CCRS proposal for evaluating LANDSAT-D MSS and TM data

Accomplishments in the evaluation of LANDSAT 4 data are reported. The objectives of the Canadian proposal are: (1) to quantify the LANDSAT-4 sensors and system performance for the purpose of updating the radiometric and geometric correction algorithms for MSS and for developing and evaluating new correction algorithms to be used for TM data processing; (2) to compare and access the degree to which LANDSAT-4 MSS data can be integrated with MSS imagery acquired from earlier LANDSAT missions; and (3) to apply image analysis and information extraction techniques for specific user applications such as forestry or agriculture

Isolement et détection des champignons causant la brûlure de la pousse dans les plantations de sapins du Québec

La production des arbres de Noël représente un marché distinct et marginal comparé aux autres types de production végétale. En effet, comme la valeur des arbres vendus dans ces activités économiques est proportionnelle à la qualité du feuillage, les différents facteurs influençant ce paramètre sont donc dominants dans les considérations des organismes régissant et encadrant cette culture. Les maladies d’origine fongique s’attaquant au feuillage des arbres de Noël représentent un phénomène environnemental important dans cette optique, engendrant des pertes de plus en plus prononcées dans les plantations du Québec. Dans le cas de cette province, considérée comme la plus grande productrice canadienne, la majorité des plantations produisent des sapins baumiers (Abies balsamea) qui sont, depuis ces dernières années, en proie à une maladie foliaire nommée la brûlure de la pousse. Cette maladie, causée par Delphinella abietis et Delphinella balsameae, est caractérisée par des symptômes comme un recroquevillement des aiguilles faisant partie des pousses de l’année, en plus de l’apparition de fructifications foncées visibles à l’oeil nu un an après l’infection. Même si des traitements aux fongicides sont présentement employés dans le but de contrôler cette maladie, la minime quantité d’informations disponibles au sujet des agents causaux et du cycle d’infection rend ces tentatives peu efficaces et relativement dommageables pour l’environnement. De plus, les seuls diagnostiques présentement disponibles pour les organismes de dépistage sont les observations au microscope des structures de dissémination qui n’est possible qu’à l’apogée des symptômes, rendant les diagnostics inefficaces pour contrer la maladie. Le but de ce projet de recherche était donc d’en apprendre davantage sur le cycle d’infection du Delphinella au Québec, de pouvoir isoler et caractériser les différents champignons qui sont présents au cours de la brûlure de la pousse et finalement de produire des outils diagnostiques, basés sur la technique des PCRs, qui permettraient de détecter plus rapidement et efficacement les agents pathogènes impliqués dans la brûlure de la pousse. À l’aide d’échantillonnages réguliers au courant des étés 2015 et 2016, des tendances plaçant les étapes critiques du cycle d’infection au début du mois de juin ont pu être observées par rapport à la dissémination des spores. Les échantillons récoltés en plantation suite à l’exposition ont permis l’acquisition d’aiguilles infectées qui ont été utilisées afin de pouvoir isoler les agents causaux de cette maladie. En effet, la dissection et le broyage des fructifications suivis par la mise sur milieu de culture des lysats résultants ont permis d’isoler plusieurs endophytes du sapin baumier. De plus, des isolements ont aussi été effectuée en plaçant au-dessus de la surface de milieux de culture stériles des fructifications, associées aux symptômes de la maladie, pendant l’étape de la dissémination et en obtenant ainsi une multitude de colonies appartenant à la même espèce. Dans les deux cas, l’identification moléculaire à l’aide du séquençage de la région ITS a permis de mettre en évidence l’acquisition d’isolats appartenant à l’espèce D. balsameae. Une autre espèce d’agent pathogène, Sydowia polyspora, a aussi été isolé à plusieurs reprises au cours du projet. Des protocoles de PCR basés sur la technique de type « touchdown » ont été développés afin de pouvoir détecter ces deux agents pathogènes dans les aiguilles de sapins. Pour ce faire, la région ITS ainsi que deux autres régions génétiques, le gène codant pour le facteur d’élongation 1 alpha (EF1A) et le gène codant pour la beta-tubuline (BTUB) ont été séquencés chez les isolats afin de concevoir des amorces spécifiques à l’ADN génomique des espèces ciblées. Les amorces se sont avérées efficaces pour détecter spécifiquement les deux champignons étudiés dans les aiguilles de sapins avec un seuil de détection de 10 ng/μl. De plus, ces outils de détection ont permis de déterminer des tendances quant à l’occurrence de D. balsameae qui n’est détecté que dans des aiguilles infectées et S. polyspora qui est autant retrouvé dans les aiguilles infectées que saines. Finalement, des sapins baumiers juvéniles ont été mis ou non en contact avec des aiguilles contaminées et apparemment matures en ce qui a trait à la dissémination des ascospores afin de confirmer le rôle d’agent pathogène de D. balsameae dans l’établissement de la brûlure des pousses. Deux mois après l’exposition, les arbres présentaient des symptômes de stress qu’ils aient ou non, été exposés à l’agent pathogène. Par contre, D. balsameae a pu être détecté avec les outils de diagnostic seulement dans certains des arbres exposés aux aiguilles porteuses de spores. Le projet a permis le développement d’outils qui pourront être appliqués dans la lutte contre cette maladie en expansion

Evaluating LANDSAT-4 MSS and TM data

Interband line pixel misregistrations were determined for the four MSS bands of the Mistassini, Ontario scene and multitemporal registration of LANDSAT-4 products were tested for two different geocoded scenes. Line and pixel misregistrations are tabulated as determined by the manual ground control points and the digital band to band correlation techniques. A method was developed for determining the spectral information content of TM images for forestry applications

CCRS proposal for evaluating LANDSAT-4 MSS and TM data

The measurement of registration errors in LANDSAT MSS data is discussed as well as the development of a revised algorithm for the radiometric calibration of TM data and the production of a geocoded TM image

Nucleon-induced reactions at intermediate energies: New data at 96 MeV and theoretical status

Double-differential cross sections for light charged particle production (up to A=4) were measured in 96 MeV neutron-induced reactions, at TSL laboratory cyclotron in Uppsala (Sweden). Measurements for three targets, Fe, Pb, and U, were performed using two independent devices, SCANDAL and MEDLEY. The data were recorded with low energy thresholds and for a wide angular range (20-160 degrees). The normalization procedure used to extract the cross sections is based on the np elastic scattering reaction that we measured and for which we present experimental results. A good control of the systematic uncertainties affecting the results is achieved. Calculations using the exciton model are reported. Two different theoretical approches proposed to improve its predictive power regarding the complex particle emission are tested. The capabilities of each approach is illustrated by comparison with the 96 MeV data that we measured, and with other experimental results available in the literature.Comment: 21 pages, 28 figure

Destruction of the Mott Insulating Ground State of Ca_2RuO_4 by a Structural Transition

We report a first-order phase transition at T_M=357 K in single crystal Ca_2RuO_4, an isomorph to the superconductor Sr_2RuO_4. The discontinuous decrease in electrical resistivity signals the near destruction of the Mott insulating phase and is triggered by a structural transition from the low temperature orthorhombic to a high temperature tetragonal phase. The magnetic susceptibility, which is temperature dependent but not Curie-like decreases abruptly at TM and becomes less temperature dependent. Unlike most insulator to metal transitions, the system is not magnetically ordered in either phase, though the Mott insulator phase is antiferromagnetic below T_N=110 K.Comment: Accepted for publication in Phys. Rev. B (Rapid Communications

Neutron-induced Light Ion Production From Fe, Pb And U At 96 Mev

Double-differential cross sections for light-ion production (up to A=4) induced by 96 MeV neutrons have been measured for $^{nat}$Fe, $^{nat}$Pb and $^{nat}$U. The experiments have been performed at the The Svedberg Laboratory in Uppsala, using two independent devices, MEDLEY and SCANDAL. The recorded data cover a wide angular range (20º - 160º) with low energy thresholds. The work was performed within the HINDAS collaboration studying three of the most important nuclei for incineration of nuclear waste with accelerator-driven systems (ADS). The obtained cross section data are of particular interest for the understanding of the so-called pre-equilibrium stage in a nuclear reaction and are compared with model calculations performed with the GNASH, TALYS and PREEQ code

Akt Is S-Palmitoylated: A New Layer of Regulation for Akt

The protein kinase Akt/PKB participates in a great variety of processes, including translation, cell proliferation and survival, as well as malignant transformation and viral infection. In the last few years, novel Akt posttranslational modifications have been found. However, how these modification patterns affect Akt subcellular localization, target specificity and, in general, function is not thoroughly understood. Here, we postulate and experimentally demonstrate by acyl-biotin exchange (ABE) assay and (3)H-palmitate metabolic labeling that Akt is S-palmitoylated, a modification related to protein sorting throughout subcellular membranes. Mutating cysteine 344 into serine blocked Akt S-palmitoylation and diminished its phosphorylation at two key sites, T308 and T450. Particularly, we show that palmitoylation-deficient Akt increases its recruitment to cytoplasmic structures that colocalize with lysosomes, a process stimulated during autophagy. Finally, we found that cysteine 344 in Akt1 is important for proper its function, since Akt1-C344S was unable to support adipocyte cell differentiation in vitro. These results add an unexpected new layer to the already complex Akt molecular code, improving our understanding of cell decision-making mechanisms such as cell survival, differentiation and death