Calibration and concept of renovation of universal measurement microscope

Tato práce je zaměřená na laserový měřící systém. Komplexně popisuje jednotlivé složky laserového systému, jeho aplikaci při kalibraci, následné vyhodnocení výsledků a učinění obnovy mikroskopu.This thesis is focused on laser measuring system. It describes comprehensively single components of laser system, its aplication within calibration, subsequent evaluation of results and performance of renovation of the microscope.

Integrated physical map of bread wheat chromosome arm 7DS to facilitate gene cloning and comparative studies

Bread wheat (Triticum aestivum L.) is a staple food for a significant part of the world’s population. The growing demand on its production can be satisfied by improving yield and resistance to biotic and abiotic stress. Knowledge of the genome sequence would aid in discovering genes and QTLs underlying these traits and provide a basis for genomics-assisted breeding. Physical maps and BAC clones associated with them have been valuable resources from which to generate a reference genome of bread wheat and to assist map-based gene cloning. As a part of a joint effort coordinated by the International Wheat Genome Sequencing Consortium, we have con- structed a BAC-based physical map of bread wheat chromosome arm 7DS consisting of 895 contigs and covering 94% of its estimated length. By anchoring BAC contigs to one radiation hybrid map and three high resolution genetic maps, we assigned 73% of the assembly to a distinct genomic position. This map integration, inter- connecting a total of 1713 markers with ordered and sequenced BAC clones from a minimal tiling path, provides a tool to speed up gene cloning in wheat. The process of physical map assembly included the integration of the 7DS physical map with a whole-genome physical map of Aegilops tauschii and a 7DS Bionano genome map, which together enabled efficient scaffolding of physical-map contigs, even in the non-recombining region of the genetic centromere. Moreover, this approach facilitated a comparison of bread wheat and its ancestor at BAC-contig level and revealed a reconstructed region in the 7DS pericentromere

Stopy historie v postagrárních lesích

IMPRINTS OF HISTORY IN POST-AGRICULTURAL FORESTS Ph.D. Thesis Jaroslav Vojta Charles University in Prague, Faculty of Science Praha, 2010 Promotor: Ivan Suchara List of original papers I. Relative importance of historical and natural factors influencing vegetation of secondary forests in abandoned villages (Jaroslav Vojta - Preslia 79: 223-244) II. Land use legacies in post-agricultural forests in the Doupovské Mountains, Czech Republic (Martin Kopecký & Jaroslav Vojta - Applied Vegetation Science 12: 251-260) III. Woody vegetation continuity, topography, and distance to ancient forests have complex effects on the vegetation and species richness of abandoned pastures (Lucie Drhovská & Jaroslav Vojta - submitted) 1 Introduction Land use changes have had a profound effect on vegetation cover. Often, succession results in the recovery of forests on former agricultural land. As areas of post-agricultural forests become increasingly prominent in landscapes of developed countries, these processes have attracted the attention of ecologists. Many questions have arisen regarding the possibility of restoring original forest communities on former agricultural lands (Flinn and Vellend, 2005; Hermy and Verheyen, 2007). At the same time, current and past land use changes could be seen as "natural experiments" that could...8 Úvod V rozvinutých zemích tvoří lesy vzniklé na bývalé zemědělské půdě (postagrární lesy, novodobé lesy, sekundární lesy) stále významnější součást krajiny a proto přitahují pozornost ekologů. Z praktického i teoretického hlediska je zajímavá otázka možnosti obnovy lesních společenstev na bývalé zemědělské půdě a na současné a historické změny krajiny můžeme pohlížet jako na přírodní experiment, který může pomoci porozumět některým základním ekologickým otázkám. Mnoho ekologických studií využívá podrobných prostorově explicitních informací z historických záznamů. Nejčastěji jsou používány staré mapy pro odlišení lesů, které vznikly na zemědělské půdě (novodobé lesy, postagrární lesy) od lesů které existují kontinuálně po dobu několika století (starobylé lesy). Na základě těchto informací bylo doloženo, že kolonizační schopnosti druhů jsou zvláště významné v dlouhodobém vývoji lesní vegetace. Osidlování nově vzniklých lesů může probíhat velmi pomalu a populace pomalu migrujících druhů mohou být omezeny na porosty starobylých lesů nebo na drobné "starobylé" biotopy jako jsou meze s dřevinami. Omezená schopnost lesních druhů kolonizovat sekundární lesy může mít za důsledek homogenizaci společenstev lesních druhů mezi stanovišti. Lesní druhy však tvoří specifickou ekologickou skupinu a o celkové diverzitě...Department of BotanyKatedra botanikyFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Imprints of history in post-agricultural forests

IMPRINTS OF HISTORY IN POST-AGRICULTURAL FORESTS Ph.D. Thesis Jaroslav Vojta Charles University in Prague, Faculty of Science Praha, 2010 Promotor: Ivan Suchara List of original papers I. Relative importance of historical and natural factors influencing vegetation of secondary forests in abandoned villages (Jaroslav Vojta - Preslia 79: 223-244) II. Land use legacies in post-agricultural forests in the Doupovské Mountains, Czech Republic (Martin Kopecký & Jaroslav Vojta - Applied Vegetation Science 12: 251-260) III. Woody vegetation continuity, topography, and distance to ancient forests have complex effects on the vegetation and species richness of abandoned pastures (Lucie Drhovská & Jaroslav Vojta - submitted) 1 Introduction Land use changes have had a profound effect on vegetation cover. Often, succession results in the recovery of forests on former agricultural land. As areas of post-agricultural forests become increasingly prominent in landscapes of developed countries, these processes have attracted the attention of ecologists. Many questions have arisen regarding the possibility of restoring original forest communities on former agricultural lands (Flinn and Vellend, 2005; Hermy and Verheyen, 2007). At the same time, current and past land use changes could be seen as "natural experiments" that could..

Interpretace měření hmotnosti usazených srážek pomocí automatického rosoměru =Interpretation of the deposited precipitation weight measurement using an automatic dew gauge

V příspěvku je popsáno automatické zařízení pro měření množství (hmotnosti) usazených srážek (dále jen automatický rosoměr) vyvinuté Ústavem fyziky atmosféry Akademie věd České republiky (ÚFA AVČR). Jsou zde uvedeny i příklady měření různých druhů usazených srážek. V příspěvku jsou rovněž zmíněny reakce měřicího přístroje na padající srážky a vliv větru na měření. První výsledky měření ukázaly, že přístroj plně vyhovuje pro automatické, kontinuální monitorování usazených srážek.An automatic device for measuring the amount (weight) of the deposited precipitation (automatic dew gauge), developed at the Institute of Atmospheric Physics, Academy of Sciences of the Czech Republic (IAP ASCR), is described. Examples of measurements of the various types of deposited precipitation are presented. The paper also discusses the reaction of the measuring instrument to falling precipitation and the influence of wind on the measurements. The results of the first measurements proved that the instrument is suitable for the automatic and continuous monitoring of the deposited precipitation.12913

Význam sněhové pokrývky v ekologii rostlin =The Importance of Snow Cover for Plant Ecology

181