Monitoring antiretroviral therapy in HIV/AIDS patients in resource-limited settings: CD4 counts or total lymphocyte counts?

SummaryObjectiveIn order to improve the monitoring of disease progression and therapeutic effectiveness in the management of HIV/AIDS in a resource-limited setting, this study was carried out to establish a correlation between total lymphocyte counts (TLC) and CD4 lymphocyte counts in HIV-1 infected/AIDS adults in Yaoundé, Cameroon.MethodsFull blood counts, differential white, and CD4 counts were measured in 149 patients using standard methods. The correlation coefficient established correlation between values. Sensitivity, specificity, and positive predictive values were calculated as required.ResultsThe mean TLC, CD4 count, and CD4% as well as CD4/CD8 ratios were 1.932±0.895×109/L, 268±183cells/mm3, 14.51±15.9%, and 0.34±0.25, respectively. Only a weak correlation was observed between TLC and CD4 counts (r=0.41, p=0.05). As a predictor of CD4 count, TLC cut-offs <2.0 and <1.0×109/L were unable to predict these values reliably, but showed that at TLC cut-offs of <1.0×109/L there was a high chance of CD4 counts being under 200cells/mm3.ConclusionsThese data suggest that TLC are of limited value in predicting CD4 counts and should not be substituted for CD4 counts whenever possible. However, TLC may be reliably used in designing algorithms and programs for initiating patient management and follow-up in this setting

Cartographie des écosystèmes et paramètres biophysiques satellitaires pour l'étude des flux hydriques sur le continent africain

Dans le contexte des changements climatiques, l'objectif du travail effectué est de caractériser l'hétérogénéité du continent africain afin de mieux comprendre et quantifier les processus de surface agissant sur les flux hydriques. Ce travail s'inscrit dans le cadre de la mise à jour de la base de données ECOCLIMAP-I constituée d'une carte d'occupation des sols et des cartes de paramètres biophysiques. Pour cela, on s'appuie sur des données de télédétection acquises par les capteurs de dernière génération MODIS et SPOT/VEGETATION entre 2000 et 2007. Dans un premier temps, deux techniques de classification ont été développées afin de cartographier les différents écosystèmes. L'une, supervisée, a été conduite dans le contexte du programme AMMA afin de discriminer les écosystèmes sur la région ouest-africaine en combinant l'information complémentaire contenue dans les cartes d'occupation du sol GLC2000 et ECOCLIMAP-I par analyse supervisée de l'indice foliaire (LAI) MODIS. L'autre, non supervisée et hybride, utilise les principes de regroupement hiérarchique et dynamique de manière automatique en combinant l'usage du classificateur k-NN et celui de la transformée de Fourier Discrète sur la base des données d'indice de végétation normalisé (NDVI) SPOT/VEGETATION pour identifier les écosystèmes africains. Dans un deuxième temps, des méthodes d'estimation des paramètres biophysiques tels que l'albédo, la fraction de végétation, l'indice foliaire ont été développées et/ou appliquées sur le continent. Une approche statistique permet de déterminer la contribution du sol nu et de la végétation à la constitution de l'albédo de surface comme tel que cela est requis dans les modèles de surface. La méthode a d'abord été appliquée sur la région ouest-africaine et sa robustesse a été prouvée lors de son application à l'intégralité du continent africain. Ces conditions de surface ont ensuite été implémentées dans le modèle de surface ISBA pour reproduire les processus de surface. La sensibilité d'ISBA au forçage physiographique a été étudiée en analysant deux simulations avec le même forçage atmosphérique sur la région ouest-africaine : l'une en utilisant la classification ECOCLIMAP-I et l'autre en utilisant la nouvelle paramétrisation de la surface développée sur la région ouest-africaine. Les flux de chaleur latente et sensible sont principalement pilotés par la fraction de végétation. Le modèle ISBA peut être utilisé pour prédire l'impact d'un changement d'occupation du sol et par conséquent des actions anthropiques sur le bilan hydrique.In the context of climate change, the aim of this study is to characterize the heterogeneity of the African continent in order to provide some elements to better understand and quantify surfaces process acting on hydric fluxes. This work is intented to update the double ECOCLIMAP-I database which is constituted by a land cover map and a dassets of land biophysical parameters. To this end, we use remotely sensed data acquired by the latest generation sensors MODIS and SPOT/VEGETATION between 2000 and 2007. During the first step, two methods of classifications has been developed for the mapping of different ecosystems. The first method, which is supervised, is obtained by combining information provided by the both global land cover map GLC2000 and ECOCLIMAP-I using an interactive analysis of MODIS leaf area index (LAI). It has been performed in the framework of the AMMA project to discriminate ecosystems over the western African Region. The second method is hybrid in that it combines k-NN clustering, hierarchical principles and the Fast Fourier Transform (FFT) on the basis of multi-annual NDVI data from SPOT/VEGETATION to identify ecosystems at the whole African continent. Then, methods for the estimation of land surface biophysical variables such as albedo, fractional vegetation cover and leaf area index has been developed and/or applied over the mainland. A statistical approach allows us to determine the contribution of bare soil albedo and vegetation albedo to the constitution of albedo as required in land surface models. After the application of the latter approach over the western african region, we demonstrate the robustness of the method by applying it over the entire mainland. The sensitivity of two land surface scenarios was studied by analysing two simulations with the same atmospheric forcing over the western African Region:one using the ECOCLIMAP-I classification and another using the new physiographic forcing specifically developed over the western African region. Heat and latent flux are mainly driven by the fractional vegetation coverage. The land surface model ISBA can be used to predict the impact of land cover change and accordingly the anthropic pressure on hydric fluxes

Facteurs obstétricaux, infectieux et traumatiques associés à l’épilepsie dans la zone rurale de Bangoua (Ouest, Cameroun)

Introduction:&nbsp;les étiologies des épilepsies sont très variées et résultent de la conjonction de facteurs génétiques, périnataux, les anomalies du développement cortical, et des lésions acquises du cortex cérébral. La présente étude a été conçue pour déterminer les facteurs obstétricaux, infectieux et traumatiques pouvant expliquer la prévalence élevée de l'épilepsie à Bangoua. Méthodes:&nbsp;la présente étude cas-témoins a été réalisée dans la localité de Bangoua, département du Ndé, région de l'Ouest du Cameroun. Les patients épileptiques consentants et les témoins non épileptiques appariés selon l'âge et le sexe ont été recrutés du 4 août au 20 octobre 2008. Le diagnostic d'épilepsie était retenu lorsqu'un patient avait rapporté au moins deux crises d'épilepsie non provoquées au cours des deux dernières années. Résultats:&nbsp;l'âge des patients variait de 6 à 65 ans avec une moyenne de 26,7 ± 10,6 ans. Le sexe masculin prédominait chez les patients épileptiques (54,3%). Plus de la moitié (57,1%) des patients épileptiques avaient des antécédents familiaux d'épilepsie et les atteintes infectieuses du système nerveux central étaient deux fois plus fréquentes (p=0,005) chez les participants épileptiques (38,6%) que chez les témoins (17,4%). Conclusion:&nbsp;la présente étude a relevé que dans la localité de Bangoua, un antécédent familial d'épilepsie, le paludisme, une infection urinaire ou une éclampsie pendant la grossesse, un antécédent d'encéphalite sont des facteurs associés à l'épilepsie

Dry deposition of nitrogen compounds (NO 2 , HNO 3 , NH 3 ), sulfur dioxide and ozone in west and central African ecosystems using the inferential method

Abstract. This work is part of the IDAF program (IGAC-DEBITS-AFRICA) and is based on the long-term monitoring of gas concentrations (1998–2007) established at seven remote sites representative of major African ecosystems. Dry deposition fluxes were estimated by the inferential method using on the one hand surface measurements of gas concentrations (NO2, HNO3, NH3, SO2 and O3) and on the other hand modeled exchange rates. Dry deposition velocities (Vd) were calculated using the big-leaf model of Zhang et al. (2003b). The bidirectional approach is used for NH3 surface–atmosphere exchange (Zhang et al., 2010). Surface and meteorological conditions specific to IDAF sites have been used in the models of deposition. The seasonal and annual mean variations of gaseous dry deposition fluxes (NO2, HNO3, NH3, O3 and SO2) are analyzed. Along the latitudinal transect of ecosystems, the annual mean dry deposition fluxes of nitrogen compounds range from −0.4 to −0.8 kg N ha−1 yr−1 for NO2, from −0.7 to −1.0 kg N ha−1 yr−1 for HNO3 and from −0.7 to −8.3 kg N ha−1 yr−1 for NH3 over the study period (1998–2007). The total nitrogen dry deposition flux (NO2+HNO3+NH3) is more important in forests (−10 kg N ha−1 yr−1) than in wet and dry savannas (−1.6 to −3.9 kg N ha−1 yr−1). The annual mean dry deposition fluxes of ozone range between −11 and −19 kg ha−1 yr−1 in dry and wet savannas, and −11 and −13 kg ha−1 yr−1 in forests. Lowest O3 dry deposition fluxes in forests are correlated to low measured O3 concentrations, lower by a factor of 2–3, compared to other ecosystems. Along the ecosystem transect, the annual mean of SO2 dry deposition fluxes presents low values and a small variability (−0.5 to −1 kg S ha−1 yr−1). No specific trend in the interannual variability of these gaseous dry deposition fluxes is observed over the study period

Human Immunodeficiency Virus and Hepatitis C Virus Co-infection in Cameroon: Investigation of the Genetic Diversity and Virulent Circulating Strains

Background: RNA virus infections represent a significant cause of illness and death in vertebrates. Specifically in humans, RNA viruses are responsible for a wide range of acute, chronic, emerging and re-emerging infections. HIV and HCV rank as some of the most severe RNA viruse infections facing Africa. Methods: To determine genotypes and subtypes of HIV and HCV among co-infected patients in Cameroon, viral RNA was isolated from HIV/HCV co-infected individuals, in Douala, Cameroon. A total of 36 HIV/HCV co-infected isolates (22 from volunteer blood donors and 14 from people living with HIV/AIDS not yet on antiretroviral treatment) were analyzed using molecular biology techniques that involved RT-PCR, gene/TOPO cloning, DNA sequencing, and bioinformatics tools for sequence management and analysis. Epidemiological data were examined as well.Results: Results show that HIV strains isolated belong to the circulating recombinant forms CRF02_AG, whereas HCV isolates from Cameroon belong to genotypes 1, 2, and 4. The corresponding HCV subtypes investigated were 1a, 1b, 1c, 2a, 2c, 2k, and 4a. Subtypes 1a and 1b, most frequently found in developed countries, also circulate in Cameroon. Epidemiologic data show that HIV/HCV co-infected patients are older than HIVmono-infected patients.Conclusions: These results indicate that HIV/HCV co-infection represent a significant threat in Cameroon. There is evidence of genetic diversity of HIV and HCV; virulent hepatitis C virus subtypes 1a and 1b circulate in Cameroon. An epidemiological and molecular database on HIV and HCV is necessary for the development of further intervention in Cameroon as an imperative for monitoring disease progression.Key words: HIV; HCV; Co-infection ; Genotypes ; Virulent

Lord of the Bridges

To design and build a device that automates the registration and tests for the Alief Popsicle Bridge competition and organize the data in a way that outputs the tested attributes for each bridge and assigns ranks in a specified format