Tuberculous meningitis: evaluation of polymerase chain reaction (PCR) as a diagnostic tool – a pilot study.

Meningite é uma forma grave e potencialmente fatal de tuberculose. O diagnóstico envolve a detecção de bacilos álcool-ácido resistentes no líquido cefalorraquidiano por microscopia ou cultura. Entretanto, a dificuldade de detectar o organismo representa um desafio ao diagnóstico. O uso da reação em cadeia da polimerase (PCR) na abordagem diagnóstica de meningite causada por Mycobacterium tuberculosis (MTB) tem sido relatado como um método rápido e preciso, com diversos kits comerciais disponíveis. Como alternativa, algumas instituições vêm desenvolvendo testes in house com baixo custo. Em nossa instituição, usamos PCR in house para tuberculose. O desempenho de nossa PCR para o diagnóstico de meningite causada por MTB foi analisado em 148 pacientes consecutivos, usando a cultura do MBT como padrão-ouro. A sensibilidade da PCR no líquido cefalorraquidiano para o diagnóstico de meningite causada por MTB foi de 50%, especificidade de 98,6% e concordância coma cultura de 96% (kappa = 0,52). O desempenho de nossa PCR é semelhante ao obtido com os kits comerciais disponíveis.Meningitis is a severe and potentially fatal form of tuberculosis. The diagnostic workup involves detection of acid-fast bacilli in the cerebrospinal fluid by microscopy or culture. However the difficulty in detecting the organism poses a challenge to diagnosis. Use of polymerase chain reaction (PCR) in the diagnostic approach to Mycobacterium tuberculosis (MTB) meningitis has been reported as a fast and accurate method, with several commercial kits available. As an alternative, some institutions have been developing inexpensive in-house assays. In our institution, we use an in-house PCR for tuberculosis. The performance of our PCR for the diagnosis of MTB meningitis was analyzed in 148 consecutive patients, using MTB culture as the gold standard. Sensitivity of cerebrospinal fluid PCR for the diagnosis of MTB meningitis was 50%, specificity was 98.6%, and concordance with culture was 96% (kappa = 0.52). The performance of our PCR is similar to that obtained with the available commercial kits

Diagnóstico de toxoplasmose disseminada através de técnica de reação em cadeia da polimerase realizada no lavado bronco-alveolar de paciente com SIDA

Pulmonary toxoplasmosis is a challenging diagnosis in immunosuppressed patients with nonspecific clinical picture and radiologic findings. We present a case of pneumonia due to Toxoplasma gondii diagnosed by polymerase chain reaction (PCR) in the bronchoalveolar lavage (BAL) fluid of a patient with acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). Coinfection with Pneumocystis jirovecii was found in the same specimen. Direct examination and culture for bacteria, mycobacteria and other fungus were negative. Despite the intensive management, respiratory compromise evolved rapidly, with the need for ventilatory support. Acute respiratory distress syndrome developed, and the patient died of multiple organ failure. This case illustrates that a high index of suspicion is necessary for diagnosis of pulmonary toxoplasmosis, a potentially fatal condition. Due to high diagnostic performance, PCR in BAL fluid should be included in the evaluation of immunosuppressed patients with nonspecific pulmonary diseases.O diagnóstico de toxoplasmose pulmonar em pacientes imunossuprimidos é difícil, devido ao quadro clínico e aos achados radiológicos inespecíficos. Neste artigo, relatamos o caso de uma paciente com síndrome da imunodeficiência adquirida (SIDA), que apresentou pneumonia por Toxoplasma gondii diagnosticada através de reação em cadeia da polimerase (PCR) no lavado bronco-alveolar (LBA). A paciente apresentava co-infecção com Pneumocystis jirovecii. Os demais exames microbiológicos, como bacterioscópico, cultural para bactérias, micobactérias e fungos, foram negativos. Apesar do manejo intensivo, a paciente evoluiu com síndrome do desconforto respiratório agudo e óbito por falência múltipla dos órgãos. Este caso demonstra que um alto índice de suspeita clínica é necessário para o diagnóstico de pneumonia por Toxoplasma gondii. Devido ao seu desempenho diagnóstico, o PCR para Toxoplasma gondii no LBA deve ser incluído na avaliação de pacientes imunossuprimidos com quadros pulmonares inespecíficos

Meningite tuberculosa : avaliação da reação em cadeia da polimerase como ferramenta diagnóstica : um estudo piloto

Meningitis is a severe and potentially fatal form of tuberculosis. The diagnostic workup involves detection of acidfast bacilli in the cerebrospinal fluid by microscopy or culture. However the difficulty in detecting the organism poses a challenge to diagnosis. Use of polymerase chain reaction (PCR) in the diagnostic approach to Mycobacterium tuberculosis (MTB) meningitis has been reported as a fast and accurate method, with several commercial kits available. As an alternative, some institutions have been developing inexpensive in-house assays. In our institution, we use an inhouse PCR for tuberculosis. The performance of our PCR for the diagnosis of MTB meningitis was analyzed in 148 consecutive patients, using MTB culture as the gold standard. Sensitivity of cerebrospinal fluid PCR for the diagnosis of MTB meningitis was 50%, specificity was 98.6%, and concordance with culture was 96% (kappa = 0.52). The performance of our PCR is similar to that obtained with the available commercial kits.Meningite é uma forma grave e potencialmente fatal de tuberculose. O diagnóstico envolve a detecção de bacilos álcool-ácido resistentes no líquido cefalorraquidiano por microscopia ou cultura. Entretanto, a dificuldade de detectar o organismo representa um desafio ao diagnóstico. O uso da reação em cadeia da polimerase (PCR) na abordagem diagnóstica de meningite causada por Mycobacterium tuberculosis (MTB) tem sido relatado como um método rápido e preciso, com diversos kits comerciais disponíveis. Como alternativa, algumas instituições vêm desenvolvendo testes in house com baixo custo. Em nossa instituição, usamos PCR in house para tuberculose. O desempenho de nossa PCR para o diagnóstico de meningite causada por MTB foi analisado em 148 pacientes consecutivos, usando a cultura do MBT como padrão-ouro. A sensibilidade da PCR no líquido cefalorraquidiano para o diagnóstico de meningite causada por MTB foi de 50%, especificidade de 98,6% e concordância coma cultura de 96% (kappa = 0,52). O desempenho de nossa PCR é semelhante ao obtido com os kits comerciais disponíveis

Comparação de métodos de avaliação da função ventricular no seguimento de pacientes submetidos à quimioterapia com adriamicina

13

Avaliação da custo-efetividade do tratamento do adenocarcinoma de pulmão avançado direcionado pela avaliação molecular do EGFR

INTRODUÇÃO: O câncer de pulmão é um importante problema de saúde pública, frequentemente diagnosticado em fases avançadas e associado a alto consumo de recursos de saúde. Em pacientes com adenocarcinoma, a presença de mutações ativadoras no receptor do fator de crescimento epidérmico (EGFR) confere importante benefício clínico ao uso de inibidores de tirosina cinase (ITKs) com ação em EGFR em comparação com a quimioterapia, ao passo que na ausência de tais mutações o tratamento com quimioterapia mostra-se superior. O Sistema Único de Saúde (SUS) não disponibiliza a avaliação molecular do EGFR ou ITKs para o tratamento de pacientes com câncer de pulmão. OBJETIVOS: Avaliar a custo efetividade da estratégia de tratamento do adenocarcinoma de pulmão avançado baseada na avaliação molecular do EGFR em relação à estratégia convencional no âmbito do SUS. MÉTODOS: Foi desenvolvido modelo de Markov representando uma coorte hipotética de pacientes com adenocarcinoma de pulmão avançado, comparando a custo-efetividade da estratégia convencional, na qual os pacientes recebem quimioterapia, com estratégia de decisão terapêutica baseada na avaliação molecular do EGFR. Nessa estratégia, pacientes com mutações ativadoras são tratados com gefitinib, um ITK, e aqueles sem mutações, com quimioterapia. Dados de sobrevida e consumo de recursos de saúde foram obtidos a partir de coorte de pacientes com câncer de pulmão avançado tratados no Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Foram utilizados dados do Instituto Nacional do Câncer (INCA) para estimar a prevalência de mutações ativadoras em EGFR e a melhor evidência disponível na literatura para efetividade do gefitinib e utilidades de pacientes em tratamento para câncer de pulmão. Os custos diretos relacionados ao manejo do câncer de pulmão foram obtidos através de tabelas de reembolso do Ministério da Saúde, enquanto da avaliação molecular e do gefitinib, obtidos através de pesquisa de preço em serviços privados. Tempo de sobrevida e anos de vida ajustados para qualidade (QALYs) foram utilizados para expressar efetividade. Custos foram expressos em reais (R$). Foram realizadas análises de sensibilidade para as principais variáveis e análise de sensibilidade probabilística para lidar com a incerteza de parâmetros. Utilizou-se taxa de desconto de 5$ 163.840/QALY. Os parâmetros mais sensíveis no modelo foram o custo e a efetividade do gefitinib e a prevalência de mutações no EGFR. Análise de sensibilidade revelou que a estratégia molecular torna-se custo-efetiva com custo mensal do gefitinib abaixo de um terço do atual. CONCLUSÃO: Nos preços atualmente praticados, a estratégia baseada na avaliação molecular do EGFR não se mostrou custo-efetiva no tratamento do adenocarcinoma de pulmão avançado.INTRODUCTION: Lung cancer is a major health problem worldwide frequently diagnosed in advanced stages and associated with an elevated consumption of resources. Patients with adenocarcinoma harboring epidermal growth factor receptor (EGFR) activating mutations derive important clinical benefit from treatment with EGFR tyrosine kinase inhibitors (TKIs), contrary to patients with wild type EGFR, in which chemotherapy is superior. EGFR molecular testing and TKIs are not available in Brazilian Public Health Service (BPHS). OBJETIVE: To evaluate the cost-effectiveness of EGFR testing strategy to select treatment in adenocarcinoma patients compared to conventional strategy in BPHS. METHODS: A Markov model was constructed to represent a hypothetical cohort of advanced lung adenocarcinoma patients. Patients in conventional strategy receive chemotherapy and those in EGFR testing strategy are treated according to EGFR mutation status with gefitinib or chemotherapy. Survival data and health resources consumption were derived from a cohort of advanced lung cancer patients treated at a tertiary care public hospital in South Brazil. Prevalence of EGFR activating mutations was estimated from data of Brazilian National Institute of Cancer. Gefitinib effectiveness and utilities of pacientes with lung cancer were obtained from available studies. Direct costs related to lung cancer management were obtained from reimbursement codes of BPHS. EGFR testing and gefitinib costs were obtained from private practice services. Effectiveness was measured in overall survival and qualityadjusted life years (QALYs). Costs are expressed in Brazilian Reais (R$). One-way sensitivity analyses and probabilistic sensitivity analyses were conducted. A discount rate of 5$ 163,840/QALY. The model was most sensitive to cost and effectiveness of gefitinib, and to the prevalence of EGFR activating mutations. Threshold analysis showed that EGFR testing strategy becomes cost-effective when gefitinib cost less than a third of actual price. CONCLUSION: At current practiced prices EGFR testing strategy is not costeffective in BPHS

Avaliação da custo-efetividade do tratamento do adenocarcinoma de pulmão avançado direcionado pela avaliação molecular do EGFR

INTRODUÇÃO: O câncer de pulmão é um importante problema de saúde pública, frequentemente diagnosticado em fases avançadas e associado a alto consumo de recursos de saúde. Em pacientes com adenocarcinoma, a presença de mutações ativadoras no receptor do fator de crescimento epidérmico (EGFR) confere importante benefício clínico ao uso de inibidores de tirosina cinase (ITKs) com ação em EGFR em comparação com a quimioterapia, ao passo que na ausência de tais mutações o tratamento com quimioterapia mostra-se superior. O Sistema Único de Saúde (SUS) não disponibiliza a avaliação molecular do EGFR ou ITKs para o tratamento de pacientes com câncer de pulmão. OBJETIVOS: Avaliar a custo efetividade da estratégia de tratamento do adenocarcinoma de pulmão avançado baseada na avaliação molecular do EGFR em relação à estratégia convencional no âmbito do SUS. MÉTODOS: Foi desenvolvido modelo de Markov representando uma coorte hipotética de pacientes com adenocarcinoma de pulmão avançado, comparando a custo-efetividade da estratégia convencional, na qual os pacientes recebem quimioterapia, com estratégia de decisão terapêutica baseada na avaliação molecular do EGFR. Nessa estratégia, pacientes com mutações ativadoras são tratados com gefitinib, um ITK, e aqueles sem mutações, com quimioterapia. Dados de sobrevida e consumo de recursos de saúde foram obtidos a partir de coorte de pacientes com câncer de pulmão avançado tratados no Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Foram utilizados dados do Instituto Nacional do Câncer (INCA) para estimar a prevalência de mutações ativadoras em EGFR e a melhor evidência disponível na literatura para efetividade do gefitinib e utilidades de pacientes em tratamento para câncer de pulmão. Os custos diretos relacionados ao manejo do câncer de pulmão foram obtidos através de tabelas de reembolso do Ministério da Saúde, enquanto da avaliação molecular e do gefitinib, obtidos através de pesquisa de preço em serviços privados. Tempo de sobrevida e anos de vida ajustados para qualidade (QALYs) foram utilizados para expressar efetividade. Custos foram expressos em reais (R$). Foram realizadas análises de sensibilidade para as principais variáveis e análise de sensibilidade probabilística para lidar com a incerteza de parâmetros. Utilizou-se taxa de desconto de 5$ 163.840/QALY. Os parâmetros mais sensíveis no modelo foram o custo e a efetividade do gefitinib e a prevalência de mutações no EGFR. Análise de sensibilidade revelou que a estratégia molecular torna-se custo-efetiva com custo mensal do gefitinib abaixo de um terço do atual. CONCLUSÃO: Nos preços atualmente praticados, a estratégia baseada na avaliação molecular do EGFR não se mostrou custo-efetiva no tratamento do adenocarcinoma de pulmão avançado.INTRODUCTION: Lung cancer is a major health problem worldwide frequently diagnosed in advanced stages and associated with an elevated consumption of resources. Patients with adenocarcinoma harboring epidermal growth factor receptor (EGFR) activating mutations derive important clinical benefit from treatment with EGFR tyrosine kinase inhibitors (TKIs), contrary to patients with wild type EGFR, in which chemotherapy is superior. EGFR molecular testing and TKIs are not available in Brazilian Public Health Service (BPHS). OBJETIVE: To evaluate the cost-effectiveness of EGFR testing strategy to select treatment in adenocarcinoma patients compared to conventional strategy in BPHS. METHODS: A Markov model was constructed to represent a hypothetical cohort of advanced lung adenocarcinoma patients. Patients in conventional strategy receive chemotherapy and those in EGFR testing strategy are treated according to EGFR mutation status with gefitinib or chemotherapy. Survival data and health resources consumption were derived from a cohort of advanced lung cancer patients treated at a tertiary care public hospital in South Brazil. Prevalence of EGFR activating mutations was estimated from data of Brazilian National Institute of Cancer. Gefitinib effectiveness and utilities of pacientes with lung cancer were obtained from available studies. Direct costs related to lung cancer management were obtained from reimbursement codes of BPHS. EGFR testing and gefitinib costs were obtained from private practice services. Effectiveness was measured in overall survival and qualityadjusted life years (QALYs). Costs are expressed in Brazilian Reais (R$). One-way sensitivity analyses and probabilistic sensitivity analyses were conducted. A discount rate of 5$ 163,840/QALY. The model was most sensitive to cost and effectiveness of gefitinib, and to the prevalence of EGFR activating mutations. Threshold analysis showed that EGFR testing strategy becomes cost-effective when gefitinib cost less than a third of actual price. CONCLUSION: At current practiced prices EGFR testing strategy is not costeffective in BPHS