population cancer Registry (db pcr) of the Northwestern Federal district of the Russian Federation, with an assessment of one- and five-year survival rates. Material and methods. To calculate the survival rates for patients with small intestine cancer, we selected 1922 patients from the database of the pcr of the Northwestern Federal district of the Russian Federation, for the period from 2000 to 2018. Standard methods for calculating survival rates according to the eurocare program were used. Results. The one-year survival rate of small intestine cancer patients increased from 50.0 % to 61.1 % from 2000 to 2018, and the five-year survival rate remained almost unchanged. The relative one-year survival rate of patients was 2.0 % higher. The five-year survival rate for five-year cohorts indicates defects in staging of small intestine cancer rather than an improvement in patient care; although this rate increased from 31.5 to 32.9 %. The histological detail of small intestine cancer according to the icd-10 was investigated. Conclusion. The study confirmed the high mortality rates and modest survival benefits in survival rates in patients with small intestine cancer. Defects in the distribution of patients by disease stages were revealed. The most common histological types of small intestine cancer with calculations of patient survival were identified.Актуальность. Рак тонкого кишечника (РТК) среди населения различных стран мира, в том числе и в России, встречается редко – 1 случай на 100 000 населения. В 2020 г. в России учтено 1 711 случаев РТК, в том числе 781 среди мужского населения и 930 среди женского. Важно отметить, что, несмотря на снижение общего числа зарегистрированных в России новых случаев злокачественных новообразований (ЗНО), связанных с эпидемией коронавируса, число больных РТК с 2019 по 2020 г. возросло на 68 случаев, или на 4,14 %. В СЗФО РФ в 2020 г. было учтено 216 первичных больных РТК, т.е. на 29 больных больше, чем в предыдущем. Цель исследования – впервые в России изучить эффективность деятельности онкологической службы относительно РТК на основе созданной базы данных Популяционного ракового регистра (БД ПРР) СЗФО РФ с расчетами показателей однолетней и пятилетней выживаемости. Материал и методы. Для расчета показателей выживаемости больных РТК мы отобрали из базы данных ПРР СЗФО РФ 1 922 больных, учтенных за период с 2000 по 2018 г. Использованы стандартные методы расчета выживаемости по программе eurocare. Результаты. Уровень 1-летней выживаемости больных с 2000 по 2018 г. возрос с 50,0 до 61,1 %, пятилетняя выживаемость практически не изменилась. Относительная 1-летняя выживаемость больных была на 2,0 % выше. Пятилетняя выживаемость по пятилетним когортам свидетельствует в большей мере о дефектах установления стадии заболевания больных РТК, чем об улучшении лечения больных, хотя этот показатель возрос с 31,5 до 32,9 %, улучшение показателя происходит крайне медленно. Исследована детальная структура РТК по четвертому знаку МКБ-10. Заключение. Проведенное исследование редкой локализации ЗНО – РТК подтвердило высокий уровень летальности больных данной группы ЗНО, скромные успехи динамики показателей выживаемости больных. Выявлены дефекты в распределении больных по стадиям заболевания, отмечены успехи в регистрации данной группы редких локализаций ЗНО, определены ведущие гистотипы опухолей с расчетами выживаемости больных

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ НОВООБРАЗОВАНИЯ КОСТЕЙ. ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬ, СМЕРТНОСТЬ, ДОСТОВЕРНОСТЬ УЧЕТА, ВЫЖИВАЕМОСТЬ БОЛЬНЫХ С УЧЕТОМ ГИСТОЛОГИЧЕСКИХ ФОРМ

Introduction. Standardized (world standard) incidence of malignant tumors of bones (S40,41) does not have has significant fluctuations. According to IARC among male population the most common incidence rates range from 1 to 2 cases per 100.000 and among female population – from 0.5 to 1.0 among women.  Purpose of study. To study dynamics of morbidity and mortality from malignant tumors of bones, the quality of estimation, observed and relative survival of patients according to histological forms. The work of this level is held in Russia for the first time. Material and methods of study. There were used an open world and domestic sources to estimate the prevalence of malignant tumors of bones, databases of population-based cancer registers, classical methods of population-based estimation of the prevalence of malignant tumors of bones. results of study. The basis of this work is data from the Population-based Cancer Registry of St. Petersburg and special studies being held before its establishing in 1993. Annually in St. Petersburg there are registered 40–60 primary cases of malignant tumors of bones (S40, 41). The level of morphological verification of these malignancies in Russia is 82.1 %, in St. Petersburg – 84.9 %. There is a high rate of undefined stage: in Russia – 19.7 %, in St. Petersburg – 24.5 %, in Moscow – 23.5 %. During the first year of observation 27.3 % of patients die in Russia, 21.7 % in St. Petersburg, and 11.1 % in Moscow. In comparison with the average data (Eurocare program) the relative survival of patients in St. Petersburg is significantly lower: in men (St. Petersburg – 42.2–48.2 %, (Eurocare-3,4 – 55–58 %), in women (St. Petersburg – 32.2–54.6 % (Eurocare – 59–63 %). conclusion. Thus, in this work for the first time in Russia it is showed dynamics of absolute and relative incidence rates of malignant tumors of bones since 1980 by sex and age-specific indicators. It is presented a set of analytical indicators, the level of morphological verification, one-year mortality as well as observed and relative survival. For the first time it is provided dynamics of a 5-year survival of patients with malignant tumors of bone in accordance with the histological forms. There is marked a growth of a 5-year survival rates of patients with chondrosarcoma and osteosarcoma.Введение. Стандартизованный (мировой стандарт) показатель заболеваемости населения злокачественными новообразованиеми костей (С40, 41) не имеет значительных колебаний. По данным Международного агентства по изучению рака, уровни заболеваемости колеблются от 1 до 2 случаев на 100 000 мужского и от 0,5 до 1,0 на 100 000 женского населения. Цель исследования. Изучить динамику заболеваемости и смертности населения от злокачественных новообразований костей, качество учета, наблюдаемую и относительную выживаемость больных с учетом гистологических форм опухолей. Материал и методы. Основой работы являются данные Популяционного ракового регистра г. Санкт-Петербурга и проводимых до его создания в 1993 г. исследований. Использованы открытые мировые и отечественные источники для оценки распространенности злокачественных новообразований костей, базы данных Популяционных раковых регистров, классические методы популяционной оценки распространенности злокачественных новообразований костей. результаты исследования. В г. Санкт-Петербурге ежегодно регистрируется 40–60 первичных случаев злокачественных новообразований костей (С40, 41). Уровень морфологической верификации ЗНО костей по России – 82,1 %, в г. Санкт-Петербурге – 84,9 %. Высок процент по России числа больных с неуточненной стадией заболевания – 19,7 %, в г. Санкт-Петербурге он еще выше – 24,5 %, в г. Москве – 23,5 %. На первом году наблюдения в России погибают 27,3 % больных, в г. Санкт-Петербурге – 21,7 %, в г. Москве – 11,1 %. В сравнении со среднеевропейскими данными (программа Eurocare- 3,4, 2003 г.), относительная выживаемость больных в г. Санкт-Петербурге (1994–1997, 1998–2001 гг.) существенно ниже: мужчин 42,2–48,2 %, (Eurocare-3, 4 – 55–58 %); женщин 32,2–54,6 % (Eurocare – 59–63 %). заключение. В данной работе впервые в России представлена динамика абсолютных и относительных показателей заболеваемости населения злокачественными новообразованиями костей с 1980 г. с учетом пола и повозрастных показателей. Представлен комплекс аналитических показателей, уровень морфологической верификации, одногодичная летальность, наблюдаемая и относительная выживаемость. Впервые представлена динамика 5-летней выживаемости больных ЗНО костей с учетом гистологических форм опухолей. Отмечен рост показателей 5-летней выживаемости больных с хондросаркомой и остеосаркомой

Phenotypic and genotypic variations within a single bacteriophage species

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Although horizontal gene transfer plays a pivotal role in bacteriophage evolution, many lytic phage genomes are clearly shaped by vertical evolution. We investigated the influence of minor genomic deletions and insertions on various phage-related phenotypic and serological properties.</p> <p>Findings</p> <p>We collected ten different isolates of <it>Pseudomonas aeruginosa </it>bacteriophage ϕKMV. All sequenced genomes (42-43 kb, long direct terminal repeats) are nearly identical, which intuitively implied strongly similar infections cycles. However, their latent periods vary between 21 and 28 minutes and they are able to lyse between 5 and 58% of a collection of 107 clinical <it>P. aeruginosa </it>strains. We also noted that phages with identical tail structures displayed profound differences in host spectra. Moreover, point mutations in tail and spike proteins were sufficient to evade neutralization by two phage-specific antisera, isolated from rabbits.</p> <p>Conclusion</p> <p>Although all analyzed phages are 83-97% identical at the genome level, they display a surprisingly large variation in various phenotypic properties. The small overlap in host spectrum and their ability to readily escape immune defences against a nearly identical phage are promising elements for the application of these phages in phage therapy.</p