Samambaias e licófitas de um fragmento de Mata Atlântica na Serra da Jiboia, Bahia, Brasil

A floristic survey of ferns and lycophytes from an area of Atlantic Rain Forest in the semi-arid region is presented. The Serra da Jiboia is a small set of hills which hosts several vegetation types: caatinga at the base, wet forests on the slope and campos rupestres (rocky fields) on the top; this is one of the prioritary areas for biodiversity conservation of the Brazilian Atlantic Forest. Field trips to collect material were carried out monthly, between 2009 and 2010. The specimens are deposited in HUEFS. A total of 97 species, in 51 genera and 22 families, were found; Elaphoglossum iguapense, E. itatiayense e Pecluma sicca are recorded for the first time from Northeast Brazil. Identification keys to families and species, as well as comments and geographic distribution are presented.É apresentado um levantamento das samambaias e licófitas de um encrave de Mata Atlântica na região semiárida. A Serra da Jiboia corresponde a um pequeno conjunto de morros que abriga vários tipos vegetacionais: caatinga na base, mata higrófila na encosta e campo rupestre no topo, sendo considerada uma área prioritária para conservação da biodiversidade da Mata Atlântica brasileira. Foram realizadas coletas mensais entre os anos de 2009 e 2010. O material coletado encontra-se depositado no herbário HUEFS. Foram encontradas 97 espécies, em 51 gêneros e 22 famílias; Elaphoglossum iguapense, E. itatiayense e Pecluma sicca são novos registros para o Nordeste. São apresentadas chaves de identificação para as famílias e para as espécies, bem como comentários e distribuição geográfica

Metagenomic Approaches for Investigating the Role of the Microbiome in Gut Health and Inflammatory Diseases

The human gut microbiota makes fundamental contributions to host metabolism and immune system. Therefore, perturbations in its composition, a process known as dysbiosis, have an important role in the development of several chronicle diseases, mainly intestinal inflammatory disorders. Culture-independent molecular methods are allowing scientific community to uncover substantive findings, thus giving a more detailed description of the human intestinal microbiota. This chapter presents a review on current metagenomic approaches, based on next-generation sequencing technologies, for investigating bacterial taxonomic classification and predictive function associated with the human gut in health and disease. In this context, we describe recent studies that have been trying to elucidate important alterations in microbiome composition across individuals according to delivery mode, aging, diet and medication that might be linked to susceptibility to immune-mediated diseases. A description of the main bacterial taxa and genes acting in dysbiosis during inflammation, focusing on chronic inflammatory bowel diseases and colorectal cancer, is also explored in this chapter

Ocorrência de microrganismos em ração animal preparada artesanalmente a partir do licuri (Syagrus coronata)

During the dry season in the Brazilian Caatinga region when sources of food are very scanty, many farmers use alternative forms to feed their livestock. One of these alternative forms is the feed made with the fruits of licuri palm (Syagrus coronata), produced by hand by farmers or associations without any microbial control, until the present study. The control of the microbial growth in feeds, used in the animal feeding, aims mainly to decrease risks in the health of the meat consumers, by increasing sanitation and hygienic quality of the feed. Therefore, this work aimed to carry out a microbiological analysis (presence of salmonela, counting of mesophilic microorganisms, and contamination by filamentous fungi and yeasts) of the ration of licuri prepared by an association of agricultural producers from the town of Valente, Bahia. The microbiological quality in the analyzed samples was good in accordance with standardized microbiological norms from The Netherlands, without salmonela, low counting of mesophilic microorganisms, and low contamination by filamentous fungi and yeasts in all analyses that were conducted. This is the first work published that describes the microbiological quality of the licuri feed produced by hand.Durante a época de seca na região da Caatinga brasileira, quando a oferta de alimento é escassa, muitos produtores utilizam formas alternativas para alimentar seu rebanho. Uma delas é a ração à base de frutos de licurizeiro (Syagrus coronata), processada artesanalmente pelos próprios produtores rurais ou associações, sem nenhum controle microbiano, feito até o presente estudo. O controle do desenvolvimento microbiano em rações utilizadas na alimentação animal visa principalmente diminuir os riscos à saúde dos consumidores de carnes, melhorando a qualidade higiênica e sanitária da ração. Por isso, este trabalho objetivou a análise microbiológica (presença de salmonelas, contagem de microsganismos mesófilos e contaminação por fungos e leveduras) da ração à base de licuri preparada por uma associação de produtores rurais do município de Valente, Bahia. A qualidade microbiológica encontrada nas amostras analisadas foi boa quando comparada com as normas microbiológicas para ração padronizadas da Holanda, ocorrendo ausência de salmonelas, baixa contagem de microrganismos mesófilos e baixa contaminação por fungos filamentosos e leveduras em todas as análises realizadas. Este é o primeiro trabalho na literatura que descreve a qualidade microbiológica da ração à base de licuri produzida artesanalmente

Diversity of Saccharomyces cerevisiae strains isolated of the spontaneous fermentation of cachaça from northeastern Brazil / Diversidade de linhagens de Saccharomyces cerevisiae isoladas de fermentações espontâneas de cachaça do nordeste Brasileiro

Cachaça is a beverage obtained by distilling fermented sugar cane juice. The state of Bahia in northeastern Brazil is the second-largest producer of traditional cachaça, and this region has the potential to improve the quality and quantity of its beverage production. The aim of this study was to analyze the genetic diversity of Saccharomyces cerevisiae populations isolated from must in six distilleries in Bahia using mitochondrial DNA restriction fragment length polymorphism (mtDNA-RFLP). Among the three hundred and thirty S. cerevisiae strains isolated, mtDNA-RFLP analysis identified a total of 30 molecular patterns. Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the greatest genetic variation was found among, rather than within, the populations. Population structure analyses showed the presence of three distinct gene pools, thereby corroborating the AMOVA results. This study represents an important contribution to better understanding the molecular characterization and genetic variability of S. cerevisiae strains during the fermentation of cachaça. The dominant molecular patterns identified here may be used to select S. cerevisiae strains that could improve the quality and volume of traditional cachaça production in Bahia.

Potencial biotecnológico de leveduras carotenogênicas: uma breve revisão

Carotenoids are natural colorants produced primarily by plants and microorganisms. Some of them are precursors of vitamin A and, recently, these compounds have been assigned an important role in reducing the risk of various degenerative diseases. Carotenoids in commercial formulations are of two types: vegetable extracts and synthetic. Those carotenoids obtained from microorganisms may make minor fluctuations in the composition, in relation to those obtained from extracts of plants and can be cheaper that the synthetic ones. However, the production of carotenoids by microorganisms is now an interesting alternative because of the possibility of obtaining natural pigments in industrial scale. The industrial applications of carotenoids relate to their use as supplemental food and coloring of food and diet. Thus, this review has the objective to disseminate the industrial production of natural carotenoids through microbial fermentations for biotechnological purposes.Os carotenóides são corantes naturais, biossintetizados exclusivamente por vegetais e microrganismos. Alguns são precursores de vitamina A e, recentemente, a estes compostos tem sido atribuído um importante papel na diminuição do risco de várias doenças degenerativas. Os carotenóides em formulações comerciais são de dois tipos: obtidos de extratos vegetais ou sintéticos. Os carotenóides obtidos a partir de microrganismos podem apresentar menores flutuações na composição, em relação aos obtidos a partir de extratos de plantas e podem ser mais baratos que os carotenóides sintéticos. A produção de carotenóides por meio de microrganismos constitui ainda uma alternativa interessante devido à possibilidade da obtenção de pigmentos naturais em escala industrial. As aplicações industriais dos carotenóides envolvem seu uso como suplementação alimentar e como corantes de alimentos e de ração. Assim, esta breve revisão tem por objetivo a divulgação do potencial industrial e biotecnológico de leveduras carotenogênicas

AVALIAÇÃO DE PARÂMETROS FERMENTATIVOS DE INÓCULOS UTILIZADOS NA PRODUÇÃO DA CACHAÇA DE ALAMBIQUE

A Cachaça de Alambique é uma bebida tipicamente brasileira, dotada de sabor e aroma característico, sendo produzida exclusivamente do caldo de cana-de-açúcar, sem a adição de produtos químicos, nos chamados engenhos, e destilada em alambiques de cobre. Na produção da Cachaça de Alambique o inóculo utilizado na fermentação do caldo de cana pode ser de três tipos. Existem os inóculos selvagens, formados pela microbiota natural existente na cana-de-açúcar; os selecionados, que consistem em linhagens selecionadas de S. cerevisiae isoladas da fermentação da cachaça; e o comercial, que é produto destinado a panificação contendo células da levedura S. cerevisiae. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o rendimento, a eficiência e a produtividade da fermentação realizada por linhagem selecionada de S. cerevisiae SC82, por inóculo selvagem e por inóculo comercial. Verificou-se que o tempo médio fermentativo das três bateladas de fermentações realizadas alcançado pela cepa SC82 foi de 14 h, já o do inóculo comercial foi de 21 h. O inóculo selvagem no final da etapa de multiplicação não conseguiu zerar o Brix da etapa para dar prosseguimento as fermentações e por conta disto foi descartado. Na avaliação do desempenho fermentativo verificou-se que a cepa SC82 apresentou um rendimento médio (47,46 %), uma eficiência média (92,89 %) e uma produtividade média (1,91 g/Lh) melhor que os valores médios do rendimento (42,90 %), da eficiência (83,95 %) e da produtividade (1,25 g/Lh) alcançados pelo inóculo comercial ao final das três bateladas de fermentações realizadas

PRODUÇÃO E ANÁLISE QUÍMICA DE CACHAÇA DE ALAMBIQUE A PARTIR DE CEPA SELECIONADA DE SACCHAROMYCES CEREVISIAE

As leveduras e as condições de fermentação são apontadas como os fatores que influenciam no sabor das bebidas alcoólicas, pois a maioria dos compostos secundários responsáveis pela qualidade sensorial da bebida é formada durante a fermentação. A utilização de leveduras selecionadas para produção de cachaça tem sido pesquisada, visando ao aumento da produtividade, vantagens tecnológicas e melhoria das características sensoriais da bebida. Assim, o presente trabalho teve como objetivo verificar a qualidade química da cachaça artesanal produzida em alambique de cobre, seguindo os parâmetros da legislação brasileira, por levedura selecionada segundo o consumo de açúcares (ºBrix) durante a multiplicação celular e a fermentação do caldo de cana, bem como o tempo transcorrido para concluir a fermentação. Foram testadas 16 linhagens de S. cerevisiae previamente isoladas de dornas de fermentação de destilarias artesanais localizadas no estado da Bahia, Brasil. Considerando parâmetros de consumo de açúcares durante a etapa de multiplicação e de fermentação, a linhagem S. cerevisiae SC82 foi escolhida para a produção de cachaça em alambique de cobre em pequena escala (10 L). Entretanto os valores de álcoois superiores estariam acima do permitido pela legislação na concentração alcoólica de 45 % (v/v). Fatores como cepa utilizada, presença de micro-organismos contaminantes na fermentação, concentração dos suplementos orgânicos adicionados na fermentação, e o tipo do equipamento usado na destilação, podem estar influenciando a produção destes álcoois superiores

Early development of Moniliophthora perniciosa basidiomata and developmentally regulated genes

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The hemibiotrophic fungus <it>Moniliophthora perniciosa </it>is the causal agent of Witches' broom, a disease of <it>Theobroma cacao</it>. The pathogen life cycle ends with the production of basidiocarps in dead tissues of the infected host. This structure generates millions of basidiospores that reinfect young tissues of the same or other plants. A deeper understanding of the mechanisms underlying the sexual phase of this fungus may help develop chemical, biological or genetic strategies to control the disease.</p> <p>Results</p> <p>Mycelium was morphologically analyzed prior to emergence of basidiomata by stereomicroscopy, light microscopy and scanning electron microscopy. The morphological changes in the mycelium before fructification show a pattern similar to other members of the order <it>Agaricales</it>. Changes and appearance of hyphae forming a surface layer by fusion were correlated with primordia emergence. The stages of hyphal nodules, aggregation, initial primordium and differentiated primordium were detected. The morphological analysis also allowed conclusions on morphogenetic aspects. To analyze the genes involved in basidiomata development, the expression of some selected EST genes from a non-normalized cDNA library, representative of the fruiting stage <it>of M. perniciosa</it>, was evaluated. A macroarray analysis was performed with 192 selected clones and hybridized with two distinct RNA pools extracted from mycelium in different phases of basidiomata formation. This analysis showed two groups of up and down-regulated genes in primordial phases of mycelia. Hydrophobin coding, glucose transporter, Rho-GEF, Rheb, extensin precursor and cytochrome p450 monooxygenase genes were grouped among the up-regulated. In the down-regulated group relevant genes clustered coding calmodulin, lanosterol 14 alpha demethylase and PIM1. In addition, 12 genes with more detailed expression profiles were analyzed by RT-qPCR. One aegerolysin gene had a peak of expression in mycelium with primordia and a second in basidiomata, confirming their distinctiveness. The number of transcripts of the gene for plerototolysin B increased in reddish-pink mycelium and indicated an activation of the initial basidiomata production even at this culturing stage. Expression of the glucose transporter gene increased in mycelium after the stress, coinciding with a decrease of adenylate cyclase gene transcription. This indicated that nutrient uptake can be an important signal to trigger fruiting in this fungus.</p> <p>Conclusion</p> <p>The identification of genes with increased expression in this phase of the life cycle of <it>M. perniciosa </it>opens up new possibilities of controlling fungus spread as well as of genetic studies of biological processes that lead to basidiomycete fruiting. This is the first comparative morphologic study of the early development both <it>in vivo </it>and <it>in vitro </it>of <it>M. perniciosa </it>basidiomata and the first description of genes expressed at this stage of the fungal life cycle.</p