ESTs from a wild Arachis species for gene discovery and marker development

BACKGROUND: Due to its origin, peanut has a very narrow genetic background. Wild relatives can be a source of genetic variability for cultivated peanut. In this study, the transcriptome of the wild species Arachis stenosperma accession V10309 was analyzed. RESULTS: ESTs were produced from four cDNA libraries of RNAs extracted from leaves and roots of A. stenosperma. Randomly selected cDNA clones were sequenced to generate 8,785 ESTs, of which 6,264 (71.3%) had high quality, with 3,500 clusters: 963 contigs and 2537 singlets. Only 55.9% matched homologous sequences of known genes. ESTs were classified into 23 different categories according to putative protein functions. Numerous sequences related to disease resistance, drought tolerance and human health were identified. Two hundred and six microsatellites were found and markers have been developed for 188 of these. The microsatellite profile was analyzed and compared to other transcribed and genomic sequence data. CONCLUSION: This is, to date, the first report on the analysis of transcriptome of a wild relative of peanut. The ESTs produced in this study are a valuable resource for gene discovery, the characterization of new wild alleles, and for marker development. The ESTs were released in the [GenBank:EH041934 to EH048197]

Métrica Induzida da Correntropia Complexa Comparada ao NESTA no Problema de Amostragem Compressiva / Induced Complex Correntropy Metric Compared to NESTA on the Compressive Sampling Problem

Esse artigo compara ao algoritmo de Nesterov (NESTA) o desempenho da métrica induzida da correntropia complexa (Complex Correntropy Induced Metric - CCIM) enquanto uma aproximação de l0 num problema de amostragem compressiva. As simulações mostram que a CCIM é capaz de reconstruir um vetor esparso complexo usando menos medidas do que o NEST

Refletindo sobre ser professor na formação inicial: relato de uma experiência no PET Química da UFPR

...

Impactos ambientais do manejo agroecológico da caatinga no Rio Grande do Norte.

O objetivo deste trabalho foi avaliar os impactos ambientais do manejo agroecológico da caatinga, em unidades de produção familiar no Rio Grande do Norte, pelo método Ambitec de produção animal - dimensão ambiental, desenvolvido pela Embrapa Meio Ambiente. Foram avaliadas sete unidades de produção familiar, em quatro projetos de assentamentos de reforma agrária do Município de Apodi, RN. Os dados para o levantamento foram obtidos por meio de questionários aplicados aos representantes das unidades produtivas familiares, que atribuíram, a cada variável estudada, um valor que representou a alteração proporcionada pela implementação da tecnologia. Após a inserção dos coeficientes de alteração de cada variável dos indicadores por unidade de produção, o coeficiente de impacto foi automaticamente calculado por meio da planilha Ambitec. O manejo agroecológico da caatinga resultou num impacto ambiental positivo, e suas maiores contribuições foram relacionadas aos efeitos positivos dos seguintes indicadores: capacidade produtiva do solo, uso de insumos materiais, qualidade do produto e diminuição da emissão de poluentes à atmosfera. Dois indicadores geraram efeitos negativos: o uso de energia e o uso de recursos naturais. Pela superioridade dos benefícios gerados, o manejo agroecológico da caatinga é uma inovação tecnológica geradora de impactos ambientais positivos