Assessment of Knowledge, Attitude and Practice of Voluntary Blood Donation and Associated Factors among Residents of Birbir Town, Southern Ethiopia

Blood transfusion is a medical procedure that is designed to provide patients who need blood or blood products to correct a defect. Secure supply of safe blood components, based on voluntary, non-remunerated blood donation is an important national goal to prevent blood shortages. Now a day, in many low- and middle-income countries, blood supply is critically inadequate. Therefore, the objective of this study was to assess knowledge, attitude, and practice of voluntary blood donation and associated factors among adults of Birbir town residents. Community based cross sectional study design was employed among residents of Birbir town with 387 samples from July 1- 30, 2016. After proportional allocation to size to each of 4 villages, systematic sampling method was used to select households. Data was collected from all villages by investigators using standard questionnaire. Finally data was entered and analyzed using SPSS version 20 software. About 144 (38.3%),  170 (45.2%)  and 40 (10.6%) of respondents have adequate knowledge,  favorable attitude  and donated blood respectively. Educational status and occupation were determinants of knowledge, age and knowledge were determinants of attitude and  attitude was the only determinant of practice of voluntary blood donation. This study revealed that the prevalence of knowledge, attitude and practice of voluntary blood donation is low . There is a need to design and implement awareness creation program on blood donation. Offices of blood banks in the country, health offices and other stake holders should organize educational campaigns to build community awareness, positive attitude and boost voluntary blood donation among the communities. Keywords: knowledge; attitude; practice; voluntary blood donation; Birbir; Southern Ethiopia; factor

Ontogeny and phylogeny of gasteroid members of Agaricaceae (Basidiomycetes)

The focus of this work are the gasteromycetation events of fungi related to the Basidiomycete family of Agaricaceae. These fungi occur in a diversity of shapes, and yet are all adapted to angio- or cleistocarpic, passive spore dispersal. Traditionally, they were treated within Lycoperdaceae and Tulostomataceae, or in various secotioid genera of uncertain assignment. By molecular phylogeny, ten independent events of gasteromycetation are revealed within Agaricaceae s. l., and relationships to hymenothecial taxa are shown. Five major clades are revealed, which are referred to as Tulostomataceae, Coprinaceae, Lepiotaceae, Lycoperdaceae and Agaricaceae s. str. For Langermannia gigantea, the new flabelloid type of hymenial development is shown, with considerable differences to other Lycoperdaceae. Ontogeny of Lycoperdaceae generally deviates from the results of previous analyses. New data on distribution of gasteroid fungi is gained by fungus-floristic analyses of the secotioid fungi of Mongolia, and the gasteroid fungi of Panama. Two new records for Mongolia, and ten new findings for Panama are given. In a review of the morphological features of gasteroid Agaricaceae s. l. under consideration of ecological background and phylogenetic relationships, gasteromycetation is explained as evolutionary process where the presence of comparable ecological constraints led to analogous anatomical changes, often concealing phylogenetic heritage. The evolutionary age can not fully explain the morphological differences between gasteroid groups. Paedomorphosis, understood as disturbance of the succession of developmental regulation, is assumed as triggering process of gasteromycetation. The primary dispersal strategy of gasteroid Agaricaceae is euanemochory, which is established mainly in steppe and desert habitats. From there, colonisation of other biomes followed under evolution of appropriate anatomical features

Zielgerichtete Synthese von helikalen und zyklischen Harnstoffoligomeren über die Beeinflussung der Kettenkonformation

In der vorliegenden Arbeit sollten sowohl neue Polyharnstoffe als auch makrozyklische Harnstoffe bzw. Amidine auf Basis von 2,6-Diaminopyridin im Hinblick auf eine potentielle Anwendung in der supramolekulare Chemie hergestellt und charakterisiert werden. Ab initio-Berechnungen zufolge, sollten die linearen Harnstoffoligomere aufgrund von nichtkovalenten Wechselwirkungen ab dem Tetramer eine helikale Struktur aufweisen. In dieser Arbeit sollten die Harnstoffoligomere über einen stufenweisen Aufbau mit 2,6-Diaminopyridin (2,6-DAPy) bzw. dem Dimermolekül als Ausgangsstoff synthetisiert werden. Die Idee war unter Verwendung des Dimers im ersten Aufbauschritt das lineare Tetramer als Hauptprodukt zu erhalten und die Bildung von zyklischen Trimeren zu unterbinden. Bei der Darstellung der Harnstoffoligomere mit einem Überschuss an 2,6-DAPy und N,N'-Carbonyldiimidazol (CDI) bei 100 °C und bei Raumtemperatur in DMSO wurden Harnstoffgemische aus linearem Dimer (linH-Di), Trimer (linH-Tri), Tetramer (linH-Tetra) und zyklischem Trimer (cyH-Tri1) erhalten. Eine Trennung dieser durch Extraktion oder mittels Säulenchromatographie konnte aufgrund der strukturellen Ähnlichkeiten der Verbindungen nicht durchgeführt werden. Allerdings konnte durch Verwendung von THF das lineare Dimer bei Raumtemperatur rein erhalten werden. Eine Umsetzung des Dimers linH-Di mit CDI in DMSO bei 100 °C führte nicht zu den gewünschten offenkettigen Harnstoffen, sondern zu zyklischen Verbindungen. NMR-Untersuchungen zeigten, dass es sich hierbei um ein Gemisch aus zwei zyklischen Trimeren und einem zyklischen Tetramer handelt. Zwei Hauptgründe sind für die Bildung der Zyklen im Falle des Dimers als Ausgangsstoff verantwortlich: Erstens ist das Dimer in DMSO bei höheren Temperaturen instabil, was durch entsprechende Versuche bei 100 bis 140 °C gezeigt werden konnte. In den NMR-Spektren sind neben dem zyklischen Trimer cyH-Tri1 sowohl lineare Harnstoffe linH-Tri und linH-Tetra als auch das 2,6-Diaminopyridin nachzuweisen. Zweitens belegen sowohl TGA-Messungen als auch temperaturabhängige Synthesen (80 °C bis 180 °C in DMSO), dass das zyklische Trimer cyH-Tri1 thermodynamisch am stabilsten ist. Die unerwartete Bildung der zyklischen Trimere bei den Umsetzungen des linH-Di kann durch Austausch- und Nebenreaktionen erklärt werden. Durchgeführte Modellreaktionen belegen, dass freie Aminogruppen für Austauschreaktionen (zwischen NH2- und NH-Gruppe) notwendig sind. Andernfalls sind keine Reaktionen, z. B. zwischen zwei Harnstoffgruppen, nachzuweisen. Des Weiteren treten vermutlich auch Nebenreaktionen zwischen einem Dimermolekül und einem temporär vorliegenden Isocyanat unter Bildung einer Biuretverbindung auf. Durch den Zerfall der Biuretverbindung entsteht ein Isocyanat, das mit einem weiteren Dimermolekül zu einem linearen Trimer reagieren kann. Eine anschließende Reaktion mit CDI führt dann zur Bildung eines zyklischen Trimers. Mittels ESI-MS- und NMR-Untersuchungen konnte erstmals eine mögliche Struktur des zyklischen Tetramers cyH-Tetra angegeben werden. Bei cyH-Tetra können maximal zwei H-Brücken ausgebildet werden, wohingegen die Struktur des zyklischen Trimers durch drei intramolekulare H-Brücken stabilisiert wird. Das erklärt auch die thermodynamische Bevorzugung des zyklischen Trimers. Um nun aber gezielt offenkettige Harnstoffoligomere herzustellen und eine Zyklenbildung vollständig zu vermeiden, wurde die Reaktion kinetisch beeinflusst. Dazu wurde neben der Temperatur und der Stöchiometrie auch das Lösungsmittel variiert. Bei den Untersuchungen zeigte sich, dass nur bei niedrigen Temperaturen (T < 80 °C) die Zyklenbildung unterdrückt werden kann. Des Weiteren ist die Verwendung von polaren Lösungsmitteln (DMSO, THF, DMF und Aceton) notwendig, um die Edukte in ausreichender Menge zu lösen. Hinsichtlich der Stöchiometrie ist das Bild uneinheitlich. Als beste Methoden zur Darstellung des linH-Tetra erwiesen sich die Synthesen bei Raumtemperatur in THF und DMF. Ein weiterer Ansatz wurde mit MALDI-TOF-MS charakterisiert. Neben dem linearen Tetramer linH-Tetra treten noch längerkettige, vorwiegend geradzahlige Oligomere bis zum Dodecamer und zyklische Harnstoffe (bis zum Octamer) auf. Dabei ist die Intensität des linearen Tetramers am größten. Mittels dieser Methode wurde somit erstmals der Nachweis für das Auftreten von längerkettigen Harnstoffen erbracht. Alternative Synthesemethoden zur Darstellung von Harnstoffoligomeren mit Di-tert-butyldicarbonat und mit Hilfe von Templaten wurden ebenfalls in dieser Arbeit durchgeführt. In beiden Fällen konnten sowohl lineare als auch zyklische Harnstoffe hergestellt werden. Eine Verbesserung hinsichtlich der Ausbeute an linH-Tetra konnte mit diesen Synthesevarianten jedoch nicht erzielt werden, da die Anteile an längerkettigen Verbindungen geringer ausfielen als bei den Umsetzungen des Dimers mit CDI. Ein weiteres Ziel der Arbeit war die Synthese von substituierten zyklischen Harnstoff- und Amidintrimeren über Kondensationsreaktionen der entsprechenden 4-Alkyl-(Aryl)-oxy-2,6-diaminopyridine mit CDI in DMSO und mit Triethylorthoformiat in Substanz. Die benötigten substituierten Diamine wurden ausgehend von der Chelidamsäure über eine Veresterung/Veretherung und einen Curtius- bzw. Hofmann-Abbau hergestellt. TGA-Untersuchungen an diesen Trimeren zeigten, dass der Masseverlust bei den Proben mit einer Butyloxyseitenkette im Vergleich zu den anderen geringer ist. Das hängt damit zusammen, dass bei den Zyklen mit einer Hexyloxy-, Dodecyloxy- und Benzyloxyseitenkette neben dem Abbau der Seitenketten auch ein uncharakteristischer Zerfall der Hauptkette (Ringsystem) stattfindet. Hingegen werden die Butyloxyseitenketten nacheinander und nur unvollständig für T < 800 °C abgespalten; ein Abbau der Hauptkette ist nicht ersichtlich.:1 Einleitung 2 Zielstellung 3 Grundlagen 3.1 Foldamere 3.2 Formamidine 3.2.1 Synthese von Amidinen bzw. Formamidinen 3.2.2 Lineare und makrozyklische Formamidine 3.3 Harnstoffderivate 3.3.1 Synthese von Harnstoffderivaten 3.3.2 Lineare Harnstoffderivate 3.3.3 Makrozyklen 3.4 Substituierte 2,6-Diaminopyridine 3.4.1 Synthese über den Hofmann-Säureamidabbau 3.4.2 Synthese via Curtius-Reaktion 4 Ergebnisse und Diskussion 4.1 Synthese substituierter 2,6-Diaminopyridine 4.2 Synthese der Modellsubstanzen 4.3 Stufenweiser Aufbau von linearen Harnstoffderivaten des 2,6-Diaminopyridins 4.3.1 Umsetzung von 2,6-Diaminopyridin mit N,N’-Carbonyldiimidazol 4.3.2 Umsetzung des Dimers linH-Di mit N,N’-Carbonyldiimidazol 4.3.3 Lösungsmitteleffekt 4.3.4 Alternative Carbonylierungsreagenzien 4.4 Quantenmechanische Geometrieoptimierung 4.5 Umsetzung von 2,6-Diaminopyridin mit Di-tert-butyldicarbonat 4.6 Umsetzung substituierter 2,6-Diaminopyridine mit N,N’-Carbonyldiimidazol 4.7 Beeinflussung der Kettenkonformation linearer Harnstoffe durch Template 4.8 Zyklische Amidin- und Harnstoffderivate des 2,6-Diaminopyridins 4.8.1 Synthese von substituierten zyklischen Amidinen 4.8.2 Synthese von substituierten zyklischen Harnstoffen 4.9 Untersuchung der Assoziatbildung zwischen Harnstoff- und Amidinoligomeren 5 Zusammenfassung und Ausblick 6 Experimenteller Teil 6.1 Methoden der Charakterisierung 6.2 Verwendete Chemikalien und Reagenzien 6.3 Synthese der Modellsubstanzen 6.3.1 1,3-Bis(4-methyl-2-pyridyl)-harnstoff (linH-1) 6.3.2 N,N’-Bis(4-methyl-2-pyridyl)-formamidin (linF-1) 6.3.3 1,3-Bis(4,6-dimethyl-2-pyridyl)-harnstoff (linH-2) 6.3.4 N,N’-Bis(4,6-dimethyl-2-pyridyl)-formamidin (linF-2) 6.4 Synthese substituierter 2,6-Diaminopyridine 6.4.1 2,6-Diamino-4-pentyloxypyridin (C5-DAPy) 6.4.2 2,6-Diamino-4-butyloxypyridin (C4-DAPy) 6.4.3 2,6-Diamino-4-dodecyloxypyridin (C12-DAPy) 6.4.4 2,6-Diamino-4-hexyloxypyridin (C6-DAPy) 6.4.5 2,6-Diamino-4-benzyloxypyridin (Bn-DAPy) 6.5 Synthese linearer Harnstoffderivate des 2,6-Diaminopyridins 6.5.1 1,3-Bis(6-amino-2-pyridyl)-harnstoff (linH-Di) 6.5.2 Reaktionen des 2,6-Diaminopyridins mit N,N’-Carbonyldiimidazol 6.5.3 Reaktionen des Dimers (linH-Di) mit N,N’-Carbonyldiimidazol 6.5.4 Reaktionen mit (Boc)2O 6.5.5 Synthesen mit 4-Alkyloxy-2,6-diaminopyridinen und N,N’-Carbonyldiimidazol 6.6 Synthesen linearer Harnstoffe mit Hilfe von Templaten 6.7 Synthese zyklischer Harnstoffe und Formamidine 6.7.1 Cyclo-tri(4-alkyloxy-2,6-pyridylharnstoffe) 6.7.2 Cyclo-tri(4-alkyloxy-2,6-pyridylformamidine) 6.8 NMR-Untersuchungen zur Assoziatbildung zwischen Harnstoff- und Amidinderivaten 6.9 Modellreaktionen für Synthese des Dimers mit N,N’-Carbonyldiimidazol 6.9.1 Umsetzung von 1,3-Bis(4-methyl-2-pyridyl)-harnstoff (linH-1) mit 1,3-Bis-(4,6-dimethyl-2-pyridyl)-harnstoff (lin-H-2) 6.9.2 Umsetzung von 1,3-Bis(4-methyl-2-pyridyl)-harnstoff (linH-1) mit 2,6-Diaminopyridin 6.9.3 Temperaturversuche mit Dimer linH-Di (A6)6 7 Anhang 7.1 Massenspektren 7.1.1 EI-Massenspektren von A2-a-F1, A2-a-F2 und A2-a-F3 7.1.2 MALDI-TOF-Massenspektrum von A10-e-1-1 7.2 Wichtige Berechnungsformeln 7.2.1 Berechnung der molaren Anteile (mol-%) der Harnstoffderivate 7.2.2 Berechnung der Ausbeute an linearem Dimer bzw. Tetramer 8 Literaturverzeichnis 9 Danksagun

A stable backbone for the fungi

Fungi are abundant in the biosphere. They have fascinated mankind as far as written history goes and have considerably influenced our culture. In biotechnology, cell biology, genetics, and life sciences in general fungi constitute relevant model organisms. Once the phylogenetic relationships of fungi are stably resolved individual results from fungal research can be combined into a holistic picture of biology. However, and despite recent progress, the backbone of the fungal phylogeny is not yet fully resolved. Especially the early evolutionary history of fungi and the order or below-order relationships within the ascomycetes remain uncertain. Here we present the first phylogenomic study for a eukaryotic kingdom that merges all publicly available fungal genomes and expressed sequence tags (EST) to build a data set comprising 128 genes and 146 taxa. The resulting tree provides a stable phylogenetic backbone for the fungi. Moreover, we present the first formal supertree based on 161 fungal taxa and 128 gene trees. The combined evidences from the trees support the deep-level stability of the fungal groups towards a comprehensive natural system of the fungi. They indicate that the classification of the fungi, especially their alliance with the Microsporidia, requires careful revision. Our analysis is also an inventory of present day sequence information for the fungi. It provides insights into which phylogenenetic conclusions can and which cannot be drawn from the current data and may serve as a guide to direct further sequencing initiatives. Together with a comprehensive animal phylogeny, we provide the second of three pillars to understand the evolution of the multicellular eukaryotic kingdoms, fungi, metazoa, and plants, in the past 1.6 billion years

Chaenothecopsis schefflerae (Ascomycota: Mycocaliciales): a widespread fungus on semi-hardened exudates of endemic New Zealand Araliaceae

Ascomycetes specialised to live on hardened plant exudates occur worldwide, but the number of species so far described is relatively small (c.30). Particularly within the genus Chaenothecopsis (Ascomycota:Mycocaliciales), many species produce their ascomata on hardened but still relatively fresh outpourings of conifer resin or angiosperm exudate. Temperate rainforests of New Zealand provide habitat for several endemic Chaenothecopsis species, including Chaenothecopsis schefflerae, which was previously known from a single sample collected from the exudate of Schefflera digitata (Araliaceae) in the early 1980s. Here we show that C.schefflerae is neither lost nor very rare, but occurs sporadically throughout New Zealand. The fungus does not primarily grow on Schefflera but on exudate of several species of Pseudopanax (Araliaceae),also endemic to the region. We compare the morphology of the new specimens to the type specimen of C. schefflerae and provide a detailed description of the new material. Phylogenetic analyses based on nuclear ITS and LSU rDNA place C.schefflerae together with other morphologically similar Chaenothecopsis species growing on angiosperm exudates.Peer reviewe

A Consistent Phylogenetic Backbone for the Fungi

The kingdom of fungi provides model organisms for biotechnology, cell biology, genetics, and life sciences in general. Only when their phylogenetic relationships are stably resolved, can individual results from fungal research be integrated into a holistic picture of biology. However, and despite recent progress, many deep relationships within the fungi remain unclear. Here, we present the first phylogenomic study of an entire eukaryotic kingdom that uses a consistency criterion to strengthen phylogenetic conclusions. We reason that branches (splits) recovered with independent data and different tree reconstruction methods are likely to reflect true evolutionary relationships. Two complementary phylogenomic data sets based on 99 fungal genomes and 109 fungal expressed sequence tag (EST) sets analyzed with four different tree reconstruction methods shed light from different angles on the fungal tree of life. Eleven additional data sets address specifically the phylogenetic position of Blastocladiomycota, Ustilaginomycotina, and Dothideomycetes, respectively. The combined evidence from the resulting trees supports the deep-level stability of the fungal groups toward a comprehensive natural system of the fungi. In addition, our analysis reveals methodologically interesting aspects. Enrichment for EST encoded data—a common practice in phylogenomic analyses—introduces a strong bias toward slowly evolving and functionally correlated genes. Consequently, the generalization of phylogenomic data sets as collections of randomly selected genes cannot be taken for granted. A thorough characterization of the data to assess possible influences on the tree reconstruction should therefore become a standard in phylogenomic analyses

Towards 'operating within' the field: doctoral students' views of supervisors' discipline expertise

Aim/Purpose: This paper considers the role of supervisors’ discipline expertise in doctoral learning from a student perspective. Background: Doctoral students need to develop expertise in a particular field of study. In this context, developing expertise requires doctoral students to master disciplinary knowledge, conventions and scholarship under the guidance of supervisors. Methodology: The study draws on a mixed-method approach, using an online survey and semi-structured interviews conducted with doctoral students. Contribution: The paper brings to the fore the role of supervisors’ discipline expertise on doctoral students’ research progress. Findings: The survey data suggest that doctoral students nominate their supervisors on the basis of their discipline expertise. They also view supervisors’ expertise as key to the development of ‘insider’ knowledge of their doctoral research. Recommendations for Practitioners: Supervisors play a pivotal role in helping doctoral students overcome intellectual barriers by imparting their discipline knowledge as well as balancing satisfactory doctoral completion rate and high quality student experience. Impact on Society: Doctoral supervision equips doctoral students with the right arsenal to be able to competently operate within their field and prepares them for their future research or professional career that demands a high level of discipline expertise. Future Research: The scope of the findings leaves open a discussion about the experiences of doctoral students matched with non-discipline expert supervisory teams; for example, the extent of the mismatch and its ramifications