Kinetic modeling of molecular motors: pause model and parameter determination from single-molecule experiments

Single-molecule manipulation experiments of molecular motors provide essential information about the rate and conformational changes of the steps of the reaction located along the manipulation coordinate. This information is not always sufficient to define a particular kinetic cycle. Recent single-molecule experiments with optical tweezers showed that the DNA unwinding activity of a Phi29 DNA polymerase mutant presents a complex pause behavior, which includes short and long pauses. Here we show that different kinetic models, considering different connections between the active and the pause states, can explain the experimental pause behavior. Both the two independent pause model and the two connected pause model are able to describe the pause behavior of a mutated Phi29 DNA polymerase observed in an optical tweezers single-molecule experiment. For the two independent pause model all parameters are fixed by the observed data, while for the more general two connected pause model there is a range of values of the parameters compatible with the observed data (which can be expressed in terms of two of the rates and their force dependencies). This general model includes models with indirect entry and exit to the long-pause state, and also models with cycling in both directions. Additionally, assuming that detailed balance is verified, which forbids cycling, this reduces the ranges of the values of the parameters (which can then be expressed in terms of one rate and its force dependency). The resulting model interpolates between the independent pause model and the indirect entry and exit to the long-pause state mode

Control de la dinámica de vórtices en nano-películas superconductoras con espesor modulado

Resumen del póster presentado a la 6ª Jornada de Jóvenes Investigadores en Física y Química de Aragón celebrada en Zaragoza el 20 de noviembre de 2014.Peer reviewe

UNA PROPUESTA DE ÍNDICE DE ACTIVIDAD CIENTÍFICA Y SU VALIDACIÓN EN EL CAMPO DE CIENCIAS SOCIALES Y HUMANIDADES

The international academic rankings that allow comparing universities globally have become widespread in recent years (Buela-Casal et al., 2007). One of the most prominent is that published by The Institute of Higher Education, Shanghai Jiao Tong University (Liu and Cheng, 2005), with its predominant methodological criteria being the publication in scientific journals.Classifications have also been made at European regional level (Merisotis, 2002) and also at country level such as the CHE in Germany (Federkeil, 2002) or the SAR in the United Kingdom (Eccles, 2002). In the mentioned classifications, academic publications have an increasingly important role in assessing the quality of research in different academic contexts. For example, (Bence and Oppenheim (2004) describe the evolution of its importance in the governmental evaluation of research in universities in the United Kingdom (SAR). While formally it is a peer evaluation process, the authors emphasize the role hegemonic publications in the evaluation process.Los Ranking académicos internacionales que permiten comparar universidades a nivel global se han generalizado en los últimos años (Buela-Casal et al., 2007). Uno de los más destacados es el publicado por The Institute of Higher Education, Shanghai Jiao Tong University (Liu and Cheng, 2005) siendo su criterio metodológico predominante la publicación en revistas científicas.Asimismo se han realizado clasificaciones a nivel regional europeo (Merisotis, 2002) y también a nivel de país como por ejemplo el CHE en Alemania (Federkeil, 2002) o el RAE en Reino Unido (Eccles, 2002). En las mencionadas clasificaciones, las publicaciones académicas tienen un rol cada vez más importante a la hora de evaluar la calidad de investigación en diferentes contextos académicos. Por ejemplo, (Bence and Oppenheim (2004) describen la evolución de su importancia en la evaluación gubernamental de la investigación en universidades en Reino Unido (RAE). Si bien formalmente se trata de un proceso de evaluación de pares, los autores remarcan el rol hegemónico de las publicaciones en el proceso de evaluación

Identificación y evaluación de los ecosistemas en el término municipal de Sos del Rey Católico

Sos del Rey Católico es un municipio de la comarca de las Cinco Villas con un gran patrimonio histórico y cultural. A pesar de ello, también ha sufrido la despoblación rural ocurrida en las últimas décadas. Los efectos de las reforestaciones, el asilvestramiento y los cambios en el uso del suelo debido a la pérdida de las prácticas agrosilvopastoriles tradicionales se pueden observar en el paisaje. Este trabajo pretende identificar las unidades ambientales que existen en la actualidad y hacer una comparación con el paisaje de un escenario tradicional de 1956. A partir de esta comparación se ha evaluado cómo ha influido la evolución del uso del suelo en la provisión de servicios ambientales como la provisión de agua y el almacenamiento de carbono. Se proponen dos tipos de restauraciones de ecosistemas, uno en ecosistemas forestales y otro en agroecosistemas. Estas propuestas tienen dos objetivos conjuntos, en los ecosistemas forestales favorecer los recursos que nos proporcionan, gestionar su conservación y mejorar su biodiversidad, y en los agroecosistemas, crear setos que mejoren los servicios ambientales, así como la biodiversidad, sin comprometer la productividad.<br /

BIOCOMERCIAL: SISTEMA INFORMÁTICO PARA LA GESTIÓN DE INFORMACIÓN DE LOS PRODUCTOS BIOTECNOLÓGICOS / BIOCOMERCIAL: COMPUTER SYSTEM FOR INFORMATION MANAGEMENT OF BIOTECHNOLOGICAL PRODUCTS

En la actualidad, las empresas se apoyan cada vez más en las Tecnologías de la Información estableciendo canales para comunicar las mejoras de sus productos y /o servicios. Por lo que la adopción de un sistema de información que automatice procesos de negocio, está pasando a ser un requerimiento importante, adaptándose rápidamente a cambios y progresos. La Subdirección de Escalado y Transferencia Tecnológica del Centro de Bioplantas, es la responsable de la comercialización de especies frutales, forestales, ornamentales y de interés agrícola, que actualmente han presentado poca publicidad de sus productos, pérdidas económicas por errores de cálculos manuales y alta inversión de tiempo en sus actividades. Para solucionar el problema, la presente investigación se centra en la creación de un Sistema Informático para la Gestión de Información de los productos biotecnológicos del Grupo de Gestión Comercial del Centro de Bioplantas de la Universidad de Ciego de Ávila. Para la elaboración de este sistema se utilizan los frameworks de desarrollo Laravel v5.7 y Bootstrap 4, con los lenguajes JavaScript, JQuery, PHP 7, HTML5 y CSS3, visualizando la aplicación sobre el servidor web Xampp. Los datos son consultados mediante el Sistema Gestor de Bases de Datos MySQL y como metodología de desarrollo de software eXtreme Programming (XP). El Sistema Informático propuesto constituye un impacto positivo para la estrategia de comercialización de productos biotecnológicos del Grupo de Gestión Comercial del Centro de Bioplantas de la Universidad de Ciego de Ávila, permitiendo desarrollar los procesos de una manera sencilla, segura y rápida

Thickness-modulated tungsten-carbon superconducting nanostructures grown by focused ion beam induced deposition for vortex pinning up to high magnetic fields

We report efficient vortex pinning in thickness-modulated tungsten–carbon-based (W–C) nanostructures grown by focused ion beam induced deposition (FIBID). By using FIBID, W–C superconducting films have been created with thickness modulation properties exhibiting periodicity from 60 to 140 nm, leading to a strong pinning potential for the vortex lattice. This produces local minima in the resistivity up to high magnetic fields (2.2 T) in a broad temperature range due to commensurability effects between the pinning potential and the vortex lattice. The results show that the combination of single-step FIBID fabrication of superconducting nanostructures with built-in artificial pinning landscapes and the small intrinsic random pinning potential of this material produces strong periodic pinning potentials, maximizing the opportunities for the investigation of fundamental aspects in vortex science under changing external stimuli (e.g., temperature, magnetic field, electrical current)

Bidaia geometrikoa kurbetatik itsas maskorretara

Naturako objektu asko harrigarriak dira, bai beren egituren formagatik eta bai betetzen dituzten propietateengatik. Baina, normalean, egitura misteriotsuak direla sinestearekin konformatzen gara, haien azterketa gure jakinduriaren irispidean ez dagoela uste baitugu. Artikulu honetan, itsas maskorrek itsasoko bizi-baldintza bortitzetan bizirauteko daukaten gaitasunaz erakarrita, erakutsiko dugu beren gorputzek deskribatzen dituzten egiturak argitu, ulertu eta imitatu ere egin ditzakegula. Horretarako, guztiok ezagun ditugun elementu geometriko batzuez baliatuko gara: kurbak. Kurbak izango dira eredu geometriko baten eraikuntzaren oinarria, zeinak, konputazio grafikoak eskaintzen dituen tresnekin batera, itsas maskorren mundura bidaiatzea ahal-bidetuko digun garraioa osatuko duen. Bidaia irudi errealisten sorkuntzarekin amaituko da.; There are many objects in nature which are amazing both for the shape of their structures and for the properties they fulfill. But, we usually settle for believing that they are mysterious structures, since we think that the study of them is not within the reach of our wisdom. In this article, attracted by the shells’ ability to survive in the harsh living conditions at sea, we will show that it is possible to reveal, understand and even imitate the structures that describe their bodies. To achieve this goal, we will make use of geometric elements that we all know, curves. Curves will be the basis for the construction of a geometric model that, together with the tools provided by computer graphics, will make up the transport that will allow us to travel to the world of seashells. The trip will end with obtaining photorealistic images that are difficult to distinguish from reality

Necesidades de formación del profesorado universitario para la adaptación de su docencia al Espacio Europeo de Educación Superior (EEES)

En este trabajo se presentan los resultados de una investigación llevada a cabo en cinco universidades españolas para diagnosticar las necesidades de formación en competencias del profesorado universitario. Utilizando técnicas de encuesta, aplicadas a una amplia muestra d profesorado de las cinco áreas de conocimiento, se han detectado necesidades de formación en seis bloques de competencias: a) la Planificación de la Docencia;  b) el Desarrollo de la Docencia; c)  la Evaluación;  d) la Tutoría;  e) la Gestión;  f) la Formación Continua.  Se han hallado diferencias significativas en las necesidades en función del área de conocimiento y las categorías profesionales

Zonificación paisajística para la planificación territorial: el caso de las directrices del Bajo Aragón

The zonification of territory in landsacpe units was made in accordance to the geosistemic analysis framework by studing its components in different scales. Land uses and geomorphological features are two important characteristics in subunits definition. This settings served as the base to the territorial model definition of the Bajo Arag&oacute;n region planning strategy.En el marco conceptual y metodol&oacute;gico del estudio geosist&eacute;mico, se procede a la zonificaci&oacute;n del territorio en unidades de paisaje a partir del an&aacute;lisis de sus componentes a diversas escalas. Para la definici&oacute;n de subunidades, el uso del suelo y los rasgos geomorfol&oacute;gicos se revelan de gran importancia. Ello colabora a la definici&oacute;n de un modelo territorial para la propuesta de directrices de ordenaci&oacute;n de la comarca del Bajo Arag&oacute;n