Species Distribution and Susceptibility to Azoles of Vaginal Yeasts Isolated Prostitutes

Objective. We investigated the use of miconazole among female prostitutes in Costa Rica as well as the distribution of vaginal yeasts and the susceptibility pattern to azoles of strains obtained from this population. Our intention was to relate a frequent use of miconazole to occurrence of vaginal yeasts resistant to azoles. Methods. Vaginal samples were taken from 277 patients that have previously used azoles. Vaginal swabs were obtained for direct microscopy and culture. Yeast isolates were identified by germ tube test and assimilation pattern. Susceptibility testing was determined using a tablet diffusion method. Results. The number of clinical Candida isolates (one from each patient) was 57 (20.6%). C. albicans was the predominant species (70%), followed by C. parapsilosis (12%), C. tropicalis (5.3%), C. glabrata and C. famata (3.5% each), C. krusei, C. inconspicua and C. guilliermondii (1.7% each). The majority of vaginal Candida isolates were susceptible to ketoconazole (91%), fluconazole (96.5%), and itraconazole (98%). A lower susceptibility of some isolates to miconazole (63%) was observed as compared to the other azoles tested. Moreover, the strains, nonsusceptible to miconazole, were more often obtained from patients that have used this antifungal at least four times within the last year before taking the samples as compared to those with three or less treatments (P<.01). Conclusion. An indiscriminate use of miconazole, such as that observed among female prostitutes in Costa Rica, results in a reduced susceptibility of vaginal yeasts to miconazole but not to other azoles

Tipificación molecular y susceptibilidad in vitro frente a fluconazol de aislamientos clínicos costarricenses del complejo Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii

Introducción: La criptococosis es una infección micótica oportunista causada por el complejo Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii. El objetivo del trabajo fue determinar los patrones moleculares del complejo C. neoformans/C. gattii de aislamientos clínicos y su susceptibilidad in vitro al fluconazol (FL). Métodos: Se analizaron los expedientes clínicos de 74 pacientes diagnosticados con criptococosis, entre el 2011 y el 2014. Los aislamientos obtenidos fueron caracterizados: (i) fenotípicamente mediante el sistema automatizado Vitek® (BioMérieux, Francia), la prueba de la ureasa, la prueba de la fenil oxidasa y la inoculación en medio canavanina-glicina y azul de bromotimol (ii) genéticamente mediante la restricción enzimática del gen URA5 con las enzimas Sau96I y HhaI y (iii) de acuerdo a su patrón de susceptibilidad in vitro al FL mediante la técnica de microdilución en medio líquido. Resultados: Se encontró que la mayoría de los pacientes eran de sexo masculino (86.5 %), con una edad promedio de 43.5 años, VIH positivos (75.7 %) y que ingresaron al centro médico con un cuadro de meningitis criptococóccica. Con respecto a la caracterización fenotípica y genotípica se encontró que el 93.2 % de los aislamientos pertenecían al genotipo VNI, el 5.4 % al VNII y el 1.4 % a la especie Cryptococcus laurentii. Además, todas las levaduras analizadas fueron sensibles al FL. Conclusiones: Se demostró por primera vez en Costa Rica el predominio de C. neoformans var. grubii VNI, en aislamientos clínicos, y que la resistencia no constituye un problema entre los aislamientos estudiados

Caracterización fenotípica y genotípica de aislamientos clínicos de los complejos de especies Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii en Costa Rica

Introduction: Cryptococcosis is a life-threatening mycosis. It is caused by the Cryptococcus neoformans species complex (C. neoformans and C. deneoformans) and the Cryptococcus gattii species complex (C. gattii, C. bacillisporus, C. deuterogattii, C. tetragattii y C. decagattii). Methods: In the present investigation, 36 clinical isolates were studied. The isolates were identified by standard methods, such as india ink preparation, growth at 37 °C, urease test, growth on L-dopa and canavanine-glycine-bromothymol blue agar (CGB). The molecular types were assigned by RFLP-URA5 analysis. Results: All isolates produced a capsule, grew at 37 °C, synthesized ureases and melanin. The isolates were identified as C. neoformans n = 33 (91.67 %) (molecular type VNI (n = 22; 61.11 %) and VNII (n = 11; 30.56 %)), C. gattii (VGI) n = 2 (5.56 %) and VGIV (C. tetragattii/ or C. decagattii) n = 1 (2.78 %). Conclusion: We demonstrate for the first time the presence VGI and VGIV in Costa Rica and, hence, the circulation of three species belonging to the complexes. Therefore, we recommend the usage of CGB in the clinical laboratories, since the correct species identification has a direct impact on the effectiveness of the treatment.Introducción: La criptococosis es una infección micótica oportunista causada por levaduras del género Cryptococcus spp. Mediante técnicas moleculares se ha logrado establecer que el complejo de especies C. neoformans está conformado por dos especies: C. neoformans y C. deneoformans y el complejo de especies C. gattii por cinco: C. gattii, C. bacillisporus, C. deuterogattii, C. tetragattii y C. decagattii. Además, existen híbridos entre las especies. Métodos: Se analizaron un total de 36 aislamientos clínicos costarricenses. Los hongos fueron caracterizados fenotípicamente mediante la presencia de cápsula, crecimiento a 37 °C, ureasas y lacasas y crecimiento en agar canavanina, glicina, azul de bromotimol (CGB) y genéticamente mediante la técnica del polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP, por sus siglas en inglés) del gen URA5. Resultados: Todas las levaduras analizadas presentaron cápsula, crecieron a 37 °C, sintetizaron ureasas y lacasas; el 8.34 % (n = 3) crecieron en agar CGB. Al analizar los patrones de restricción se encontró que la especie más frecuente fue C. neoformans n = 33 (91.67 %) (patrón molecular VNI (n = 22; 61.11 %) y VNII (n = 11; 30.56 %)), seguido de C. gattii (VGI) n = 2 (5.56 %) y VGIV (C. tetragattii o C. decagattii) n = 1 (2.78 %). Conclusiones: se demuestra por primera vez la presencia de los patrones moleculares VGI y VGIV en Costa Rica. Por lo tanto, se recomienda la implementación del medio CGB en los distintos laboratorios clínicos ya que la especie incide en la efectividad del tratamiento

Functional rarity and evenness are key facets of biodiversity to boost multifunctionality

The functional traits of organisms within multispecies assemblages regulate biodiversity effects on ecosystem functioning. Yet how traits should assemble to boost multiple ecosystem functions simultaneously (multifunctionality) remains poorly explored. In a multibiome litter experiment covering most of the global variation in leaf trait spectra, we showed that three dimensions of functional diversity (dispersion, rarity, and evenness) explained up to 66% of variations in multifunctionality, although the dominant species and their traits remained an important predictor. While high dispersion impeded multifunctionality, increasing the evenness among functionally dissimilar species was a key dimension to promote higher multifunctionality and to reduce the abundance of plant pathogens. Because too-dissimilar species could have negative effects on ecosystems, our results highlight the need for not only diverse but also functionally even assemblages to promote multifunctionality. The effect of functionally rare species strongly shifted from positive to negative depending on their trait differences with the dominant species. Simultaneously managing the dispersion, evenness, and rarity in multispecies assemblages could be used to design assemblages aimed at maximizing multifunctionality independently of the biome, the identity of dominant species, or the range of trait values considered. Functional evenness and rarity offer promise to improve the management of terrestrial ecosystems and to limit plant disease risks.This work was funded by the British Ecological Society (SR17\1297 grant, PI: P.G.-P.) and by the European Research Council (ERC Grant Agreement #647038, BIODESERT, PI: F.T.M.). Y.L.B.-P. was supported by a Marie Sklodowska-Curie Actions Individual Fellowship within the European Program Horizon 2020 (DRYFUN Project #656035). H.S. was supported by a Juan de la Cierva-Formación grant from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (FJCI-2015-26782). F.T.M. and S.A. were supported from the Generalitat Valenciana (CIDEGENT/2018/041). M.D. was supported by a Formación del Profesorado Universitario (FPU) fellowship from the Spanish Ministry of Education, Culture and Sports (FPU-15/00392). S.A. was supported by the Spanish MINECO for financial support via the DIGGING_DEEPER project through the 2015 to 2016 BiodivERsA3/FACCE‐JPI joint call for research proposals. B.K.S. research on biodiversity-ecosystem functions was supported by the Australian Research Council (DP170104634 and DP190103714). P.G.-P. was supported by a Ramón y Cajal grant from the Spanish Ministry of Science and Innovation (RYC2018-024766-I). R.M. was supported by MINECO (Grants CGL2014-56567-R and CGL2017-83855-R)

Agentes etiológicos de onicomicosis diagnosticadas en el laboratorio de micología médica de la Universidad de Costa Rica Etiological agents of onychomycosis diagnosed in the medical mycology laboratory of the University of Costa Rica

Justificación y objetivos: Entre las onicodistrofias, la onicomicosis es la afección más frecuente. Esta infección no solo representa un problema estético para el paciente, sino que puede afectar sus actividades diarias. Para el dermatólogo se hace indispensable realizar el diagnóstico diferencial, por lo que el laboratorio de micología médica es de gran ayuda para este propósito. En cuanto a los agentes etiológicos incriminados, los dermatofitos son los más frecuentes; sin embargo, otros hongos filamentosos no dermatofitos se han aislado, cuya sensibilidad a los antimicóticos es menor. En este trabajo se estudió la frecuencia de las onicomicosis diagnosticadas en el laboratorio de Micología Médica de la UCR durante cuatro años, según edad y sexo de los pacientes, así como agentes etiológicos identificados. Métodos: Se incluyó a todos los pacientes que solicitaron el servicio de acción social que brinda la sección de Micología Médica, Facultad de Microbiología, Universidad de Costa Rica, entre enero del 2007 a diciembre del 2010 y que presentaban alteraciones ungueales sospechosas de onicomicosis. Se registró la edad y sexo de los pacientes y las muestras se procesaron por examen directo y cultivo. Resultados: Se procesaron 431 muestras de uñas, el 85,4% eran de pie y el 14,6% de mano, la edad promedio de los pacientes fue de 49 años, el 64% eran mujeres y el 36% eran hombres. En el 73,4% se diagnosticó onicomicosis, ya sea por examen directo positivo y cultivo positivo, o solo con el examen directo, de las cuales 89,4% eran uñas de pie y 10,6% uñas de manos. De las uñas de los pies se aisló más frecuentemente Trichophyton rubrum y en segundo lugar Fusarium spp. En uñas de manos C. albicans fue el agente etiológico más frecuente. Conclusión: En el diagnóstico de las onicomicosis se debe considerar tanto la clínica como los hallazgos de laboratorio. En la población estudiada se identificaron dermatofitos, levaduras y hongos filamentosos no dermatofitos, lo que es importante tener en cuenta por las implicaciones en la elección del tratamiento.Background and aim: Among the onychodistrophies, onychomycosis are the most frequently encountered. This infection not only constitutes an esthetic problem for the patients, but can also affect their daily activities. For dermatologists, it is crucial to make a differential diagnosis; thus, the medical mycology laboratory plays an important role to achieve this purpose. The fungal agents most frequently encountered are the dermatophytes, however, other filamentous non-dermatophyte fungi have been isolated and are known to be less susceptible to antifungals. In the present work, the frequency of onychomycosis among patients attending the medical mycology laboratory, UCR, was studied during four years, according to the age and sex of the patients, as well as the isolated etiological agents identified. Methods: The study included all patients that requested the community service provided by the Department of Medical Mycology, School of Microbiology, UCR, between January 2007 and December 2010 and that showed nail alterations suspicious for onychomycosis. The age and sex of each patient were registered and samples were processed for direct microscopy and culture. Results: A total of 431 nail samples were collected, of which 85.4% were toenails and 14.6% fingernails. The mean age of the patients was 49 years, of which 64% were females and 36% males. Onychomycosis was diagnosed, either by direct microscopy and culture, or only with positive direct microscopy, in 73.4% of the sample population, of which 89.4% were toenails and 10.6% fingernails. Trichophyton rubrum was the etiological agent most frequently isolated from toenails, followed by Fusarium spp. C albicans was the most frequent fungal agent observed in fingernails. Conclusion: The diagnosis of onychomycosis relies upon both the clinical and laboratory diagnosis. Dermatophytes, yeasts and non-dermatophyte filamentous fungi were identified in the population studied. These findings should be considered due to their implications to the choice of the most appropriate treatment

Tipificación molecular y susceptibilidad in vitro frente a fluconazol de aislamientos clínicos costarricenses del complejo Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii

Introducción: La criptococosis es una infección micótica oportunista causada por el complejo Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii. El objetivo del trabajo fue determinar los patrones moleculares del complejo C. neoformans/C. gattii de aislamientos clínicos y su susceptibilidad in vitro al fluconazol (FL). Métodos: Se analizaron los expedientes clínicos de 74 pacientes diagnosticados con criptococosis, entre el 2011 y el 2014. Los aislamientos obtenidos fueron caracterizados: (i) fenotípicamente mediante el sistema automatizado Vitek® (BioMérieux, Francia), la prueba de la ureasa, la prueba de la fenil oxidasa y la inoculación en medio canavanina-glicina y azul de bromotimol (ii) genéticamente mediante la restricción enzimática del gen URA5 con las enzimas Sau96I y HhaI y (iii) de acuerdo a su patrón de susceptibilidad in vitro al FL mediante la técnica de microdilución en medio líquido. Resultados: Se encontró que la mayoría de los pacientes eran de sexo masculino (86.5 %), con una edad promedio de 43.5 años, VIH positivos (75.7 %) y que ingresaron al centro médico con un cuadro de meningitis criptococóccica. Con respecto a la caracterización fenotípica y genotípica se encontró que el 93.2 % de los aislamientos pertenecían al genotipo VNI, el 5.4 % al VNII y el 1.4 % a la especie Cryptococcus laurentii. Además, todas las levaduras analizadas fueron sensibles al FL. Conclusiones: Se demostró por primera vez en Costa Rica el predominio de C. neoformans var. grubii VNI, en aislamientos clínicos, y que la resistencia no constituye un problema entre los aislamientos estudiados

Caracterización fenotípica y genotípica de aislamientos clínicos de los complejos de especies Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii en Costa Rica

Introduction: Cryptococcosis is a life-threatening mycosis. It is caused by the Cryptococcus neoformans species complex (C. neoformans and C. deneoformans) and the Cryptococcus gattii species complex (C. gattii, C. bacillisporus, C. deuterogattii, C. tetragattii y C. decagattii). Methods: In the present investigation, 36 clinical isolates were studied. The isolates were identified by standard methods, such as india ink preparation, growth at 37 °C, urease test, growth on L-dopa and canavanine-glycine-bromothymol blue agar (CGB). The molecular types were assigned by RFLP-URA5 analysis. Results: All isolates produced a capsule, grew at 37 °C, synthesized ureases and melanin. The isolates were identified as C. neoformans n = 33 (91.67 %) (molecular type VNI (n = 22; 61.11 %) and VNII (n = 11; 30.56 %)), C. gattii (VGI) n = 2 (5.56 %) and VGIV (C. tetragattii/ or C. decagattii) n = 1 (2.78 %). Conclusion: We demonstrate for the first time the presence VGI and VGIV in Costa Rica and, hence, the circulation of three species belonging to the complexes. Therefore, we recommend the usage of CGB in the clinical laboratories, since the correct species identification has a direct impact on the effectiveness of the treatment.Introducción: La criptococosis es una infección micótica oportunista causada por levaduras del género Cryptococcus spp. Mediante técnicas moleculares se ha logrado establecer que el complejo de especies C. neoformans está conformado por dos especies: C. neoformans y C. deneoformans y el complejo de especies C. gattii por cinco: C. gattii, C. bacillisporus, C. deuterogattii, C. tetragattii y C. decagattii. Además, existen híbridos entre las especies. Métodos: Se analizaron un total de 36 aislamientos clínicos costarricenses. Los hongos fueron caracterizados fenotípicamente mediante la presencia de cápsula, crecimiento a 37 °C, ureasas y lacasas y crecimiento en agar canavanina, glicina, azul de bromotimol (CGB) y genéticamente mediante la técnica del polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP, por sus siglas en inglés) del gen URA5. Resultados: Todas las levaduras analizadas presentaron cápsula, crecieron a 37 °C, sintetizaron ureasas y lacasas; el 8.34 % (n = 3) crecieron en agar CGB. Al analizar los patrones de restricción se encontró que la especie más frecuente fue C. neoformans n = 33 (91.67 %) (patrón molecular VNI (n = 22; 61.11 %) y VNII (n = 11; 30.56 %)), seguido de C. gattii (VGI) n = 2 (5.56 %) y VGIV (C. tetragattii o C. decagattii) n = 1 (2.78 %). Conclusiones: se demuestra por primera vez la presencia de los patrones moleculares VGI y VGIV en Costa Rica. Por lo tanto, se recomienda la implementación del medio CGB en los distintos laboratorios clínicos ya que la especie incide en la efectividad del tratamiento