Identificació de varietats de vitis vinifera L. de diverses regions del món mitjançant tècniques de biologia molecular

Durant els últims vint anys, una intensa renovació varietal ha canviat la realitat vitícola del nostre país i de gran part de la vinya del món, propiciant l'abandonament del conreu de nombroses varietats autòctones per substituir- les per altres de més prestigi internacional presents arreu. Aquesta renovació varietal ha permès revitalitzar el sector, afavorir les noves inversions i obrir nous mercats per als nostres vins, però ha contribuït a fer que les característiques de la major part dels vins s'uniformitzessin, i que el concepte de tipicitat, anteriorment atribuït a la zona de producció, es diluís enfront de la creixent homogeneïtat dels vins. El propòsit d'aquest projecte és estudiar unes quatre-centes varietats viníferes procedents de diversos països del món per identificar-les i tipificar-les. El desenvolupament de la biologia molecular ha permès l'aparició de metodologies que fan possible la identificació i classificació més exacta de diferents varietats analitzant directament el genoma de cada individu (ADN). La tècnica dels SSR (seqüències simples repetides, simple sequence repeat), també coneguts com a microsatèl·lits, és perfectament aplicable a la finalitat descrita. D'altra banda, el fet de disposar d'un camp de varietats tan ampli com el que es planteja ofereix també la possibilitat d'estudiar tot el conjunt sota un punt de vista evolutiu, en què s'agrupen les varietats en funció de la seva proximitat genètica. En el següent article presentem la metodologia triada per dur a terme aquest estudi i les raons que ens han motivat a escollir aquesta tècnica i no cap altra.Durante los últimos veinte años, una intensa renovación varietal ha cambiado la realidad vitícola de nuestro país y de gran parte del viñedo mundial, propiciando el abandono del cultivo de numerosas variedades autóctonas para sustituirlas por otras de más prestigio internacional presentes por todas partes. Esta renovación varietal ha permitido revitalizar el sector, favorecer las nuevas inversiones y abrir nuevos mercados para nuestros vinos, pero ha contribuido a que las características de la mayor parte de los vinos se uniformizarán, consiguiendo que el concepto de tipicidad anteriormente atribuido a la zona de producción, se diluyera frente a la creciente homogeneidad de los vinos. El propósito de este proyecto, es el de estudiar unas cuatrocientas variedades viníferas procedentes de varios países del mundo por identificarlas y tipificarlas. El desarrollo de la Biología Molecular, ha permitido la aparición de metodologías que permiten la identificación y clasificación más exacta de diferentes variedades analizando directamente el genoma de cada individuo (ADN). La técnica de los SSR (simple sequence repeat) o también conocida como microsatélites es perfectamente aplicable a la finalidad descrita. Por otra parte, la posibilidad de disponer de un campo de variedades tan amplio, como el que se plantea, ofrece también la posibilidad de estudiar todo el conjunto bajo un punto de vista evolutivo, en el que se agrupan las variedades en función de su proximidad genética. En el siguiente artículo presentamos la metodología utilizada para la realización de este estudio, así como las razones que nos han motivado a escoger esta técnica de microsatélites

Caracterització dels vins escumosos de la varietat trepat

En l?aspecte visual dels vins escumosos s?aprecia la formació d?escuma, que ha de ser blanca i compacta, amb bombolles de grandària petita. Per això han d?aparèixer cordons de bombolles que en arribar a la superfície migrin cap als costats formant una corona que cobreixi tot el disc de líquid. Per a avaluar l?escuma hi ha un aparell anomenat Mosalux, que s?ha emprat per a comparar l?escumabilitat del trepat amb vins d?altres varietats. El trepat té unes propietats escumants comparables a les millors varietats avaluades, i és un vi molt adequat per a l?elaboració d?escumosos.En el aspecto visual de los vinos espumosos se aprecia la formación de espuma, que ha de ser blanca y compacta, con burbujas pequeñas. Para eso han de aparecer cordones de burbujas que al llegar a la superficie se desplacen hacia los lados formando una corona que cubra todo el disco de líquido. Para evaluar la espuma existe un aparato llamado Mosalux, que se ha utilizado para comparar la espumabilidad del trepat con vinos de otras variedades. El trepat tiene unas propiedades espumeantes comparables a las mejores variedades evaluadas, siendo un vino muy adecuado para la elaboración de espumosos

Estudi de la influència del coure i la diclofuanida sobre la cinètica fermentativa i el metabolisme de Saccharomyces cerevisiae

La presencia de productos fitosanitarios en la vendimio procedentes de los tratamientos viticolas para prevenir las plagas y las enfermedades de la viña, puede llegar a provocar retrasos y paradas durante la fermentación alcoholica. La presente tesis doctoral, es un estudio de los efectos del oxicloruro de cobre y la diclofluanida sobre la fermentación alcoholica. Su presencia ocacinó retrasos en la cinética fermentativa así como una elevada mortalidad de la población de células viables, cuando no se guardaban los períodos de seguridad aconsejados. En estas mismas circunstancias, se observaron modificacions de las actividades enzimaticas de dos enzimas claves de la fermentación alcohólica (Hexoquinasa y alcohol deshidrogenasa) modificaciones que no llegaron a justificar los retrasos de la fermentación observados anteriormente. Sin embargo quedaron muy afectados tanto la actividad de la atpasa de protones como la actividad del transportador de baja afinidad de la glucosa, mecanismos bioquimico/celulares que si explicarían los retrasos observados durante la fermentación. En los vinos procedentes de mostos tratados con los pesticidas estudiados, también se observaron alteraciones tanto de los parámetros químicos como de los parámetros que influyen en la composición aromática de los vinos

Analysis of the Diversity Presented by Vitis vinifera L. in the Volcanic Island of La Gomera (Canary Archipelago, Spain) Using Simple Sequence Repeats (SSRs) as Molecular Markers

La Gomera Island is one of the areas of our planet where the phylloxera plague never arrived. To measure the genetic diversity of the vine after more than 500 years (inter- and intravarietal variability) of adaptation to this new environment, a prospection was carried out. For this purpose, 120 samples were collected and genotyped with 20 SSRs. A total of 52 unique profiles were found corresponding to 4 new varieties (Coello blanca, Barrerita negra, Malvasia periquin gomerae, Verdello gomerae), 9 individuals identical to the most widespread profile, and 39 individuals that presented variations (1 corresponding to a mutation of a new variety (Verdello gomerae de Monacal) and 38 corresponding to variations of known varieties, some of which included cases of triallelism or quadriallelism). The population of local vines in La Gomera Island is considered to be the most unique in the Canary Islands to date. It is hypothesised that the grapevine varieties Malvasia periquin gomerae and Verdello gomerae are possibly the most unique and that the Barrerita negra variety may have resulted from an interspecific crossbreeding. The Coello blanco variety (admixed) seems to have a strong Central European influence. Finally, we propose that the prime name for the Albillo forastero variety, which was arbitrarily imposed by the scientific community, be changed to the more widespread and better-known name in La Gomera Island and the Canary Archipelago, which is Forastera gomerae

Resultats de la tècnica dels microsatèl·lits o SSR aplicada al trepat

L?objectiu d?aquest treball és fer la caracterització de la varietat trepat mitjançant la tècnica dels microsatèl·lits (SSR), i a partir del germoplasma de Bodegues Sumarroca, SL. Es tracta, doncs, de fer una exhaustiva revisió de les bases de dades ampelogràfiques, de la bibliografia i de tota la informació en línia, i comparar-la amb els resultats obtinguts a partir de l?estudi del genoma (microsatèl·lits en aquest cas).El objetivo de este trabajo es hacer la caracterización de la variedad trepat mediante la técnica de microsatélites (S. S. R.) y a partir del germoplasma de Bodegas Sumarroca, S. L. Se trata, pues, de hacer una exhaustiva revisión de las bases de datos ampelográficas, de la bibliografía y de toda la información en línea y compararla con los resultados obtenidos a partir del estudio del genoma (microsatélites en este caso)

Resultats de la tècnica dels microsatèl·lits o SSR aplicada al trepat

L?objectiu d?aquest treball és fer la caracterització de la varietat trepat mitjançant la tècnica dels microsatèl·lits (SSR), i a partir del germoplasma de Bodegues Sumarroca, SL. Es tracta, doncs, de fer una exhaustiva revisió de les bases de dades ampelogràfiques, de la bibliografia i de tota la informació en línia, i comparar-la amb els resultats obtinguts a partir de l?estudi del genoma (microsatèl·lits en aquest cas).El objetivo de este trabajo es hacer la caracterización de la variedad trepat mediante la técnica de microsatélites (S. S. R.) y a partir del germoplasma de Bodegas Sumarroca, S. L. Se trata, pues, de hacer una exhaustiva revisión de las bases de datos ampelográficas, de la bibliografía y de toda la información en línea y compararla con los resultados obtenidos a partir del estudio del genoma (microsatélites en este caso)

Estudi de l'evolució de la climatologia a la Conca de Barberà en els darrers cinquanta anys i les possibles repercussions en la viticultura del segle XXI

L'estudi s'ha dut a terme a Montblanc (capital de la Conca de Barberà). S'han analitzat tendències de temperatures i pluviometries per a cada estadi fenològic de la vinya, amb la finalitat de poder determinar els impactes sobre la viticultura de la zona. La base de dades correspon a l'observatori de Montblanc (coordenades UTM: X: 341.175; Y: 4.584.350; Z: 441 m s. n. m.). La sèrie climàtica de temperatures va des de l'any 1950 fins al 2007 i la pluviometria va des de l'any 1914 fins al 2007. Es poden observar tendències creixents de temperatures màximes i una lleugera pujada de les temperatures mínimes. Les precipitacions disminueixen progressivament cada any i es concentren en determinades èpoques de l'any, per tant, es desestacionalitzen els períodes de pluges, i s'incrementa el dèficit hídric entre la brotada i el verol (és important recalcar que en aquest període l'estrès hídric ha de ser nul).El estudio se ha llevado a cabo en Montblanc (capital de la Conca de Barberà). Se ha analizado tendencias de temperaturas y pluviometrías para cada estado fenológico de la vid, con la finalidad de poder determinar los impactos sobre la viticultura de la zona. La base de datos corresponde al observatorio de Montblanc (coordenadas UTM: X: 341.175; Y: 4.584.350; Z: 441 m s. n. m.) La serie climática de temperaturas va desde el año 1950 hasta el 2007 y la pluviometría va desde el año 1914 hasta el 2007. Se pueden observar tendencias crecientes de temperaturas máximas y una ligera subida de las temperaturas mínimas. Las precipitaciones disminuyen progresivamente cada año y se concentran en determinadas épocas del año, por lo tanto se desestacionalizan los periodos de lluvia y se incrementa el déficit hídrico entre el brote y el envero (es importante recalcar que en este periodo el estrés hídrico ha de ser nulo)

Mortality risk in patients on hemodiafiltration versus hemodialysis : a 'real-world' comparison from the DOPPS

Background. With its convective component, hemodiafiltration (HDF) provides better middle molecule clearance compared with hemodialysis (HD) and is postulated to improve survival. A previous analysis of Dialysis Outcomes and Practice Patterns Study (DOPPS) data in 1998-2001 found lower mortality rates for high replacement fluid volume HDF versus HD. Randomized controlled trials have not shown uniform survival advantage for HDF; in secondary (non-randomized) analyses, better outcomes were observed in patients receiving the highest convection volumes. Methods. In a 'real-world' setting, we analyzed patients on dialysis >90 days from seven European countries in DOPPS Phases 4 and 5 (2009-15). Adjusted Cox regression was used to study HDF (versus HD) and mortality, overall and by replacement fluid volume. Results. Among 8567 eligible patients, 2012 (23%) were on HDF, ranging from 42% in Sweden to 12% in Germany. Median follow-up was 1.5 years during which 1988 patients died. The adjusted mortality hazard ratio (95% confidence interval) was 1.14 (1.00-1.29) for any HDF versus HD and 1.08 (0.92-1.28) for HDF > 20 L replacement fluid volume versus HD. Similar results were found for cardiovascular and infection-related mortality. In an additional analysis aiming to avoid treatment-by-indication bias, we did not observe lower mortality rates in facilities usingmore HDF (versus HD). Conclusions. Our results do not support the notion that HDF provides superior patient survival. Further trials designed to test the effect of high-volume HDF (versus lower volume HDF versus HD) on clinical outcomes are needed to adequately inform clinical practices

Expression analysis of the long non-coding RNA antisense to Uchl1 (AS Uchl1) during dopaminergic cells' differentiation in vitro and in neurochemical models of Parkinson's disease

Antisense (AS) transcripts are RNA molecules that are transcribed from the opposite strand to sense (S) genes forming S/AS pairs. The most prominent configuration is when a lncRNA is antisense to a protein coding gene. Increasing evidences prove that antisense transcription may control sense gene expression acting at distinct regulatory levels. However, its contribution to brain function and neurodegenerative diseases remains unclear. We have recently identified AS Uchl1 as an antisense to the mouse Ubiquitin carboxy-terminal hydrolase L1 (Uchl1) gene (AS Uchl1), the synthenic locus of UCHL1/PARK5. This is mutated in rare cases of early-onset familial Parkinson's Disease (PD) and loss of UCHL1 activity has been reported in many neurodegenerative diseases. Importantly, manipulation of UchL1 expression has been proposed as tool for therapeutic intervention. AS Uchl1 induces UchL1 expression by increasing its translation. It is the representative member of SINEUPs (SINEB2 sequence to UP-regulate translation), a new functional class of natural antisense lncRNAs that activate translation of their sense genes. Here we take advantage of FANTOM5 dataset to identify the transcription start sites associated to S/AS pair at Uchl1 locus. We show that AS Uchl1 expression is under the regulation of Nurr1, a major transcription factor involved in dopaminergic cells' differentiation and maintenance. Furthermore, AS Uch1 RNA levels are strongly down-regulated in neurochemical models of PD in vitro and in vivo. This work positions AS Uchl1 RNA as a component of Nurr1-dependent gene network and target of cellular stress extending our understanding on the role of antisense transcription in the brain