137 research outputs found
GIBaren kontrako tratamendua. Berrikuspen historikoa
Despite its relatively recent emergence, HIV has managed to become a public health problem on a global scale and according to the WHO[1] it standed in the top 10 causes of death until 2016. When it first appeared the reaction of health systems in developed countries was slow, but HIV soon became one of the most studied viruses. Nowadays we know many of the details of its biology, its life cycle and the pathophysiology of the disease it causes: the Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS). This knowledge promted the pharmacological research, which, from a few compounds of limited efficacy, managed to create several families of molecules. Although these molecules are not capable to eradicate the virus, they have turned a deadly infection into a chronic disease, specially in the first world countries, where the provision of these drugs is guaranteed. The development of new drugs against HIV was arduous and it became possible thanks to the advances in molecular biology, physics and pharmaceutical chemistry that took place in the last century. However, there is still a long way to go and, although there are still many aspects of HIV to be elucidated, some deep changes in its treatment can be foreseen in the upcoming years.; Giza immunoeskasiaren birusa (GIBa) oldar sartzea nahiko berria izan arren, mundu mailako osasun- arazo publiko bihurtu da. WHO [1]-aren arabera, 2016ra arte heriotza-arrazoietan lehenengo hamarretako bat zen, eta nahiz eta haren agerpenak herrialde garatuen osasun-sistemetan erreakzio motela eragin, laster, gehien ikerturiko birusetakoa bilakatu zen. Gaur egun, haren biologiaren, bizi-zikloaren eta eragindako gaixotasuna den hartutako immunoeskasiaren sindromeari (HIESari) buruzko fisiopatologiaren inguruko xehetasun ugari ezagutzen dugu. Hau guztia ikerketa farmakologikoetara islatu da, non eraginkortasun mugatua zuten konposatu batzuetatik abiatuta, molekula-familia ugari sortu den. Molekula hauek ezin dute birusa ezabatu, baina infekzio hilkorra gaixotasun kroniko bihurtu dute; batez ere, lehen munduan, non konposatu hauen lorpena bermatuta dagoen. Molekula hauen garapena zaila izan da, eta, horretarako, teknikarik aurreratuenak erabili dira; hots, azken mendean biologiaren, fisikaren eta farmazia-kimikaren alorretan egindako goren-mailako aurrerapenak. Hala eta guztiz ere, oraindik sendabide eraginkorraren lorpenaren bidean gaude, eta GIBaren alde asko argitzeke dagoen arren, hurrengo urteetako terapeutikan aldaketa sakon batzuk aurreikus daitezke
Model Systems of Precursor Cellular Membranes: Long-Chain Alcohols Stabilize Spontaneously Formed Oleic Acid Vesicles
AbstractOleic acid vesicles have been used as model systems to study the properties of membranes that could be the evolutionary precursors of more complex, stable, and impermeable phospholipid biomembranes. Pure fatty acid vesicles in general show high sensitivity to ionic strength and pH variation, but there is growing evidence that this lack of stability can be counterbalanced through mixtures with other amphiphilic or surfactant compounds. Here, we present a systematic experimental analysis of the oleic acid system and explore the spontaneous formation of vesicles under different conditions, as well as the effects that alcohols and alkanes may have in the process. Our results support the hypothesis that alcohols (in particular 10- to 14-C-atom alcohols) contribute to the stability of oleic acid vesicles under a wider range of experimental conditions. Moreover, studies of mixed oleic-acid-alkane and oleic-acid-alcohol systems using infrared spectroscopy and Langmuir trough measurements indicate that precisely those alcohols that increased vesicle stability also decreased the mobility of oleic acid polar headgroups, as well as the area/molecule of lipid
Effect of ATG12-ATG5-ATG16L1 autophagy E3 complex on the ability of LC3/GABARAP proteins to induce
Trabajo presentado en el 44º Congreso Nacional de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM), celebrado en Málaga entre el 6 y el 9 de septiembre de 2022.In macroautophagy, the autophagosome (AP) engulfs portions of cytoplasm to allow their lysosomal degradation. AP formation in humans requires the concerted action of the ATG12 and LC3/GABARAP conjugation systems. The ATG12–ATG5-ATG16L1 (E3) complex acts as a ubiquitin-like E3 ligase enzyme, promoting LC3/GABARAP protein anchoring to the AP membrane. The role of the various proteins in the AP expansion process is still unclear, in part because there are no studies comparing LC3/GABARAP-family member roles under the same conditions, and also because the full human E3 complex was only recently available. In the present study, the lipidation of six members of the LC3/GABARAP family has been reconstituted in the presence and absence of E3, and the mechanisms by which E3 and LC3/GABARAP proteins participate in vesicle tethering and fusion have been investigated. In the absence of E3, GABARAP and GABARAPL1 showed the highest activities. Differences found within LC3/GABARAP proteins suggest the existence of a lipidation threshold, lower for the GABARAP subfamily, as a requisite for tethering and inter-vesicular lipid mixing. E3 increases and speeds up lipidation and LC3/GABARAP-promoted tethering. However E3 hampers LC3/GABARAP capacity to induce intervesicular lipid mixing or subsequent fusion, presumably through formation of a rigid scaffold on the vesicle surface. Our results suggest a model of AP expansion in which the growing regions would be areas where the LC3/GABARAP proteins involved should be susceptible to lipidation in the absence of E3, or else a regulation should exist to inhibit the formation of an E3 immobile scaffold
E3 autophagy complex and LC3/GABARAP proteins in autophagosome generation
Póster presentado al 8th International Iberian Biophysics Congress celebrado en Bilbao los días 20 y 21 de junio de 2022.In macroautophagy, autophagosome (AP) formation in humans requires the concerted action of the LC3/GABARAP and ATG12 ubiquitin-like conjugation systems. In the present study, the conjugation to the membrane of six members of the LC3/GABARAP family has been reconstituted in the presence and absence of the product of the ATG12 system (the E3 complex). In addition, the mechanisms by which the different LC3/GABARAP proteins and E3 could participate in vesicle tethering and fusion during AP expansion have been investigated. In the absence of E3, GABARAP and GABARAPL1 showed the highest activities. E3 increases and speeds up lipidation and LC3/GABARAP-promoted tethering. However, E3 hampers LC3/GABARAP capacity to induce inter-vesicular lipid mixing or subsequent fusion, presumably through formation of a rigid scaffold on the vesicle surface. Our results suggest a model of AP expansion in which the growing regions would be areas where the LC3/GABARAP proteins involved should be susceptible to lipidation in the absence of E3, or else a regulation should exist to inhibit the formationof an E3 immobile scaffold
Prevalencia relativa de microdeleción 22Q11.2 en pacientes pediátricos y adultos asistidos en la ciudad de Córdoba
La microdeleción intersticial 22q11.2, es la más frecuentes en humanos; se estima una prevalencia de 1/ 4000 recién nacidos, presentando una marcada variabilidad Clínica que abarca Síndrome de Di George, Velocardiofacial, Cayler, cardiopatías conotruncales aisladas, formas autosómicas dominantes de Opitz BBB y un subtipo de esquizofrenia caracterizada por dismorfias y disfunción cognitiva. Hipótesis: en nuestro medio existe un subdiagnóstico de esta patología especialmente adultos con problemas de comportamiento tardíos, probablemente atribuible al desconocimiento de la gran variabilidad fenotípica. Objetivos: estimar la prevalencia relativa de microdeleción 22q11.2 en nuestro medio. Correlacionar los hallazgos clínicos con la citogenética de alta resolución y molecular. Diagnosticar las formas heredables. Material y Método: se evaluarán prospectivamente los pacientes derivados por los servicios de cardiología, cardiocirugía, inmunología, psiquiatría que reúnan criterios clínicos de sospecha de microdeleción 22q11.2 desde octubre de 2009 hasta septiembre de 2011. Se excluirán pacientes con cardiopatías conotruncales, insuficiencias velopalatinas, inmunodeficiencias y esquizofrenia encuadradas en otros diagnósticos. Se solicitará consentimiento informado. Se realizará evaluación clínica en el consultorio de Genética Médica. Se efectuará citogenética con técnicas de alta resolución e hibridación in situ fluorescente (FISH). A los progenitores de los pacientes positivos se les realizará igual evaluación clínica y de laboratorio. Resultados: se espera realizar diagnóstico de certeza de microdeleción 22q11.2 en el 90% de los Síndromes de Di George/Velocardiofacial, 20% de las anomalías conotruncales aisladas, 7 al 10% de las formas heredables, 2% de pacientes con esquizofrenia; en este último grupo; el porcentaje puede ascender a un 6%, según datos publicados, si se eligen subpoblaciones de pacientes con retraso del desarrollo, dismorfias, antecedentes de trastornos en el aprendizaje y el lenguaje, voz nasal, historia de hipocalcemia y de aplasia o hipoplasia tímica. Importancia del proyecto: realizar diagnóstico precoz de esta entidad en pacientes pediátricos, adultos con esquizofrenia y formas heredables, lo que permitirá realizar un abordaje interdisciplinario integral de estos individuos y su familia, contribuyendo a un uso racional de los recursos disponibles para optimizar la calidad del servicio de salud.Pertinencia: en relación al tema "innovación y desarrollo tecnológico en medicamentos y tecnología médica" se realizarán técnicas de citogenética molecular (hibridación in situ fluorescente-FISH), indicadas para realizar diagnóstico de certeza de la enfermedad, tanto en las formas esporádicas como en las heredables.Fil: Rossi, Norma Teresa. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Juaneda Simian, Ernesto Mario. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias de la Salud; Argentin
Prevalencia relativa de Microdeleción 22q11.2 en pacientes pediátricos y adultos asistidos en la Ciudad de Córdoba
La microdeleción intersticial 22q11.2, es la más frecuentes en humanos; se estima una prevalencia de 1/ 4000 recién nacidos, presentando una marcada variabilidad Clínica que abarca Síndrome de Di George, Velocardiofacial, Cayler, cardiopatías conotruncales aisladas, formas autosómicas dominantes de Opitz BBB y un subtipo de esquizofrenia caracterizada por dismorfias y disfunción cognitiva. Hipótesis: en nuestro medio existe un subdiagnóstico de esta patología especialmente adultos con problemas de comportamiento tardíos, probablemente atribuible al desconocimiento de la gran variabilidad fenotípica. Objetivos: estimar la prevalencia relativa de microdeleción 22q11.2 en nuestro medio. Correlacionar los hallazgos clínicos con la citogenética de alta resolución y molecular. Diagnosticar las formas heredables. Material y Método: se evaluaran prospectivamente los pacientes derivados por los servicios de cardiología, cardiocirugía, inmunología, psiquiatría que reúnan criterios clínicos de sospecha de microdeleción 22q11.2 desde octubre de 2009 hasta septiembre de 2011. Se excluirán pacientes con cardiopatías conotruncales, insuficiencias velopalatinas, inmunodeficiencias y esquizofrenia encuadradas en otros diagnósticos. Se solicitará consentimiento informado. Se realizará evaluación clínica en el consultorio de Genética Médica. Se efectuará citogenética con técnicas de alta resolución e hibridación in situ fluorescente (FISH). A los progenitores de los pacientes positivos se les realizará igual evaluación clínica y de laboratorio. Resultados: se espera realizar diagnóstico de certeza de microdeleción 22q11.2 en el 90% de los Síndromes de Di George/Velocardiofacial, 20% de las anomalías conotruncales aisladas, 7 al 10% de las formas heredables, 2% de pacientes con esquizofrenia; en este último grupo; el porcentaje puede ascender a un 6%, según datos publicados, si se eligen subpoblaciones de pacientes con retraso del desarrollo, dismorfias, antecedentes de trastornos en el aprendizaje y el lenguaje, voz nasal, historia de hipocalcemia y de aplasia o hipoplasia tímica. Importancia del proyecto: realizar diagnóstico precoz de esta entidad en pacientes pediátricos, adultos con esquizofrenia y formas heredables, lo que permitirá realizar un abordaje interdisciplinario integral de estos individuos y su familia, contribuyendo a un uso racional de los recursos disponibles para optimizar la calidad del servicio de salud. Pertinencia: en relación al tema “innovación y desarrollo tecnológico en medicamentos y tecnología médica” se realizarán técnicas de citogenética molecular (hibridación in situ fluorescente-FISH), indicadas para realizar diagnóstico de certeza de la enfermedad, tanto en las formas esporádicas como en las heredables.Fil: Rossi, Norma Teresa. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Juaneda Simian, Ernesto Mario. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias de la Salud; Argentin
Prevalencia relativa de Microdeleción 22q11.2 en pacientes pediátricos y adultos asistidos en la Ciudad de Córdoba
La microdeleción intersticial 22q11.2, es la más frecuentes en humanos; se estima una prevalencia de 1/ 4000 recién nacidos, presentando una marcada variabilidad Clínica que abarca Síndrome de Di George, Velocardiofacial, Cayler, cardiopatías conotruncales aisladas, formas autosómicas dominantes de Opitz BBB y un subtipo de esquizofrenia caracterizada por dismorfias y disfunción cognitiva. Hipótesis: en nuestro medio existe un subdiagnóstico de esta patología especialmente adultos con problemas de comportamiento tardíos, probablemente atribuible al desconocimiento de la gran variabilidad fenotípica. Objetivos: estimar la prevalencia relativa de microdeleción 22q11.2 en nuestro medio. Correlacionar los hallazgos clínicos con la citogenética de alta resolución y molecular. Diagnosticar las formas heredables. Material y Método: se evaluaran prospectivamente los pacientes derivados por los servicios de cardiología, cardiocirugía, inmunología, psiquiatría que reúnan criterios clínicos de sospecha de microdeleción 22q11.2 desde octubre de 2009 hasta septiembre de 2011. Se excluirán pacientes con cardiopatías conotruncales, insuficiencias velopalatinas, inmunodeficiencias y esquizofrenia encuadradas en otros diagnósticos. Se solicitará consentimiento informado. Se realizará evaluación clínica en el consultorio de Genética Médica. Se efectuará citogenética con técnicas de alta resolución e hibridación in situ fluorescente (FISH). A los progenitores de los pacientes positivos se les realizará igual evaluación clínica y de laboratorio. Resultados: se espera realizar diagnóstico de certeza de microdeleción 22q11.2 en el 90% de los Síndromes de Di George/Velocardiofacial, 20% de las anomalías conotruncales aisladas, 7 al 10% de las formas heredables, 2% de pacientes con esquizofrenia; en este último grupo; el porcentaje puede ascender a un 6%, según datos publicados, si se eligen subpoblaciones de pacientes con retraso del desarrollo, dismorfias, antecedentes de trastornos en el aprendizaje y el lenguaje, voz nasal, historia de hipocalcemia y de aplasia o hipoplasia tímica. Importancia del proyecto: realizar diagnóstico precoz de esta entidad en pacientes pediátricos, adultos con esquizofrenia y formas heredables, lo que permitirá realizar un abordaje interdisciplinario integral de estos individuos y su familia, contribuyendo a un uso racional de los recursos disponibles para optimizar la calidad del servicio de salud. Pertinencia: en relación al tema “innovación y desarrollo tecnológico en medicamentos y tecnología médica” se realizarán técnicas de citogenética molecular (hibridación in situ fluorescente-FISH), indicadas para realizar diagnóstico de certeza de la enfermedad, tanto en las formas esporádicas como en las heredables.Fil: Rossi, Norma Teresa. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Juaneda Simian, Ernesto Mario. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias de la Salud; Argentin
Modeling what we sample and sampling what we model: challenges for zooplankton model assessment
Zooplankton are the intermediate trophic level between phytoplankton and fish, and are an important component of carbon and nutrient cycles, accounting for a large proportion of the energy transfer to pelagic fishes and the deep ocean. Given zooplankton's importance, models need to adequately represent zooplankton dynamics. A major obstacle, though, is the lack of model assessment. Here we try and stimulate the assessment of zooplankton in models by filling three gaps. The first is that many zooplankton observationalists are unfamiliar with the biogeochemical, ecosystem, size-based and individual-based models that have zooplankton functional groups, so we describe their primary uses and how each typically represents zooplankton. The second gap is that many modelers are unaware of the zooplankton data that are available, and are unaccustomed to the different zooplankton sampling systems, so we describe the main sampling platforms and discuss their strengths and weaknesses for model assessment. Filling these gaps in our understanding of models and observations provides the necessary context to address the last gap—a blueprint for model assessment of zooplankton. We detail two ways that zooplankton biomass/abundance observations can be used to assess models: data wrangling that transforms observations to be more similar to model output; and observation models that transform model outputs to be more like observations. We hope that this review will encourage greater assessment of zooplankton in models and ultimately improve the representation of their dynamics
Effect of ATG12-ATG5-ATG16L1 autophagy E3-like complex on the ability of LC3/GABARAP proteins to induce vesicle tethering and fusion
In macroautophagy, the autophagosome (AP) engulfs portions of cytoplasm to allow their lysosomal degradation. AP formation in humans requires the concerted action of the ATG12 and LC3/GABARAP conjugation systems. The ATG12-ATG5-ATG16L1 or E3-like complex (E3 for short) acts as a ubiquitin-like E3 enzyme, promoting LC3/GABARAP proteins anchoring to the AP membrane. Their role in the AP expansion process is still unclear, in part because there are no studies comparing six LC3/GABARAP family member roles under the same conditions, and also because the full human E3 was only recently available. In the present study, the lipidation of six members of the LC3/GABARAP family has been reconstituted in the presence and absence of E3, and the mechanisms by which E3 and LC3/GABARAP proteins participate in vesicle tethering and fusion have been investigated. In the absence of E3, GABARAP and GABARAPL1 showed the highest activities. Differences found within LC3/GABARAP proteins suggest the existence of a lipidation threshold, lower for the GABARAP subfamily, as a requisite for tethering and inter-vesicular lipid mixing. E3 increases and speeds up lipidation and LC3/GABARAP-promoted tethering. However, E3 hampers LC3/GABARAP capacity to induce inter-vesicular lipid mixing or subsequent fusion, presumably through the formation of a rigid scaffold on the vesicle surface. Our results suggest a model of AP expansion in which the growing regions would be areas where the LC3/GABARAP proteins involved should be susceptible to lipidation in the absence of E3, or else a regulatory mechanism would allow vesicle incorporation and phagophore growth when E3 is present.Open Access funding provided thanks to the CRUE-CSIC agreement with Springer Nature. This work was supported in part by the Spanish Ministerio de Ciencia e Innovación (MCI), Agencia Estatal de Investigación (AEI) and Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) (grants No. PGC2018-099857-B-I00 and PID2021-124461NB-I00), by the Basque Government (grants No. IT1625-22 and IT1270-19), by Fundación Biofísica Bizkaia, by Fundación Ramón Areces (grant No. CIVP20A6619), and by the Basque Excellence Research Centre (BERC) program of the Basque Government. MI and YV were recipients of predoctoral FPU fellowships from the Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities (FPU16/05873, FPU18/00799), UB thanks the University of the Basque Country for a predoctoral contract. This work was supported by Human Frontiers Science Program RGP0026/2017 (S.M.).Peer reviewe
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