Advances in genetic improvement in Latin America and future perspectives

Animal breeding has been traditionally based on phenotypic and pedigree information. While traditional breeding methods have been effective in selecting animals for easy-to-measure traits, selection for difficult-to-measure traits can be favored by using DNA information. Thus, the advent of genomics has caused shifts in the animal breeding paradigm. However, genomic information has not changed the underlying principles of animal breeding, which consider the phenotype as essential to achieving genetic improvement. Therefore, new challenges have arisen, and with them the need for the adequacy of methods used so far and the development of research for the adaptation of new methodologies that will contribute to increase genetic gain and cost reductions of breeding programs

Gestão zootécnica e genética informatizadas em pequenos ruminantes: uma revisão

A criação de pequenos ruminantes tem se expandido em todos os estados brasileiros e, independentemente do objetivo da exploração, tem muito a contribuir para o desenvolvimento socioeconômico do país. Entretanto, esse setor enfrenta constantes desafios, como, por exemplo, a falta de informações e acesso às tecnologias, sendo a ausência de informatização uma das principais limitações para o registro de dados no campo. Dessa forma, objetivou-se, com esta revisão da literatura, compilar informações a respeito da utilização de ferramentas informatizadas aplicadas aos controles zootécnico e genético e à seleção de acasalamentos em pequenos ruminantes. Constatou-se que a adoção dessas ferramentas na ovinocultura e caprinocultura ainda é bastante limitada

Random regression models with different residual variance structures for describing litter size in swine

Objetivou-se comparar modelos de regressão aleatória com diferentes estruturas de variância residual, a fim de se buscar a melhor modelagem para a característica tamanho da leitegada ao nascer (TLN). Utilizaram-se 1.701 registros de TLN, que foram analisados por meio de modelo animal, unicaracterística, de regressão aleatória. As regressões fixa e aleatórias foram representadas por funções contínuas sobre a ordem de parto, ajustadas por polinômios ortogonais de Legendre de ordem 3. Para averiguar a melhor modelagem para a variância residual, considerou-se a heterogeneidade de variância por meio de 1 a 7 classes de variância residual. O modelo geral de análise incluiu grupo de contemporâneo como efeito fixo; os coeficientes de regressão fixa para modelar a trajetória média da população; os coeficientes de regressão aleatória do efeito genético aditivo-direto, do comumde-leitegada e do de ambiente permanente de animal; e o efeito aleatório residual. O teste da razão de verossimilhança, o critério de informação de Akaike e o critério de informação bayesiano de Schwarz apontaram o modelo que considerou homogeneidade de variância como o que proporcionou melhor ajuste aos dados utilizados. As herdabilidades obtidas foram próximas a zero (0,002 a 0,006). O efeito de ambiente permanente foi crescente da 1a (0,06) à 5a (0,28) ordem, mas decrescente desse ponto até a 7a ordem (0,18). O comum-de-leitegada apresentou valores baixos (0,01 a 0,02). A utilização de homogeneidade de variância residual foi mais adequada para modelar as variâncias associadas à característica tamanho da leitegada ao nascer nesse conjunto de dado.The objective of this work was to compare random regression models with different residual variance structures, so as to obtain the best modeling for the trait litter size at birth (LSB) in swine. One thousand, seven hundred and one records of LSB were analyzed. LSB was analyzed by means of a random-regression, single-characteristic animal model. The fixed and random regressions were represented by continuous functions over the farrowing order, adjusted by third-order Legendre’s orthogonal polynomials. To obtain the best modeling for the residual variance, variance heterogeneity was assumed by means of 1 to 7 classes of residual variance. The general analysis model included a contemporary group; the fixed regression coefficients for modeling the population’s average trajectory; the random regression coefficients of the direct additive genetic effects both of the litter and of the animal’s permanent environment; and the residual random effect. The likelihood-ratio test, Akaike’s information criterion, and Schwarz’s Bayesian information criterion appointed the model that considered variance homogeneity as being the one that provided the best adjustment to the data used. Overall, the heritabilities obtained were close to zero (0.002 to 0.006). Regarding the permanent environment proportion, different magnitudes were observed for the farrowing order: increasing from the 1st (0.06) to the 5th (0.28) orders and decreasing from there to the 7th order (0.18). The common litter effect presented low values (from 0.01 to 0.02). The use of residual variance homogeneity was more suitable for modeling variances associated to the trait litter size at birth in this data set.publishe

APROVEITAMENTO INTEGRAL DO COCO BABAÇU COMO ESTRATÉGIA DE EDUCAÇÃO E DESENVOLVIMENTO SOCIAL SUSTENTÁVEL

Este estudo teve como objetivo avaliar os efeitos da introdução de uma tecnologia de aproveitamento racional do coco babaçu em comunidades de baixa renta no município de Miguel Alves-PI. Foram realizadas ações de ensino-aprendizagem para o aproveitamento integral dos constituintes do coco babaçu, visando o desenvolvimento social e econômico dos moradores das comunidades em estudo. Foi utilizada uma metodologia participativa e multidisciplinar, valorizando a participação da comunidade para a promoção da troca de saberes e práticas com a universidade. Os recursos aplicados foram investimentos importantes para a realização de oficinas de arte, nutrição, operação e manejo de máquinas para beneficiamento do coco babaçu, empreendedorismo, desenvolvimento da região e das potencialidades para uso do coco babaçu; fortalecimento e incentivo de expressões e iniciativas artístico-culturais; criação de cooperativa para a produção de artesanato; multiplicação e impacto social das ações; contemplando ainda a formação acadêmica dos discentes. 

Diversity and Genetic Relationship of Free-Range Chickens from the Northeast Region of Brazil

In this study, we aimed to evaluate the genetic diversity within and among chicken breeds from the northeast region of Brazil (states of Bahia and Piauí) using microsatellite markers. In addition, we assessed the identity and genetic relationships of chickens from Europe, Africa, and South America, as well as their influence on the formation of the Brazilian breeds. A total of 25 microsatellite markers and a panel containing 886 samples from 20 breeds (including the Brazilian chickens) were used in this study. Different statistical parameters were used to estimate the genetic diversity and relationship among the genetic groups studied. Our study indicates that the Brazilian Creole chickens have high genetic variability. The results show that chickens reared in the states of Bahia and Piauí could have originated from different ancestors. The Brazilian breeds studied have an evolutionary relationship with chickens from Portugal, Nigeria, Chile, and Spain. Our results will contribute directly to the conservation and recognition of Brazilian Creole chicken breeds and provide a solid basis for the demonstration of their genetic identity and genetic conservation of American Creole chicken populations

Homogeneidade e heterogeneidade de variância residual em modelos de regressão aleatória sobre o crescimento de caprinos Anglo‑Nubianos

The objective of this work was to compare random regression models with different structures of residual variances, in the estimate of covariance components and genetic parameters for growth traits in goats. Regression functions using Legendre orthogonal polynomials of the fourth order were used for modeling animal growth trajectory, and polynomial of third order for modeling direct and maternal additive genetic effects, and permanent environmental effect. Different residual variance structures were considered using alternatively step functions (from one to seven different classes of residual variances) or variance functions using ordinary and Legendre polynomials, with orders of fit from the first to fourth order. Models were compared by likelihood ratio test, Akaike's information criterion and Schwarz's bayesian criterion. Models including residual variance functions showed better results than those including classes of variance. The ordinary polynomial of third order showed better results than the other models. Genetic parameters are affected by different residual variance structures in the models, however, genetic parameters estimates using four classes of residual variance, ordinary polynomial and Legendre polynomial of third order are similar.O objetivo deste trabalho foi comparar modelos de regressão aleatória com diferentes estruturas de variâncias residuais, na estimação dos componentes de covariância e parâmetros genéticos de características de crescimento de caprinos. A função de regressão por meio de polinômios ortogonais de Legendre de ordem quatro foi usada para modelar a trajetória média de crescimento animal, e de ordem três, para modelar os efeitos genéticos aditivos direto e materno e de ambiente permanente. Diferentes estruturas de variâncias residuais foram consideradas, por meio de classes de uma a sete variâncias residuais, e funções de variâncias com uso dos polinômios ordinários e de Legendre, com ordens que variaram de linear até a do quarto grau. Os modelos foram comparados pelo teste de razão de verossimilhança, o critério de informação de Akaike e o critério bayesiano de Schwarz. Os modelos com funções de variâncias residuais foram superiores aos de classes de variância. O polinômio ordinário de terceira ordem apresentou melhores resultados. Os parâmetros genéticos são influenciados pelo ajuste da variância residual, no entanto, os estimados pelos modelos que consideraram classes de variância, polinômio ordinário e polinômio de Legendre, de terceira ordem, são semelhantes

PARASITOS INTESTINAIS IDENTIFICADOS EM PELOS DE CÃES EM TERESINA/PIAUÍ

The presence of dogs in domestic environments has become quite common, but it is necessary to maintain care of the animals, since they can transmit pathogens to humans causing zoonotic diseases and one of the forms of transmission can be by accidental ingestion of parasite eggs present in the hairs. The objective of this study was to evaluate the occurrence of intestinal parasites in the hair of dogs attended at two veterinary clinics in the city of Teresina, PI. The collected hairs were taken to the Parasitology Laboratory at UFPI for evaluation and underwent a washing process through a technique modified for this purpose. Of 59 dog hair samples, 11 were positive for helminths or protozoa, being found eggs of the family Taeniidae and the genus Ancylostoma, besides to cysts Giardia spp. and oocysts of Cryptosporidium spp., important zoonotic potential parasites. Once parasitized, the dogs can pose a risk of contamination to humans through their faeces or through their hair. It is concluded that the eggs helminths of the Taeniidae family and of the Ancylostoma genus and the protozoa of the Giardia and Cryptosporidium genus can be adhered to the hairs of the perianal region of dogs, and these last parasites are the first reports in the hair in this animals species.A presença de cães em ambientes domiciliares se tornou bastante comum, porém é preciso manter cuidados com relação aos animais, uma vez que eles podem transmitir patógenos ao homem, causando, assim, doenças zoonóticas; e que uma das formas de transmissão pode ser por ingestão acidental de ovos de parasitos presentes nos pelos. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência de parasitos intestinais em pelos de cães atendidos em duas clínicas veterinárias do município de Teresina/PI. Os pelos colhidos foram levados ao Laboratório de Parasitologia da UFPI para avaliação e passaram por um processo de lavagem por meio de uma técnica modificada para essa finalidade. De 59 amostras de pelos de cães, 11 foram positivas para helmintos ou protozoários, sendo encontrados ovos da família Taeniidae e do gênero Ancylostoma, além de cistos de Giardia spp. e oocistos de Cryptosporidium spp., importantes parasitos de potencial zoonótico. Uma vez parasitados, os cães podem oferecer risco de contaminação para os humanos, tanto por meio das fezes como por meio dos pelos. Conclui-se que ovos de helmintos da família Taeniidae e do gênero Ancylostoma e os protozoários do gênero Giardia e Cryptosporidium podem ficar aderidos nos pelos da região perianal de cães, sendo que as ocorrências destes últimos parasitos são os primeiros relatos nos pelos dessa espécie animal

PARASITOS DE POTENCIAL ZOONÓTICO EM SOLOS DE PARQUES PÚBLICOS EM TERESINA/PIAUÍ

Environmental contamination by parasitic forms can represent a public health problem, as many of these agents can contaminate the human beings. Thus, this study aimed to investigate the existence of parasites of zoonotic potential in two public parks in the city of Teresina (Piauí, Brazil) during the rainy and dry period in the region. For this purpose, sand samples were collected during 2018, firstly in March, representing the rainy period, and then in October, the dry period. A total of 20 samples was collected, 10 from each park. From the samples collected in park 1during the rainy season, two were positive for hookworm and Toxocara spp. Larvae. In this same period, park 2 was without the presence of parasites. During the dry period, one site in park 1 remained positive for hookworm and Toxocara spp. larvae, while these parasitic forms were found in two locations in park 2. In both parks, the presence of dogs and cats was observed in and around these environments. These findings reveal the risk of human contamination by parasites of zoonotic potential in the two public parks at different times of the year, serving as a warning for the population of Teresina.A contaminação ambiental por formas parasitárias pode representar um problema de saúde pública, pois muitos desses agentes podem contaminar os seres humanos. Desta forma, o objetivo deste estudo foi investigar a existência de parasitos de potencial zoonótico em dois parques públicos do município de Teresina (Piauí, Brasil) durante os períodos chuvoso e seco da região. Para isso, amostras de areia foram coletadas durante o ano de 2018, primeiramente em março, representando o período chuvoso, e depois em outubro, o período seco. Foi coletado um total de 20 amostras, sendo 10 de cada parque. Das amostras coletadas no parque 1durante o período chuvoso, duas foram positivas para larvas de ancilostomídeos e de Toxocara spp. Nesse mesmo período, o parque 2 encontrava-se sem a presença de parasitos. Durante o período seco, um local do parque 1 continuou sendo positivo para larvas de ancilostomídeos e Toxocara spp., enquanto no parque 2 foram encontradas essas formas parasitárias em dois locais. Em ambos os parques, foi observada a presença de cães e gatos dentro e nos arredores dos ambientes. Esses achados revelam o risco de contaminação humana por parasitos de potencial zoonótico nos dois parques públicos em diferentes épocas do ano, servindo de alerta para a população de Teresina

Optimum genetic contribution applied to the selection of Santa Ines sheep

O objetivo deste trabalho foi avaliar estratégias de seleção simulada pela contribuição genética ótima quanto ao ganho genético, com restrição sobre a coancestria, para a característica peso aos 84 dias idade, em ovinos Santa Inês. As análises foram definidas conforme um algoritmo de evolução diferencial, que otimizou uma função‑objetivo composta pelo mérito genético e a coancestria média dos animais candidatos à reprodução. A estratégia definida como ótima indicou a utilização de 19 carneiros, o que resultaria em ganho médio esperado de 1,1259 unidades de desvio‑padrão, e coancestria igual a 0,0249 (estratégia 5). Em comparação à seleção com base apenas no valor genético, a estratégia ótima reduziu a coancestria em 12%, e o ganho genético, em apenas 3%. A seleção de ovinos pela contribuição genética ótima oferece diferentes níveis de ganho genético, que são atingíveis a partir de restrições sobre a coancestria. Assim, é possível minimizar a coancestria, ou restringi‑la em um valor pré‑definido, e maximizar o ganho genético simultaneamente com o uso da contribuição genética ótima.The objective of this work was to evaluate strategies of simulated selection by optimum contribution for the genetic gain, with restriction on coancestry, for the weight trait of 84‑day old Santa Ines sheep. The analyses were performed using a differential evolution algorithm, which optimized an objective function accounting for average coancestry of the candidate animals for reproduction and genetic merit. The optimal selection strategy indicated the use of 19 rams, which would result in an expected average gain of 1.1259 units of standard deviation, and coancestry equal to 0.0249 (strategy 5). Compared to the selection based only on breeding values, the optimum strategy reduced the coancestry by 12%, and the genetic gain by only 3%. The selection of sheep by the optimum contribution offers different levels of genetic gain, which are achievable from restrictions on the coancestry. Therefore, it is possible to minimize the coancestry, or restrict it to a predefined value, and maximize the genetic gain while using the optimum contribution