Engineered Picornavirus VPg-RNA Substrates: Analysis of a Tyrosyl-RNA Phosphodiesterase Activity

Using poliovirus, the prototypic member of Picornaviridae, we have further characterized a host cell enzymatic activity found in uninfected cells, termed “unlinkase,” that recognizes and cleaves the unique 5′ tyrosyl-RNA phosphodiester bond found at the 5′ end of picornavirus virion RNAs. This bond connects VPg, a viral-encoded protein primer essential for RNA replication, to the viral RNA; it is cleaved from virion RNA prior to its engaging in protein synthesis as mRNA. Due to VPg retention on nascent RNA strands and replication templates, but not on viral mRNA, we hypothesize that picornaviruses utilize unlinkase activity as a means of controlling the ratio of viral RNAs that are translated versus those that either serve as RNA replication templates or are encapsidated. To test our hypothesis and further characterize this enzyme, we have developed a novel assay to detect unlinkase activity. We demonstrate that unlinkase activity can be detected using this assay, that this unique activity remains unchanged over the course of a poliovirus infection in HeLa cells, and that unlinkase activity is unaffected by the presence of exogenous VPg or anti-VPg antibodies. Furthermore, we have determined that unlinkase recognizes and cleaves a human rhinovirus-poliovirus chimeric substrate with the same efficiency as the poliovirus substrate

Language of Lullabies: The Russification and De-Russification of the Baltic States

This article argues that the laws for promotion of the national languages are a legitimate means for the Baltic states to establish their cultural independence from Russia and the former Soviet Union

Sorghum Detoxification Mechanisms

The influence of cadmium (Cd) on internal and external defense mechanisms of Sorghum bicolor (L.) Moench. x Sorghum sudanense was studied by electrochemical methods to infer the type of detoxification processes developed by the plant under environmental stress conditions. Hydroponic experiments with sorghum were conducted in nutrient solutions in the absence and presence of 0.1 mg Cd L−1. Plant exposure to Cd stimulated the release of root exudates with metal-binding affinity. However, their presence should not affect significantly the bioavailability of Cd, since the complex was dissociated within a very short period (≤ 50 milliseconds) in response to the consumption of the free metal ion at the root interface. The presence of Cd in the solution also stimulated a very significant increase of thiolic groups inside the plant, even at the very low concentration of 0.1 mg Cd L−1. These results suggest that the main defense mechanism developed by sorghum against metal toxicity is an internal process, i.e., the synthesis of phytochelatins

Impact of non-axisymmetric magnetic field perturbations on flows

International audienc

Manutenção do solo com cobertura com manta Ecoblanket em pomar de pessegueiros da Beira Interior.

Comunicação da qual só está disponível o resumo.As operações de manutenção do solo podem ser realizadas de diferentes formas interferindo, não só no controlo de infestantes, mas também ao nível das árvores e do ecossistema. Estas operações têm efeito ao nível do solo no que diz respeito ao teor de matéria orgânica, teor de humidade, diversidade e quantidade de microrganismos. Dada a pequena longevidade dos pomares de pessegueiro, que se situa em média entre 10 a 12 anos, verifica-se uma constante renovação dos pomares por parte dos fruticultores [1]. Em pomares novos não é aconselhada a aplicação de herbicidas na linha pelo risco de contacto do herbicida com os órgãos verdes das plantas, pelo que são utilizadas outras técnicas nomeadamente: i) Técnicas de mobilização, muitas vezes efetuadas de forma manual (sacha), que para além de poderem provocar feridas nas jovens plantas, aceleram a degradação da matéria orgânica, aspeto bastante negativo uma vez que os solos dos pomares de pessegueiros apresentam um teor médio de MO de 1,5% [2]; ii) Técnicas de corte das infestantes na linha através da utilização de motorroçadoras. Este método exige a utilização de tubos individuais de proteção das plantas e cuidados em termos de segurança no trabalho, tornando-se dispendioso e moroso. Esta técnica exige sucessivas intervenções uma vez que permite controlar mas não eliminar a competição das infestantes, isto porque se cortes não ocorrerem antes da floração e produção de sementes levam à sua disseminação [3]; iii) Utilização de cobertura do solo com diversos materiais, que podem ser orgânicos ou inorgânicos, sendo mais frequente o uso de tela plástica, que apresenta efeito na disponibilidade de nutrientes, na temperatura e na atividade microbiana. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da utilização da manta Ecoblanket em pomares de pessegueiro (Figura 1), não só nas condições de temperatura, humidade e salinidade do solo, a 5 cm, como no desenvolvimento de infestantes e no crescimento das plantas do pomar. À semelhança dos resultados alcançados com a utilização da manta na produção de alface [4], observou-se que temperatura média não difere significativamente entre modalidades. Contudo existem diferenças na amplitude térmica registando-se uma média de amplitude térmica entre 9ºC e 10ºC no período de maio a julho na modalidade sem cobertura, enquanto na modalidade com manta Ecoblanket a amplitude térmica se situa entre 4ºC a 5ºC no mesmo período. Relativamente às infestantes observou-se um efeito muito positivo no seu controlo, embora o material que constitui a manta não seja completamente estanque e haja infestantes que conseguem emergir através de pequenas ruturas que surgem. No entanto, se houver um controlo pontual e dirigido na fase inicial do desenvolvimento dessas infestantes é possível retirar o máximo partido deste tipo de manutenção do solo. Relativamente às espécies de infestantes presentes verifica-se que Chenopodium album e Poligonum aviculare são ubíquas. A presença de grama (Cynodon dactylon) e de linguinha (Rumex acetosella) deverá exigir particular atenção no primeiro ano de instalação dada a sua capacidade de cobrir o solo e a sua resistência às diferentes técnicas de manutenção do solo, conseguindo romper a manta com alguma facilidade. Será necessário continuar a monitorizar o desenvolvimento das infestantes para avaliar a capacidade de controlo da grama com a utilização da manta Ecoblanket.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Impact of the aspect ratio on tokamak reactor design: Application to demo using the 0-dimensional ScaLa model

International audienceThe impact of the aspect ratio R/a (major over minor radius) on the design of tokamak reactors is addressed by means of the generic and comprehensive 0-dimensional ScaLa model for tokamak dimensioning. The European DEMO (fusion gain Q=40 and power P$_{fus}$=2.037GW) is taken as the target. Three scaling laws are considered for the energy confinement time, namely IPB98(y,2) used as the ITER reference, the electrostatic DS03 law and the recently upgraded ITPA20 one. First, it appears that the increase of the energy confinement time with A found in two of the scaling laws does not necessarily result in an advantage of working at large A, cross-dependencies leading to sometimes counter-intuitiveyet realtrends. Second, the opposite trends with respect to a scan in A which is observed regarding the product of the plasma volume times the square of the magnetic fieldused as a proxy for the costdoes not provide a clear answer as to whether small or large aspect ratio tokamaks should be favoured. This mild conclusion pushes for consolidating experimental databases with tokamaks exhibiting aspect ratios departing from the common 3 value

Postconditioning with cyclosporine a reduces early renal dysfunction by inhibiting mitochondrial permeability transition

International audienceBACKGROUND: Ischemia-reperfusion (IR) injury leads to mitochondrial permeability transition pore opening, which contributes to cell death. The aim of this study is to determine whether ischemic or pharmacological postconditioning with cyclosporine A (CsA) might protect the kidney from lethal reperfusion injury. METHODS: Male mice underwent a unilateral (right) nephrectomy followed by 30 minutes of contralateral (left) clamping of the renal artery. We studied 4 groups at 20 minutes and 24 hours of reperfusion: a sham group (n = 4), an ischemic group (n = 6), CsA-postconditioned group (postcond-CsA, injection of 3 mg/kg of CsA 5 minutes before the end of ischemia, (n = 6), and an ischemic postconditioning (IPC) group (n = 6), consisting of 3 cycles of 30 seconds of renal ischemia with 30 seconds intervening reperfusion. After 24 hours of reperfusion, we measured plasma creatinine, urea, and histological kidney injury. The kidney mitochondria were isolated to assess the mitochondria calcium retention capacity and oxidative phosphorylation. RESULTS: At 24 hours after reperfusion, serum creatinine decreased in postcond-CsA and IPC compared to ischemic group. The histological score was also significantly improved with postcond-CsA and IPC. At 20 minutes and 24 hours of reperfusion, calcium retention capacity was decreased significantly in the ischemic group. The mitochondrial respiration stay decreased in the ischemic group at 24 hours of reperfusion, whereas the respiration was improved significantly in the postcond-CsA and IPC group. Bax and cleaved caspase 3 decreased in PostCsA and IPC group. CONCLUSIONS: Our results suggest that IPC and CsA, administered immediately before reperfusion, protect the kidney from lethal injury