Ruminococcal cellulosome systems from rumen to human

This article is protected by copyright. All rights reserved. The authors appreciate the kind assistance of Miriam Lerner (ImmunArray Ltd. Company, Rehovot, Israel) with experiments involving the MicroGrid II arrayer. This research was supported by a grant (No. 1349) to EAB also from the Israel Science Foundation (ISF) and a grant (No. 24/11) issued to RL by The Sidney E. Frank Foundation also through the ISF. Additional support was obtained from the establishment of an Israeli Center of Research Excellence (I-CORE Center No. 152/11) managed by the Israel Science Foundation, from the United States-Israel Binational Science Foundation (BSF), Jerusalem, Israel, by the Weizmann Institute of Science Alternative Energy Research Initiative (AERI) and the Helmsley Foundation. The authors also appreciate the support of the European Union, Area NMP.2013.1.1-2: Self-assembly of naturally occurring nanosystems: CellulosomePlus Project number: 604530 and an ERA-IB Consortium (EIB.12.022), acronym FiberFuel. HF and SHD acknowledge support from the Scottish Government Food Land and People programme and from BBSRC grant no. BB/L009951/1. In addition, EAB is grateful for a grant from the F. Warren Hellman Grant for Alternative Energy Research in Israel in support of alternative energy research in Israel administered by the Israel Strategic Alternative Energy Foundation (I-SAEF). E.A.B. is the incumbent of The Maynard I. and Elaine Wishner Chair of Bio-organic ChemistryPeer reviewedPostprin

Rumen cellulosomics : divergent fiber-degrading strategies revealed by comparative genome-wide analysis of six ruminococcal strains

Peer reviewedPublisher PD

Cellulosomics, a gene-centric approach to investigating the intraspecific diversity and adaptation of Ruminococcus flavefaciens within the rumen

Peer reviewedPublisher PD

Expression of Cellulosome Components and Type IV Pili within the Extracellular Proteome of Ruminococcus flavefaciens 007

Funding: The Rowett Institute receives funding from SG-RESAS (Scottish Government Rural and Environmental Science and Analysis Service). Visit of M.V. was supported by research grants from FEMS and Slovene human resources development and scholarship funds. Parts of this work were funded by grants from the United States-Israel Binational Science Foundation (BSF), Jerusalem, Israel – BSF Energy Research grant to E.A.B. and B.A.W. and Regular BSF Research grants to R.L. and B.A.W. – and by the Israel Science Foundation (grant nos 966/09 and 159/07 291/08). The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.Peer reviewedPublisher PD

El trabajo comunitario en UDELAS: una revisión crítica

A partir del año 2018, la Universidad Especializada de las Américas (UDELAS), inicia un proceso de estudio y análisis del enfoque de la extensión crítica, con el propósito de introducir cambios en las políticas de Extensión Universitaria, en el marco de la formulación del nuevo plan estratégico 2019-2023. Al momento del impacto de la Pandemia por la COVID-19, que inicia en marzo de 2020, el mundo experimenta un momento de crisis generalizada, que ha dado como resultado procesos de revisión a lo interno de las instituciones de educación superior. La UDELAS, en atención a esta nueva realidad, ha debido replantearse y adoptar nuevos lineamientos para cumplir con sus funciones de docencia, investigación, extensión y gestión, acorde con las normativas sanitarias emitidas por las autoridades de salud en Panamá, que redefinen un cambio en la vida nacional, desde el punto vista económico, social, político y cultural. El trabajo en los territorios, una de las áreas de acción de la Extensión Universitaria en UDELAS, se constituye en uno de los mayores desafíos en esta nueva realidad, en tanto la presencia de la universidad en la comunidad está limitada debido a las medidas de aislamiento social (MINSA, 2020) que decretaron las autoridades nacionales y, por tanto, la puesta en vigencia de la modalidad de trabajo a distancia adoptada por la universidad. Es precisamente este escenario el que plantea la necesidad de hacer una mirada a la evolución del trabajo comunitario en UDELAS, identificando, en cada etapa, aquellos elementos que permitan replantearnos la puesta en práctica del enfoque de la extensión crítica como parte esencial de las nuevas políticas de Extensión Universitaria, de los modelos de trabajo en territorios y la adecuación de nuevos esquemas para una renovada vinculación con la sociedad

Paradigmatic status of an endo- and exoglucanase and its effect on crystalline cellulose degradation

BACKGROUND: Microorganisms employ a multiplicity of enzymes to efficiently degrade the composite structure of plant cell wall cellulosic polysaccharides. These remarkable enzyme systems include glycoside hydrolases (cellulases, hemicellulases), polysaccharide lyases, and the carbohydrate esterases. To accomplish this challenging task, several strategies are commonly observed either separately or in combination. These include free enzyme systems, multifunctional enzymes, and multi-enzyme self-assembled designer cellulosome complexes. RESULTS: In order to compare these different paradigms, we employed a synthetic biology approach to convert two different cellulases from the free enzymatic system of the well-studied bacterium, Thermobifida fusca, into bifunctional enzymes with different modular architectures. We then examined their performance compared to those of the combined parental free-enzyme and equivalent designer-cellulosome systems. The results showed that the cellulolytic activity displayed by the different architectures of the bifunctional enzymes was somewhat inferior to that of the wild-type free enzyme system. CONCLUSIONS: The activity exhibited by the designer cellulosome system was equal or superior to that of the free system, presumably reflecting the combined proximity of the enzymes and high flexibility of the designer cellulosome components, thus enabling efficient enzymatic activity of the catalytic modules

Caracterización, alternativas de reutilización y formación ambiental en residuos sólidos con los habitantes del barrio bellavista – municipio de Buenaventura

En el año 1998 el proyecto plan pacifico a través Gobernación del Valle intentó implementar un programa LIFE para el desarrollo del reciclaje a nivel de cada una de las 12 comunas de la parte urbana del Municipio de Buenaventura, pero finalmente no se pudo ejecutar por falta de recursos. Contribuyendo con un grado de arena, para que parte de este proyecto sea realidad se presenta el trabajo de Caracterización, alternativas de reutilización y formación ambiental en residuos sólidos con los habitantes del Barrio Bellavista – Municipio de Buenaventura, el cual se realizó en mayo 9 de 2005 a marzo 15 de 2006, con el fin de determinar la cantidad de los materiales que componen el residuo sólido e identificar la producción per capita de acuerdo con el estrato socio-económico de la población y capacitación a los habitantes del sector sobre residuos sólidos y alternativas de reutilización.1. Objetivos 3 2. Justificación 4 3. Planteamiento del problema 6 4. Estado del arte 8 5. Marco teórico 12 5. 1. Descripción y localización del Municipio de Buenaventura 12 5. 2. Estratificación en Buenaventura y su impacto social 14 5. 3. Estructura urbana 17 5. 4. Estructura social 18 5. 5. Salud 20 5. 6. Los residuos sólidos 21 5. 7. Aspectos generales y financieros del servicio de aseo en Buenaventura 31 6. Materiales y métodos 35 7. Resultados 43 8. Discusion de resultado 49 8. 1. Inferencia estadística 51PregradoLicenciado en Biología y Educación Ambienta

Cell surface enzyme attachment is mediated by family 37 carbohydrate-binding modules, unique to Ruminococcus albus

The rumen bacterium Ruminococcus albus binds to and degrades crystalline cellulosic substrates via a unique cellulose degradation system. A unique family of carbohydrate-binding modules (CBM37), located at the C terminus of different glycoside hydrolases, appears to be responsible both for anchoring these enzymes to the bacterial cell surface and for substrate binding

Complexity of the Ruminococcus flavefaciens FD-1 cellulosome reflects an expansion of family-related protein-protein interactions

This work was supported in part by the European Union, Area NMP.2013.1.1–2: Self-assembly of naturally occurring nanosystems: CellulosomePlus Project number: 604530, and by the EU Seventh Framework Programme (FP7 2007–2013) under the WallTraC project (Grant Agreement no 263916), and BioStruct-X (grant agreement no 283570). This paper reflects the author’s views only. The European Community is not liable for any use that may be made of the information contained herein. CMGAF is also supported by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Lisbon, Portugal) through grants PTDC/BIA-PRO/103980/2008 and EXPL/BIA-MIC/1176/2012. EAB is also funded by a grant (No. 1349/13) from the Israel Science Foundation (ISF), Jerusalem, Israel and by a grant (No. 2013284) from the U.S.-Israel Binational Science Foundation (BSF). E.A.B. is the incumbent of The Maynard I. and Elaine Wishner Chair of Bio-organic Chemistry.Peer reviewedPublisher PD