A Grid Infrastructure for Parallel and Interactive Applications

The int.eu.grid project aims at providing a production quality grid computing infrastructure for e-Science supporting parallel and interactive applications. The infrastructure capacity is presently about 750 cpu cores distributed over twelve sites in seven countries. These resources have to be tightly coordinated to match the requirements of parallel computing. Such an infrastructure implies high availability, performance and robustness resulting in a much larger management effort than in traditional grid environments which are usually targeted to run sequential non-interactive applications. To achieve these goals the int.eu.grid project offers advanced brokering mechanisms and user friendly graphical interfaces supporting application steering. The int.eu.grid environment is deployed on top of the gLite middleware enabling full interoperability with existing gLite based infrastructures

O Quadro Nacional de Bio-Segurança para Cabo Verde

A aplicação das biotecnologias é hoje considerada uma parte importante da solução aos problemas gerados pela insegurança alimentar e a redução da pobreza no mundo. Contudo, há necessidade da avaliação dos riscos reais associados à liberação dos Organismos Geneticamente Modificados (OGMs) desde que existe a possibilidade potencial de danos ao ambiente e à saúde humana, pela alteração da diversidade biológica. Face ao desenvolvimento acelerado da biotecnologia moderna e face ao desconhecimento das reais consequências das interacções dos OGMs com os diversos ecossistemas, a comunidade internacional adoptou o Protocolo de Cartagena sobre a Bio-segurança como um instrumento de prevenção dos riscos provenientes de produtos biotecnológicos. Este Protocolo é um instrumento jurídico internacional de cariz obrigatório adoptado pela Conferência das Partes aquando da Convenção “Quadro das Nações Unidas sobre a Diversidade Biológica (CDB)”, em 1992. A Convenção, reconhecendo o enorme potencial da biotecnologia moderna para a resolução dos problemas antes mencionados, objectiva “contribuir para assegurar um nível adequado de protecção para a transferência, manipulação e utilização segura dos organismos vivos modificados resultantes da biotecnologia moderna, e que possam ter efeitos adversos para a conservação e utilização sustentável da diversidade biológica, considerando igualmente os riscos para a saúde humana, e centrando-se especificamente nos movimentos transfronteiriços”. O governo de Cabo Verde, consciente da importância que se relaciona à protecção da biodiversidade das ilhas e da saúde pública contra os potenciais riscos dos OGMs, assinou, através do Decreto nº 11/2005 de 26 de Setembro, o Protocolo de Cartagena sobre a Bio-segurança. Com a ratificação do PCB, a 1 de Novembro de 2005, o país comprometeu-se a cumprir as exigências e obrigações do Protocolo, dentre as quais, a elaboração e materialização do O objectivo primário do Projecto para o desenvolvimento do Quadro Nacional de Bio-segurança ou, simplesmente, Projecto Nacional de Bio-segurança (PNB), é o de desenvolver um Quadro Nacional de Bio-segurança para CV, de acordo com as necessidades relevantes do protocolo de Cartagena, considerando principalmente que “cada parte deve tomar as medidas legais, administrativas e outras apropriadas para implementar suas obrigações sob o protocolo”. Para a implementação do Plano, Cabo Verde fez uma análise do cenário actual da biotecnologia e da Bio-segurança, propôs um quadro jurídico institucional Nacional e elaborou um plano de acção para implementação do Quadro Nacional de Bio-segurança (QNB). Este Quadro consiste num conjunto de instrumentos políticos, legais, administrativos e técnicos, próprios para atingir as necessidades relevantes do Protocolo de Cartagena. Especificamente, o quadro visa o estabelecimento de bases científicas e sistemas transparentes de tomada de decisão que habilitem o país a beneficiar dos potenciais benefícios da biotecnologia moderna, assegurando a máxima protecção do ambiente, saúde humana e animal dos potenciais riscos dessa biotecnologia; assegurar que a investigação, liberação e manuseio de produtos da biotecnologia moderna sejam desenvolvidos de forma a minimizar os potenciais riscos para o ambiente, saúde humana e animal e; assegurar o manuseio e o movimento transfronteiriço seguros de produtos derivados da biotecnologia moderna. Entretanto, embora o país não dispõe de nenhuma política que aborde a questão concreta da Bio-segurança, existem prioridades nacionais no contexto de objectivos maiores de desenvolvimento, como o desenvolvimento sustentável, conservação da biodiversidade, desenvolvimento agrícola, segurança alimentar, etc., sob os quais uma política de biotecnologia e Biosegurança no quadro do QNB será desenvolvida. Ela será alicerçada nas políticas existentes para os vários sectores, principalmente, nos domínios do ambiente (conservação da biodiversidade), da saúde pública, da agricultura (protecção fitossanitária e sanidade animal) e da pesca, embora a investigação neste domínio seja ainda incipiente. O desenvolvimento e a implementação do quadro nacional de Bio-segurança enfatizam e priorizam o reforço da capacitação institucional e técnico para o manuseamento dos OGMs, permitindo a adequação e reorganização das estruturas existentes. Não obstante, o país pode utilizar os produtos da biotecnologia moderna já disponíveis, em benefício da produção alimentar, da saúde humana e animal, do ambiente, do melhoramento do sector florestal, da pesca e da indústria. Para concretizar o plano, foi proposta a criação de um sistema administrativo e institucional composto por seis órgãos, nomeadamente, a Autoridade Nacional Competente, o Conselho Nacional de Bio-segurança; o Comité Regulador (CR) /Monitorização e Fiscalização; o Secretariado Técnico (ST); o Painel Técnico Científico (PTC) e; o Comité Público. Cada um desses órgãos tem funções específicas que vão desde a orientação das vertentes políticas do país até a sensibilização e educação do público no referente ao assunto. A proposta inclui uma Autoridade Nacional Competente única, sob a alçada do Ministério do Ambiente e Agricultura, como o órgão responsável pela autorização ou não da introdução/criação de OGMs, pela coordenação de todas as actividades ligadas à Bio-segurança; e pela recepção de pedidos de autorização e a gestão de notificações, sejam eles para importação, liberação, propagação ou comercialização; ou uso directo para a alimentação, derivado ou produtos do processamento de produtos alimentares, através do Secretariado Técnico. O diploma legislativo proposto estabelece as normas de segurança e mecanismos de fiscalização à importação, exportação, trânsito, produção, manipulação, manuseamento e utilização de organismos geneticamente modificados (OGM) e seus produtos, em conformidade com o princípio da precaução e tendo em vista a protecção da vida e a saúde do homem, dos animais e das plantas, bem como, o meio ambiente. As normas estabelecidas pelo diploma aplicam-se a todas as entidades públicas e privadas envolvidas na importação, exportação, trânsito, produção, manipulação, manuseamento e utilização de OGM e seus produtos, sem prejuízo do regime fixado para as operações de comércio externo de e para Cabo Verde e demais legislação aplicável. O diploma também não se aplica aos movimentos transfronteiriços de fármacos para seres humanos, que sejam OGM e seus produtos, e que estejam sujeitos a legislação específica. E finalmente, visando assegurar que o QNB para Cabo Verde seja cabalmente activo no país, foi concebido um plano de acção quinquenal para sua operacionalização. Este plano de acção consiste num conjunto de actividades que deverão ser adoptadas e realizadas nos próximos cinco anos, sendo estas: o estabelecimento de um quadro institucional e administrativo de Bio-segurança; estabelecimento de um sistema de consciencialização, educação e participação para bio-segurança; criação de capacidade local para o manuseio da biotecnologia; reforço da capacidade local institucional existente no domínio da biotecnologia/bio-segurança; estudo dos impactos da biotecnologia moderna na agricultura local (incluindo produção pecuária e aquacultura); manutenção do uso seguro de produtos farmacêuticos e alimentares como uma prioridade no domínio da saúde pública e; certificação de um conjunto de medidas e políticas efectivas que acompanhem as constantes mudanças

Abstract book : poster week 1/14

Poster Week 1/14. ESTeSC – Coimbra Health School. April 28 – May 2, 2014.info:eu-repo/semantics/draf

Simultaneous determination of natural and synthetic steroid estrogens and their conjugates in aqueous matrices by liquid chromatography / mass spectrometry

An analytical method for the simultaneous determination of nine free and conjugated steroid estrogens was developed with application to environmental aqueous matrices. Solid phase extraction (SPE) was employed for isolation and concentration, with detection by liquid chromatography/mass spectrometry (LC/MS) using electrospray ionisation (ESI) in the negative mode. Method recoveries for various aqueous matrices (wastewater, lake and drinking water) were determined, recoveries proving to be sample dependent. When spiked at 50 ng/l concentrations in sewage influent, recoveries ranged from 62-89 % with relative standard deviations (RSD) < 8.1 %. In comparison, drinking water spiked at the same concentrations had recoveries between 82-100 % with an RSD < 5%. Ion suppression is a known phenomenon when using ESI; hence its impact on method recovery was elucidated for raw sewage. Both ion suppression from matrix interferences and the extraction procedure has bearing on the overall method recovery. Analysis of municipal raw sewage identified several of the analytes of interest at ng/l concentrations, estriol (E3) being the most abundant. Only one conjugate, estrone 3-sulphate (E1-3S) was observe

Determinants of the Use of Health and Fitness Mobile Apps by Patients With Asthma: Secondary Analysis of Observational Studies

Background: Health and fitness apps have potential benefits to improve self-management and disease control among patients with asthma. However, inconsistent use rates have been reported across studies, regions, and health systems. A better understanding of the characteristics of users and nonusers is critical to design solutions that are effectively integrated in patients' daily lives, and to ensure that these equitably reach out to different groups of patients, thus improving rather than entrenching health inequities. Objective: This study aimed to evaluate the use of general health and fitness apps by patients with asthma and to identify determinants of usage. Methods: A secondary analysis of the INSPIRERS observational studies was conducted using data from face-to-face visits. Patients with a diagnosis of asthma were included between November 2017 and August 2020. Individual-level data were collected, including age, gender, marital status, educational level, health status, presence of anxiety and depression, postcode, socioeconomic level, digital literacy, use of health services, and use of health and fitness apps. Multivariate logistic regression was used to model the probability of being a health and fitness app user. Statistical analysis was performed in R. Results: A total of 526 patients attended a face-to-face visit in the 49 recruiting centers and 514 had complete data. Most participants were ≤40 years old (66.4%), had at least 10 years of education (57.4%), and were in the 3 higher quintiles of the socioeconomic deprivation index (70.1%). The majority reported an overall good health status (visual analogue scale [VAS] score>70 in 93.1%) and the prevalence of anxiety and depression was 34.3% and 11.9%, respectively. The proportion of participants who reported using health and fitness mobile apps was 41.1% (n=211). Multivariate models revealed that single individuals and those with more than 10 years of education are more likely to use health and fitness mobile apps (adjusted odds ratio [aOR] 2.22, 95%CI 1.05-4.75 and aOR 1.95, 95%CI 1.12-3.45, respectively). Higher digital literacy scores were also associated with higher odds of being a user of health and fitness apps, with participants in the second, third, and fourth quartiles reporting aORs of 6.74 (95%CI 2.90-17.40), 10.30 (95%CI 4.28-27.56), and 11.52 (95%CI 4.78-30.87), respectively. Participants with depression symptoms had lower odds of using health and fitness apps (aOR 0.32, 95%CI 0.12-0.83). Conclusions: A better understanding of the barriers and enhancers of app use among patients with lower education, lower digital literacy, or depressive symptoms is key to design tailored interventions to ensure a sustained and equitable use of these technologies. Future studies should also assess users' general health-seeking behavior and their interest and concerns specifically about digital tools. These factors may impact both initial engagement and sustained use.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Chronic hepatitis C treatment in HIV co-infection in Portugal: Results from a cohort OF 2133 patients presented by GEPCOI (Portuguese Coinfection Study Group)

Direct-acting antiviral drugs (DAAs) have recently changed the paradigm of hepatitis C therapy, significantly improving treatment response rates, patient life expectancy and quality of life. In Portugal, sofosbuvir (SOF) and SOF/ledipasvir (SOF/LDV) were fully reimbursed by the National Health System since early 2015 and generalized use of interferon-free DAA based regimens became current practice. During 2016, the remaining DAAs were sequentially added and covered by the same health access policy. The Portuguese Study Group of Hepatitis and HIV Co-infection (GEPCOI) collected data from 15 clinical centres in Portugal, pertaining to the HCV treatment experience with DAA regimens. A cohort of 2133 patients was analysed, representing one of the largest DAA treated HCV/HIV co-infected individuals. The global sustained virologic response (SVR) achieved was 95% in this real-life cohort setting. Linear regression analysis showed significant differences in treatment response rates when using SOF plus ribavirin (RBV) combination in genotype 2 or 3 infected individuals (P < .002) and in those with liver cirrhosis (P < .002). These findings corroborate that early treatment is mandatory in HIV/HCV co-infected patients, as response rates may be negatively influenced by higher fibrosis stages and suboptimal DAA regimens. The current national Portuguese health policy should continue to promote wider treatment access and individualized therapy strategies, aiming at the elimination of HCV infection in this high-risk co-infected populationinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Dysregulation of glycerophospholipid metabolism during Behçet's disease contributes to a pro-inflammatory phenotype of circulating monocytes

Behcet's disease (BD) is a relapsing, multisystem and inflammatory condition characterized by systemic vasculitis of small and large vessels. Although the etiopathogenesis of BD remains unknown, immune-mediated mechanisms play a major role in the development of the disease. BD patients present leukocyte infiltration in the mucocutaneous lesions as well as neutrophil hyperactivation. In contrast to neutrophils, whose involvement in the pathogenesis of BD has been extensively studied, the biology of monocytes during BD is less well known. In this study, we analyzed the phenotype and function of circulating monocytes of 38 BD patients from Hospital of Braga. In addition, we evaluated the impact of inflammatory and metabolomic plasma environment on monocyte biology. We observed a worsening of mitochondrial function, with lower mitochondrial mass and increased ROS production, on circulating monocytes of BD patients. Incubation of monocytes from healthy donors with the plasma of BD patients mimicked the observed phenotype, strongly suggesting the involvement of serum mediators. BD patients, regardless of their symptoms, had higher serum pro-inflammatory TNF-alpha and IP-10 levels and IL-1 beta/IL-1RA ratio. Untargeted metabolomic analysis identified a dysregulation of glycerophospholipid metabolism on BD patients, where a significant reduction of phospholipids was observed concomitantly with an increase of lysophospholipids and fatty acids. These observations converged to an enhanced phospholipase A2 (PLA(2)) activation. Indeed, inhibition of PLA(2) with dexamethasone or the downstream cyclooxygenase (COX) enzyme with ibuprofen was able to significantly revert the mitochondrial dysfunction observed on monocytes of BD patients. Our results show that the plasma inflammatory environment coupled with a dysregulation of glycerophospholipid metabolism in BD patients contribute to a dysfunction of circulating monocytes