DNA Oligomers - From Protein Binding to Probabilistic Modelling

This dissertation focuses on rationalised DNA design as a tool for the discovery and development of new therapeutic entities, as well as understanding the biological function of DNA beyond the storage of genetic information. The study is comprised of two main areas of study: (i) the use of DNA as a coding unit to illustrate the relationship between code-diversity and dynamics of self-assembly; and (ii) the use of DNA as an active unit that interacts and regulates a target protein. In the study of DNA as a coding unit in code-diversity and dynamics of self-assembly, we developed the DNA-Based Diversity Modelling and Analysis (DDMA) method. Using Polymerase Chain Reaction (PCR) and Real Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), we studied the diversity and evolution of synthetic oligonucleotide populations. The manipulation of critical conditions, with monitoring and interpretation of their effects, lead to understanding how PCR amplification unfolding could reshape a population. This new take on an old technology has great value for the study of: (a) code-diversity, convenient in a DNA-based selection method, so semi-quantitation can evaluate a selection development and the population\'s behaviour can indicate the quality; (b) self-assembly dynamics, for the simulation of a real evolution, emulating a society where selective pressures direct the population's adaptation; and (c) development of high-entropy DNA structures, in order to understand how similar unspecific DNA structures are formed in certain pathologies, such as in auto-immune diseases. To explore DNA as an active unit in Tumour Necrosis Factor α (TNF-α) interaction and activity modulation, we investigate DNA's influence on its spatial conformation by physical environment regulation. Active TNF-α is a trimer and the protein-protein interactions between its monomers are a promising target for drug development. It has been hypothesised that TNF-α forms a very intricate network after its activation between its subunits and receptors, but the mechanism is still not completely clear. During our research, we estimate the non-specific DNA binding to TNF-α in the low micro-molar range. Cell toxicity assays confirm this interaction, where DNA consistently enhances TNF-α's cytotoxic effect. Further binding and structural studies lead to the same conclusion that DNA binds and interferes with TNF-α structure. From this protein-DNA interaction study, a new set of tools to regulate TNF-α's biological activity can be developed and its own biology can be unveiled

CUIDADOS DE ENFERMAGEM EM SITUAÇÕES DE TRAUMA CRÂNIO-ENCEFÁLICO

Dos diferentes estudos e outras obras bibliográficas das pesquisas exploratórias decorrentes desse trabalho, sobressai como um dado incontornável o facto de o traumatismo craniano representar uma das causas com maior índice de mortalidade. A população masculina é apontada como a que mais atingida por esse tipo de trauma provocado essencialmente por acidentes de viação e quedas. Para além do elevado índice de mortalidade a que está associado o Traumatismo Crânio Encefálico (TCE), esta referenciado como um dos mais importantes redutores de capacidades no seio da população activa. Um quadro que interpela os profissionais de saúde sobre as melhores condutas a serem adoptadas no atendimento das vítimas, que nessas circunstância, apresentam lesões numa das partes vitais do corpo, pelo que é imperativo um correcto e atempado diagnóstico, bem como tratamentos condizentes para se evitar consequência gravosas para a saúde e vida do paciente. Daí a importância da capacidade técnica das equipes de urgência no atendimento dos casos de traumatismo craniano, no qual assume um papel relevante o enfermeiro. A nossa pesquisa como enfoque a enfermagem, no cuidado aos pacientes vítimas de TCE em serviço de urgência/emergência. Tentar-se-á entender o nível dos serviços actualmente prestados, e até que ponto o profissional de enfermagem estará suficientemente preparado para dar assistência necessária a este tipo de paciente, facilitar a sua rápida recuperação, evitando assim maiores complicações e diminuindo o tempo de internamento hospitalar. Nesse particular, é igualmente propósito, perceber e realçar a sistematização de enfermagem como algo imprescindível para esse tipo de cuidado. E porque a humanização do cuidado de enfermagem é actualmente tida como vertente fundamental e pressuposto básico de um competente serviço de assistência, assim tentaremos aperceber se existe ou não uma cultura colectiva do verdadeiro sentido do cuidar em enfermagem e as implicações daí decorrentes na qualidade do serviço prestado que, por sua vez e inevitavelmente, estará atrelada as políticas administrativas traçadas para o sector. Confrontado o resultado da revisão bibliográfica com a situação vivida nos nossos serviços de saúde, estar-se-á em condições de melhor aferir sobre o grau de observância dos 6 preceitos indispensáveis a um competente serviço de cuidado e procurar soluções para as falhas e/ou carências

Synergistic effect of the homologous PB1–NA gene constellation in Influenza A virus reassortants: Evaluation and characterization of reassortant influenza variant viruses cross-resistant to influenza Neuraminidase Inhibitors

This project aims to elucidate the functional impact of specific mutation induced changes in the NA and PB1 genes on the viral fitness and cross-resistance profile of A(H1N1)pdm09 viruses.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Development of intelligent vehicles for delivery of anti-tumoral drugs

The female reproductive system is essential for the maintenance of the human species. However, it can be affected by several diseases such as ovarian cysts or cancer, pelvic infection, cervical cancer, cervical cysts and polyps, endometrial cancer, endometriosis, endometrial polyps, hyperplasia and fibroids, tipped uterus, prolapsed uterus and breast cancer, which can lead to infertility problems or patient death. Cervical cancer remains as one of the leading causes of women’s death worldwide, and it does not present any signs or symptoms. It has been intimately related whit Human Papilloma Virus duo to the genetic mutations that this virus can cause, when it enters in the cervical cells. For the treatment of cervical cancer surgery, radiotherapy or chemotherapy, alone or combined can be used. Chemotherapy use different drugs as therapeutic agents and the most used in cervical cancer are cisplatin, ifosfamide, paclitaxel, irinotecan and gemcitabine. These drugs can be administered either orally or intravenously. The lack of specificity of these chemotherapeutics agents avoids their accumulation at the target tissue and allows its spreading along the body causing side effects in the healthy tissues. In an attempt to minimize side effects and improve the efficacy of the currently available treatments, new therapeutic approaches are currently being developed. New drug delivery systems are currently being developed to allow the transport of a therapeutic substance through the body and a sustained drug release at the target tissue. Among the different drug delivery systems, nanoparticles are the most used due to their higher capacity to be internalizing by cells and release the drug that they transport inside them. There are several types of nanoparticles that belong to two main groups: organic and inorganic. The magnetic nanoparticles constitute the larger group of inorganic nanoparticles, whereas liposomes, dendrimers and polymeric nanoparticles belong to the organic group. The objective of the present work was to produce polymeric poly-ε-caprolactone/poly-methyl methacrylate nanoparticles with a sustained drug release to be used for cancer treatment. The produced nanoparticles were characterized by Scanning Electron Microscopy, Transmission Electron Microscopy, Dynamic Light Scattering and Fourier Transform Infrared spectroscopy. Moreover, Cisplatin was used as model drug for the characterization of the loading and release profiles of these nanocarriers, as well as to evaluate the therapeutic potential of the produced system. In addition the in vitro studies were performed to evaluate the cellular internalization and biocompatibility of the produced nanocarriers, and also characterize the release profile and therapeutic efficacy of the loaded drug to cancer cells. The results obtained, suggest that the produce nanosystem has suitable properties to be used as a drug delivery system for cancer therapy.O sistema reprodutor feminino é essencial para garantir a continuidade da espécie humana. No entanto este está sujeito a várias doenças tais como quistos ou cancro nos ovários, infeções pélvicas, cancro, quistos e pólipos no colo do útero, cancro do endométrio, endometriose, pólipos no endométrio, hiperplasia, miomas e cancro da mama, que podem levar a problemas de infertilidade ou mesmo à morte das doentes. O cancro do colo do útero continua a ser uma das principais causas de morte entre mulheres em todo o mundo, e não apresenta sinais ou sintomas. Esta doença está intimamente relacionada com o Papiloma Vírus Humano, devido ao poder mutagénico que este vírus tem após infetar as células do colo do útero. No tratamento do cancro do colo do útero pode ser usada cirurgia, radioterapia e quimioterapia, sozinhas ou combinadas. A quimioterapia usa fármacos como agentes terapêuticos, sendo os mais usados a cisplatina, ifosfamida, paclitaxel, irinotecano e gencitabina, que podem ser administrados quer por via oral ou intravenosa. A falta de especificidade dos fármacos usados faz com que eles não se acumulem apenas no tecido alvo mas também se espalhem pelo corpo afetando os em tecidos saudáveis e destruindo órgãos vitais. Na tentativa de minimizar os efeitos colaterais e melhorar os resultados obtidos com as terapias disponíveis, tem sido desenvolvidas novas abordagens que assentam no desenvolvimento de sistemas de entrega de fármacos. Estas formulações/dispositivos podem transportar uma substância terapêutica através do corpo e promover a sua libertação durante o período de tempo necessário e no órgão alvo. As nanopartículas são os sistemas mais utilizados devido à grande capacidade para entrar nas células e libertar o fármaco no seu interior. Na atualidade existem vários tipos de nanopartículas, sendo divididas em dois grandes grupos: orgânicas e inorgânicas. Dentro das nanopartículas inorgânicas podemos encontrar as nanopartículas magnéticas. No que se refere as nanopartículas orgânicas as mais estudadas são os lipossomas, dendrímeros, e as nanopartículas poliméricas. O objetivo do presente trabalho foi produzir nanopartículas poliméricas de poli-ε-caprolactona/poli-metil metacrilato que permitissem o transporte de fármacos e a sua libertação em células cancerígenas para serem utilizadas no tratamento do cancro. As nanopartículas produzidas foram caracterizadas por microscopia eletrónica de varrimento, microscopia eletrónica de transmissão, dispersão dinâmica de luz e espectroscopia de infravermelho. Estudos in vitro foram realizados para avaliar a biocompatibilidade e a capacidade das nanopartículas serem internalizadas pelas células cancerígenas, assim como avaliar a eficiência de encapsulação do fármaco no interior da nanopartículas e a sua libertação, usando Cisplatina como fármaco modelo, de forma a permitir caracterizar a eficiência terapêutica do sistema apresentado. Os resultados obtidos sugerem que as nanopartículas produzidas constituem bons candidatos para futuras aplicações de entrega de fármacos à nano-escala para terapia do cancro

Associação entre neofobia alimentar, craving por doces e uso do alimento como recompensa e prazer com estado nutricional e escolhas alimentares em adolescentes

Orientador: Jorge Herman BehrensTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de AlimentosResumo: O comportamento alimentar é influenciado pela interação entre fatores fisiológicos, sociais, culturais, emocionais e sensoriais. Nesse contexto, destacam-se dois tipos de atitudes em relação aos alimentos ¿ a recusa em experimentar alimentos novos e o intenso desejo por determinado tipo ou grupo de alimento como, por exemplo, os doces. Tais atitudes antagônicas, relacionadas, principalmente a fatores sensoriais e hedônicos, refletem nas escolhas e preferências alimentares e, consequentemente, na formação de hábitos de consumo. O presente trabalho teve como objetivo verificar a neofobia alimentar, o craving por doces, o uso do alimento como recompensa e prazer e sua associação com o estado nutricional e as escolhas alimentares de adolescentes. Primeiramente, realizou-se uma revisão narrativa sobre os determinantes da neofobia alimentar e sua influência nas escolhas alimentares. Após a revisão, a escala de neofobia alimentar (ENA) foi traduzida e validada para o português. A versão brasileira da ENA provou ser conceitualmente equivalente ao instrumento original, sem diferença entre os itens das versões em inglês e português (P>0,05) e com alta reprodutibilidade para avaliar a neofobia alimentar (alfa de Cronbach = 0,916). Posteriormente, foi realizado um estudo transversal com 132 adolescentes, de 15 a 19 anos, matriculados em cursos técnicos do Instituto Federal de Poços de Caldas, MG, Brasil. Foram coletados dados sociodemográficos, alimentares, antropométricos e de composição corporal dos adolescentes entre outubro e dezembro de 2015. Apenas 15,9% dos adolescentes foram classificados com alta neofobia alimentar, enquanto a maioria apresentou nível moderado a elevado de craving por doces (69,7%), uso do alimento como recompensa (67,4%) e prazer (73,5%). Além disso, o craving por doces foi associado com excesso de peso, omissão de refeição, inatividade física e consumo de doces (P0.05) and with high reproducibility (Cronbach's alpha = 0.916). Subsequently, a cross-sectional study was conducted with 132 teenagers aged 15 to 19 enrolled in technical courses at the Federal Institute of Poços de Caldas, MG, Brazil. Socio-demographic, food behavior, anthropometric and body composition data were collected between October and December 2015. Only 15.9% of the adolescents were classified with high food neophobia, while the majority had moderate to high levels of craving for sweets (69.7%), using food as reward (67.4%) and pleasure (73.5%). Craving for sweets was associated with overweight, meal omission, physical inactivity and sweets intake (P<0.05). Using food as reward was associated with adiposity, physical inactivity, lack of interest in information about food and, also, consumption of sweets (P<0.05). Using food as pleasure was associated with physical inactivity, lack of interest in information about food, consumption of sweets and soft drinks (P<0.05). In addition, there was a higher degree of craving for sweets, using food as pleasure and percentage of body fat among female individuals. Regarding the nutritional status, 81.8% of the teenagers were eutrophic, 10.6% were overweight and 7.6% were obese. Finally, the majority of teenagers presented inadequate fruits (87.9%) and vegetables intake (93.9%). As a conclusion, this study contributed to validate the Portuguese version of the FNS, which will be a useful tool to measure food neophobia in the Brazilian population. However, more research is needed in Brazil to investigate the food neophobia and its impact on food behavior among different age group. The present work also contributed to a better understanding of the association among the factors related to taste (craving for sweets, reward and pleasure) with nutritional status and food choices in adolescence. However, further research is still needed to better explore this relationship with eating habits and obesity. This will allow the proposition of nutritional and motivational orientations directed to healthier food choices in adolescenceDoutoradoConsumo e Qualidade de AlimentosDoutora em Alimentos e Nutrição140397/2014-0CNP

Comparison of humic acids production by Trichoderma viride and Trichoderma reesei using the submerged fermentation of oil palm empty fruit bunch

The remarkable properties of humic acids have generated a broad spectrum of applications in pharmaceutical, cosmetic and agricultural fields, and encouraged fermentation studies focusing on humic acids production. This work compares the humic acids production of Trichoderma (viride and reesei) species using empty fruit bunch as the substrate during submerged fermentation. The performance of each species was compared by examining spore production in oat medium, and the significant medium components and fermentation conditions were identified using Plackett and Burman statistical design. For both Trichoderma species, the results indicate that humic acids production can be enhanced by increasing the temperature, empty fruit bunch and peptone concentrations and by decreasing the (NH4)2SO4 concentration. T. reesei performed better than T. viride, generating 3-fold more of humic acids.Keywords: Humic acids, Trichoderma reesei, Trichoderm aviride, submerged fermentation, empty fruit bunchAfrican Journal of Biotechnology, Vol. 13(9), pp. 1067-1074, 26 February, 201

Somatization in Latin America: a review of the classification of somatoform disorders, functional syndromes and medically unexplained symptoms

OBJETIVO: Os sintomas sem explicação médica são frequentes e estão associados a sofrimento mental em vários contextos. Estudos prévios apontam que as populações latino-americanas são propensas à somatização. Diante da reformulação da Classificação Internacional de Doenças para sua 11ª edição, as particularidades dos nativos desta região do mundo devem ser levadas em consideração. O objetivo deste estudo é prover informações sobre somatização na população latino-americana para a tomada de decisões quanto às categorias diagnósticas ligadas a sintomas sem explicação médica na Classificação Internacional de Doenças-11ª edição. MÉTODO: Revisão extensa da produção de 1995 a 2011 sobre somatização em populações de origem latino-americana. RESULTADOS: A análise dos 106 estudos incluídos nesta revisão foi dividida em 15 categorias: revisões sistemáticas, revisões conceituais, prevalências, atenção primária, depressão e ansiedade, fatores de risco, violência, quadros orgânicos, relacionamento com profissionais e o sistema de saúde, etnia, síndromes ligadas à cultura, síndrome da fadiga crônica, fibromialgia, transtorno dismórfico corporal, e conversão e dissociação. CONCLUSÃO: Os estudos latino-americanos confirmam a dificuldade na definição categorial de quadros com sintomas sem explicação médica. O suposto "traço somatizador" das culturas latinas pode estar associado mais à expressão cultural e linguística do que a um caráter de natureza étnica, e tais particularidades devem estar na agenda na nova classificação destes fenômenos na Classificação Internacional de Doenças-11ª edição.OBJECTIVE: medically unexplained symptoms are common and associated with mental illness in various contexts. Previous studies show that Latin American populations are prone to somatization. Given the reformulation of the International Classification of Diseases towards its 11th edition the peculiarities of the population from this region of the world shall be taken into consideration. The objective of this study is to provide information on somatization in Latin American populations to help the decision making about medically unexplained symptoms diagnostic categories in the 11th edition of the International Classification of Diseases. METHOD: Extensive review of the academic production from 1995 to 2011 on somatization in populations of Latin American origin. RESULTS: The analysis of 106 studies included in this review was divided into 15 categories: systematic reviews, conceptual reviews, prevalence, primary care, depression and anxiety, risk factors, violence, organic conditions, relationship with health care, ethnicity, culture-bound syndromes, chronic fatigue syndrome, fibromyalgia, body dysmorphic disorder, and conversion and dissociation. CONCLUSION: The Latin American studies confirm the difficulty in defining medically unexplained symptoms categories. The supposed "somatizing trace" of Latin cultures may be linked more to cultural and linguistic expression than to an ethnic nature, and these peculiarities must be on the agenda for the new classification of these phenomena in the Classification of Diseases-11th edition

Vigilância epidemiológica de um evento de massas em contexto urbano, 2015-2016

Poster sobre a vigilância epidemiológica do Carnaval de Torres Vedras em 2015 e 2016N/