77 research outputs found

    Mining alleles for tar spot complex resistance from CIMMYT's maize Germplasm Bank

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    The tar spot complex (TSC) is a devastating disease of maize (Zea mays L.), occurring in 17 countries throughout Central, South, and North America and the Caribbean, and can cause grain yield losses of up to 80%. As yield losses from the disease continue to intensify in Central America, Phyllachora maydis, one of the causal pathogens of TSC, was first detected in the United States in 2015, and in 2020 in Ontario, Canada. Both the distribution and yield losses due to TSC are increasing, and there is a critical need to identify the genetic resources for TSC resistance. The Seeds of Discovery Initiative at CIMMYT has sought to combine next-generation sequencing technologies and phenotypic characterization to identify valuable alleles held in the CIMMYT Germplasm Bank for use in germplasm improvement programs. Individual landrace accessions of the “Breeders' Core Collection” were crossed to CIMMYT hybrids to form 918 unique accessions topcrosses (F1 families) which were evaluated during 2011 and 2012 for TSC disease reaction. A total of 16 associated SNP variants were identified for TSC foliar leaf damage resistance and increased grain yield. These variants were confirmed by evaluating the TSC reaction of previously untested selections of the larger F1 testcross population (4,471 accessions) based on the presence of identified favorable SNPs. We demonstrated the usefulness of mining for donor alleles in Germplasm Bank accessions for newly emerging diseases using genomic variation in landraces

    Aromaticity in cyanuric acid

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    This study analyzes the aromatic nature of cyanuric acid (hexahydrotriazine) and some of its derivatives, in terms of aromatic stabilization energy (ASE) and electronic behavior. The simplest molecule (C3N3O3H3) is the most aromatic item out of the entire set, but some of the others also display aromatic character. The structure of all the rings is analyzed considering their molecular orbitals as well as studying the inductive effect

    Actividad antihipertensiva de péptidos de zeína extraídos de maíz (Zea mays L.) criollo (azul y rojo) del Estado de México

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    Objective: To evaluate the antihypertensive activity of peptides extracted from nixtamalized and non-nixtamalized creole corn (blue and red) zein from the Estado de México. Design / methodology / approach: Bioinformatic tools, such as the NCBI database, were used to search for primary sequences of the maize zein protein. The methodology included a prediction of peptides with antihypertensive activity through various bioinformatic servers. Inhibitory activity was determined by percentage regression. Statistical analysis was performed to assess possible significant differences using the Tukey test (p <0.05). Results: The following peptides were found by in silico hydrolysis: IFSILMLLA, LSACVLDATI, TASVCENPTL, LPLSPLLFQQ, SPALSLVQSL, LSPYSQQQQF, PFSQLATAY, LPFYQQFSAN and PAAFYQQHII that showed inhibition activity. The results showed that the GH (grade of hydrolysis) was higher in blue corn (13.96 ± 0.02) than in red corn (10.38 ± 0.79) without nixtamalization, while, with the nixtamalization process, this parameter was also higher in blue corn (10.52 ± 0.57) than in red corn (8.96 ± 0.01). Study limitations / implications: The enzyme used for hydrolysis generates oligopeptides that may not be as closely related to the angiotensin-converting enzyme. Findings / Conclusions: In vitro antihypertensive activity of unhydrolyzed blue corn zein showed a lower percentage of ACE inhibition compared to unhydrolyzed red corn. Trypsin hydrolysis only increases ACE inhibitory activity in blue corn at a concentration of 0.3 mg / mL without nixtamalizing.Objetivo: Evaluar la actividad antihipertensiva de péptidos extraídos de zeína de maíz criollo azul y rojo nixtamalizado y sin nixtamalizar del Estado de México. Diseño/metodología/aproximación: Se emplearon herramientas bioinformáticas, tales como la base de datos NCBI para la búsqueda de secuencias primarias de la proteína zeína del maíz. La metodología incluyó una predicción de los péptidos con actividad antihipertensiva a través de diversos servidores bioinformáticos. La actividad inhibitoria se determinó mediante la regresión del porcentaje. Se realizó un análisis estadístico para evaluar las posibles diferencias significativas utilizando la prueba de Tukey (p<0.05). Resultados: Por medio de la hidrólisis in sílico se encontraron los siguientes péptidos: IFSILMLLA, LSACVLDATI, TASVCENPTL, LPLSPLLFQQ, SPALSLVQSL, LSPYSQQQQF, PFSQLATAY,            LPFYQQFSAN y PAAFYQQHII que mostraron actividad de inhibición de la ECA. Los resultados mostraron que el GH de la zeína fue mayor en maíz azul (13.96±0.02) que en maíz rojo (10.38±0.79) sin nixtamalizar, mientras que, con el proceso de nixtamalización, este parámetro también fue mayor en el maíz azul (10.52±0.57) que en el maíz rojo (8.96±0.01). Limitaciones del estudio/implicaciones: La enzima utilizada para la hidrólisis enzimática genera oligopéptidos que tal vez no puedan ser tan afines a la enzima convertidora de angiotensina. Hallazgos/conclusiones: La actividad antihipertensiva in vitro del maíz azul sin hidrolizar mostraron un menor porcentaje de inhibición de la ECA con respecto al maíz rojo sin hidrolizar. La hidrólisis con tripsina solo incrementa la actividad inhibitoria de la ECA en maíz azul a concentración de 0.3 mg/mL sin nixtamalizar

    Métodos y técnicas de monitoreo y predicción temprana en los escenarios de riesgos socionaturales

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    Esta obra concentra los métodos y las técnicas fundamentales para el seguimiento y monitoreo de las dinámicas de los escenarios de riesgos socionaturales (geológicos e hidrometeorológicos) y tiene como objetivo general orientar, apoyar y acompañar a los directivos y operativos de protección civil en aterrizar las acciones y políticas públicas enfocadas a la gestión del riesgo local de desastre

    ANÁLISIS MOLECULAR DE LA CONSTANTE DIELÉCTRICA EN FUNCIÓN DE LA TENSIÓN SUPERFICIAL DE UN FLUIDO POLAR

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    Tesis de LicenciaturaSe analiza la relación entre la tensión superficial y la constante dieléctrica del agua y de dos alcoholes: metanol y etanol. Se propone un ecuación empírica que relaciona ambas propiedades termodinámicas. Logramos reproducir datos experimentales de la constante dieléctrica del agua y los alcoholes a partir de los datos experimentales y de simulación molecular de la tensión superficial de cada fluido. Sin embargo, la ecuación que propusimos no es general, necesita ajustar constantes para cada fluido. La explicación de porque funciona la ecuación empírica es porque la sustancia no cambia su naturaleza al encontrarse en equilibrio térmico en una fase o en dos fases. Lo que cambia es su estado termodinámico

    Geoquímica de As, Hg, Pb y Zn y mineralogía en sedimentos superficiales de la cuenca de drenaje del distrito minero El Triunfo, B.C.S., México

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    El distrito minero de El Triunfo se localiza a 45 km al sureste de la ciudad de La Paz y pertenece al municipio de La Paz B.C.S., el cual desde mediados del siglo XVIII ha sido uno de los centros de mayor explotación minera en la región siendo los principales yacimientos de tipo relleno de fisuras, depósitos de contacto, así como “stockwork” y principalmente diseminados, asociados a intrusivos de cuarzo-diorita-tonalita, los que contienen mineralización de oro, plata, plomo, zinc, cobre y arsénico. El objetivo de este estudio es conocer la composición mineralógica y geoquímica de sedimentos superficiales del Distrito Minero El Triunfo (DM- ET) y su influencia en los sedimentos superficiales en el arroyo El Hondo-Las Gallinas-El Carrizal, hasta su desembocadura en el Océano Pacífico y así determinar la presencia de elementos traza de importancia ambiental en esta zona. Para esto se colectaron sedimentos superficiales en las inmediaciones del Distrito Minero, en las cenizas de fundición, en los jales y en los sedimentos del arroyo. La caracterización textural indico distribuciones unimodales con predominio de arenas medias a gruesas, con un decremento en el tamaño de grano desde el DM- ET hasta la desembocadura del arroyo. La mineralogía dominante es cuarzo, feldespatos, sulfuros (arsenopirita, pirita) y piroxenos. principalmente, El análisis semicuantitativo EDS de microscopia electrónica detecto elementos como As, Al, Ca, Mg, Li, K, Fe, Mn, Cr, Co, Cu, Ni, Pb y Zn, de los cuales se puede inferir la presencia de minerales como el cuarzo y minerales metálicos como la galena, pirita y arsenopirita, ya que se detectaron elementos tales como. La composición geoquímica de los sedimentos se midió por: activación neutrónica, Plasma óptico inductivamente acoplado, Espectrofotómetro de plasma masas (INAA, ICP-EOS e ICP-MS) y FIMS (Flow Injection Mercury System). Los resultados fueron validados con estándares de referencia certificados PACS-2 y MESS-3. Los sedimentos superficiales cercanos al DM-ET están enriquecidos en As, Pb y Zn derivado de dos fuentes principales: la actividad antropogénica cerca del distrito minero y decrecen en sus concentraciones a niveles naturales hacia la desembocadura del arroyo. Mientras que el Hg se encuentra únicamente enriquecido por actividad antropogénica
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