Aislamiento de núcleos para citometría de flujo en plantas con alto contenido de compuestos mucilaginosos: un ejemplo en el género Viola L. (Violaceae)

Flow cytometry analysis has been widely applied in the determination of nuclear DNA content and ploidy level in many organisms. Despite being the most appropriate method for DNA content measurement, flow cytometry also presents some limitations. A fairly common, but little-studied problem is the effect on measurements of the presence of secondary metabolites. A good example is the genus Viola, which is composed of 525-600 species distributed worldwide. These species have proved to be problematic for flow cytometric analyses due to the release of extremely mucilaginous compounds into the nuclear suspension. In this work, the genome size of 13 species of Viola using flow cytometry are presented for the first time. Despite obtaining histograms with high coefficients of variation, we here present an optimized protocol to remove cytoplasmic compounds, particularly mucilaginous ones, from plant nuclei that pave the way for its application to estimate the genome size of other species exhibiting similar problems. Statistical analyses revealed significant differences between sections Viola and Melanium, and within each section (P < 0.001). Furthermore, statistically significant differences were not detected among samples of the same species.El análisis mediante citometría de flujo ha sido aplicado de modo general para determinar el contenido de ADN nuclear y el nivel de ploidía en muchos organismos. A pesar de ser el método más adecuado para medir la cantidad de ADN, esta técnica también presenta algunas limitaciones. Un problema bastante común, aunque poco estudiado, es el efecto de los metabolitos secundarios en los resultados obtenidos. Un ejemplo respecto a la presencia de estos compuestos se encuentra en el género Viola, compuesto por 525-600 especies distribuidas por todo el mundo. Las especies de este género ya han sido previamente descritas como problemáticas en los análisis de citometría de flujo debido a la presencia de compuestos extremadamente mucilaginosos en las suspensiones de núcleos. En el presente trabajo se analiza por primera vez el tamaño genómico de 13 especies del genero Viola mediante el empleo de citometría de flujo. A pesar de los altos valores mostrados en los coeficientes de variación de los histogramas, se presenta un protocolo optimizado para eliminar compuestos citoplasmáticos, y más concretamente mucilaginosos de las suspensiones nucleares, siendo de aplicación en la estimación del tamaño genómico de plantas con problemas similares. Los análisis estadísticos mostraron diferencias significativas entre las secciones Viola y Melanium, así como dentro de cada sección (P < 0,001). Además, no se encontraron diferencias significativas entre aquellas muestras pertenecientes a la misma especie

Single-locus-sequence-based typing of the mgpB gene reveals transmission dynamics in mycoplasma genitalium

Sexually transmitted infections (STIs) by Mycoplasma genitalium are a major problem worldwide, especially given their marked and rapid propensity for developing antimicrobial resistance. Since very few treatment options exist, clinicians face an important challenge in the management of the infection. In this scenario, little is known regarding the transmission dynamics of M. genitalium and the epidemiology of antimicrobial resistance. This mgpB-based molecular typing study, conducted among 54 asymptomatically infected individuals prospectively recruited from an STI screening service, reveals two distinct epidemiological clusters that significantly correlate with sexual conduct in heterosexuals and men who have sex with men (MSM), respectively. This well-defined structuration suggests the presence of two independent sexual networks with little connectivity between them. On the other hand, the study demonstrates the multiclonal feature of the emergence of antibiotic resistance in M. genitalium to both macrolides and fluoroquinolones. The high prevalence of macrolide resistance in M. genitalium among MSM, influenced by dense network connectivity and strong antibiotic selective pressure, may correspond to allodemics affecting other STIs such as gonorrhea, syphilis and enteric pathogens. Collaterally, the structural and functional impact of mutations in the mgpB gene, encoding the major adhesin P140 (MgpB), may require further investigation.This work was partially supported by an “Ayuda SEIMC” grant from the Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology (SEIMC)

Isolation of plant nuclei suitable for flow cytometry from species with extremely mucilaginous compounds: an example in the genus <i>Viola</i> L. (Violaceae)

Cires, E., Cuesta, C., Fernández, M.A., Nava, H.S., Vázquez, V.M. & Fernández, J.A. 2011. Isolation of plant nuclei suitable for flow cytometry from species with extremely mucilaginous compounds: an example in the genus Viola L. (Violaceae). Anales.Iard. Bot. Madrid 68(2): 139-154. Flow cytometry analysis has been widely appljed in the determination of nuclear DNA content and ploidy level in many organisms. Despite being the most appropriate method for DNA content measurement, flow cytometry also presents some limitations. A fairly common, but little-studied problem is the effect on measurements of the presente of secondary metabolites. A good example is the genus Viola, which is composed of 525-600 species distributed worldwide. These species have proved to be problematic for flow cytometric analyses due to the release of extremely mucilaginous compounds into the nuclear suspension. In this work, the genome size of 13 species of Viola using flow cytometry are presented for the first time. Despite obtaining histograms with high coefficients of variation, we here pre-sent an optimized protocol to remove cytoplasmic compounds, particularly mucilaginous ones, from plant nudei that paye the way for its application to estimate the genome size of other species exhibiting similar problems. Statistical analyses revealed significant differences between sections Viola and Melanium, and within each section (P < 0.001). Furthermore, statistically significant differences were not detected among samples of the same species.Cires, E., Cuesta, C., Fernández, M.A., Nava, H.S., Vázquez, V.M. & Fernández, J.A. 2011. Aislamiento de núcleos para citometría de flujo en plantas con alto contenido de compuestos mucilaginosos: un ejemplo en el género Viola L. (Violaceae). Anales.lard. Bot. Madrid 68(2): 139-154 (en inglés). El análisis mediante citometría de flujo ha sido aplicado de modo general para determinar el contenido de ADN nuclear y el nivel de ploidía en muchos organismos. A pesar de ser el método más adecuado para medir la cantidad de ADN, esta técnica también presenta algunas limitaciones. Un problema bastante común, aunque poco estudiado, es el efecto de los metabolitos secundarios en los resultados obtenidos. Un ejemplo respecto a la presencia de estos compuestos se encuentra en el género Viola, compuesto por 525-600 especies distribuidas por todo el mundo. Las especies de este género ya han sido previamente descritas como problemáticas en los análisis de citometría de flujo debido a la presencia de compuestos extremadamente mucilaginosos en las suspensiones de núcleos. En el presente trabajo se analiza por primera vez el tamaño genómico de 13 especies del genero Viola mediante el empleo de citometría de flujo. A pesar de los altos valores mostrados en los coeficientes de variación de los histogramas, se presenta un protocolo optimizado para eli-minar compuestos citoplasmáticos, y más concretamente mucilaginosos de las suspensiones nucleares, siendo de aplicación en la estimación del tamaño genómico de plantas con problemas similares. Los análisis estadísticos mostraron diferencias significativas entre las secciones Viola y Melanium, así como dentro de cada sección (P < 0,001). Además, no se encontraron diferencias significativas entre aquellas muestras pertenecientes a la misma especie

Label-free plasmonic biosensor for rapid, quantitative, and highly sensitive COVID-19 serology: implementation and clinical validation

Serological tests are essential for the control and management of COVID-19 pandemic, not only for current and historical diagnostics but especially for surveillance, epidemiological, and acquired immunity studies. Clinical COVID-19 serology is routinely performed by enzymatic or chemiluminescence immunoassays (i.e., ELISA or CLIA), which provide good sensitivities at the expense of relatively long turnaround times and specialized laboratory settings. Rapid serological tests, based on lateral flow assays, have also been developed and widely commercialized, but they suffer from limited reliability due to relatively low sensitivity and specificity. We have developed and validated a direct serological biosensor assay employing proprietary technology based on Surface Plasmon Resonance (SPR). The biosensor offers a rapid -less than 15 min- identification and quantification of SARS-CoV-2 antibodies directly in clinical samples, without the need of any signal amplification. The portable plasmonic biosensor device employs a custom-designed multi-antigen sensor biochip, combining the two main viral antigens (RBD peptide and N protein), for simultaneous detection of human antibodies targeting both antigens. The SPR serology assay reaches detection limits in the low ng mL-1 range employing polyclonal antibodies as standard, which are well below the commonly detected antibody levels in COVID-19 patients. The assay has also been implemented employing the first WHO approved anti-SARS-CoV-2 immunoglobulin standard. We have carried out a clinical validation with COVID-19 positive and negative samples (n=120) that demonstrates the excellent diagnostic sensitivity (99%) and specificity (100%). This positions our biosensor device as an accurate, robust, and easy-to-use diagnostics tool for rapid and reliable COVID-19 serology to be employed both at laboratory and decentralized settings for the management of COVID-19 patients and for the evaluation of immunological status during vaccination, treatment or in front of emerging variants.H2020 Research and Innovation Programme of the European Commission Project, No. 101003544 Spanish Research Agency (AEI, grant no. SEV-2017-0706AEI, grant no. SEV-2017-0706) Spanish Ministry of Science and Innovation and the Spanish Research Agency and the European Social Fund (ESF)BES-2017-080527 GENCAT-DGRIS COVID EU H2020 Programme (644956) Plan Nacional de I+D+i 2013-2016 ISCIII- Ministerio de Ciencia e Innovación, Vall d’Hebron University Hospital Biobank PT17/0015/0047 European Virus Archive GLOBAL (EVA-GLOBAL) EU Horizon 2020 (grant agreement No. 871029) Fundació Glòria Soler for COVIDBANK collection Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI RD16/0016/0003)N

Supporting information Label-Free Plasmonic Biosensor for Rapid, Quantitative, and Highly Sensitive COVID-19 Serology: Implementation and Clinical Validation

15 pages. -- Content: 1. Supplementary text: 1.1.Chemical and biological reagents; 1.2.SPR biosensor device; 1.3.Plasmonic sensor chip preparation; 1.4.Clinical samples collection; 1.5.Stratification of convalescent COVID patients. Samples collection from Clinic Hospital (Barcelona); 1.6. Standard analytical techniques (ELISA, CLIA and LFA); 1.7.Data analysis; 1.8.Diagnostic sensitivity and specificity. -- 2. Figures. -- Tables S1-S3. -- References.Serological tests are essential for the control and management of COVID-19 pandemic (diagnostics and surveillance, and epidemiological and immunity studies). We introduce a direct serological biosensor assay employing proprietary technology based on plasmonics, which offers rapid (<15 min) identification and quantification of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) antibodies in clinical samples, without signal amplification. The portable plasmonic device employs a custom-designed multiantigen (RBD peptide and N protein) sensor biochip and reaches detection limits in the low ng mL–1 range employing polyclonal antibodies. It has also been implemented employing the WHO-approved anti-SARS-CoV-2 immunoglobulin standard. A clinical validation with COVID-19 positive and negative samples (n = 120) demonstrates its excellent diagnostic sensitivity (99%) and specificity (100%). This positions our biosensor as an accurate and easy-to-use diagnostics tool for rapid and reliable COVID-19 serology to be employed both at laboratory and decentralized settings for the disease management and for the evaluation of immunological status during vaccination or treatment.Peer reviewe

Aislamiento de núcleos para citometría de flujo en plantas con alto contenido de compuestos mucilaginosos: un ejemplo en el género Viola L. (Violaceae): un ejemplo en el género Viola L. (Violaceae)

Cires, E., Cuesta, C., Fernández, M.A., Nava, H.S., Vázquez, V.M. & Fernández, J.A. 2011. Isolation of plant nuclei suitable for flow cytometry from species with extremely mucilaginous compounds: an example in the genus Viola L. (Violaceae). Anales.Iard. Bot. Madrid 68(2): 139-154. Flow cytometry analysis has been widely appljed in the determination of nuclear DNA content and ploidy level in many organisms. Despite being the most appropriate method for DNA content measurement, flow cytometry also presents some limitations. A fairly common, but little-studied problem is the effect on measurements of the presente of secondary metabolites. A good example is the genus Viola, which is composed of 525-600 species distributed worldwide. These species have proved to be problematic for flow cytometric analyses due to the release of extremely mucilaginous compounds into the nuclear suspension. In this work, the genome size of 13 species of Viola using flow cytometry are presented for the first time. Despite obtaining histograms with high coefficients of variation, we here pre-sent an optimized protocol to remove cytoplasmic compounds, particularly mucilaginous ones, from plant nudei that paye the way for its application to estimate the genome size of other species exhibiting similar problems. Statistical analyses revealed significant differences between sections Viola and Melanium, and within each section (P < 0.001). Furthermore, statistically significant differences were not detected among samples of the same species.Cires, E., Cuesta, C., Fernández, M.A., Nava, H.S., Vázquez, V.M. & Fernández, J.A. 2011. Aislamiento de núcleos para citometría de flujo en plantas con alto contenido de compuestos mucilaginosos: un ejemplo en el género Viola L. (Violaceae). Anales.lard. Bot. Madrid 68(2): 139-154 (en inglés). El análisis mediante citometría de flujo ha sido aplicado de modo general para determinar el contenido de ADN nuclear y el nivel de ploidía en muchos organismos. A pesar de ser el método más adecuado para medir la cantidad de ADN, esta técnica también presenta algunas limitaciones. Un problema bastante común, aunque poco estudiado, es el efecto de los metabolitos secundarios en los resultados obtenidos. Un ejemplo respecto a la presencia de estos compuestos se encuentra en el género Viola, compuesto por 525-600 especies distribuidas por todo el mundo. Las especies de este género ya han sido previamente descritas como problemáticas en los análisis de citometría de flujo debido a la presencia de compuestos extremadamente mucilaginosos en las suspensiones de núcleos. En el presente trabajo se analiza por primera vez el tamaño genómico de 13 especies del genero Viola mediante el empleo de citometría de flujo. A pesar de los altos valores mostrados en los coeficientes de variación de los histogramas, se presenta un protocolo optimizado para eli-minar compuestos citoplasmáticos, y más concretamente mucilaginosos de las suspensiones nucleares, siendo de aplicación en la estimación del tamaño genómico de plantas con problemas similares. Los análisis estadísticos mostraron diferencias significativas entre las secciones Viola y Melanium, así como dentro de cada sección (P < 0,001). Además, no se encontraron diferencias significativas entre aquellas muestras pertenecientes a la misma especie

Radio para la democracia vol. III: La evolución de la música nacional

Las producciones radiofónicas denominadas Radio para la democracia vol. I, II y III son una iniciativa producida por la Prosecretaría Académica en articulación con el Taller de estrategias de comunicación sonora y radial cátedra II, el Taller de edición y realización de proyectos radiofónicos, y el Taller de producción de contenidos y narrativas sonoras y radiales de la Facultad de Periodismo y Comunicación Social; en el marco de la celebración de los 40 años de democracia ininterrumpida en Argentina. En este sentido y en consonancia con los contenidos curriculares, los equipos docentes junto a los/as estudiantes de las asignaturas mencionadas pudieron explorar y producir nuevos conocimientos en relación a dicho hecho central de la vida institucional del país. De este modo se realizaron 40 piezas comunicacionales en formato radioteatro, mesa redonda, informe, columna radial, entrevistas, entre otras; abordando las siguientes temáticas: la censura durante la dictadura, la evolución de la música nacional durante los 40 años de democracia, el juicio a las Juntas Militares, el legado de Néstor Kirchner, la lucha feminista por la Ley de interrupción legal del embarazo, el rol de los medios de comunicación, el atentado a la vicepresidenta Cristina Fernández de Kirchner y, casos emblemáticos como el de Miguel Bru o Jorge Julio López, entre otros. Los equipos docentes a cargo de la producción de los podcasts estuvieron conformados por: María Eugenia García, Carina Calvo, Rosario Sandoval, Rodrigo García y Leonardo Meiorin; Viviana Vila y Verónica Bustos; y Sandra Gabay, Mariano Cattáneo, Marisol Morzilli, Juan Manuel Aravena y Julieta Nava; quienes contaron con la operación técnica de Mariano y Martín Fernández. Las cuarenta piezas además se encuentran publicadas en el canal de Spotify de la Facultad: Perio UNLP Podcast. Este podcast ofrece un recorrido histórico de la evolución de la música nacional durante los 40 años de democracia. Fue producido por estudiantes del Taller de producción de contenidos y narrativas sonoras y radiales, a cargo de la docente Julieta Nava. Autores: Milagros Acosta, Martina Bejar, Milagros Relli, Candela Guerreiro, Agustina Monzón. Equipo de producción Pro Secretaría Académica FP y CS: Jimena Espinoza, Maria Juliana Franceschi, Malena Escalante Sánchez, Camilo González Balducchi y Julián Cáneva. Operación técnica: Mariano Fernández y Martín Fernández.Facultad de Periodismo y Comunicación Socia