Colonized patients by Candida auris: Third and largest outbreak in Brazil and impact of biofilm formation

ObjectiveTo describe the clinical–epidemiological features of patients colonized by Candida auris in the largest outbreak in Brazil and to show the biofilm formation capacity of yeast strains.MethodsClinical yeasts suspected of C. auris isolated from urine and surveillance samples were seeded on chromogenic media at 30°C and Sabouraud agar at 42°C. matrix-assisted laser desorption/ionization–time of flight mass spectometry was used for reliable identification. After proteomic confirmation, the genomic approach and culture on Chromagar Candida Plus media were carried out. Biofilm formation was investigated based on metabolic activity, and the clinical–epidemiological profile of patients was described.ResultsA total of 11 C. auris clinical yeasts from nine patients were identified between the end of December 2021 and March 2022. Two clinical yeasts were isolates from urine and nine clinical yeasts were isolates from axillary and inguinal surveillance swabs. No case is related to previous Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection. However, all the yeasts showed a high ability of biofilm formation.ConclusionC. auris requires great vigilance as its high capacity to colonize and form biofilms contributes to its dissemination. The rapid and precise identification of this species is essential for the management, control, and prevention of infections

Avaliação dos micronúcleos de células inflamatórias em pacientes com esporotricose e cromomicose

Subcutaneous mycoses as the sporotrichosis (ST) and chromoblastomycosis (CM), possess great incidence in Latin America. Their clinical signs happen initially with the formation of nodular lesions in ST and verrucoid or warty lesions in the CM, both developing for granulomatous microabscesses merged with pseudoepitheliomatous hyperplasia, that consist of neutrophils, macrophage and Langhans’giants cells. As consequence of that immune response, the inflammatory cells intensify theirmetabolism and increase the protein synthesis, what leads the micronucleus formation. Micronuclei are chromatin fragments proceeding aberrant mitoses. The aim of this study was to assess the frequency of micronuclei of inflammatory cell in the cutaneous lesions of ST and CM. Biopsies of epidermal tissue of patient carriers of ST (n=10) or CM (n=10) were selected. Cytochemistry was carried out by staining with Feulgen reaction and the counter-stained with Fast Green. The obtained results indicate that micronuclei frequency is significantly higher in the characteristic lesions of ST, when compared to the cases of CM (p < 0.05). The preliminary results suggest different cytogenetic mechanisms of response of the inflammatory cells, although the histopatologic profiles of the lesions are similar.Atualmente, micoses subcutâneas, como a esporotricose (ST) e cromomicose (CM), possuem grande incidência na América Latina. Seus sinais clínicos ocorrem inicialmente com a formação de nódulos gomosos na ST e lesões eritematosas e verrucosas na CM, ambas evoluindo para lesões granulomatosas, geralmente combinadas com pseudocarcinomas, formadas principalmente pelo sistema fagocítico-mononuclear, plasmócitos e células gigantes tipo Langerhans. Como conseqüência dessa resposta imune, as células inflamatórias intensificam seu metabolismo e aumenta a síntese protéica, o que conduz a formação de micronúcleos. Os micronúcleos são porções da cromatina oriundas de mitoses aberrantes. Este estudo tem como objetivo quantificar o número médio de micronúcleos por célula inflamatória nas lesões cutâneas de ST e CM. Foram selecionadas biópsias de tecido epidérmico de pacientes portadores de ST (n=10) ou CM (n=10). Realizou-se citoquímica pela coloração com a reação de Feulgen e a contracoloração com Fast Green. Os resultados obtidos indicam que a freqüência dos micronúcleos é significativamente mais alta nas lesões características de ST, quando comparada à dos casos de CM (p < 0,05). Os resultados preliminares sugerem diferentes mecanismos citogenéticos de resposta das células inflamatórias, embora os perfis histopatológicos das lesões sejam semelhantes

Rapid and reliable identification of intact Candida clinical isolates using MALDI-TOF ICMS

The significant increase in the frequency of candidiasis wide world has promoted the study and development of fast and reliable techniques aimed at the replacement of traditional methods used for identification and typing of Candida clinical isolates. Matrix Assisted Laser Desorption/Ionisation Time-Of-Flight lntact Cell Mass Spectrometry (MALDI-TOF ICMS) has been applied as current method for Candida identification in clinical laboratories. This method is reported as suitable fur routine identification in clinical laboratories and fast and reliable for identification of pathogenic yeasts. The main aim of this study was to compare MALDI-TOF ICMS performance with the classical phenotypic approach and molecular analyses to identify Candida species from clinical cases. Forty clinical Candida isolates preserved in URM Culture Collection fur I to 52 years were identified by morphological and biochemical analysis as Candida albicans (20), C. krusei (05), C. parapsilosis (11) and C. tropicalis (04). These identifications were compared with the discriminative capability of the new phenotypic approaches using MALDI-TOF ICMS. MALDI-TOF ICMS data demonstrated 15% discordance when compared with morphological and biochemical analyses. The discordant isolates were analysed by ITS sequencing which corroborated the MALDI-TOF ICMS identifications. Five Candida krusei isolates were renamed Issatchenkia orientalis by MALDI-TOF ICMS SARAMISTM database, which is their teleomorphic name. ln conclusion MALDI-TOF ICMS represents a rapid and reliable method of identifying Candida and also presents clear benefits when compared with the performance of existing daily routine methods applied at health centres and hospitals. Research leading to these results received funding from the European Community's Seventh Framework Program (FP7, 2007-2013), Research lnfrastructures Action, under grant agreement No. FP7-228310 (EMbaRC project). Thanks are also due to Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES, Brazil) for funding support.European Community's Seventh Fmmework Progmm (FP7, 2007-2013), Research lnfrastructures Action, under gmnt agreement No. FP7-228310 (EMbaRC project), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES, Brazil

Bloodstream infection by candida in patients with hematologic neoplasia: polyphasic taxonomy and antifungal susceptibility / Infecção sanguínea por candida em pacientes com neoplasia hematológica: taxonomia polifásica e suscetibilidade antifúngica

Bloodstream infection (BSI) by species of Candida has been identified as an important cause of death in patients with neutropenia who undergo chemotherapy for the treatment of hematologic malignancies This study aimed to verify the occurrence of bloodstream infections by Candida species in patients admitted to the haematology-oncology service of a public hospital specialized in the treatment of cancer in Northeast Brazil.  A total of 105 clinical samples from 62 patients with haematological malignancies were analyzed at the Laboratory of Medical Mycology at the Federal University of Pernambuco. Only 7 of 105 individuals were in the ICU environment. The mycological diagnosis was performed through automation (BACTEC 9120 / PHOENIX™), proteomic identification (MALDI-TOF MS) and molecular analysis (PCR). The antifungal susceptibility test followed the bloodstream infection recommendations of Clinical &amp; Laboratory Standards Institute. Among the samples studied, nine strains (8,57%) were of the genus Candida, being six C. tropicalis and three C. albicans. The isolates were completely susceptible to the antifungal agents tested. Deaths occurred in 66,6% of the cases. Patients with hematologic malignancies hospitalized in intensive care and the state of septic shock present a higher risk of occurrence of BSI by Candida and death by this opportunistic pathogen

Desnutrição associada à giardíase em escolares: Análise de parâmetros antropométricos e socioeconômicos / Malnutrition associated with giardiasis in school children: Analysis of anthropometric and socioeconomic parameters

Giardia lamblia é um dos principais protozoários que causa diarréia em crianças de países em desenvolvimento, assim esse trabalho teve como objetivo avaliar a prevalência de infecção por Giardia sp nas crianças de uma creche pública do Recife, correlacionando os aspectos antropométricos e socioeconômicos, tais como: tabagismo na família, aleitamento materno, renda e escolaridade materna. A frequência foi determinada através de amostras fecais processadas de acordo com os métodos de Hoffman e Faust. Crianças com infecção por outros parasitos foram eliminadas do estudo. A prevalência foi correlacionada com aspectos antropométricos e sociais. A análise desses dados mostrou haver associação estatisticamente significante da infecção por Giardia sp com os baixos índices de IMC (p=0,0293) e com o baixo grau de aleitamento materno (p=0,0447), além de mostrar associação parcialmente significante com a baixa renda familiar (p=0,09). Os resultados sugerem haver associação entre a infecção e desnutrição e aleitamento materno inadequado (por um período menor que 6 meses). A renda familiar sugere uma forte tendência à infecção nas classes sociais mais baixas

Stenotrophomonas maltophilia isolates in a tertiary care hospital in Northeastern Brazil / Isolados de Stenotrophomonas maltophilia em um hospital terciário no nordeste do Brasil

Introduction: Stenotrophomonas maltophilia (S.maltophilia) has emerged as an important opportunistic, nosocomial pathogen capable of causing respiratory, bloodstream and urinary infections in a debilitated host. Prevention of acquisition and infection depends upon the application of modern infection-control practices. Methods: We conducted a retrospective and observational laboratory-based study on S. maltophilia to evaluate the distribution of these pathogen isolates between February 2008 and December 2012 in a 38-bed intensive care unit in northeastern Brazil. The study began by surveying all positive S. maltophilia cultures processed by the microbiology laboratory during the period of study. The cultures, originating from various types of biological material were processed by Vitek® System. The cultures were processed in protocol in accordance with CLSI -M100- S25. The incidence rate was calculated per 1,000 admissions. Results: A total of 100 sample isolates were tested positive for S. maltophilia. The isolates were obtained from 50.301 hospitalized patients (0.19%). A total of 8.572 positive cultures were detected in different biological materials. Ninety four (94%) isolates were from patients in adult intensive care. Seventy (70%) S. maltophilia isolates were from tracheal cultures. All S. maltophilia isolates were sensitive to Co-trimoxazole and levofloxacin. Conclusions: This study shows the importance of other analytical epidemiologic studies that correlate the presence of S. maltophilia incidence associated with the risk factor, and the outcomes, in our region.

Conhecimento, conservação e uso de fungos

A publicação deste livro com o conteúdo das palestras que foram apresentadas durante o IX Congresso Brasileiro de Micologia, realizado no período de 24 a 27 de junho de 2019 na cidade de Manaus - Amazonas, tem a finalidade de reunir os conhecimentos científicos apresentados por pesquisadores brasileiros e estrangeiros nas mais diversas áreas da Micologia e disponibilizar com acesso irrestrito para a comunidade, como alunos de graduação e pós-graduação, pesquisadores nacionais e internacionais com interesse nas diferentes áreas de aplicação da micologia e profissionais de empresas, incubadoras e privadas ligadas à aplicação biotecnológica de fungos. Esperamos que essa iniciativa tenha alcançado seus objetivos a contento e que as informações científicas contidas nessa obra possam contribuir para o avanço do conhecimento da micologia e para o desenvolvimento científico brasileiro

Ocorrência de leveduras na cavidade oral e traqueia de aves de rapina

Objetivou-se com esta pesquisa isolar e identificar leveduras da cavidade oral e traqueia de aves de rapina. Para este estudo, utilizaram-se 17 aves de rapina (três carcarás (Caracara plancus), 11 gaviões-carijós (Rupornis magnirostris), 1 coruja-das-torres (Tyto furcata) e duas corujas-orelhuda (Rhinoptynx clamator). As amostras foram colhidas da cavidade oral e traqueia com auxílio de swabs estéreis. Foram cultivadas 34 amostras em ágar Sabouraud dextrose com cloranfenicol (100 mg/L) e incubadas em aerobiose à temperatura ambiente por um período mínimo de sete dias e máximo de 15 dias, sendo observadas diariamente. Foram isolados 14 (93,3%) amostras de leveduras da cavidade oral e apenas uma (6,7%) da traqueia. Dos 15 isolados, 14 (93,3%) foram obtidos de amostras de gavião-carijós (Rupornis magnirostris) e uma (6,67%) em carcará (Caracara plancus). As espécies identificadas foram: Candida albicans (13,3%), C. parapsilosis (20%), C. tropicallis (26,7%), C. magnoliae (6,78%), Candida sp. (13,3%) e Trichosporon cutaneum (20%). O isolamento e identificação de leveduras em aves de rapina é epidemiologicamente importante para uma melhor compreensão dos processos patológicos na cavidade oral e na traqueia das espécies estudadas, uma vez que seu conhecimento permite adoção de medidas para a prevenção de doenças causadas por esses agentes oportunistas

Capacidade de aderência às células epiteliais da cavidade oral e perfil histoquímico de culturas de cândida estocadas na micoteca URM

A capacidade de aderência de espécies de Candida às células epiteliais, é um dos fatores relevantes de patogenicidade que está associado ao perfil histoquímico da superfície da célula. O objetivo dessa pesquisa foi avaliar a habilidade de aderência de espécies de Candida às células epiteliais da cavidade oral e correlacionar ao perfil histoquímico da parede celular. Foram testados 20 isolados de Candida albicans, seis de C. krusei, 15 C. parapsilosis e cinco de C. tropicalis frente às células epiteliais da cavidade oral. As células epiteliais foram incubadas com suspensões de leveduras sob agitação. Histoquímica foi estudada usando lectinas conjugadas a peroxidase. Resultados mostraram que C. albicans e C. tropicalis foram mais aderentes que C. krusei e C. parapsilosis (P<0.01), apresentando alta expressão de resíduos de -L-fucose na superfície celular. Três isolados de C. parapsilosis apresentaram valores similares de aderência e perfil histoquímico ao observado em C. albicans e C. tropicalis (r=0.8336, P=0.0001). Todos os isolados de C. krusei foram fracamente aderentes, mostrando a baixa patogenicidade inerente a esta espécie. Adicionalmente, nossos resultados mostraram a presença de -D-glicose/-Dmanose, N-acetil-D-glicosamina/ácido N-acetilneuramínico e D-galactose/N-acetil-Dgalactosamina na parede celular das espécies estudadas. Carboidratos complexos sobre a superfície de espécies de Candida podem representar um meio pelo qual as interações entre os fungos e seus hospedeiros podem ser estabelecida