On the classification of lakes and lake-like bodies of the Ukraine [Translation from: Gidrobiologicheskie Zhurnal, Kiev 19(2) 100-101, 1983]

In the Ukraine there are several thousand large, medium and small lakes and lake-like reservoirs, distinguished by origin, salinity, regional position, productivity and by construction a significant number of large and small water bodies, ponds and industrial reservoirs of variable designation. The problem of national systems necessitates the creation of specific schemes and classifications. Classifying into specific types of reservoir by means of suitable specifications is required for planning national measures with the objective of the rational utilisation of natural resources. It is now necessary to consider the present-day characteristics of Ukranian lakes. In the case of the Ukraine it is possible to use two approaches - genetical and ecological. This paper uses the genetical system to classify the lake-like water bodies of the Ukraine

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA

Aim. To determine the similarity and dissimilarity of the nucleotide sequences of the S. globisporus 1912-2 chromosome and primary structures of genomes of some Streptomycetes strains. Methods. NCBI tools (BLAST: blastn and bl2seq: megablast) and Internet NCBI databases (Genome, Nucleotide) were used for in silico analysis of the primary structure contigs of S. grlobisporus 1912-2. Results. A few strains with significant identity of their DNA primary structures to the nucleotide sequences of the chromosomal DNA of S. globisporus 1912-2 (identity 88–97 %) and a degree of query cover (55–82 %) were identified. Primary structures of genomes of the strains S. globisporus C-1027 and S. griseus NBRC13350 were chosen as most identical to the nucleotide sequence of the S. globisporus 1912-2 chromosomal DNA. No fragments with a homologous primary structure to seven S. globisporus 1912-2 contigs were found in Streptomycetes spp. from the NCBI databases. Conclusions. S. globisporus 1912-2 strain is a member of the S. griseus clade. We detected a high biosynthetic potential of the strain S. globisporus 1912-2 due to many unique nucleotide sequences.Мета. Визначити подібності та відмінності первинних структур геномів ряду штамів стрептоміцетів і хромосомної ДНК S. globisporus 1912-2 in silico. Методи. Використовували ресурси сервера NCBI (BLAST: blastn і bl2seq: megablast) для in silico аналізу первинної структури контигів S. grlobisporus 1912-2 і ряду Інтернет баз даних NCBI (Genome, Nucleotide). Результати. Виявлено ряд штамів зі значними показниками гомології їх первинної структури ДНК і нуклеотидної послідовності хромосомної ДНК S. globisporus 1912-2 (ступенем ідентичності (88–97 %) і ступенем покриттям (55–82 %)). Максимальна ідентичність нуклеотидній послідовності хромосомної ДНК S. globisporus 1912-2 було виявлена у геномів штамів S. globisporus C-1027 (97 %) і S. griseus NBRC13350 (96%). Жодного фрагмента з первинною структурою, гомологичною структурам семи контігов S. globisporus 1912-2 не було знайдено серед нуклеотидних послідовностей стрептоміцетів з базах даних NCBI. Висновки. Встановлено, що штам S. globisporus 1912-2 є членом клади S. griseus. Ми виявили великий біосинтетичний потенціал штаму S. globisporus 1912-2, можливий завдяки його багатьом унікальним нуклеотидним послідовностям.Цель. Определить in silico сходство и отличие первичных структур геномов ряда штаммов стрептомицетов и хромосомной ДНК S. globisporus 1912-2. Методы. Использовали ресурсы сервера NCBI (BLAST: blastn и bl2seq: megablast) для in silico анализа первичной структуры контигов S. globisporus 1912‑2 и ряда Интернет баз данных NCBI (Genome, Nucleotide). Результаты. Выявлено ряд штаммов со значительными показателями гомологии их первичной структуры ДНК и нуклеотидной последовательности хромосомной ДНК S. globisporus 1912-2 (степенью идентичности (88–97 %) и степенью покрытием (55–82 %)). Максимальная идентичность нуклеотидной последовательности хромосомной ДНК S. globisporus 1912‑2 была выявлена у геномов штаммов S. globisporus C-1027 (97 %) и S. griseus NBRC13350 (96 %). Ни одного фрагмента с первичной структурой, гомологичной структурам семи контигов S. globisporus 1912‑2 не было найдено среди нуклеотидных последовательностей стрептомицетов из базы данных NCBI. Выводы. Установлено, что штамм S. globisporus 1912‑2 является членом клады S. griseus. Мы выявили большой биосинтетический потенциал штамма S. globisporus 1912-2, возможный благодаря его многим уникальным нуклеотидным последовательностям

VALUE OF ALTERNATIVE SOURCES OF ENERGY AND ECONOMIC EFFICIENCY OF BEEF PRODUCTION WHEN KEEPING NOT TETHERED IN BOXES

Оцінка енергетичної цінності забійної маси, отриманої при забої надремонтного молодняку великої рогатої худоби української чорно–рябої молочної породи показали, що показник бичків у віці 15 місяців становив 2726,0 МДж, що на 18,8% більше ніж показник теличок, а в 18 місяців – 3256,7 МДж – на 19,2% відповідно. Еквівалентний показник отриманої електроенергії із додаткової передзабійної живої маси у бичків 18 місяців – 61,5 кВт, що на 17,6% більше, порівняно з аналогічним показником у віці 15 місяців, еквівалентний показник отриманої електроенергії із додаткової забійної маси у бичків 18 місяців був більший на 17,6% відповідно. За відсотком відхилень додаткової альтернативної енергії встановлено, що вирощування бичків ефективніше на 28,9 – 29%, порівняно із вирощуванням теличок. Оцінка забою бичків, порівняно з теличками показали суттєву перевагу бичків за виходом парної туші на 22,0% у 15 місяців та на 34,7% у 18 місяців, за забійною масою – на 18,38% і 31,50% відповідно. Дотримання нормованих умов годівлі та утримання дозволили від бичків та теличок української чорно–рябої молочної породи отримати прибуток від реалізації бичків у 15 місяців на 36,4% менше, порівняно з прибутком після утримання до 18 місяців, теличок – на 25,2%, рівень рентабельності – на 9,0% і 2,2%, відповідно.Оценка энергетической ценности убойной массы, полученной при забое надремонтного молодняка крупного рогатого скота украинской черно–пестрой молочной породы показали, что показатель бычков в возрасте 15 месяцев составил 2726,0 МДж, что на 18,8% больше показателя телочек, а в 18 месяцев – 3256,7 МДж – на 19,2% соответственно. Эквивалентный показатель полученной электроэнергии с дополнительной предубойной живой массы у бычков 18 месяцев – 61,5 кВт, что на 17,6% больше по сравнению с аналогичным показателем в возрасте 15 месяцев, эквивалентный показатель полученной электроэнергии с дополнительной убойной массы у бычков 18 месяцев был больше на 17,6% соответственно. По проценту отклонений дополнительной альтернативной энергии установлено, что выращивание бычков эффективнее на 28,9 – 29% по сравнению с выращиванием телок. Оценка забоя бычков, по сравнению с телочками показали существенное преимущество бычков за выходом парной туши на 22,0% в 15 месяцев и на 34,7% в 18 месяцев, по убойной массе – на 18,38% и 31,50% соответственно. Соблюдение нормированных условий кормления и содержания позволили от бычков и телочек украинской черно–пестрой молочной породы получить прибыль от реализации бычков в 15 месяцев на 36,4% меньше по сравнению с прибылью после содержания до 18 месяцев, телочек – на 25,2%, уровень рентабельности – на 9,0% и 2,2%, соответственно.The assessment of the energy value of the slaughter weight obtained in young cattle of Ukrainian black–and–motley dairy breed have shown that the rate of bull–calves at the age of 15 months was 2726.0 megajoule. It is by 18.8% more than the rate of heifers. It was 3.256.7 megajoule and by 19.2% respectively at the age of 18 months. The rate of obtained electricity from additional live weight before slaughter in bull–calves of 18 months old was equivalent to 61.5 kilowatt. It is 17.6% more compared to the same rate at the age of 15 months. The rate of obtained electricity from additional slaughter weight in bull–calves of 18 months old was more than 17.6% respectively. It was found that bull–calves raising is by 28.9 – 29% more effective compared with that of heifers in the percentage of additional alternative deviations. The evaluation of bull–calves slaughter compared to heifers have shown a significant advantage in the release of pair carcass by 22.0% at the age of 15 months and 34.7% at the age of 18 months, in the slaughter weight – by 18.38% and 31.50% respectively. Observing standardized feeding and keeping conditions allowed to make profit from the sale of bull–calves of Ukrainian black–and–motley dairy breed at the age of 15 months by 36.4% and of heifers by 25.2% less compared with the profit when keeping till the age of 18 months. The profitability was 9.0% and 2.2%, respectively

Genetic characterization of porcine circovirus type 2 (PCV2) from wild boars detected in different regions of Ukraine

Circovirus type 2 are an extremely common swine virus in terms of [is a swine virus extremely widespread in] industrial farming worldwide, including Ukraine]. A similar situation was de-scribed in Ukraine. It leads to an immunosuppressive condition of animals and high mortality of animals. Due to the [Considering a] variety of PCV-2 strains in the world, and the difference be-tween strains common in wildlife and farms, [it is necessary to characterize] the characterization of field isolates found among wild boars in Ukraine is required. So, in this work [the] isolates from wild boars from different regions of Ukraine were characterized and differentiated by phy-logenent [phylogenetic] analysis. As a result of the study, it was shown that [the] isolates from the Chernihiv, Zaporizhzhya, Cherkasy and Kharkiv regions belong to different subgroups of the PCV-2 and have different origin. In addition [Additionally], a relatively high level of similarity with the isolates from Croatia and Brazil has been established. At the same time, the similarity of isolates isolated from wild boars from the Zaporizhzhya and Chernihiv oblasts has been shown to have been isolated from pigs from industrial farms. [At the same time, it has been shown the simi-larity of isolates from wild boars from the Zaporizhzhya and Chernihiv regions with those from pigs of industrial farms.]Цирковірус свиней 2 типу є надзвичайно розповсюдженим у всьому світі вірусом серед свиней в умовах промислового вирощування. Ураження вірусом призводить до імуносупресивного стану тварин та високої смертності. З огляду на велику різноманітність штамів ЦВС-2 у світі, та відмінність між штамами, розповсюдженими в дикій природі та на фермах, необхідною є характеристика польових ізолятів, виявлених в Україні серед диких кабанів. Мета. Охарактеризувати та диференціювати ізоляти ЦВС-2, виділені від диких кабанів з різних регіонів України. Методи. Філогенентичний аналіз. Результати. Показано, що ізоляти з Чернігівської, Запорізької, Черкаської та Харківської областей належать до різних субгруп ЦВС-2 та мають різне походження. Крім того, встановлено досить високий рівень їхньої подібності з ізолятами з Хорватії та Бразилії. Водночас, показано подібність ізолятів, виділених від диких кабанів із Запорізької та Чернігівської областей з такими, що були виділені від свиней з промислових господарств. Висновки.Цирковирус свиней 2 типа является чрезвычайно распространенным во всем мире вирусом среди свиней в условиях промышленного выращивания. Заражение вируса приводит к иммуносупрессивному состоянию животных и высокой смертности. Учитывая большое разнообразие штаммов ЦВС-2 в мире, и различие между штаммами, распространенными в дикой природе и на фермах, необходима характеристика полевых изолятов, выявленных в Украине среди диких кабанов. Цель. Охарактеризовать и дифференцировать изоляты ЦВС-2, выделенные от диких кабанов из разных регионов Украины. Методы. Филогенентический анализ . Результаты. Показано, что изоляты из Черниговской, Запорожской, Черкасской и Харьковской областей относятся к различным субгрупам ЦВС-2 и имеют разное происхождение. Кроме того, установлено достаточно высокий уровень их сходства с изолятами из Хорватии и Бразилии. В то же время, показано сходство изолятов, выделенных от диких кабанов Запорожской и Черниговской областей, с выделенными от свиней из промышленных хозяйств. Выводы. Ключевые слова: цирковирус свиней 2 типа, дикие кабаны, филогенетический анализ, генетическое разнообразие

Cladoceran birth and death rates estimates

I. Birth and death rates of natural cladoceran populations cannot be measured directly. Estimates of these population parameters must be calculated using methods that make assumptions about the form of population growth. These methods generally assume that the population has a stable age distribution. 2. To assess the effect of variable age distributions, we tested six egg ratio methods for estimating birth and death rates with data from thirty-seven laboratory populations of Daphnia pulicaria. The populations were grown under constant conditions, but the initial age distributions and egg ratios of the populations varied. Actual death rates were virtually zero, so the difference between the estimated and actual death rates measured the error in both birth and death rate estimates. 3. The results demonstrate that unstable population structures may produce large errors in the birth and death rates estimated by any of these methods. Among the methods tested, Taylor and Slatkin's formula and Paloheimo's formula were most reliable for the experimental data. 4. Further analyses of three of the methods were made using computer simulations of growth of age-structured populations with initially unstable age distributions. These analyses show that the time interval between sampling strongly influences the reliability of birth and death rate estimates. At a sampling interval of 2.5 days (equal to the duration of the egg stage), Paloheimo's formula was most accurate. At longer intervals (7.5–10 days), Taylor and Slatkin's formula which includes information on population structure was most accurate

Clinical-epidemiological characteristics of acute bacterial meningitis in children of Khmelnitskyi region (Podilsky region, Ukraine): fifteen-year-long

Acute bacterial meningitis (ABM) leads to a significant number of complications and high mortality. The aim - to analyze the etiological structure, epidemiological, socio-demographic features and complications in ABM in children of Khmelnitskyi region during 2004-2018. Materials and methods. The analysis of 346 cases of ABM, of which 217 boys and 129 girls was conducted. The etiology of meningitis was determined by bacterioscopy, bacteriological sowing, latex agglutination and polymerase chain reaction. Complications were revealed based on the clinical picture and computed tomography and мagnetic resonance imaging. The processing of the results was carried out using analytical method, t-criterion and constructing 95% confidence interval. Results. The disease started with fever 346 (100%), neck stiffness 289 (83.5%) and vomiting 273 (78.9%), less common, alteration of consciousness 28 (8.1%) and seizures 9 (2.6%). The high level of the cytosis were observed in meningococcal (5801.3±4856.7 cells/mm3) and Hib meningitis (5152.6±4153.1 cells/mm3), the lowest level was in pneumococcal meningitis (2601.0±1839.6 cells/mm3). The highest level of liquor protein was in pneumococcal meningitis (179.0±51.0 mg/dl), and the lowest level was in meningococcal meningitis (102.0±49.0 mg/dl) and Hib meningitis (112.0±56.0 mg/dl). The etiological factor was established in 121 (35.0%) of patients. 52 (15.4%) of patients had neurological complications. Conclusions. The majority (58.1%) of ABM are in children under the age of 3. The main causative agent remains N. meningitidis - 57.9%, the second place is S. pneumoniae - 21.5%, the third Hib - 9.9% of cases. Frequent complications were brain edema 32 (61.5%), seizures 19 (36.5%) and hydrocephalus 8 (15.4%). The study was conducted in accordance with the principles of the Declaration of Helsinki. The research protocol was approved by the Local Ethics Committee of the institution mentioned in the work. Informed consent of the children’s parents was obtained for the research. No conflict of interests was declared by the authors

Genotype by yield × trait (GYT) biplot analysis for the identification of the superior winter and facultative barley breeding lines

Received: January 25th, 2023 ; Accepted: May 21st, 2023 ; Published: June 17th, 2023 ; Corresponding author e-mail: [email protected] the present study, in a panel of promising winter and facultative barley (Hordeum vulgare L.) breeding lines, the peculiarities of yield performance and its combination with resistance (tolerance) to the most common under conditions of the Ukrainian Forest-Steppe abiotic and biotic stresses have been determined. In 2016-17–2018-19 the breeding lines were differentiated based on grain yield, thousand kernel weight, frost resistance, leakage of electrolytes, relative drought tolerance, lodging resistance, and resistance to powdery mildew (caused by Blumeria graminis (DC.) E. O. Speer, f. sp. hordei emend. É. J. Marchal (anamorph Oidium monilioides Link)), spot blotch (caused by Cochliobolus sativus (anamorph Bipolaris sorokiniana [Sacc.] Shoem.)), and leaf rust (caused by Puccinia hordei Otth.). GYT (genotype by yield × trait) biplot model was used for comprehensive evaluation of the breeding lines by a combination of yield with a complex of traits. As a result, the winter breeding line ‘Pallidum 5096’ and facultative breeding line ‘Pallidum 5110’ superior to others in terms of yield × traits combinations have been identified. These breeding lines as new varieties ‘MIP Atlas’ and ‘MIP Yanus’ accordingly have been submitted to the Ukrainian Institute for Plant Variety Examination for further State Qualification Examination. The winter (‘Pallidum 5134’, ‘Pallidum 5097’, ‘Pallidum 5024’, ‘Pallidum 5090’, and ‘Pallidum 5130’) and facultative (‘Pallidum 5153’, ‘Pallidum 5102’, ‘Pallidum 5126’, and ‘Pallidum 5131’) breeding lines can be used as valuable genetic sources in breeding programs in Ukraine and some other Central a nd Eastern European countries

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA.

Aim. To determine the similarity and dissimilarity of the nucleotide sequences of the S. globisporus 1912-2 chromosome and primary structures of genomes of some Streptomycetes strains. Methods. NCBI tools (BLAST: blastn and bl2seq: megablast) and Internet NCBI databases (Genome, Nucleotide) were used for in silico analysis of the primary structure contigs of S. grlobisporus 1912-2. Results. A few strains with significant identity of their DNA primary structures to the nucleotide sequences of the chromosomal DNA of S. globisporus 1912-2 (identity 88–97 %) and a degree of query cover (55–82 %) were identified. Primary structures of genomes of the strains S. globisporus C-1027 and S. griseus NBRC13350 were chosen as most identical to the nucleotide sequence of the S. globisporus 1912-2 chromosomal DNA. No fragments with a homologous primary structure to seven S. globisporus 1912-2 contigs were found in Streptomycetes spp. from the NCBI databases. Conclusions. S. globisporus 1912-2 strain is a member of the S. griseus clade. We detected a high biosynthetic potential of the strain S. globisporus 1912-2 due to many unique nucleotide sequences.Мета. Визначити подібності та відмінності первинних структур геномів ряду штамів стрептоміцетів і хромосомної ДНК S. globisporus 1912-2 in silico. Методи. Використовували ресурси сервера NCBI (BLAST: blastn і bl2seq: megablast) для in silico аналізу первинної структури контигів S. grlobisporus 1912-2 і ряду Інтернет баз даних NCBI (Genome, Nucleotide). Результати. Виявлено ряд штамів зі значними показниками гомології їх первинної структури ДНК і нуклеотидної послідовності хромосомної ДНК S. globisporus 1912-2 (ступенем ідентичності (88–97 %) і ступенем покриттям (55–82 %)). Максимальна ідентичність нуклеотидній послідовності хромосомної ДНК S. globisporus 1912-2 було виявлена у геномів штамів S. globisporus C-1027 (97 %) і S. griseus NBRC13350 (96%). Жодного фрагмента з первинною структурою, гомологичною структурам семи контігов S. globisporus 1912-2 не було знайдено серед нуклеотидних послідовностей стрептоміцетів з базах даних NCBI. Висновки. Встановлено, що штам S. globisporus 1912-2 є членом клади S. griseus. Ми виявили великий біосинтетичний потенціал штаму S. globisporus 1912-2, можливий завдяки його багатьом унікальним нуклеотидним послідовностям.Цель. Определить in silico сходство и отличие первичных структур геномов ряда штаммов стрептомицетов и хромосомной ДНК S. globisporus 1912-2. Методы. Использовали ресурсы сервера NCBI (BLAST: blastn и bl2seq: megablast) для in silico анализа первичной структуры контигов S. globisporus 1912‑2 и ряда Интернет баз данных NCBI (Genome, Nucleotide). Результаты. Выявлено ряд штаммов со значительными показателями гомологии их первичной структуры ДНК и нуклеотидной последовательности хромосомной ДНК S. globisporus 1912-2 (степенью идентичности (88–97 %) и степенью покрытием (55–82 %)). Максимальная идентичность нуклеотидной последовательности хромосомной ДНК S. globisporus 1912‑2 была выявлена у геномов штаммов S. globisporus C-1027 (97 %) и S. griseus NBRC13350 (96 %). Ни одного фрагмента с первичной структурой, гомологичной структурам семи контигов S. globisporus 1912‑2 не было найдено среди нуклеотидных последовательностей стрептомицетов из базы данных NCBI. Выводы. Установлено, что штамм S. globisporus 1912‑2 является членом клады S. griseus. Мы выявили большой биосинтетический потенциал штамма S. globisporus 1912-2, возможный благодаря его многим уникальным нуклеотидным последовательностям

Genetic characterization of porcine circovirus type 2 (PCV2) from wild boars detected in different regions of Ukraine

Circovirus type 2 are an extremely common swine virus in terms of [is a swine virus extremely widespread in] industrial farming worldwide, including Ukraine]. A similar situation was de-scribed in Ukraine. It leads to an immunosuppressive condition of animals and high mortality of animals. Due to the [Considering a] variety of PCV-2 strains in the world, and the difference be-tween strains common in wildlife and farms, [it is necessary to characterize] the characterization of field isolates found among wild boars in Ukraine is required. So, in this work [the] isolates from wild boars from different regions of Ukraine were characterized and differentiated by phy-logenent [phylogenetic] analysis. As a result of the study, it was shown that [the] isolates from the Chernihiv, Zaporizhzhya, Cherkasy and Kharkiv regions belong to different subgroups of the PCV-2 and have different origin. In addition [Additionally], a relatively high level of similarity with the isolates from Croatia and Brazil has been established. At the same time, the similarity of isolates isolated from wild boars from the Zaporizhzhya and Chernihiv oblasts has been shown to have been isolated from pigs from industrial farms. [At the same time, it has been shown the simi-larity of isolates from wild boars from the Zaporizhzhya and Chernihiv regions with those from pigs of industrial farms.]Цирковірус свиней 2 типу є надзвичайно розповсюдженим у всьому світі вірусом серед свиней в умовах промислового вирощування. Ураження вірусом призводить до імуносупресивного стану тварин та високої смертності. З огляду на велику різноманітність штамів ЦВС-2 у світі, та відмінність між штамами, розповсюдженими в дикій природі та на фермах, необхідною є характеристика польових ізолятів, виявлених в Україні серед диких кабанів. Мета. Охарактеризувати та диференціювати ізоляти ЦВС-2, виділені від диких кабанів з різних регіонів України. Методи. Філогенентичний аналіз. Результати. Показано, що ізоляти з Чернігівської, Запорізької, Черкаської та Харківської областей належать до різних субгруп ЦВС-2 та мають різне походження. Крім того, встановлено досить високий рівень їхньої подібності з ізолятами з Хорватії та Бразилії. Водночас, показано подібність ізолятів, виділених від диких кабанів із Запорізької та Чернігівської областей з такими, що були виділені від свиней з промислових господарств. Висновки.Цирковирус свиней 2 типа является чрезвычайно распространенным во всем мире вирусом среди свиней в условиях промышленного выращивания. Заражение вируса приводит к иммуносупрессивному состоянию животных и высокой смертности. Учитывая большое разнообразие штаммов ЦВС-2 в мире, и различие между штаммами, распространенными в дикой природе и на фермах, необходима характеристика полевых изолятов, выявленных в Украине среди диких кабанов. Цель. Охарактеризовать и дифференцировать изоляты ЦВС-2, выделенные от диких кабанов из разных регионов Украины. Методы. Филогенентический анализ . Результаты. Показано, что изоляты из Черниговской, Запорожской, Черкасской и Харьковской областей относятся к различным субгрупам ЦВС-2 и имеют разное происхождение. Кроме того, установлено достаточно высокий уровень их сходства с изолятами из Хорватии и Бразилии. В то же время, показано сходство изолятов, выделенных от диких кабанов Запорожской и Черниговской областей, с выделенными от свиней из промышленных хозяйств. Выводы. Ключевые слова: цирковирус свиней 2 типа, дикие кабаны, филогенетический анализ, генетическое разнообразие

Plasmids From Soil Streptomyctes

An investigation on a small collection of Streptomyces strains, freshly isolated from soil, showed the presence of plasmids in 25% of the cultures. Two plasmids were subjected to restriction enzymes