Mutaciones del gen ARN ribosómico 23S de Helicobacter pylori asociadas con resistencia a claritromicina en pacientes atendidos en una unidad de endoscopia de Medellín, Colombia

Introduction: Clarithromycin is the first-line antibiotic for the treatment of Helicobacter pylori infection. Bacterial resistance is mainly due to the presence of specific mutations in the 23S ribosomal RNA (rRNA) gene.Objective: To determine the frequency of A2143G and A2142G specific mutations in the 23S rRNA gene associated with clarithromycin resistance of H. pylori in samples from patients with dyspeptic manifestations in Medellín, northwestern Colombia.Materials and methods: DNA was extracted from gastric biopsy samples of patients with dyspeptic manifestations seen at an endoscopy unit in Medellín between 2016 and 2017. PCR was performed to amplify the bacterial s and m vacA regions, and a region in the 23S rRNA gene. The presence of the A2142G and A2143G mutations was determined using the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique with the BbsI and BsaI enzymes, respectively.Results: The prevalence of infection was 44.2% (175/396), according to the histopathology report. The positive samples were analyzed and the three regions of the bacterial genome were amplified in 143 of the 175 samples. The A2143G and A2142G mutations were identified in 27 samples (18.8%, 27/143). The most frequent mutation was A2143G (81.5%, 22/27).Conclusions: We found a high prevalence of H. pylori mutations associated with clarithromycin resistance in the study population. Further studies are required to determine the bacterial resistance in the Colombian population in order to define first line and rescue treatments.Introducción. La claritromicina es el antibiótico de primera línea para el tratamiento de la infección por Helicobacter pylori. La resistencia bacteriana se produce principalmente por mutaciones puntuales del gen ARN ribosómico 23S (ARNr 23S).Objetivo. Determinar la frecuencia de las mutaciones puntuales A2143G y A2142G del gen ARNr 23S asociadas con la resistencia de H. pylori a la claritromicina en muestras de pacientes con manifestaciones dispépticas en Medellín, región noroccidental de Colombia.Materiales y métodos. Se extrajo ADN a partir de muestras de biopsia gástrica obtenidas de pacientes con manifestaciones dispépticas atendidos en una unidad de endoscopia entre el 2016 y el 2017. Mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR), se amplificaron las regiones s y m del gen vacA y una región del gen ARNr 23S bacteriano. La presencia de las mutaciones A2142G y A2143G se determinó por la técnica de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP) con las enzimas BbsI y BsaI, respectivamente.Resultados. Se encontró una prevalencia de infección de 44,2 % (175/396), según el informe de histopatología. En 143 de estas 175 muestras positivas se amplificaron las tres regiones del genoma bacteriano. Se identificaron las mutaciones A2143G y A2142G en 27 muestras (18,8 %; 27/143), la mutación más frecuente fue la A2143G (81,5 %; 22/27).Conclusiones. Hubo una gran prevalencia de mutaciones asociadas con la resistencia de H. pylori a la claritromicina en la población de estudio. Se requieren estudios adicionales para establecer la resistencia bacteriana en la población colombiana y, así, determinar los tratamientos de primera línea y de rescate

Investigation of the use of luminescent markers as gunshot residue indicators

The addition of luminescent markers into ammunition cartridges is an appealing proposal to achieve a greater individual identification of the ammunition. The lanthanide elements present in these luminescent materials act as characteristic chemical markers that, also, offer the great benefit of making gunshot residues (GSR) collection easier. In this work, conventional ammunition cartridges tagged with two types of luminescent markers were shot. Then, the particles produced were visualized under UV light on the floor, clothing targets and the shooter. The luminescent particles spread over the floor determined the shooter position and the bullet trajectory. The illumination of the shot targets allows the visualization of the GSR patterns only using a portable UV lamp, avoiding the use of colorimetric test. The GSR particles were collected and subjected to SEM-EDX and Raman spectroscopy analysis to get information about their inorganic and organic composition. The results indicated that part of the marker and the GSR merge and travel together. With this, particles composed by the marker and propellant organic compounds can be identified by Raman spectroscopy, and the unequivocal identification of the GSR and the marker can be achieved by SEM-EDX. Consequently, the luminescent particles detected under UV light improve the evidence collection and offer information about the GSR and the marker.Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO

Emprendimiento como factor del desarrollo turístico rural sostenible

Se investigó el desarrollo turístico rural teniendo en cuenta emprendimientos como factor de su desarrollo, en la parroquia Tachina de la provincia Esmeraldas, Ecuador. Se aplicó el análisis estructural como herramienta de diagnóstico. Se identificaron 19 variables internas y externas, así como variables de resultados de tipo social. Se aplicó la matriz causa-problema-efecto-solución como herramienta de gestión para dirigir las actividades emprendedoras. Se detectó que los emprendedores locales tienen acceso limitado a créditos bancarios e inician sus actividades con recursos propios; por tanto constituyen iniciativas débiles por carecer de varios elementos, lo cual afecta su viabilidad. La actividad turística se encuentra desvinculada del ordenamiento territorial y del Plan Estratégico del Buen Vivir, lo que dificulta el aprovechamiento de las potencialidades turísticas locales.

Retos y soluciones para una evaluación virtual más segura

En la formación semipresencial y virtual, la evaluación en línea representa uno de los mayores desafíos en lo que respecta a la identificación de estudiantes y la certificación en la autoría de sus trabajos. En la última década, está proliferando el uso de sistemas de seguridad, aunque su uso conlleva retos en el diseño de las actividades de evaluación. En este artículo se describe una experiencia docente de rediseño e implementación de un sistema de e-autenticación para incrementar la seguridad en la evaluación en línea. El sistema y la opinión de los diferentes actores se describe para dos asignaturas del Grado de Ingeniería Informática de la Universitat Oberta de Catalunya.E-assessment in blended and virtual education has become one of the major challenges for checking the identity of the students and the authorship of the work they perform. In the past decade, the use of secure systems is widespread. However, the design of e-assessment activities is seriously affected when those systems are integrated. In this paper, an experience is described based on the integration of an e-authentication system for a secure assessment. Considerations about the design and implementation of the activities are also shown. The system and the opinion of the actors in the teaching-learning process are shown from two courses of the Computer Science Bachelor in the Universitat Oberta de Catalunya.Este trabajo ha sido financiado por el proyecto H2020-ICT-2015/H2020-ICT-2015 TeSLA “An Adaptive Trust-based e-assessment System for Learning”, Number 688520

Polimorfismos en los genes de la enzima alcohol deshidrogenasa (ADH1) y la citocromo P450 2E1 (CYP2E1) en pacientes con cirrosis y carcinoma hepatocelular

Introducción. Uno de los principales factores de riesgo del carcinoma hepatocelular es el consumo crónico de alcohol. En estudios en diferentes poblaciones, se sugiere que las variantes genéticas de las enzimas que participan en el metabolismo del alcohol, como la alcohol deshidrogenasa (ADH) y la citocromo P450 (CYP2E1), estarían asociadas con riesgo de enfermedades hepáticas terminales. Objetivo. Identificar y caracterizar las variantes alélicas de los genes ADH1B, ADH1C y CYP2E1 en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Materiales y métodos. Se incluyeron muestras de pacientes atendidos entre el 2005 y el 2007, y entre el 2014 y el 2016, en la unidad de hepatología de un hospital de Medellín. La genotipificación de las muestras se hizo mediante reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase Chain Reaction, PCR) con análisis de los polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP). Los resultados se compararon con los de dos grupos de control y con lo reportado en la base de datos del 1000 Genomes Project. Resultados. Se recolectaron 97 muestras de pacientes con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Los dos factores de riesgo más frecuentes fueron el consumo crónico de alcohol (18,6 %) y las colangiopatías (17,5 %). Los genotipos más frecuentes en la población de estudio fueron el ADH1B*1/1 (82 %), el ADH1C*1/1 (59 %) y el CYP2E1*C/C (84 %). Conclusiones. En este primer estudio de los polimorfismos en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular, los genotipos más frecuentes fueron el ADH1B*1/1, el ADH1C*1/1 y el CYP2E1*C/C. No se observaron diferencias estadísticamente significativas en la frecuencia de los genotipos entre los casos y los controles. Se requieren estudios adicionales en población colombiana para evaluar el riesgo de la enfermedad hepática terminal por consumo crónico de alcohol y la asociación con los polimorfismos

Análisis demográfico de la tasa de transmisión Materno-Infantil de VIH en Chile, en el periodo de 2015-2019

Introducción: El VIH es una enfermedad progresiva que se transmite mediante el contacto sexual, sanguíneo y/o materno infantil (gestación, en el parto y/o lactancia materna). Las cifras de Transmisión Materno Infantil (TMI) han ido disminuyendo en el paso de los años debido a las medidas y políticas públicas, de prevención, promoción, detecciones precoces y tratamientos, sin embargo, nuevos escenarios demográficos hacen necesario estudiar en profundidad esta realidad. Objetivo: Esta investigación tiene como objetivo realizar un análisis demográfico de la tasa de TMI de VIH en Chile entre los años 2015-2019, lo que permitirá, identificar y describir el comportamiento de la tasa de transmisión en Chile, las macrozonas y sus regiones.Método. Lo anterior mediante un enfoque cuantitativo a partir de la base de datos entregado por INE (Instituto Nacional de Estadísticas). Resultados: Se logra observar que, a nivel nacional según datos obtenidos del INE, el año con más contagios fue el 2019 con una tasa de 5,26%, cifra muy superior comparado con los años anteriores los cuales no superan los 3,5%. En cuanto a la tendencia, en la región Metropolitana, se expresa un aumento de la TMI (R2 de 0,99), esta tendencia no aplica en las otras regiones. La tendencia en Chile, es al aumento (R2 de 0,80) Conclusiones: Se pudo concluir que a lo largo de los años se evidencia un aumento en las cifras, mostrando a las regiones de la macrozona Norte y también de la región Metropolitana entre los lugares con mayores tasas. Se atribuye como posible causa de los casos de TMI a diferentes determinantes sociales que se mencionan durante el estudio, como por ejemplo la nacionalidad, ocupación o nivel socioeconómico, lo que invita a proponer nuevas estrategias de eliminación de TMI de VIH con enfoque local y territorial

Endoscopic treatment (endoscopic balloon dilation/self-expandable metal stent) vs surgical resection for the treatment of de novo stenosis in Crohn's disease (ENDOCIR study): an open-label, multicentre, randomized trial.

Background: Stenosis is one of the most common complications in patients with Crohn's disease (CD). Endoscopic balloon dilation (EBD) is the treatment of choice for a short stenosis adjacent to the anastomosis from previous surgery. Self-expandable metal stents (SEMS) may be a suitable treatment option for longer stenoses. To date, however, there is no scientific evidence as to whether endoscopic (EBD/SEMS) or surgical treatment is the best approach for de novo or primary stenoses that are less than 10 cm in length. Methods/design: Exploratory study as "proof-of-concept", multicentre, open-label, randomized trial of the treatment of de novo stenosis in the CD; endoscopic treatment (EBD/SEMS) vs surgical resection (SR). The type of endoscopic treatment will initially be with EDB; if a therapeutic failure occurs, then a SEMS will be placed. We estimate 2 years of recruitment and 1 year of follow-up for the assessment of quality of life, costs, complications, and clinical recurrence. After the end of the study, patients will be followed up for 3 years to re-evaluate the variables over the long term. Forty patients with de novo stenosis in CD will be recruited from 15 hospitals in Spain and will be randomly assigned to the endoscopic or surgical treatment groups. The primary aim will be the evaluation of the patient quality of life at 1 year follow-up (% of patients with an increase of 30 points in the 32-item Inflammatory Bowel Disease Questionnaire (IBDQ-32). The secondary aim will be evaluation of the clinical recurrence rate, complications, and costs of both treatments at 1-year follow-up. Discussion: The ENDOCIR trial has been designed to determine whether an endoscopic or surgical approach is therapeutically superior in the treatment of de novo stenosis in CD

IFNAR2 relevance in the clinical outcome of individuals with severe COVID-19

Interferons (IFNs) are a group of cytokines with antiviral, antiproliferative, antiangiogenic, and immunomodulatory activities. Type I IFNs amplify and propagate the antiviral response by interacting with their receptors, IFNAR1 and IFNAR2. In COVID-19, the IFNAR2 (interferon alpha and beta receptor subunit 2) gene has been associated with the severity of the disease, but the soluble receptor (sIFNAR2) levels have not been investigated. We aimed to evaluate the association of IFNAR2 variants (rs2236757, rs1051393, rs3153, rs2834158, and rs2229207) with COVID-19 mortality and to assess if there was a relation between the genetic variants and/or the clinical outcome, with the levels of sIFNAR2 in plasma samples from hospitalized individuals with severe COVID-19. We included 1,202 subjects with severe COVID-19. The genetic variants were determined by employing Taqman® assays. The levels of sIFNAR2 were determined with ELISA in plasma samples from a subgroup of 351 individuals. The rs2236757, rs3153, rs1051393, and rs2834158 variants were associated with mortality risk among patients with severe COVID-19. Higher levels of sIFNAR2 were observed in survivors of COVID-19 compared to the group of non-survivors, which was not related to the studied IFNAR2 genetic variants. IFNAR2, both gene, and soluble protein, are relevant in the clinical outcome of patients hospitalized with severe COVID-19

Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

La renovación de la palabra en el bicentenario de la Argentina : los colores de la mirada lingüística

El libro reúne trabajos en los que se exponen resultados de investigaciones presentadas por investigadores de Argentina, Chile, Brasil, España, Italia y Alemania en el XII Congreso de la Sociedad Argentina de Lingüística (SAL), Bicentenario: la renovación de la palabra, realizado en Mendoza, Argentina, entre el 6 y el 9 de abril de 2010. Las temáticas abordadas en los 167 capítulos muestran las grandes líneas de investigación que se desarrollan fundamentalmente en nuestro país, pero también en los otros países mencionados arriba, y señalan además las áreas que recién se inician, con poca tradición en nuestro país y que deberían fomentarse. Los trabajos aquí publicados se enmarcan dentro de las siguientes disciplinas y/o campos de investigación: Fonología, Sintaxis, Semántica y Pragmática, Lingüística Cognitiva, Análisis del Discurso, Psicolingüística, Adquisición de la Lengua, Sociolingüística y Dialectología, Didáctica de la lengua, Lingüística Aplicada, Lingüística Computacional, Historia de la Lengua y la Lingüística, Lenguas Aborígenes, Filosofía del Lenguaje, Lexicología y Terminología