Ictal and interictal MEG in pediatric patients with tuberous sclerosis and drug resistant epilepsy

Purpose: Drug resistant epilepsy (DRE) is common in patients with tuberous sclerosis (TS). Interictal MEG has been shown as a valuable instrument in the presurgical workup. The goal of our study was to evaluate the role of ictal MEG in epileptogenic tuber selection, especially in patients with multiple irritative zones. Methods: The clinical and MEG data of 23 patients with TS and DRE from two medical/research centers were reviewed. Seven pediatric patients, who had seizures during MEG recording and underwent resection or disconnection surgery, were included into the study. Cortical sources of ictal and interictal epileptiform MEG discharges were compared with epileptogenic zone location in six patients with favorable surgery outcome. Results: In patients who improved substantially after surgery all resected and several other tubers demonstrated epileptiform activity on interictal MEG. Ictal MEG provided crucial information about lobar location of the seizure onset zone (SOZ) in two cases, and in the other four it confirmed the SOZ location derived from the interictal data. In one case, ictal MEG findings were unreliable. In one patient, who did not benefit from surgical treatment, the resected tubers did not overlap with interictal and ictal MEG sources. Conclusion: The combination of interictal and ictal MEG is a valuable tool for identification of the epileptogenic tuber/tubers in presurgical work-up in patients with TS.Peer reviewe

Etiological Structure and its Dynamics for the Period from 1999 to 2008 according to Sverdlovsk Regional Hepatological Center data

The purpose of this study is to estimate the etiology of liver cirrhosis, age characteristics of the patients with advanced live diseases in Sverdlovsk Region for the 10 years period. The objects of the research were 1033 patients, hospitalized at the inpatient department of Sverdlovsk Regional Hepatological Center. The results revealed three most often etiological groups among liver cirrhotic patients: viral etiology - 30%, cholestatic liver diseases - 28% and alcohol etiology- 22%.Цирроз печени ( ЦП) прогрессирующие заболевание с высокой летальностью. Целью настоящего исследования был анализ этиологической структуры в зависимости от возраста и динамик распространенности ЦП за период 1999г. - 2008г. по данным Свердловского областного гепатологического центра набазе ГУЗ «С0КБ№ 1» В исследование включено 1033 пациента с ЦП, поступившее в ОГЦ центр за период с 1999г. по 2008г. Критериями включения больных в исследования были: наличие портальной гипертензии и печеночно-клеточной недостаточности, а также данных обследования с целью уточнения этиологической формы ЦП. Вирусные ЦП (HBV+HCV) составляют 30 % от общего числа госпитализированных больных с циррозом печени, холестатические заболевания печени - 28 % и алкогольные ЦП - 22% за период с 1999г по 2008 г. Рост ЦП за исследуемый период составил: вирусного генеза HCV+HBV в 2,2 раза, алкогольного в 2,9 раза, холестатические заболевания печени выросли в 1,58 раза. Вирусные поражения печени выявляются в любой возрастной группе и преобладают над остальными причинами ЦП в группах 20-29лет, 50-69 лет. Холестатические заболевания распространены больше в возрасте 40-49 лет. Алкогольные ЦП чаще диагностируются в 40-59 лет. По полученным данным, самой частой причиной ЦП является вирусное поражение (30% от общего количества больных с ЦП). За десятилетний период отмечается выраженный рост алкогольных поражений печени в 2,9 раза. Вирусные ЦП преобладают над другими причинами ЦП в возрасте 20-29 лет, 50-59 лет Алкогольными ЦП страдают люди наиболее трудоспособного возраста

Histological classification of mesial temporal sclerosis

Mesial temporal sclerosis (MTS) is the most common histopathology occurring in patients with drug-resistant temporal lobe epilepsy. Over the past decades, there have been various attempts to classify the variants of hippocampal neuronal cell loss in relation to postoperative outcome. However, no consensus on the common international definition and classification of MTS has been reached. The article describes the modern histological classification based on a semiquantitative hippocampal cell loss model. The publications dealing with the histological classification of mesial temporal sclerosis are reviewed

СТРУКТУРА ВИРУСНЫХ ТРИГГЕРОВ ФЕБРИЛЬНЫХ ПРИСТУПОВ У ДЕТЕЙ РАННЕГО ВОЗРАСТА

The study presents the results of clinical and laboratory observations 121 children aged 3 to 36 months with the diagnosis «ARVI with convulsive syndrome».  The prevalence of patients with burdened hereditary anamnesis for the development of febrile seizures (FS) (31.4 ± 4.2%). During the laboratory examination along with the respiratory viruses group noted the high herpes virus infection (51.2%), particularly human herpes virus 6 type (of 38.7%). The extension of the spectrum of the diagnostic examination of children  with FS will establish  the role of infectious triggers in the occurrence of FS and thereby define rational tactics and dispensary observation of this group of patients.В работе представлены результаты клинико-лабораторного наблюдения 121 ребенка в возрасте от 3 до 36 мес., госпитализированных в стационар с диагнозом «ОРВИ, судорожный синдром». Преобладали пациенты с отягощенным наследственным анамнезом по развитию фебрильных приступов (ФП) (31,4 ± 4,2%). При проведении лабораторного обследования, наряду с вирусами респираторной группы, отмечена высокая инфицированность герпесвирусами (51,2%), в частности вирусом герпеса человека 6-го типа (ВГЧ-6) (38,7%). Расширение диагностического спектра обследования детей позволит установить роль инфекционных триггеров в возникновении ФП и тем самым определит рациональную тактику ведения и диспансерного наблюдения данной группы пациентов

Мутации изоцитратдегидрогеназ 1 и 2 и ме тилирование гена MGMT в глиомах

Gliomas are the most common brain tumors. It is difficult to detect them at early stages of disease and there is a few available therapies providing significant improvement in survival. Mutations of isocitrate dehydrogenase 1 and 2 genes (IDH1 and IDH2) play significant role in gliomogenesis, diagnostics and selection of patient therapy. We tested the distribution of IDH1 and IDH2 mutations in gliomas of different histological types and grades of malignancy by DNA melting analysis using our protocol with a sensitivity of 5 %. The results of this assay were confirmed by conventional Sanger sequencing. IDH1/2 mutations were detected in 74 % of lower grade gliomas (II and III, World Health Organization) and in 14 % of glioblastomas (IV, World Health Organization). Mutation rate in gliomas with oligodendroglioma component were significantly higher then in other glioma types (р = 0.014). The IDH1 mutations was the most common (79 % of general mutation number). IDH1/2 mutations can induce aberrant gene methylation. Detection of methylation rate of the gene encoding for O6-methylguanine-DNA-methyltransferase (MGMT), predictive biomarker for treatment of gliomas with the alkylating agents, has demonstrated a partial association with IDH1/2 mutations. In 73 % of IDH1/2-mutant tumors MGMT promoter methylation were observed. At the same time IDH1/2 mutations were not revealed in 67 % tumors with MGMT promoter methylation. These results indicate existence of another mechanism of MGMT methylation in gliomas. Our data strong support for necessity of both markers testing when patient therapy is selected.Глиомы – наиболее распространенные опухоли головного мозга, трудно поддающиеся ранней диагностике и лечению. Мутации в генах изоцитратдегидрогеназ 1 и 2 (IDH1 и IDH2) играют существенную роль в глиомогенезе, диагностике и выборе терапии пациентов. Было исследовано распределение мутаций IDH1 / 2 в глиомах различных гистологических типов и степеней злокачественности методом анализа кривых плавления ДНК с зондами TaqMan по разработанному нами протоколу, позволяющему определять мутации с чувствительностью 5 %. Специфичность определения мутаций подтверждена секвенированием по Сэнгеру. В глиомах II и III степеней злокачественности по классификации Всемирной организации здравоохранения частота мутаций IDH1 / 2 составила 74 %, в глиобластомах (IV степень злокачественности) – 14 %. Глиомы, содержащие клетки с олигодендроцитарным типом дифференцировки, достоверно чаще имели мутации IDH1 / 2, чем другие типы глиом (р = 0,014). Преобладающим типом мутаций являются мутации IDH1 (79 % от общего числа мутаций). Одно из последствий мутаций IDH1 / 2 – индукция аберрантного метилирования генов. Анализ метилирования промотора гена О6‑метилгуанин-ДНК-метил-трансферазы (MGMT, O6‑methylguanine-DNA-methyltransferase), предсказательного маркера чувствительности глиом к терапии алкилирующими агентами у тех же больных, показал частичную ассоциацию с мутациями IDH1 / 2. В 73 % случаев с мутациями IDH1 / 2 наблюдалось метилирование MGMT. В то же время в 67 % случаев с метилированием MGMT отсутствовали мутации IDH1 / 2, что указывает на существование других механизмов метилирования MGMT в глиомах. Данные свидетельствуют в пользу необходимости одновременного определения 2 биомаркеров при выборе послеоперационной терапии пациентов

Молекулярно-биологические подтипы рака молочной железы у носителей мутаций в гене BRCA1

Background. According to the literature, BRCA1-associated breast cancer (BC) most often belongs to the triple negative (TNBC) molecular subtype. The data on the contribution of other molecular subtypes to this group of patients differ among different studies.The study objective is to evaluate the frequency of different tumor molecular subtypes in BC patients with BRCA1 gene mutation treated in N. N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology in the period from 2017 to 2020.Materials and methods. The study included BC patients with a mutation in the BRCA1 gene (n = 209) identified as a result BRCA1 mutation screening of patients with BC. DNA diagnostics was carried out on blood samples of patients using the real-time polymerase chain reaction method. After analyzing the patients primary documentation clinical and morphological data were taken into account: the age of diagnosis, the stage of the disease, the results of immunohistochemical studies (estrogen receptor status, progesterone receptor status, HER2 expression, Ki-67 proliferation index). The assignment to the particular molecular tumour subtypes was performed according to estrogen receptor status, progesterone receptor status, HER2 status and Ki67 value.Results. Clinical and pathomorphological data of 209 patients with BRCA1-associated BC were analyzed. The age at diagnosis ranged from 23 to 72 years, the median age was 40 years, the mean age was 41.46 ± 9.82 years. BC associated with BRCA1 was found to be TNBC in 71.3 % and luminal B, HER2 negative (LumB–) in 19.1 % of the cases. Other tumour subtypes were much less common: luminal B, HER2 positive (LumB+) in 7.2 %, luminal A (LumA) in 1 % and HER2-positive (HER2+) in 1.4 % of the cases. The frequency of subtypes was estimated in different age groups (1st – patients 23–34 (n = 53), 2nd – 35–49 (n = 111), and 3rd – 50–72 (n = 45) years old). TNBC frequency was 81.1 % in the 1st group, 73.9 % in the 2nd and 53.4 % in the 3rd group; LumB– frequency was 15.1, 15.3 and 33.3 % respectively. Using the Fisher test it was shown that the differences in frequencies were statistically significant between groups 1st and 3 rd, as well as between groups 2 nd and 3 rd (p <0.05).Conclusion. TNBC was the main molecular subtype in all age groups of BC patients with BRCA1 germinal mutation, TNBC frequency was lower in the older age group. LumB– subtype was also common in BRCA1-associated tumors especially in older women.Введение. По данным опубликованных исследований, BRCA1-ассоциированный рак молочной железы (РМЖ) наиболее часто относится к тройному негативному молекулярному подтипу (triple-negative breast cancer, TNBC). Данные о соотношении других молекулярных подтипов среди этой группы пациентов различаются у разных авторов.Цель исследования – оценить частоту различных молекулярно-биологических подтипов опухолей в российской группе больных РМЖ с мутацией в гене BRCA1, находившихся на лечении в НМИЦ онкологии им. Н. Н. Блохина в период с 2017 по 2020 г.Материалы и методы. В исследование были отобраны пациенты с РМЖ с наличием мутации в гене BRCA1 (n = 209), выявленной в результате ДНК-диагностики при скрининге больных РМЖ. Для выявления герминальной мутации использовали ДНК пациентов, выделенную из лимфоцитов периферической крови, анализ проводили методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. При анализе первичной документации больных были учтены клинико-морфологические данные: возраст постановки диагноза, стадия заболевания, результаты иммуногистохимического исследования (статус рецепторов эстрогена и прогестерона, HER2 и индекс пролиферации Ki-67). На основании оценки статуса рецепторов эстрогена и прогестерона, экспрессии HER2 и значения Ki-67 определена частота 5 молекулярных подтипов опухолей.Результаты. Проведен анализ клинических и патоморфологических данных 209 пациентов с BRCA1-accоциированным РМЖ. Возраст постановки диагноза варьировал в диапазоне 23–72 лет (медиана 40 лет; среднее значение 41,46 ± 9,82 года). РМЖ, ассоциированный с BRCA1, в 71,3 % случаев относился к TNBC, в 19,1 % – к люминальному В, HER2-отрицательному (LumB–). Другие подтипы опухолей встречались значительно реже: люминальный В, HER2-положительный (LumB+) – в 7,2 % случаев, люминальный А (LumA) – в 1,0 %, HER2-положительный (HER2+) – в 1,4 %. Проведена оценка встречаемости подтипов в разных возрастных подгруппах: 1-я – больные в возрасте 23–34 лет (n = 53); 2-я – 35–49 лет (n = 111); 3-я – 50–72 лет (n = 45). Частота TNBC составила 81,1 % в 1-й подгруппе, 73,9 % – во 2-й и 53,4 % – в 3-й; частота LumB– составила 15,1; 15,3 и 33,3 % соответственно. При использовании критерия Фишера показано, что различия в частотах между 1-й и 3-й, а также между 2-й и 3-й подгруппами статистически значимы (p <0,05).Заключение. Во всех возрастных подгруппах пациентов с РМЖ, имеющих герминальную мутацию в гене BRCA1, основным молекулярным подтипом является TNBC, частота встречаемости которого ниже в старшей возрастной подгруппе. Подтип LumB– также характерен для BRCA1-ассоциированных опухолей, особенно у женщин старшего возраста

Treatment of children with medulloblastoma without metastatic involvement in the age group older than 3 years: international experience and results of intercenter trial

Background. During the past 20 years, some large international studies have been conducted that evaluated the effectiveness of treatment programs for children with medulloblastoma. At the same time, in the standard risk group, fairly high rates of 5-year overall survival (OS) and event-free survival (EFS) were achieved, which amounted to 85% and 80%, respectively. At the present time some risk-adaptive therapeutic programs are developed according to molecular-biological features of tumor cells and possibility of chemotherapy and craniospinal radiation (CSI) therapy dose reduction. Materials and methods. From 2008 to 2018 fifty one pediatric patients with primary diagnosed medulloblastoma in the age group 318 years were included in trial, 38 in standard risk group, 13 in high risk group (without metastatic disease). Treatment program consisted of surgical removal of the primary tumor site with subsequent chemotherapy (with high-dose cyclophosphamide or thiophosphamide) and radiation therapy (with CSI of 23.4 Gy or 36 Gy, depending on the risk group). In order to detect morphological and molecular biological distinctive features of tumor cells, the following criteria were evaluated: histological variant, molecular subgroup, methyltransferase status by DNMT and MGMT proteins expression, presence of C-MYC/N-MYC gene amplification, Iso17q and TP53 gene mutation. Results. As a result of this study, sufficiently high rates of overall survival and progression/relapse-free survival (PRFS) were achieved in standard and high-risk groups patients, which amounted to 76.08.8% and 83.310.8% with median follow-up 62.96.2 months and 52.27.8 months, respectively. There was revealed patients group in the age 37 years with 100% PRFS and median follow-up 66.98.9 months. At the same time, morphological and molecular biological factors of an unfavorable outcome of the disease were absent in the tumor samples (large cell anaplastic histology, C-MYC/N-MYC gene amplification, Iso17q and TP53 gene mutation). We have also achieved 100% PRFS in patients with desmoplastic tumor histology and in patients, who were treated with thiphosphamide-based chemotherapy regimen. Molecular-biological characteristics analysis of tumor cells showed a negative effect on PRFS of DNMT-positive status (Score 4, by 3 markers) and presence of N-MYC gene amplification (SHH molecular subgroup). Conclusion. There was identified a group of patients aged 3 to 7 years, for whom the possibility for reducing of CSR dose down to 18 Gy opens. Understanding of tumor cells methyltransferase status creates the prerequisites for using of epigenetic demethylating therapy. It is necessary more observations to assess the effect of the chemotherapy regimen with high-dose thiophosphamide on the PRFS

ПРОГНОСТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ МИКСОИДНОГО МАТРИКСА В ЗАБРЮШИННОЙ ВЫСОКОДИФФЕРЕНЦИРОВАННОЙ ЛИПОСАРКОМЕ

Objective: to assess the influence of the myxoid matrix in retroperitoneal well-differentiated liposarcoma(WDLPS ) on the long-term results of surgical treatment of patients.Material and Methods. The study included 111 patients with primary retroperitoneal WDLPS who underwent radical surgical treatment in Federal State Budgetary Institution «N.N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology» of the Ministry of Health of the Russian Federation. Histological slides of all surgical specimens were reviewed by experienced pathologist and reclassified according to criteria of WHO (2013) for histological subtypes of the WDLPS . Patients were divided into groups depending on presence or absence of the myxoid matrix in WDLPS and enrolled in intergroup analysis of overall (OS ) and recurrence-free (RFS) survival.Results. OS was significantly worse in the group of patients with the myxoid matrix in the tumor (p=0.002; log-rank test). The median OS was 142 (95 % CI , 108, 176) months in the group without the myxoid matrix, and 84 (95 % CI , 29, 139) months in the group with the myxoid matrix. The 5-year survival rates were 79 % and 44 % in the groups without myxoid matrix and with myxoid matrix, respectively. RFS was also significantly worse in the group of patients with the myxoid matrix than in the group of patients without the myxoid matrix (p=0.006; log-rank test). The median RFS was 55 (95 % CI , 38, 72) months in the WDLPS group without the myxoid matrix, and 31 (95 % CI , 15, 47) months in the WDLPS group with the myxoid matrix. The 2-year RFS rates were 75 % and 44 % in the groups without the myxoid matrix and with the myxoid matrix, respectively.Conclusion. The results of the study demonstrated that the presence of the myxoid matrix in WDLPS was associated with poor prognosis. We believe that the presence of the myxoid matrix in WDLPS can serve as an effective morphological marker of a less favorable prognosis for retroperitoneal WLPS .Цель исследования – оценка взаимосвязи миксоидного матрикса в забрюшинных  высокодифференцированных липосаркомах (ВДЛПС) с отдаленными результатами  хирургического лечения больных.Материал и методы. В исследование включено 111 пациентов с первичными забрюшинными ВДЛПС, которым выполнялось радикальное хирургическое лечение в  ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России. После пересмотра  гистологических препаратов и реклассификации в соответствии с критериями ВОЗ  (2013) все случаи были разделены на гистологические подтипы ВДЛПС. В зависимости от наличия/отсутствия миксоидного матрикса в ВДЛПС больные были поделены на  группы сравнения, включенные в межгрупповой анализ общей (ОВ) и безрецидивной (БРВ) выживаемости.Результаты. ОВ достоверно хуже в группе больных с миксоидным матриксом в опухоли (p=0,002; log-rank test). Медиана ОВ в группе без миксоидного матрикса составила 142 (95 % ДИ, 108, 176) мес, в группе с миксоидным матриксом – 84 (95 % ДИ, 29, 139) мес. Показатели 5-летней выживаемости в группах с ВДЛПС без миксоидного матрикса и ВДЛПС с миксоидным матриксом были 79 % и 44 % соответственно. БРВ больных также достоверно хуже в группе ВДЛПС с миксоидным матриксом, чем в группе пациентов с ВДЛПС без миксоидного матрикса (p=0,006; log-rank test). Медиана БРВ в группе ВДЛПС без миксоидного матрикса составила 55 (95 % ДИ, 38, 72) мес, в группе ВДЛПС с миксоидным матриксом 31 (95 % ДИ, 15, 47) мес. Показатели 2-летней БРВ в группах без миксоидного матрикса и с миксоидным матриксом составили 75 % и 44 % соответственно. Заключение. Результаты исследования демонстрируют более агрессивное течение  заболевания при наличии миксоидного матрикса в ВДЛПС. Мы полагаем, что наличие миксоидного матрикса в ВДЛПС может служить эффективным морфологическим маркером менее благоприятного прогноза при забрюшинных ВДЛПС. 

Наследственный диффузный рак желудка, ассоциированный с неописанным герминальным вариантом с.1596G>A в гене CDH1

Gastric cancer is one of the most common malignancies worldwide. Approximately 10 % of patients with gastric cancer are characterized by accumulation of gastric cancer cases in their family. The hereditary forms of gastric cancer account for 1–3 % of all gastric cancer cases. Hereditary diffuse GC syndrome is caused by germline mutations in CDH1 gene and determines a high risk of developing diffuse GC and lobular breast cancer. In this article, we present a clinical case of a 41-year-old patient with diffuse gastric cancer, who was found to be a carrier of novel germline mutation in the CDH1 gene. Next-generation sequencing (NGS) has facilitated an identification of CDH1 c.1596G>A genetic variant, thus enabling an accurate clinical diagnosis hereditary diffuse gastric cancer.Рак желудка является одним из наиболее распространенных злокачественных новообразований во всем мире. Около 10 % пациентов с данной патологией сообщают об отягощенном семейном анамнезе; наследственную форму заболевания выявляют в 1–3 % случаев. Синдром наследственного диффузного рака желудка возникает в результате герминальных мутаций в гене CDH1 и характеризуется высоким риском развития диффузного рака желудка у обоих полов и долькового рака молочной железы у женщин. В статье приведен клинический случай диагностики и лечения пациента, 41 года, с диффузным раком желудка, у которого методом массового параллельного секвенирования (next generation sequencing, NGS) выявлена неописанная герминальная мутация с.1596G>A в гене CDH1, что позволило установить точный диагноз

Высокочувствительное сканирование генных мутаций: зонды TaqMan как блокирующие агенты

DNA Melting Analysis is very effective in clinical DNA diagnostics: it is simple to perform, high throughput, labor-, time- and cost-effective and is implemented in the “closed tube” format minimizing the risk of samples cross-contamination. Although more sensitive than sequencing by Sanger (mutant allele detection limit is ~5 and ~15 % respectively), it, however, is inferior in this respect to some other, more laborious and expensive methods (in particular, ddPCR (digital droplet PCR)). Using the BRAF gene as a prototype, we developed the original version of the DNA melting analysis, based on the ability of TaqMan probes to hamper the primer extension reaction by Taq-polymerase. It is found that the weaker blocking effect on the mutant template, which is due to the mismatch in the probe-DNA heteroduplex, permits enriched amplification of the mutant allele and provides a significant (10-fold or more) increase in sensitivity of mutation scanning.Метод плавления ДНК весьма эффективен в клинической генодиагностике, прост в исполнении, производителен, экономичен и, кроме того, реализуется в «закрытом формате», сводящем к минимуму затраты времени, труда и риск перекрестного загрязнения образцов. Данный метод более чувствительный, чем секвенирование по Сэнгеру (предел обнаружения мутантных аллелей ~5 и ~15 % соответственно), однако уступает в этом отношении другим, более трудоемким и дорогим методам (в частности, капельной цифровой полимеразной цепной реакции (digital droplet PCR)). На гене BRAF (как прототипе) мы разработали оригинальный вариант метода плавления ДНК, основанный на способности зондов TaqMan затруднять движение Taq-полимеразы по матрице. Установлено, что эффект блокирования слабее выражен на мутантной матрице из-за присутствия в дуплексе зонд-ДНК неспаренного основания. Предложен протокол полимеразной цепной реакции, дискриминирующий амплификацию мутантных и нормальных аллелей и обеспечивающий существенное (10-кратное и более) повышение чувствительности мутационного сканирования