Salmonella Fimbriae: What is the Clue to Their Hairdo?

Fimbriae are important virulence factors for Salmonella pathogenesis. They mediate adhesion to host cells (including plants), food, stainless steel and much more. The fimbrial systems are organised in gene clusters of four to fifteen genes that code for structural, assembly and regulatory proteins. There are three kinds of fimbriae depending on their mode of assembly. The chaperone/usher (CU) fimbriae use a dedicated chaperone and usher protein to coordinate the subunit biogenesis on the cell surface. The curli fimbriae are assembled by nucleation/precipitation pathway. The type IV fimbria assembly requires a transmembrane apparatus and ATP to energise the reaction. Several fimbriae are conserved among Salmonella serovars, while some are present in a limited set or only specific serovars. Expression and regulation of fimbrial genes are not well understood, and most Salmonella fimbriae are poorly expressed during in vitro culture, which further complicates research concerning their regulation and role during infection. However, Salmonella fim gene cluster, coding for type-1 fimbriae, was widely studied and presents its own set of regulators. Investigating fimbrial distribution, expression and regulation will further elucidate their roles in bacterial pathogenesis and host specificity. Furthermore, fimbriae are important for developing efficient diagnostic tests and antimicrobial strategies against Salmonella

Traitement de polissage de drainage minier acide par marais épurateur.

L'industrie minière et métallurgique représente un secteur important de l'économie mondiale. Toutefois, les impacts sociaux et environnementaux engendrés par leurs activités sont non négligeables. Souvent, les sites miniers sont aux prises avec des problèmes de drainage minier acide (DMA), lesquels sont générés lorsque les minéraux sulfureux sont oxydés au contact de l'eau et de l'air et que le pouvoir neutralisant des minéraux acidivores ne permet pas de neutraliser tout l'acide qui est produit par l'oxydation des minéraux acidogènes (réactifs). Le DMA est caractérisé par un pH acide et des concentrations élevées en métaux et en sulfates. Les systèmes de traitement passif tels que les marais artificiels représentent une approche intéressante, d'un point de vue technologique, économique et environnemental, pour le traitement du DMA. Les marais épurateurs ont la capacité d'augmenter le pH et l'alcalinité, d'enlever le fer dissous et les autres métaux, ainsi que de réduire la concentration en sulfates dans le DMA. Le traitement de l'eau est accompli par une variété de processus physiques (sédimentation, floculation), chimiques (sorption) et biologiques (sulfata-réduction, phytoextration) fonctionnant de façon indépendante, dans certains cas, ou de manière interactive, dans d'autres. L'objectif principal de cette étude est de mettre en application un marais pouvant être employé à l'étape de polissage dans le cadre d'une filière de traitement passif d'un DMA chargé en Fe, Mn, Ni et Zn. Les objectifs spécifiques sont : (1) de déterminer une espèce de plante susceptible de croître dans des conditions de pollutions retrouvées sur des aires contaminées par du DMA en Abitibi-Témiscamingue; (2) de développer et d'évaluer un système de traitement passif permettant la croissance des plantes et le traitement efficace d'un DMA chargé en Fe, Mn, Ni et Zn et (3) d'évaluer les mécanismes d' enlèvement des métaux et leur spéciation opérationnelle/fractionnement dans le sol/substrat. Dans ce but, des marais épurateurs ont été reproduits à l'échelle de laboratoire dans des contenants en polypropylène de 0,2 m2 (38 x 48 x 33 cm) remplis avec deux mélanges réactifs différents, selon le type d'écoulement, à savoir vertical sous-surfacique et horizontal surfacique, et plantés avec des quenouilles (Typha latifolia). Les cellules expérimentales ont été alimentées avec un DMA synthétique ayant la composition moyenne suivante : 27,7 mg/L Fe, 5,6 mg/L Mn, 0,4 mg/L Ni et 7,2 mg/L Zn, à un pH de 4,2. Le débit d'alimentation était de 1,5 ml/min, pour un temps de résidence hydraulique (TRH) de 10 jours, et la température moyenne de 22,5 °C, pour une photopériode de 16h. L'efficacité des marais artificiels a été évaluée sur une période 98 et 70 jours, pour les marais sous-surfaciques et surfaciques, respectivement. Au cours de 1 'étude, les paramètres physico-chimiques de 1' eau à 1' entrée et à la sortie des marais ont été déterminés sur une base hebdomadaire et bimensuelle (DMA entrée), incluant une mesure du pH, du Eh et une analyse des métaux. Le pH à la sortie de tous les marais était neutre, voir basique, et variait de 6,8 à 8,9 pour un pH à l'entrée se situant entre 2,9 et 6,1. La concentration en S042 - à la sortie des marais était très variable (67-551 mg/1) pour les systèmes à écoulement vertical, avec et sans plantes, ainsi que pour les systèmes horizontaux (114-612 ml/1). Pour les deux configurations, les concentrations de S042 à l'entrée se situaient entre 0,34 et 165 mg/1. Une efficacité de traitement de près de 99% a été trouvée pour le Fe et le Zn à la sortie de tous les systèmes. Pour le Ni, l'enlèvement était très élevé pour les marais verticaux plantés (88,7 %), par opposition à ceux horizontaux, non plantés (-42,1 %). Pour les verticaux, sans quenouilles et horizontaux avec quenouilles, 1 'efficacité d'enlèvement du Ni était comparable ( 43,8 et 38,0 % respectivement). Ceci rend le traitement du Ni très variable, selon la configuration et la présence de végétaux ou non. Pour le Mn, seule la configuration sous-surfacique démontre un potentiel de traitement pour ce métal (78,4%), les autres étant peu ou pas efficaces. Les taux de traitement ont été évalués à partir des concentrations moyennes en métaux, mesurées à 1' entrée et à la sortie des marais. Ainsi, pour la rétention du Fe, le taux de traitement variait entre 265,8 et 222,6 mg/m2/jour, alors que pour le Zn le taux était moindre et variait de 67,9 à 63,5 mg/m2/jour. Pour le Ni le taux de traitement était encore plus faible < 4 mg/m2/jour, alors que pour le Mn, il varie de 42,8 mg/m2/jour à -1 ,8 mg/m2/jour. Après le démantèlement des marais, des échantillons de mélanges réactifs ont été prélevés dans les marais sous-surfaciques et surfaciques, plantés et témoins non plantés. Une extraction des métaux totaux (Fe, Mn, Ni et Zn), par digestion acide, a été réalisée sur les sédiments séchés. De plus, une extraction séquentielle a eu lieu sur les sédiments humides afin d'évaluer la spéciation opérationnelle 1 fractionnement des métaux selon six phases, soit : soluble, échangeable, liée aux carbonates, liée aux oxydes de Fe-Mn, liée à la matière organique et aux sulfures et résiduelle. La fraction qui contenait le plus de Fe (5,0 mg/g) et de Zn (1,0-1,4 mg/g) dans les marais soussurfaciques plantés et non plantés était celle liée aux oxydes de Fe-Mn, tandis que la majeure fraction du Mn (0,5-0,8 mg/g) et du Ni (0,3 mg/g) était trouvée sous la forme de carbonates. Dans les marais surfaciques, le Fe était concentré surtout dans la fraction résiduelle (6,4-6,6 mg/g) et dans la fraction liée aux oxydes ( 4,0-4,4 mg/g), dans les cellules plantées et non plantées respectivement, la quantité de Zn (0,01 mg/g) était trop faible pour être considérée, le Mn était principalement lié aux carbonates (0,5-1,2 mg/g) et le Ni (1,0-1,3 mg/g) à la fraction résiduelle. Ces résultats indiquent que les métaux se trouvent sous une forme relativement stable à 1 'intérieur des sédiments des marais filtrants. L'interprétation des résultats provenant des microcosmes doit encore être validée à l'échelle pilote de terrain où les conditions sont plus représentatives de la réalité. Ces données permettent toutefois d'observer les grandes tendances et favorisent la compréhension des processus régissant le traitement ainsi que l'évaluation des critères de dimensionnement d'un marais épurateur. L'effet des conditions climatiques sur l'efficacité de traitement des marais doit également être vérifié puisque les mécanismes régissant 1 'enlèvement des métaux peuvent être grandement affectés par le climat typique nordique de la région de 1 'Abitibi-Témiscamingue

Analyse fonctionnelle des fimbriae de type chaperon-placier chez Salmonella enterica sérovar Typhi

Salmonella enterica sérovar Typhi est une bactérie pathogène humain-spécifique et l’agent étiologique de la fièvre typhoïde. Parmi ses facteurs de virulence, il y a 14 systèmes d’adhésion putatifs nommés fimbriae qui ont été identifiés dans le génome de S. Typhi. Les fimbriae sont regroupés en opérons qui codent pour des structures protéiques extracellulaires, pour une machinerie de sécrétion et d’assemblage et parfois pour des régulateurs. Ceux-ci sont peu exprimés en conditions de laboratoire et peu étudiés chez S. Typhi. Parmi les 14 fimbriae de S. Typhi, 12 appartiennent à la classe des chaperon-placier, c’est-à-dire qu’ils possèdent un chaperon et un placier qui leur sont dédiés pour la formation de la structure fimbriaire. Je crois que ces fimbriae sont importants pour la pathogenèse de S. Typhi. Le but de ce projet est l’analyse fonctionnelle des fimbriae de type chaperon-placier chez S. Typhi. Pour ce faire, j’ai voulu établir une caractérisation générale des 12 fimbriae de type chaperon-placier, puis j’ai concentré l’étude sur la régulation de 2 de ces fimbriae, c’est-à-dire Fim et Std. La caractérisation générale des fimbriae de type chaperon-placier consistait à déterminer l’expression des promoteurs fimbriaires lors de la croissance en différentes conditions de culture mimant l’infection, à déterminer la présence et la morphologie des fimbriae à la surface de la bactérie et à évaluer l’effet des fimbriae sur la pathogenèse de S. Typhi (formation de biofilm, interactions avec les cellules de l’hôte et motilité bactérienne). L’expression maximale des fimbriae a été obtenue principalement en milieu minimal. J’ai observé pour la première fois 6 des 12 fimbriae par microscopie électronique à transmission. Chaque fimbria présentait des effets sur au moins une étape testée sur la pathogénèse. La régulation de std et fim a été étudiée en déterminant le rôle de régulateurs globaux et par criblage d’une banque de mutants par insertion de transposon. Principalement, j’ai découvert que le promoteur std était activé par Crp, responsable de la répression catabolique, tandis que fim voit son expression modulée par la chaîne de transport d’électrons (Ndh) et des perturbations de l’enveloppe (OmpR). Finalement, nos résultats démontrent que les fimbriae de type chaperon-placier sont importants pour la 6 pathogenèse de S. Typhi et que deux de ceux-ci sont régulés par des signaux environnementaux importants rencontrés par la bactérie lors de l’infection.Salmonella enterica serovar Typhi is a human-specific pathogenic bacteria and the etiologic agent of typhoid fever. Among its virulence factors, there are 14 putative adhesion systems named fimbriae identified in the S. Typhi genome. Each fimbria is clustered in an operon that encodes for extracellular proteinaceous structures, for the secretion and assembly machinery and sometime for regulators. Fimbrial genes are poorly expressed under laboratory conditions, with few studied in S. Typhi. Among the 14 fimbriae, 12 belong to the chaperone-usher class, where each one encodes a dedicated chaperone and usher that form the fimbrial structure. I propose that fimbriae are important for S. Typhi pathogenesis. The aim of this project is the functional analysis of all the chaperone-usher fimbriae of S. Typhi. My goals were to establish a general characterization of the 12 chaperone-usher fimbriae, and to study specifically the regulation of 2 fimbriae, Fim and Std. The general characterization of chaperone-usher fimbriae includes the determination of the expression of fimbrial promoters in different growth conditions mimicking infection, the observation of the presence and morphology of fimbriae at the bacterial surface, and the evaluation of the role of fimbriae on S. Typhi pathogenesis (biofilm formation, host-cells interactions and motility). Fimbrial expression was generally higher when cells were grown in minimal medium. I was able to observe for the first time the presence of 6 out of 12 fimbriae by transmission electron microscopy. Regarding the role of fimbriae in pathogenesis, each fimbria was involved in at least one step. Regulation of std and fim was studied by evaluating the implication of several general regulators and by screening a transposon-based library. Overall, I discovered that the std promoter was activated by Crp, responsible of catabolic repression, and that fim was modulated by the activity of the electron transport chain and by envelope perturbations. Finally, my results demonstrated that the chaperone-usher fimbriae are important for S. Typhi pathogenesis and two of them are regulated by important environmental signals encountered during bacterial infection

Traitement de polissage par marais épurateur du drainage minier acide

RÉSUMÉ L’industrie minière et métallurgique représente un secteur important de l’économie mondiale. Toutefois, les impacts sociaux et environnementaux engendrés par leurs activités sont non négligeables. Souvent, les sites miniers sont aux prises avec des problèmes de drainage minier acide (DMA), lesquels sont générés lorsque les minéraux sulfureux sont oxydés au contact de l’eau et de l’air et que le pouvoir neutralisant des minéraux acidivores ne permet pas de neutraliser tout l’acide qui est produit par l’oxydation des minéraux acidogènes (réactifs). Le DMA est caractérisé par un pH acide et des concentrations élevées en métaux et en sulfates. Les systèmes de traitement passif tels que les marais artificiels représentent une approche intéressante, d’un point de vue technologique, économique et environnemental, pour le traitement du DMA. Les marais épurateurs ont la capacité d’augmenter le pH et l’alcalinité, d’enlever le fer dissous et les autres métaux, ainsi que de réduire la concentration en sulfates dans le DMA. Le traitement de l'eau est accompli par une variété de processus physiques (sédimentation, floculation), chimiques (sorption) et biologiques (sulfato-réduction, phytoextration) fonctionnant de façon indépendante, dans certains cas, ou de manière interactive, dans d'autres.----------ABSTRACT Mining and metallurgical industries are critical to world’s economy; however, their socio-environmental impacts are not negligible. Often, they have to deal with acid mine drainage (AMD), which is generated by sulfide oxidation in waste following the prolonged exposure to oxygen and water, if neutralizing minerals are insufficient. The AMD is characterized by low pH and high concentrations of dissolved metals and sulfates. Environmental impacts of AMD can be minimized by passive treatment systems such as constructed wetlands (CWs). They represent an interesting approach, from technological, economic, environmental and regulatory points of view, for the efficient treatment of AMD impacted waters. Wetlands have the capacity to increase pH and alkalinity, to remove dissolved iron and other metals, and to reduce sulfate concentration in AMD. Water treatment is accomplished by various physical (e.g. sedimentation, flocculation), chemical (e.g. sorption) and biological processes (e.g. sulfate reduction, phytoextration) acting independently, in some cases, or interactively, in others. However, cold climate could be challenging for CWs efficiency

Traitement de polissage par marais épurateur du drainage minier acide

Affiche présentée dans le cadre du Colloque de l'ARC, «La culture de la recherche au collégial», dans le cadre du 82e Congrès de l'Acfas, Université Concordia, Montréal, le 14 mai 2014.Les résidus miniers représentent une source de danger potentiel pour l'environnement, en particulier lorsque ces déchets contiennent des minéraux sulfureux qui peuvent s'oxyder et générer du drainage minier acide (DMA). Ce dernier est caractérisé par un pH faible et des concentrations en sulfates et métaux dissous élevées. Les traitements biologiques constituent une solution moins coûteuse par rapport aux traitements chimiques, en plus de présenter plusieurs avantages dont des taux élevés d’enlèvement des métaux, une réduction du pH, de faibles coûts d’exploitation et une consommation minimale d’énergie. La capacité des marais filtrants à traiter un DMA chargé en fer à l’étape de polissage a été étudiée. Les systèmes consistaient en des marais artificiels à écoulement vertical et horizontal de 0,052 m3, remplis de deux différents substrats et plantés avec des quenouilles (Typha latifolia). Ils étaient alimentés pour traiter 1,5 mL/min d’un DMA ayant une concentration moyenne de 38,0 mg/L de fer, 2,6 mg/L de manganèse, 0,4 mg/L de nickel et 0,9 mg/L de zinc à un pH moyen de 4,2. Après traitement, le pH moyen à l’effluent était de 8,0 pour les marais verticaux et de 7,6 pour les horizontaux. Le taux d’enlèvement du fer et du zinc était respectivement de 95 et 96 % pour les marais à écoulement verticaux et de 87 et 94 % pour les horizontaux. Le traitement du nickel et du manganèse était négligeable

A novel antiangiogenic and vascular normalization therapy targeted against human CD160 receptor

A monoclonal anti-CD160 antibody inhibits the growth of new vessels in pathological ocular and tumor neoangiogenesis but not in healthy tissues

Transformations de graphes et nombre de stabilité

Définitions et concepts -- Le problème du stable maximum -- Transformations de graphes -- Définitions et concepts -- Incidence des transformations -- Stratégies d'utilisation des transformations -- Exemples de transformations inexactes -- Exemples de transformations exactes -- Incidence de transformations de graphes -- Définitions et concepts -- Évaluation expérimentale des estimateurs du coût de résolution -- Séquences de transformations -- Évaluation des gains escomptés et réels -- Graphes séparables -- Définitions et concepts -- Quelques classes de graphes séparables -- Quelques classe de graphe non-séparables

Des chevaux et des hommes : le développement d'une éthique animale dans la littérature du XIXe siècle à travers l'étude de la représentation du cheval dans l'oeuvre de trois auteurs : Anna Sewell, Léon Tolstoï et Émile Zola

Avant et même après l’arrivée de la machinerie et de l’industrialisation, le cheval se retrouve dans plusieurs domaines (transport, agriculture, travaux lourds, distraction, etc.). Son exploitation soulève un questionnement éthique important, abordé dans la littérature et notamment, dans la littérature du XIXe siècle. La façon dont sont traités les chevaux par les personnages révèle l'éthique animale et humaine mise de l’avant dans les textes. Black Beauty d'Anna Sewell, roman animalier dont le narrateur est un cheval, est mis en parallèle avec la nouvelle « Le cheval » de Léon Tolstoï afin de faire ressortir les enjeux éthiques liés à la représentation du cheval-narrateur. Enfin, dans l'oeuvre de Zola, le traitement du cheval et sa considération morale, ainsi que le rang social qu'il confère à l'homme, sont des éléments déterminants du récit qui illustrent le déploiement d’une éthique animale et humaine chez cet auteur important. Sur le plan théorique, cette recherche s’inspire des animal studies ou études animales qui s’intéressent surtout à la question éthique soulevée par l’exploitation de l’animal et sa survie, aux droits qu’il possède et à la question d'anthropomorphisme et de zoomorphisme. Cette recherche s'appuie principalement sur les ouvrages Histoire de la culture équestre, XVIe–XIXe siècle et Anthologie de la littérature équestre afin de dresser un portrait historique, social et culturel du cheval. Puis, ce portrait est mis en lien avec Black Beauty et « Le cheval », et enfin, avec les romans de Zola (Nana, La Débâcle, Germinal et Le docteur Pascal) afin de réfléchir à la condition animale en général et à celle du cheval en particulier, ainsi qu'aux enjeux historiques et sociaux qui y sont liés. L'étude de la représentation du cheval dans les oeuvres littéraires choisies permet surtout de faire ressortir l'éthique animale et humaine de ces textes du dix-neuvième siècle, mais aussi, de montrer que l'animal peut jouer un rôle à part entière dans le récit