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Diseño e implementación de un módulo para la anotación de imágenes médicas
Se comenzó el trabajo recabando información sobre los distintos enfoques que se le había dado a la anotación a lo largo del tiempo, desde anotación de imágenes a mano,
pasando por anotación de imágenes utilizando características de bajo nivel, como color y textura, hasta la anotación automática.
Tras entrar en materia, se procedió a estudiar artículos relativos a los diferentes algoritmos utilizados para la anotación automática de imágenes. Dado que la anotación
automática es un campo bastante abierto, hay un gran numero de enfoques. Teniendo las características de las imágenes en particular en las que se iba a centrar el proyecto, se fueron descartando los poco idoneos, bien por un coste computacional elevado, o porque estaba centrado en un tipo diferente de imágenes, entre otras cosas.
Finalmente, se encontró un algoritmo basado en formas (Active Shape Model) que se consideró que podría funcionar adecuadamente. Básicamente, los diferentes objetos de
la imagen son identicados a partir de un contorno base generado a partir de imágenes de muestra, siendo modicado automáticamente para cubrir la zona deseada. Dado que las imágenes usadas son todas muy similares en composición, se cree que puede funcionar bien.
Se partió de una implementación del algoritmo programada en MATLAB. Para empezar, se obtuvieron una serie de radiografías del tórax ya anotadas. Las imágenes contenían datos de contorno para ambos pulmones, las dos clavículas y el corazón. El primer paso fue la creación de una serie de scripts en MATLAB que permitieran:
- Leer y transformar las imágenes recibidas en RAW, para adaptarlas al tamaño y la posición de los contornos anotados - Leer los archivos de texto con los datos de los puntos del
contorno y transformarlos en variables de MATLAB
- Unir la imagen transformada con los puntos y guardarla en un formato que la implementación del algoritmo entendiera.
Tras conseguir los ficheros necesarios, se procedió a crear un modelo para cada órgano utilizando para el entrenamiento una pequeña parte de las imágenes. El modelo obtenido se probó con varias imágenes de las restantes. Sin embargo, se encontro bastante variación dependiendo de la imagen utilizada y el órgano detectado.
---ABSTRACT---The project was started by procuring information about the diferent approaches to image annotation over time, from manual image anotation to automatic annotation.
The next step was to study several articles about the diferent algorithms used for automatic image annotation. Given that automatic annotation is an open field, there
is a great number of approaches. Taking into account the features of the images that would be used, the less suitable algorithms were rejected.
Eventually, a shape-based algorithm (Active Shape Model) was found. Basically, the diferent objects in the image are identified from a base contour, which is generated from training images. Then this contour is automatically modified to cover the desired area. Given that all the images that would be used are similar in object placement, the algorithm would probably work nicely.
The work started from a MATLAB implementation of the algorithm. To begin
with, a set of chest radiographs already annotated were obtained. These images came with contour data for both lungs, both clavicles and the heart. The first step was the
creation of a series of MATLAB scripts to join the RAW images with the annotation data and transform them into a format that the algorithm could read.
After obtaining the necessary files, a model for each organ was created using part of the images for training. The trained model was tested on several of the reimaining images. However, there was much variation in the results from one image to another.
Generally, lungs were detected pretty accurately, whereas clavicles and the heart gave more problems.
To improve the method, a new model was trained using half of the available images.
With this model, a significant inprovement of the results can be seen
Repunte de la industria nacional en 1984: la magnitud del retroceso
La primera evidencia que plantea el repunte industrial en 1984 es el desmantelamiento parcial del aparato industrial propiciado por dos vías: una es la parálisis de la industria que ha derivado en una acentuada destrucción técnica y de valor de los capitales y del volumen de la producción nacional; el otro camino del desmantelamiento transita los actuales rumbos de inserción del país en la división internacional del trabajo, a propósito del nuevo carácter de las inversiones extranjeras tipo maquila
Symmetry limit properties of a priori mixing amplitudes for non-leptonic and weak radiative decays of hyperons
We show that the so-called parity-conserving amplitudes predicted in the a
priori mixing scheme for non-leptonic and weak radiative decays of hyperons
vanish in the strong-flavor symmetry limit
La génesis del mundo ibérico en la submeseta sur: el tránsito del Bronce final- I Edad del Hierro en Alarcos
Towards new multivalent supramolecular helical structures based on phthalocyanines for PDT applications
The self-assembly of α-D-glucose octafunctionalized Zn(II) phtalocyanine (ZnPc) in aqueous media has been investigated using different techniques such as UV, CD and diffusion-ordered 1H-NMR spectroscopy (DOSY). The formation of supramolecular columnar helical aggregates with a preferred handedness due to the presence of the sugar moiety has been confirmed by these techniques. Moreover, the stability of the supramolecular polymers formed has been assessed by using pyridine as a zinc ligand, disrupting the aggregates or inducing their formation by dilution of the system.M.G:I. acknowledges the MICINN for his Juan de la Cierva Fellowshi
Endogenous Fishing Mortalities: a State-Space Bioeconomic Model
A methodology that endogenously determines catchability functions that link fi shing mortality with
contemporaneous stock abundance is presented. We consider a stochastic age-structured model for
a fishery composed by a number of fi shing units (fleets, vessels or métiers) that optimally select
the level of fishing effort to be applied considering total mortalities as given. The introduction of
a balance constrain which guarantees that total mortality is equal to the sum of individual fi shing
mortalities optimally selected, enables total fishing mortality to be determined as a combination
of contemporaneous abundance and stochastic processes affecting the fishery. In this way, future
abundance can be projected as a dynamic system that depends on contemporaneous abundance.
The model is generic and can be applied to several issues of fisheries management. In particular, we
illustrate how to apply the methodology to assess the floating band target management regime for
controlling fishing mortalities which is inspired in the new multi-annual plans. Our results support
this management regime for the Mediterranean demersal fishery in Northern Spain.This work was funded by the European Commission as part of the MINOUW project (H2020-SFS-2014-2, number 634495) and the Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitiveness (ECO2016-78819-R, AEI/FEDER, UE
El poblamiento ibérico en el Alto Guadiana
This paper presents the results of the recent research on the Iberian Iron Age sites conducted in the Upper Guadiana basin of the Ciudad Real province (Castilla-La Mancha). The research included excavations and archaeological surveys conducted in this area for two decades, setting up the foundation of a model of settlement in this territory during the development of the Iberian culture.En este trabajo se presentan los resultados de las investigaciones recientes realizadas sobre la época ibérica en el Alto Guadiana, provincia de Ciudad Real (Castilla-La Mancha). Se incluyen los trabajos de excavación y prospección arqueológica llevados a cabo en esta zona, desde hace dos décadas, que han permitido plantear el modelo de poblamiento en este territorio durante el desarrollo de la cultura ibérica
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