56 research outputs found

    C-reactive protein upregulates the whole blood expression of CD59 - an integrative analysis

    Get PDF
    Elevated C-reactive protein (CRP) concentrations in the blood are associated with acute and chronic infections and inflammation. Nevertheless, the functional role of increased CRP in multiple bacterial and viral infections as well as in chronic inflammatory diseases remains unclear. Here, we studied the relationship between CRP and gene expression levels in the blood in 491 individuals from the Estonian Biobank cohort, to elucidate the role of CRP in these inflammatory mechanisms. As a result, we identified a set of 1,614 genes associated with changes in CRP levels with a high proportion of interferon-stimulated genes. Further, we performed likelihood-based causality model selection and Mendelian randomization analysis to discover causal links between CRP and the expression of CRP-associated genes. Strikingly, our computational analysis and cell culture stimulation assays revealed increased CRP levels to drive the expression of complement regulatory protein CD59, suggesting CRP to have a critical role in protecting blood cells from the adverse effects of the immune defence system. Our results show the benefit of integrative analysis approaches in hypothesis-free uncovering of causal relationships between traits.</p

    DDAO Controlled Synthesis of Organo-Modified Silica Nanoparticles with Encapsulated Fluorescent Boron Dipyrrins and Study of Their Uptake by Cancerous Cells

    Get PDF
    The design of cargo carriers with high biocompatibility, unique morphological characteristics, and capability of strong bonding of fluorescent dye is highly important for the development of a platform for smart imaging and diagnostics. In this paper, BODIPY-doped silica nanoparticles were prepared through a "one-pot" soft-template method using a sol-gel process. Several sol-gel precursors have been used in sol-gel synthesis in the presence of soft-template to obtain the silica-based materials with the most appropriate morphological features for the immobilization of BODIPY molecules. Obtained silica particles have been shown to be non-cytotoxic and can be effectively internalized into the cervical cancer cell line (HeLa). The described method of synthesis allows us to obtain silica-based carriers with an immobilized fluorescent dye that provide the possibility for real-time imaging and detection of these carriers

    GENE-CELL THERAPY OF HIV AND HEMATOLOGICAL MALIGNANCES BASED ON HEMATOPOIETIC STEM CELL TRANSPLANTATION AND SITE-SPECIFIC GENOME EDITING

    Get PDF
    Based on the annual UNAIDS reports the number of HIVinfected patients is continually growing since 1983. Antiretroviral Therapy (ART) allows to prolong life expectancy, but the problem of life quality and overall survival is still remaining. Nowadays, in the era of ART, one of the main cause of mortality in HIV-infected patients is malignancies. Lymphomas play one of the key roles in this group of diseases. The treatment of lymphomas includes combined regiments of chemotherapy with a curative potential. High dose chemotherapy with autologous hematopoietic stem cell transplant (auto-HSCT) is the main path of the treatment for relapsed / refractory lymphomas. In the last few years with a development of the genome editing technology auto-HSCT is becoming one of the most promising methods of HIV treatment. The case of “Berlin patient” when allogeneic HSCT from donor with mutation CCR5-delta32 lead to cure from HIV and proof of concept the efficacy of the gene therapy for HIV based on HSCT. Hematopoietic stem cell transplantation with edited autologous HSC (CCR5 knockout by site-specific genome editing tools with engineering nucleases) is a comprehensive treatment for this cohort of patients. On one hand, high dose chemotherapy with auto-HSCT cures the malignancy; on the other hand auto-HSCT works as a delivery method for the edited cells and creates an environment for the HIV eradication. This review is dedicated to HIV and oncology, methods of treatment of hematological malignancies and HIV-infection using genome editing technology based on HSCT

    ГЕННАЯ КЛЕТОЧНАЯ ТЕРАПИЯ ВИЧ И ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕЙ КРОВЕТВОРНОЙ И ЛИМФАТИЧЕСКОЙ ТКАНИ НА ОСНОВЕ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКОГО РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА

    Get PDF
    Based on the annual UNAIDS reports the number of HIVinfected patients is continually growing since 1983. Antiretroviral Therapy (ART) allows to prolong life expectancy, but the problem of life quality and overall survival is still remaining. Nowadays, in the era of ART, one of the main cause of mortality in HIV-infected patients is malignancies. Lymphomas play one of the key roles in this group of diseases. The treatment of lymphomas includes combined regiments of chemotherapy with a curative potential. High dose chemotherapy with autologous hematopoietic stem cell transplant (auto-HSCT) is the main path of the treatment for relapsed / refractory lymphomas. In the last few years with a development of the genome editing technology auto-HSCT is becoming one of the most promising methods of HIV treatment. The case of “Berlin patient” when allogeneic HSCT from donor with mutation CCR5-delta32 lead to cure from HIV and proof of concept the efficacy of the gene therapy for HIV based on HSCT. Hematopoietic stem cell transplantation with edited autologous HSC (CCR5 knockout by site-specific genome editing tools with engineering nucleases) is a comprehensive treatment for this cohort of patients. On one hand, high dose chemotherapy with auto-HSCT cures the malignancy; on the other hand auto-HSCT works as a delivery method for the edited cells and creates an environment for the HIV eradication. This review is dedicated to HIV and oncology, methods of treatment of hematological malignancies and HIV-infection using genome editing technology based on HSCT.По данным ежегодных докладов UNAIDS, c1983 г. количество ВИЧ-инфицированных пациентов неуклонно растет. Антиретровирусная терапия (АРВТ) позволяет увеличить продолжительность жизни, но проблемы качества жизни и долгосрочной выживаемости не решены. Одной из основных причин летальности у пациентов с ВИЧ в эру АРВТ являются онкологические заболевания, среди которых значительную часть составляют злокачественные лимфомы. Лечение лимфом включает этапную противоопухолевую химиотерапию (ПХТ) с потенциалом полного излечения пациента. Высокодозная ПХТ с аутологичной трансплантацией гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК) – основное средство лечения рецидивов и рефрактерных форм агрессивных злокачественных лимфом. В последние годы с появлением технологии редактирования генома аутологичная ТГСК становится также одним из самых перспективных методов лечения ВИЧ-инфекции. История излечения от ВИЧ «Берлинского пациента» благодаря аллогенной ТГСК от донора с мутацией гена CCR5 продемонстрировала эффективность подхода генной терапии на основе трансплантации. Высокодозная химиотерапия с трансплантацией аутологичных, подвергнутых редактированию (инактивации гена CCR5, с помощью генно-инженерных нуклеаз), гемопоэтических стволовых клеток потенциально представляет собой способ комплексного лечения этих пациентов. С одной стороны, высокодозная ПХТ с ауто-ТГСК обеспечивает излечение от злокачественной опухоли, с другой стороны, она является способом доставки отредактированных клеток и создания условий для реализации лечебного эффекта против ВИЧ.Данный обзор посвящён методам лечения опухолей кроветворной и лимфатической ткани и ВИЧинфекции с использованием редактирования генома на основе трансплантации гемопоэтических стволовых клеток.

    ПОСТАНОВКА ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ МОДЕЛИ АЛЛОГЕННОЙ ТРАНСПЛАНТАЦИИ КОСТНОГО МОЗГА И РЕАКЦИИ «ТРАНСПЛАНТАТ ПРОТИВ ХОЗЯИНА»

    Get PDF
    Modeling of allogeneic bone marrow transplantation and graft-versus-host disease (GVHD) plays a crucial role in the improvement of transplantation procedures and testing novel immunosuppressive drugs. In this study we evaluated the feasibility of busulfan and cyclophosphamide conditioning with posttransplantation cyclophosphamide (150 mg/kg) in donorrecipient pairs C57Bl/6-Balb/с and Balb/с-C57Bl/6. We observed that Balb/с mice as opposed to C57Bl/6 mice can’t be the recipients because of the unacceptably high acute mortality from acute toxicity of chemotherapeutic drug. Histological studies in the C57Bl/6 recipients revealed acute GVHD in 93 % of animals. All animals had only grade I–II severity of GVHD. This model has the potential for future studies in the field of transplantology, nonetheless a decrease in the intensity of prophylaxis is required to augment the manifestations of GVHD.Экспериментальное моделирование аллогенной трансплантации костного мозга и реакции «трансплантат против хозяина» (РТПХ) крайне важно для совершенствования технологии трансплантации и исследования новых иммуносупрессивных препаратов. В настоящем исследовании оценивали применимость кондиционирования бусульфаном и циклосфосфаном с профилактикой посттрансплантационным циклофосфаном (150 mg/kg) на комбинациях линий мышей «донор-реципиент» C57Bl/6-Balb/с и Balb/с-C57Bl/6. Выявлено, что Balb/с-мыши, в отличие от C57Bl/6-мышей, не могут быть реципиентами из-за высокой летальности от острой токсичности химиопрепаратов. При гистологическом исследовании C57Bl/6-реципиентов острая РТПХ выявлена у 93 % животных. У всех животных наблюдали РТПХ только 1–2-й степени тяжести. Данная модель является перспективной для исследований в области трансплантологии, однако требуется снижение интенсивности профилактики для усиления проявлений РТПХ

    Publisher Correction: Stroke genetics informs drug discovery and risk prediction across ancestries (Nature, (2022), 611, 7934, (115-123), 10.1038/s41586-022-05165-3)

    Get PDF
    In the version of this article initially published, the name of the PRECISE4Q Consortium was misspelled as “PRECISEQ” and has now been amended in the HTML and PDF versions of the article. Further, data in the first column of Supplementary Table 55 were mistakenly shifted and have been corrected in the file accompanying the HTML version of the article

    Эпидемиология и результаты терапии первой линии ВИЧ-ассоциированной лимфомы Ходжкина

    Get PDF
    Introduction. The risk of developing Hodgkin lymphoma (HL) with HIV infection is higher than in the general population, and the course of the disease itself is more aggressive. Currently, there is no unified approach to the treatment of HIV-related HL, and data on its epidemiology in the Russian Federation are limited.The objective was to study epidemiological characteristics, the used therapeutic tactics and the results of treatment for HIV-related HL.Methods and materials. The multicenter retrospective study included 46 patients with HIV- related HL treated in 9 centers of the Russian Federation. Descriptive statistics methods were used, the analysis of overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) was performed using the Kaplan–Meier method.Results. HIV-related HL is more often represented by an advanced stage, B-symptoms, and extranodal lesions. The ABVD regimen was used as the first-line therapy in 60 % for HIV-related HL. The overall response to therapy was 81.6 %, and the 2-year OS and PFS were 85 % and 49 %, respectively. Factors that worsened OS were CD4+˂266 cells/mcL and general somatic status ECOG≥2. Введение. Вероятность развития лимфомы Ходжкина (ЛХ) на фоне ВИЧ-инфекции выше, чем в общей популяции, а течение заболевания имеет более агрессивный характер. В настоящий момент отсутствует единый подход к терапии ЛХ на фоне ВИЧ, а данные об ее эпидемиологии в Российской Федерации ограничены.Цель – изучить эпидемиологическую характеристику, применяемую терапевтическую тактику и результаты лечения лимфомы Ходжкина на фоне ВИЧ-инфекции.Методы и материалы. В многоцентровое ретроспективное исследование были включены 46 пациентов с диагнозом «ЛХ» на фоне ВИЧ, получавших лечение в девяти центрах Российской Федерации. Применяли методы описательной статистки, анализ общей выживаемости (ОВ) и беспрогрессивной выживаемости (БПВ) выполняли с использованием метода Каплана – Мейера.Результаты. ЛХ на фоне ВИЧ чаще представлена распространенной стадией, В-симптомами и экстранодальным поражением. В качестве терапии первой линии ЛХ на фоне ВИЧ в 60 % случаев использовалась схема ABVD. Общий ответ на терапию составил 81,6 %, а 2-летняя ОВ и БПВ составили 85 и 49 % соответственно. Факторами, снижающими ОВ, являлись уровень CD4+&lt;266 кл/мкл и общесоматический статус ECOG≥2. Ключевые слова: лимфома Ходжкина, ВИЧ, CD4+, ECOG, многоцентровое исследование, терапия первой линии&gt;˂ 266 кл/мкл и общесоматический статус ECOG≥2.
    corecore