Aspects of average response computation by aperiodic stimulation

A mathematical analysis of the variance of the average evoked-response computation as a function of the numberN of stimuli presented is made for the case when the response is disturbed by additive stationary noise. A comparison is made between the variance for purely periodic stimuli and that for stimuli of which the interstimulus durations are Gaussian distributed. In the latter situation, the interval durations may be correlated with each other, e.g. according to a Gaussian Markov process. It is deduced that, in general, the introduction of aperiodic stimulation tends to make the functional relationship between the variance andN behave as though it holds for noise with a very broad frequency spectrum; the variance is proportional to 1/N

Diversité génétique et structure de population de Phytophthora megakarya, l'agent causal de la pourriture brune des cabosses en Afrique centrale et occidentale

Phytophthora megakarya est un pathogène agressif du cacaoyer. Comme le cacao a été introduit en Afrique relativement récemment et que P. megakarya est endémique sur ce continent, il est fait l'hypothèse que ce pathogène provient d'un "saut d'hôte". Pour tester cette hypothèse. des études préliminairs sur la diversité et la structure du pathogène sont nécessaires. Douze nouveaux marqueurs microsatellites ont été mis au point pour une étude génétique des populations à grande échelle. Au total, 727 souches ont été génotypées. 651 collectées dans l'ensemble du Cameroun depuis 1982, et 76 souches d'autres pays (Sao Tomé, Gabon. Nigeria. Ghana et Côte d'Ivoire). Cent soixante génotypes multilocus, définissant 71 groupes clonaux, ont été identifiés dans l'ensemble de la population. De plus, tous les isolats, sauf trois étaient de type sexuel A1. Ces résultats, associés à de faibles valeurs Fis (indices Fstat), et à une fréquence élevée de déséquilibre de liaison dans 6 populations géographiques, suggèrent fortement un mode de reproduction asexuée. La déduction de la structure de population et l'afectation d'individus à des groupes ont été faites en utilisant des méthodes standard (analyse factorielle) ainsi que des approches bayésiennes (utilisant les logiciels Structure et Geneland). L'analyse factorielle a identifié 3 groupes génétiques distincts: un groupe diversifié en Afrique centrale (Cameroun. Gabon. Sao Tomé), un groupe homogène en Afrique de l'Ouest (Nigeria. Togo, Ghana, Côte d'Ivoire plus des souches du Sud du Cameroun). et un troisième groupe, composé de souches de la zone Fako au Cameroun, dans les contreforts du Mont Camerom. Cette étude a fait ressortir la présence de 3 groupes génétiques différents au Cameroun et a confirmé, en utilisant un échantillon beaucoup plus important les réstiltats antérieurs basés sur les isoenzymes et les marqueurs RAPD. L'analyse utilisant le logiciel Structure, a classé les individus dans 3 populations bien différenciées (Fst: 0,13 à 0,37). En utilisant le logiciel Genelan, qui prend en compte l'origine géographique des souches, les individus ont été classés dans 6 populations avec des niveaux de différenciation Yariables (Fst : 0.07 à 0,42). Une corrélation a été obsen'ée entre les groupes obtenus à partir de l'analyse factorielle et ceux obtenus avec Structure. Les deux méthodes ont révélé une grande diversité génétique dans la zone "Bipindi-Lolodorf", et la présence de clones spécifiques dans la zone Fako au Cameroun, il est donc fait l'hypothèse qu'une de ces zones. Fako ou Bipindi-Lolodorf, pourrait être la zone d'origine de P. megakapya, et c'est une étape importante pour chercher un hôte primaire potentiel. De plus, il a été établi qu'un génotype était omniprésent et se diffusait dans les nouvelles plantations au Cameroun. alors que d'autres génotypes étaient limités à certains habitats. Ce résultat démontre l'adaptation à une grande diversité de conditions agroécologiques de ce génotype particulier. (Résumé d'auteur

Formulation des conidies de Trichoderma Asperellum sous forme de dispersion huileuse pour la lutte biologique contre Phytophthora Megakarya, agent responsable de la pourritutre brune des fruits du cacaoyer (Theobroma Cacao L.) au Cameroun

La pourriture brune des fruits du cacaoyer causée par Phytophthora megakarya au Cameroun est à l'origine des pertes importantes de rendement L'utilisation des conidies de Trichoderma asperellum formulées sous forme de poudre mouillable pour lutter contre l'agent responsable de la pourriture brune des fruits a montré des résultats prometteurs mais inconstants. L'objectif de cette étude était de produire une formulation des conidies de Trichoderma asperellum sous forme de dispersion huileuse afin d'améliorer l'efficacité de cet agent de lutte biologique. Dix formulations sous forme de dispersion huileuse ont été développées et caractérisées suivant la méthode CIPAC. La dispersion huileuse F8 composée de 75,5% d'huile de soja, 15% de Tensiofix NTM, 5% de Tensiofix 869, 4.5% de glucose et de 2,7 x 107 conidies de T. asperellum ml-1 s'est révélée comme étant la meilleure formulation sur la base de ses propriétés physiques (stabilité: 75%; viscosité: 106.01 cps). Par ailleurs, le taux de germination des conidies de T. asperellum dans cette formulation après 26 semaines de stockage à 4°C était de 46%. Cette formulation a donc été sélectionnée et son efficacité biologique contre P. megakarya a été évaluée in vitro et in vivo. Les résultats obtenus à l'issu des tests sur milieu artificiel ont montré que les conidies de T. aspere/lum sous forme formulée réduisaient significativement le taux de croissance du pathogène (P<0.05). Cette observation a par la suite été confirmée lors des tests réalisés sur cabosses détachées où la formulation sous forme de dispersion huileuse des conidies de T. aspereflum a inhilbé à l00% le développement de la maladie. En tout, ces résultats suggèrent que la formulation des conidies de T. asperellum sous forme de dispersion huileuse pour constituer une alternative viable à la lutte chimique contre la pourriture des fruits du cacaoyer. Cependant, la confirmation de ce potentiel requiert préalablement la réalisation des tests en champs en utilisant cette formulation. (Résumé d'auteur

Threshold model for clustered firing of neurons

Two probabilistic threshold models for burst activity of cortical neurons are proposed. In model I every input impulse increases the summed effect of previous input impulses by one unit. The decay of the summed effect takes place in discrete steps of one unit. A response occurs on arrival of an input impulse, when a threshold value is attained.\ud \ud Although after a response the summed effect is not reset to zero, it cannot exceed the threshold either. The distribution of intervals can be resolved in two components, one for long and one for short intervals. In model II intervals of the short component are terminated by a multiple response instead of one response

Stretching the Rules: Monocentric Chromosomes with Multiple Centromere Domains

The centromere is a functional chromosome domain that is essential for faithful chromosome segregation during cell division and that can be reliably identified by the presence of the centromere-specific histone H3 variant CenH3. In monocentric chromosomes, the centromere is characterized by a single CenH3-containing region within a morphologically distinct primary constriction. This region usually spans up to a few Mbp composed mainly of centromere-specific satellite DNA common to all chromosomes of a given species. In holocentric chromosomes, there is no primary constriction; the centromere is composed of many CenH3 loci distributed along the entire length of a chromosome. Using correlative fluorescence light microscopy and high-resolution electron microscopy, we show that pea (Pisum sativum) chromosomes exhibit remarkably long primary constrictions that contain 3-5 explicit CenH3-containing regions, a novelty in centromere organization. In addition, we estimate that the size of the chromosome segment delimited by two outermost domains varies between 69 Mbp and 107 Mbp, several factors larger than any known centromere length. These domains are almost entirely composed of repetitive DNA sequences belonging to 13 distinct families of satellite DNA and one family of centromeric retrotransposons, all of which are unevenly distributed among pea chromosomes. We present the centromeres of Pisum as novel ``meta-polycentric'' functional domains. Our results demonstrate that the organization and DNA composition of functional centromere domains can be far more complex than previously thought, do not require single repetitive elements, and do not require single centromere domains in order to segregate properly. Based on these findings, we propose Pisum as a useful model for investigation of centromere architecture and the still poorly understood role of repetitive DNA in centromere evolution, determination, and function

Pesticides use in cocoa sector in Cameroon: characterization of supply source, nature of actives ingredients, fashion and reasons for their utilization

The chemical control is the widely control method applied in Cameroon for pests and diseases by all the cocoa producers without technical suitable assistance by the State as before 1980'S. However, it is known that farmers have less knowledge on the good pesticides use for the control of a specific pest. The objective of this study was to provide insight in current pesticide use in the cocoa sector in Cameroon. A stratified sampling scheme was used. A total of 251 cocoa farmers, 20 post-harvest cocoa traders and 37 chemical retailers were randomly selected and interviewed. The study showed that 35 different chemicals were marketed in Cameroon for use in cocoa: 4 herbicides, 11 fungicides and 20 insecticides. Of 251 farmers consulted, 96.8% said that they use pesticides on their farms while 3.2% did not. Fungicides were used most often by farmers 61.8%) followed by insecticides (38.2%). Eight active ingredients although, officially banned, were still being used on cocoa farms. Over 77% of farmers do not respect the official spray recommendations for chemicals. Moreover, 64% do not respect recommended doses. Two main pesticide-supply-pathways exist in Cameroon: a legal and illegal supply chain, which provides 51% of pesticides to cocoa farmers, resulting in an estimated loss of value added tax for the Cameroonian government of about 550 000 to 2.4 million Euros per year. These results suggest that improved pests and diseases control by the State and raising farmer awareness about pesticide use in cocoa could greatly attribute to more sustainable cocoa economy in Cameroon. (Résumé d'auteur

Marine microbial biodiversity, bioinformatics and biotechnology (M2B3) data reporting and service standards

Contextual data collected concurrently with molecular samples are critical to the use of metagenomics in the fields of marine biodiversity, bioinformatics and biotechnology. We present here Marine Microbial Biodiversity, Bioinformatics and Biotechnology (M2B3) standards for “Reporting” and “Serving” data. The M2B3 Reporting Standard (1) describes minimal mandatory and recommended contextual information for a marine microbial sample obtained in the epipelagic zone, (2) includes meaningful information for researchers in the oceanographic, biodiversity and molecular disciplines, and (3) can easily be adopted by any marine laboratory with minimum sampling resources. The M2B3 Service Standard defines a software interface through which these data can be discovered and explored in data repositories. The M2B3 Standards were developed by the European project Micro B3, funded under 7th Framework Programme “Ocean of Tomorrow”, and were first used with the Ocean Sampling Day initiative. We believe that these standards have value in broader marine science

Fixation and Spread of Somatic Mutations in Adult Human Colonic Epithelium

We investigated the means and timing by which mutations become fixed in the human colonic epithelium by visualizing somatic clones and mathematical inference. Fixation requires two sequential steps. First, one of approximately seven active stem cells residing within each colonic crypt has to be mutated. Second, the mutated stem cell has to replace neighbors to populate the entire crypt in a process that takes several years. Subsequent clonal expansion due to crypt fission is infrequent for neutral mutations (around 0.7% of all crypts undergo fission in a single year). Pro-oncogenic mutations subvert both stem cell replacement to accelerate fixation and clonal expansion by crypt fission to achieve high mutant allele frequencies with age. The benchmarking of these behaviors allows the advantage associated with different gene-specific mutations to be compared irrespective of the cellular mechanisms by which they are conferred