Rio de Janeiro water crisis: a metagenomic approach

In Rio de Janeiro’s metropolitan area comprise, over 8 million inhabitants receive drinking water from Company responsible for water and sewage, capted by the Guandu river’s water treatment station. Such water started to present unusual odour, taste and color in January 2020, as stated by the population itself. Results obtained through raw water microbiome metagenomic analysis inferred cyanobacteria presence, with Planktothricoides gender and Planktothricoides sp. SR001 being the most abundant gender and organism. Such do pose a risk to public health, as they are able to produce cyanotoxins that affect human health

Identificação de cianobactérias na Lagoa Salgada por abordagem metagenômica, Rio de Janeiro, Brasil

Lagoa Salgada is a coastal hypersaline water body located in the north of Rio de Janeiro State and recognized by the presence of stromatolites. Cyanobacteria are the main primary producers of these structures in coastal hypersaline lagoons. The aim of the study was to identify the cyanobacteria present in Lagoa Salgada through metagenomics. The genetic material obtained from a water sample collected in June 2019 was submitted to sequencing by the shotgun method. The metagenomic data were analyzed using the MetaWrap version 1.3 pipeline to identify cyanobacteria and biological processes. The genus Synechococcus showed greater abundance, corresponding to 64.3% of the identified cyanobacteria, followed by Synechocystis (23.6%), Geminocystis (2%), and Calothrix (1.8%). The most abundant species were Synechococcus sp. RS9909 (46.7%), Synechocystis sp. PCC 6714 (16.4%), Synechococcus sp. WH 8101 (9.2%), Synechocystis sp. CACIAM 05 (4.3%). Thirty-three biological processes associated with genes present in the sample were identified. The Lagoa Salgada has a wide diversity of cyanobacteria in its aquatic ecosystem that is still little explored, justifying the need for protection and preservation of this lagoon environment.A Lagoa Salgada é um corpo aquático hipersalino costeiro localizado no norte do Estado do Rio de Janeiro e reconhecido pela presença de estromatólitos. As cianobactérias são os principais produtores primários dessas estruturas em lagoas hipersalinas costeiras. O objetivo do estudo foi identificar as cianobactérias presentes na Lagoa Salgada por meio da metagenômica. O material genético obtido de uma amostra de água coletada no mês de junho de 2019 foi submetido ao sequenciamento pelo método shotgun. Os dados metagenômicos foram analisados utilizando o pipeline MetaWrap versão 1.3 para identificação das cianobactérias e dos processos biológicos. O gênero Synechococcus apresentou maior abundância correspondendo por 64,3% das cianobactérias identificadas, seguidos por Synechocystis (23,6%), Geminocystis (2%) e Calothrix (1,8%). As espécies mais abundantes foram Synechococcus sp. RS9909 (46,7%), Synechocystis sp. PCC 6714 (16,4%), Synechococcus sp. WH 8101 (9,2%), Synechocystis sp. CACIAM 05 (4,3%). Foram identificados 33 processos biológicos associados aos genes presentes na amostra. A Lagoa Salgada apresenta uma ampla diversidade de cianobactérias em seu ecossistema aquático ainda pouco explorado, fundamentando a necessidade de proteção e preservação deste ambiente lagunar.&nbsp

CONFORMAÇÃO CORPORAL DE EQUINOS DE DIFERENTES GRUPOS GENÉTICOS

Qualquer atividade equestre exig e equino com aptidão adequada, podendo ser identificada através da conformação corporal (IC), calculada pela combinação de medidas biométricas. Objetivou-se avaliar IC de 86 equinos, pertencentes aos grupos genéticos (GG): Crioulo (CR), Brasileiro de Hipismo (BH), Árabe (ARB), Quarto de Milha (QM), Puro Sangue Inglês (PSI) e mestiços com pequena estatura corporal, rotulado Petiço (PE). Avaliaram-se relação cernelha garupa, peso corporal estimado, torácico, corporal, corporal relativo, conformação, compacidade e carga 1 e 2, carga na canela e dáctilo-torácico. Analisaram-se efeito de sexo (S), GG e interação S*GG; correlações entre IC; componentes principais, elaborando-se diagrama de dispersão com biplot, para se verificar a distribuição dos GG em relação aos IC; e cluster para verificar distância entre GG. Os efeitos foram responsáveis por variações (P<0,05) nos IC. Considerou-se o PE elipométrico e os demais, eumétricos. Considerou-se o PSI mediolíneo e os demais, brevilíneos. Equinos PSI, QM e PE apresentaram-se aptos para executar atividades com sela até tração leve e o restante, até tração pesada. Equinos BH e ARB apresentaram maior capacidade de suportar peso sem esforço exagerado sobre o dorso, trabalhando a passo e ao galope. Observaram-se maior similaridade entre QM e CR e menor entre PE com os GG. Palavras-chave: aptidões; diversidade; equinos; conformação

Influence of object position on the frequency of manual reaching in typically developing infants

The aim of this study was to evaluate the frequency of reaching in the period of three to five months of age and if the object presentation position has an influence on it. Thirteen typically developing infants were assessed at three, four, and five months of age. The frequency of reaching was evaluated with the infants in the supine position, with the object presented at midline, right, and left axillary lines. The procedure was shot and further analyzed to determine all reaching numbers at the presentation positions. For analysis, the Friedman and Wilcoxon's tests were used, considering a 5% significance level. The mean reaching frequencies increased at the fifth month, with a statistically significant difference being found between the third and fifth (p=0.011) and between the fourth and fifth months (p=0.008). The amount of reaching at midline also significantly increased between the third and the fifth (p=0.011), the fourth and the fifth months (p=0,025), and a trend towards differentiation was identified between the third and fourth months (p=0,058). At three months, reaching frequency showed a trend towards differentiation (p=0.066) between the axillary line (right or left) and at midline. No significant differences between the positions were identified at the fourth and fifth months. In conclusion, the frequency of reaching increases significantly from three to five months, and the object presentation position seems to influence the initial stage of acquisition of this skill.O objetivo deste estudo foi verificar a frequência de alcances no período de três a cinco meses de idade e se há influência da posição de apresentação do objeto. Treze lactentes com desenvolvimento típico foram avaliados aos três, quatro e cinco meses, em supino, sendo o objeto apresentado na linha média e nas linhas axilares direita e esquerda. O procedimento foi filmado e analisado para registro do número de alcances realizados nas posições de apresentação. Para análise foram utilizados os testes de Friedman e Wilcoxon, considerando o nível de significância α=0,05. As frequências médias de alcances aumentaram até o quinto mês, sendo encontrada diferença significativa entre o terceiro e o quinto (p=0,011) e entre o quarto e o quinto meses (p=0,008). O número de alcances na linha média aumentou significativamente do terceiro para o quinto (p=0,011) e do quarto para o quinto mês (p=0,025), e houve tendência de diferenciação (0,1>p>0,05) entre o terceiro e o quarto mês (p=0,058). Aos três meses, encontrou-se tendência de diferenciação (p=0,066) entre a frequência de alcances nas linhas axilar (D ou E) e média. Aos quatro e cinco meses, não foi encontrada diferença estatisticamente significativa entre as posições. Concluiu-se que a frequência de alcances aumenta significativamente de três a cinco meses e a posição de apresentação do objeto parece influenciá-la na fase inicial de aquisição desta habilidade

Influência da posição do objeto na frequência de alcances manuais em lactentes com desenvolvimento típico

The aim of this study was to evaluate the frequency of reaching in the period of three to five months of age and if the object presentation position has an influence on it. Thirteen typically developing infants were assessed at three, four, and five months of age. The frequency of reaching was evaluated with the infants in the supine position, with the object presented at midline, right, and left axillary lines. The procedure was shot and further analyzed to determine all reaching numbers at the presentation positions. For analysis, the Friedman and Wilcoxon's tests were used, considering a 5% significance level. The mean reaching frequencies increased at the fifth month, with a statistically significant difference being found between the third and fifth (p=0.011) and between the fourth and fifth months (p=0.008). The amount of reaching at midline also significantly increased between the third and the fifth (p=0.011), the fourth and the fifth months (p=0,025), and a trend towards differentiation was identified between the third and fourth months (p=0,058). At three months, reaching frequency showed a trend towards differentiation (p=0.066) between the axillary line (right or left) and at midline. No significant differences between the positions were identified at the fourth and fifth months. In conclusion, the frequency of reaching increases significantly from three to five months, and the object presentation position seems to influence the initial stage of acquisition of this skill.O objetivo deste estudo foi verificar a frequência de alcances no período de três a cinco meses de idade e se há influência da posição de apresentação do objeto. Treze lactentes com desenvolvimento típico foram avaliados aos três, quatro e cinco meses, em supino, sendo o objeto apresentado na linha média e nas linhas axilares direita e esquerda. O procedimento foi filmado e analisado para registro do número de alcances realizados nas posições de apresentação. Para análise foram utilizados os testes de Friedman e Wilcoxon, considerando o nível de significância &#945;=0,05. As frequências médias de alcances aumentaram até o quinto mês, sendo encontrada diferença significativa entre o terceiro e o quinto (p=0,011) e entre o quarto e o quinto meses (p=0,008). O número de alcances na linha média aumentou significativamente do terceiro para o quinto (p=0,011) e do quarto para o quinto mês (p=0,025), e houve tendência de diferenciação (0,1>;p>;0,05) entre o terceiro e o quarto mês (p=0,058). Aos três meses, encontrou-se tendência de diferenciação (p=0,066) entre a frequência de alcances nas linhas axilar (D ou E) e média. Aos quatro e cinco meses, não foi encontrada diferença estatisticamente significativa entre as posições. Concluiu-se que a frequência de alcances aumenta significativamente de três a cinco meses e a posição de apresentação do objeto parece influenciá-la na fase inicial de aquisição desta habilidade

Eventos atrelados a Geosmina e 2-metilisoborneol (2-MIB) em Manancial de Abastecimento do Estado do Rio de Janeiro, Brasil: estudo de caso

Tastes and odors in tap water are problems faced by water companies all over the world, with complaints from consumers especially during the summer when cyanobacterial blooms occur that produce compounds such as geosmin and 2-methylisoborneol (2-MIB).&nbsp; We analyzed data on the intensity of taste and odor, and total concentration of the substances geosmin and 2-MIB, present in drinking water and raw water collected by the sanitation company that supplies the metropolitan region of the state of RJ/Brazil, during water crises in the year 2020, and in the new event of 2021, despite the previous warnings made by experts. Statistical and correlation analysis of the public data, and metagenomic analysis of the raw water captured from the Guandu basin in the year 2020 were performed. Organoleptic data allowed us to signal the presence of these compounds in drinking water, the values of the intensity of taste were more times above the MPV of the Brazilian legislation, with the average of the data for 2020 being 37.5 and in the following year this average was 5 times lower, indicating that the measures to remove the compounds were more effective, but did not eliminate the problem. For the year 2020 there was a linear correlation of 0.97 between the taste organoleptic standard and the total concentration of the compounds. The metagenomic data of the raw water of the year 2020, related to the genes mtf, mic and glys indicated that the substance responsible for the taste and odor was 2-MIB, since the read rate for it was higher, both in the first visit and only in the second visit, when there was still perception of intensity of taste and odor. Modifications in the surveillance system of the quality of the water taken and consumed need to be adopted to circumvent the problems of cyanobacterial proliferation in the Guandu basin, since conditions favorable to blooms will occur as long as the sanitation problems in this watershed are not solved.Gostos e odores na água da torneira são problemas enfrentados por empresas produtoras de água em todo o mundo, com reclamações dos consumidores principalmente durante o verão, quando ocorrerem florações de cianobactérias produtoras dos compostos como geosmina e o 2-metilisoborneol (2-MIB).&nbsp; Foram analisados dados de intensidade do gosto e do odor, e concentração total das substâncias geosmina e 2-MIB, presente na água&nbsp; potável e na água bruta captada pela empresa de saneamento, que abastece a região metropolitana do estado do RJ/Brazil, &nbsp;durante&nbsp; crises hídricas do ano 2020, e no novo evento de 2021, a despeito dos alertas prévios feitos por especialistas. Foram realizadas análises estatísticas e de correlação dos dados públicos, e analise metagenômica da água bruta captada no manancial da Bacia do Guandu, no ano de 2020. Dados organolépticos permitiram sinalizar a presença desses compostos na água de consumo, os valores da intensidade do gosto estiveram maior número de vezes acima do VMP da legislação brasileira, sendo a&nbsp; média dos dados de 2020 de 37,5 e no ano seguinte esta média foi 5 vezes menor, indicando que as medidas para retirar dos compostos foram mais eficazes, mas não eliminaram o problema. Para o ano de 2020 houve correlação linear de 0,97 entre o padrão organoléptico gosto e a concentração total dos compostos. Os dados metagenômicos da água bruta do ano 2020, relacionados com os genes mtf, mic e glys indicaram que a substância responsável pelo gosto e odor foi o 2-MIB, visto o índice de reads para ele ter sido maior, tanto na primeira visita e único na segunda, quando ainda havia percepção de intensidade de gosto e odor. Modificações no sistema de vigilância da qualidade da água captada e de consumo precisam ser adotadas para contornar os problemas de proliferação de cianobactérias na bacia do Guandu, pois condições favoráveis às florações irão acontecer enquanto não forem resolvidos os problemas de saneamento dessa bacia hidrográfica

Caracterização dos Períodos de Crise e Pós-Crise Hídrica da Água Bruta da Bacia do Guandu através de Parâmetros de Qualidade

At the beginning of the year 2020, about 9 million inhabitants of the Metropolitan Region of Rio de Janeiro dependent of the Water Guandu System, experienced a crisis in the water supply, receiving water with taste and odor issues. In this way, this work carried out the analysis of the sanitary quality of raw water that is captured from this system, at two different moments, "in crisis" and "post-crisis", in relations to the presence of cyanobacteria and cyanotoxins in raw water, through studies of metagenomics and quantification of microcystin (MC) and &nbsp;saxitoxin (SXT) cyanotoxins by ELISA test, comparing extraction and processing methods. The analysis of raw water quality parameters was also carried out, through the evaluation of the levels of total coliforms and Escherichia coli and some physical-chemical parameters in order to compare with data from INEA analyzes. The raw water collected at both times had levels of Escherichia coli above the Maximum Acceptable Values (MAV) described in Resolution no. 357/2000 of CONAMA, while it presented satisfactory levels in the analyzed physical-chemical parameters as well as for cyanotoxin levels, for SXT. However, it is noteworthy that in the filter extraction methodology, the sample “after crisis” was not within the MAV for MC, so if it were done by this same method the samples of the moment ¨ in crisis¨ would have the values ​​of MC also much higher of the MAV, since in the commonly used methodology the value for MC was above the value for the moment ¨after crisis¨. Therefore, in the review of the Potability Ordinance, it is necessary to describe an extraction methodology that can express the real risk in relation to the levels of cyanotoxins present in raw water. Thus, it is important that sanitation be carried out as soon as possible in the cities upstream of the water treatment plant, so that events such as those that occurred during the “water crisis” are not experienced again. In addition, in the short term, it is necessary to perform periodic monitoring of reservoirs, integrating genomics, biogeochemistry and toxicity analyzes, in order to signal any problems in advance and guarantee the quality of supply, in addition to being able to support data on the implementation of the Contingency Plan, as a precaution so that the flowering situation does not increase.A principios del año 2020, aproximadamente 9 millones de habitantes de la Región Metropolitana de Río de Janeiro dependientes del Sistema Guandu del Agua, experimentaron una crisis en el suministro de agua, recibiendo agua con problemas de sabor y olor. De esta manera, este trabajo llevó a cabo el análisis de la calidad sanitaria del agua cruda que se captura de este sistema, en dos momentos diferentes, "en crisis" y "postcrisis", en relación con la presencia de cianobacterias y cianotoxinas en agua cruda, a través de estudios de metagenómica y cuantificación de cianotoxinas de microcistina (MC) y saxitoxina (SXT) por prueba ELISA, comparando métodos de extracción y procesamiento. El análisis de los parámetros de calidad del agua cruda también se llevó a cabo, a través de la evaluación de los niveles de coliformes totales y Escherichia coli y algunos parámetros físico-químicos para comparar con los datos de los análisis del INEA. El agua cruda recolectada en ambos momentos tenía niveles de Escherichia coli por encima de los valores máximos aceptables (MAV) descritos en la Resolución no. 357/2000 de CONAMA, si bien presentó niveles satisfactorios en los parámetros físico-químicos analizados, así como para los niveles de cianotoxina, para SXT. Sin embargo, es digno de mención que en la metodología de extracción de filtro, la muestra "después de la crisis" no estaba dentro del VAM para MC, por lo que si se hiciera por este mismo método, las muestras del momento "en crisis" tendrían los valores de MC también mucho más alto que el MAV, ya que en la metodología comúnmente utilizada el valor de MC estaba por encima del valor por el momento "después de la crisis". Por lo tanto, en la revisión de la Ordenanza de Potabilidad, es necesario describir una metodología de extracción que pueda expresar el riesgo real en relación con los niveles de cianotoxinas presentes en el agua cruda. Por lo tanto, es importante que el saneamiento se lleve a cabo lo antes posible en las ciudades aguas arriba de la planta de tratamiento de agua, para que los eventos como los que ocurrieron durante la "crisis del agua" no se vuelvan a experimentar. Además, a corto plazo, es necesario realizar un monitoreo periódico de los reservorios, integrando análisis de genómica, biogeoquímica y toxicidad, para señalar de antemano cualquier problema y garantizar la calidad del suministro, además de poder respaldar datos sobre La implementación del Plan de Contingencia, como precaución para que la situación de floración no aumente.No início do ano de 2020, cerca de 9 milhões de habitantes da Região Metropolitana do Rio de Janeiro dependente do Sistema Guandu, vivenciou uma crise no abastecimento de água, recebendo água com gosto e odor. Este trabalho realizou a análise da qualidade sanitária da água bruta, captada por esse sistema, em dois momentos distintos, “na crise” e “pós-crise”, quanto à presença de cianobactérias e cianotoxinas na água bruta, através de estudos de metagenômica e de quantificação de cianotoxinas, microcistina (MC) e saxitoxina (SXT) por ELISA, comparando métodos de extração e processamento. Foram também realizadas análises de parâmetros de qualidade da água bruta, através da determinação dos níveis de coliformes totais e de Escherichia coli e de alguns parâmetros físico-químicos, de modo a se comparar com dados de análises do INEA. A água bruta captada nos dois momentos estava com níveis de Escherichia coli, acima da faixa de valores máximo permitidos (VMP) descrito na Resolução n. 357/2000 do CONAMA, enquanto os parâmetros físico-quimicos analisados apresentaram níveis satisfatórios, assim como os níveis das cianotoxinas, para SXT. Entretanto, destaque-se que na metodologia de extração por filtro, a amostra “pós-crise¨ não estava dentro do VMP para a cianotoxina MC. Portanto, caso a análise tivesse sido feita por esta mesma metodologia, é provável que os valores de MC das amostras no momento da crise também estariam acima do VMP. Isto porque, na metodologia comumente usada, o valor para MC foi acima do VMP para o momento ¨pós-crise¨. Portanto, na revisão da Portaria de Potabilidade se faz necessário descrever uma metodologia de extração que possa expressar o real risco em relação aos níveis de cianotoxinas presentes na água bruta. Desta forma, é importante que seja implementado, o quanto antes, o saneamento nas cidades a montante da captação de água bruta desse manancial, a fim de que eventos como os acontecidos durante a “crise hídrica” não seja vivenciado novamente. Além disso, a curto prazo, é necessária a realização de monitoramento periódico dos reservatórios, integrando as análises de genômica, biogeoquímica e de toxicidade, para que estação de tratamento tome as decisões adequadas para evitar algum problema e garantir a qualidade do abastecimento. Outrossim, esse recomendado procedimento poderá fornecer dados para a realização do Plano de Contingência, para que o quadro de floração não se amplie

Manejo nutricional e comportamental de filhotes de Cachorro- do- mato Cerdocyon thous mantidos para reabilitação em cativeiro na Fazenda Palmares no município de Santa Cruz das Palmeiras, SP, Brasil: Nutritional and behavioral management of Crab- eating Fox Cerdocyon thous kept for captive rehabilitation at Fazenda Palmares in the municipality of Santa Cruz das Palmeiras, SP, Brazil

O cachorro- do- mato ou lobinho, raposa, graxaim- do- mato ou lobete é uma espécie onívora com hábitos noturnos e costumam caçar em duplas, onde dificilmente são encontrados grupos dos mesmos, apenas pequenas famílias. Sua distribuição geográfica é dispersa por todo o território da América do Sul, excluindo áreas como a Floresta Amazônica. Estão acostumados a diversos biomas, incluindo locais próximos às habitações humanas, o que muitas vezes ocasiona em caças ilegais, morte ou traumas por máquinas agrícolas e o contato iminente com o homem.&nbsp; Este estudo tem como objetivo relatar a reabilitação em cativeiro, baseado na história de dois cachorros- do- mato encontrados em um canavial na cidade de Leme, interior do estado de São Paulo, logo após terem sido atropelados por uma máquina agrícola durante o processo de extração da cana-de-açúcar. O Estudo foi realizado no Núcleo de Pesquisas do IBIMM, onde fez-se uso de técnicas de enriquecimento ambiental e metodologias já aplicadas em outros casos parecidos. Apontou-se que a reabilitação foi um sucesso, com os animais capacitados ao convívio normal dentro do cativeiro e sem apresentar sequelas. Revela-se que um enriquecimento bem planejado, elaborado e seguido com precisão, faz a diferença para a vida e bem estar dos animais silvestres que precisam superar o estresse do cativeiro

Descrição anatômica esquelética de uma onça-parda, Puma concolor (Linnaeus 1771) encontrado morto em rodovia na região de Itirapina-SP: Skeletal anatomical description of a Cougar Puma concolor (Linnaeus, 1771) found dead on a highway in the region of Itirapina-SP

A onça-parda (Puma concolor) é a segunda maior espécie de felídeo no Brasil, pode ser encontrada em algumas regiões da América do Norte e distribuída amplamente em toda a América do Sul. São animais de hábitos solitários, terrestres e predominantemente noturnos. Este estudo retrata a descrição anatômica osteológica e as estruturas ósseas de uma onça-parda (Suçuarana), com informações pouco descritas na literatura, com finalidade de colaborar com profissionais das áreas de medicina veterinária, biologia e áreas afins. A carcaça de onça parda utilizada neste estudo teve a finalidade de separação e preparação dos ossos para montagem do esqueleto completo, foi oriunda de vítima de atropelamento em rodovia. Os métodos e técnicas utilizadas para a maceração e clareamento foram eficazes, sem a danificação dos ossos, o que favoreceu melhor o resultado e diminuiu significamente danos nas peças anatômicas. Construiu-se assim, um guia capaz de orientar e informar a comunidade cientifica em relação às composições anatômica esqueléticas de uma espécie pouca relatada na literatura internacional