Large Genomic Imbalances in Brugada Syndrome

Purpose Brugada syndrome (BrS) is a form of cardiac arrhythmia which may lead to sudden cardiac death. The recommended genetic testing (direct sequencing of SCN5A) uncovers disease-causing SNVs and/or indels in ~20% of cases. Limited information exists about the frequency of copy number variants (CNVs) in SCN5A in BrS patients, and the role of CNVs in BrS-minor genes is a completely unexplored field. Methods 220 BrS patients with negative genetic results were studied to detect CNVs in SCN5A. 63 cases were also screened for CNVs in BrS-minor genes. Studies were performed by Multiplex ligation-dependent probe amplification or Next-Generation Sequencing (NGS). Results The detection rate for CNVs in SCN5A was 0.45% (1/220). The detected imbalance consisted of a duplication from exon 15 to exon 28, and could potentially explain the BrS phenotype. No CNVs were found in BrS-minor genes. Conclusion CNVs in current BrS-related genes are uncommon among BrS patients. However, as these rearrangements may underlie a portion of cases and they undergo unnoticed by traditional sequencing, an appealing alternative to conventional studies in these patients could be targeted NGS, including in a single experiment the study of SNVs, indels and CNVs in all the known BrS-related genes

Detecció de Copy Number Variants mitjançant seqüenciació d'alt rendiment en la Mort Sobtada Cardíaca hereditària

Arrhythmogenic cardiac diseases are the main cause of SCD among the population under 35 years of age. Despite the improvements in genetic diagnosis, the percentage of cases that remain unexplained after genetic analysis is still high. Several studies have identified CNVs as causative of cardiac diseases associated with SCD, but exhaustive analysis of multiple genes in large cohorts of patients has never been performed for most SCD-related diseases. In this thesis a CNV detection algorithm has been developed for the analysis of high-throughput sequencing data of the clinically relevant genomic regions associated with SCD and related diseases. Through the optimization of the capture probe designs we have been able to sequence samples that exhibit high quality and coverage homogeneity throughout all sequenced regions. These samples allowed the development of the CNV detection algorithm, specifically designed for this type of samples, which has shown a high sensitivity, specificity and precision.Les malalties cardíaques arritmogèniques suposen la principal causa de MSC entre la població menor de 35 anys. Tot i les millores en el diagnòstic genètic, el percentatge de casos sense causa després de l'anàlisi genètica és elevat. Diversos estudis associen les CNVs com les causants de malalties cardíaques associades a MSC. Però encara no s’ha realitzat mai el cribratge exhaustiu d’un grup important de gens en una gran cohort de pacients diagnosticats amb aquestes malalties. En aquesta tesi s’ha desenvolupat un algoritme de detecció de CNVs per l’anàlisi de dades provinents de la seqüenciació d’alt rendiment de les regions clínicament rellevants associades a la MSC i a les malalties relacionades. Optimitzant els dissenys de sondes de captura s’han seqüenciat unes mostres d’alta qualitat i d’elevada homogeneïtat de cobertura. Aquestes permeten la posada a punt d’un l’algoritme de detecció de CNVs que ha demostrat una alta sensibilitat, especificitat i precisió

Líneas de investigación y Proyectos en torno a la Cultura del Agua. Sección de Historia

Seminario organizado por Universidad de Extremadura y que tuvo lugar en el Salón de Grados- Facultad de Educación - Badajoz, el 20 de Mayo de 2016Peer reviewe

I Seminario Interuniversitario de Investigación en Ciencias Sociales (Participación en Mesa de debate)

El seminario fue organizado por la Universidad de Extremadura y tuvo lugar en Salón de Grados- Facultad de Educación - Badajoz, el día 20 de Mayo de 2016. La participación fue en la Mesa paralela(sección Historia) del Núcleo II: Líneas de investigación y Proyectos en torno a la Cultura del AguaPeer reviewe

Del conocimiento científico a la manipulación informativa: el cólera en la España rural de los últimos años del franquismo 1970-1975

Congreso organizado por Universidad de Santiago de Chile (USACH) y que se celebró entre los días 9 a 12 de octubre de 2015La epidemia de cólera que afecta a España en 1971 y que fue ocultada por el franquismo todo lo que pudo para no estrangular la que ya venía siendo una importante entrada de divisas (el turismo), aporta sobre todo tres enseñanzas: el gran retraso respecto al resto de Europa en infraestructuras de abastecimiento y saneamiento de agua en el ámbito rural, la enorme alarma social que generaba aún el cólera en nuestro país y, por último, el control informativo en materia sanitaria de la dictadura. El régimen franquista utilizó la terminología científica de los procesos diarreicos estivales y la más que discutible eficacia de una vacuna de la que no se decía para qué servía, para tratar de controlar las reacciones de la población, evitar el colapso turístico y el de las exportaciones hortofrutícolas. La principal repercusión del proceso epidémico en el país será la creación de planes de inversión que permitieran dotar a las poblaciones rurales de sistemas de abastecimiento de agua segurosPeer reviewe

Agua y Territorio, de la creación al Sello de Calidad FECYT. Reflexiones sobre el entorno y las perspectivas de los investigadores y las revistas científicas en España

España atraviesa una fase cuanto menos peculiar en la evaluación de la producción científica. La evaluación de los artículos en función de la revista en la que se publica introduce un criterio que poco tiene que ver con la calidad de los trabajos, lo cual supone abundantes y fuertes agravios entre disciplinas más o menos representadas en las grandes bases de datos internacionales.Peer reviewe

Agua y Territorio, de la creación al Sello de Calidad FECYT. Reflexiones sobre el entorno y las perspectivas de los investigadores y las revistas científicas en España

España atraviesa una fase cuanto menos peculiar en la evaluación de la producción científica. La evaluación de los artículos en función de la revista en la que se publica introduce un criterio que poco tiene que ver con la calidad de los trabajos, lo cual supone abundantes y fuertes agravios entre disciplinas más o menos representadas en las grandes bases de datos internacionales.Peer reviewe

Presentación del número 6 de Agua y Territorio, y del libro Agua, Estado y Sociedad en América Latina y España

Seminario celebrado en la Universidad Pablo de Olavide, de Sevilla, del 1 al 2 de febrero de 2016Peer reviewe

The Selectivity for Tumor Cells of Nuclear-Directed Cytotoxic RNases Is Mediated by the Nuclear/Cytoplasmic Distribution of p27^KIP1

Although single targeted anti-cancer drugs are envisaged as safer treatments because they do not affect normal cells, cancer is a very complex disease to be eradicated with a single targeted drug. Alternatively, multi-targeted drugs may be more effective and the tumor cells may be less prone to develop drug resistance although these drugs may be less specific for cancer cells. We have previously developed a new strategy to endow human pancreatic ribonuclease with antitumor action by introducing in its sequence a non-classical nuclear localization signal. These engineered proteins cleave multiple species of nuclear RNA promoting apoptosis of tumor cells. Interestingly, these enzymes, on ovarian cancer cells, affect the expression of multiple genes implicated in metabolic and signaling pathways that are critic for the development of cancer. Since most of these targeted pathways are not highly relevant for non-proliferating cells, we envisioned the possibility that nuclear directed-ribonucleases were specific for tumor cells. Here, we show that these enzymes are much more cytotoxic for tumor cells in vitro. Although the mechanism of selectivity of NLSPE5 is not fully understood, herein we show that p27KIP1 displays an important role on the higher resistance of non-tumor cells to these ribonucleases

I Seminario Internacional de Estudios sobre el Agua (Coordinación de seminario)

El Seminario fue organizado por UPO ( Universidad Pablo de Olavide) (Sevilla) y tuvo lugar en la misma, los días 1 al 2 de febrero de 2016Peer reviewe